Ta strona została przetłumaczona automatycznie i dokładność tłumaczenia nie jest gwarantowana. Proszę odnieść się do angielska wersja za tekst źródłowy.

Medyczne sekwencjonowanie całego genomu w celu odkrycia genomu

1 marca 2024 zaktualizowane przez: National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Medyczne sekwencjonowanie całego genomu w celu odkrycia genów

Tło:

- Szereg rzadkich chorób dziedzicznych dotyka tylko kilku pacjentów, a genetyczne przyczyny tych schorzeń pozostają nieznane. Naukowcy badają wykorzystanie nowej technologii zwanej sekwencjonowaniem całego genomu, aby dowiedzieć się, który gen lub geny powodują te stany. Zrozumienie genów, które powodują te choroby, jest ważne dla poprawy diagnozy i leczenia dotkniętych nimi pacjentów.

Cele:

  • Aby zidentyfikować genetyczną przyczynę zaburzeń, które są trudne do zidentyfikowania za pomocą istniejących technik.
  • Opracowanie najlepszych praktyk w zakresie medycznych i doradczych wyzwań związanych z sekwencjonowaniem całego genomu.

Kwalifikowalność:

  • Osoby cierpiące na jedno z rzadkich zaburzeń rozważanych w tym badaniu. Te stany to na ogół te, w których genetyczna przyczyna zaburzenia jest nieznana. Kwalifikowalność większości indywidualnych uczestników będzie ustalana indywidualnie dla każdego przypadku przez badaczy.
  • Członkowie rodziny osób dotkniętych chorobą, jeśli ten członek rodziny (często rodzic) może dostarczyć informacje genetyczne.

Projekt:

  • Uczestnicy tego badania będą mieli co najmniej jedną, aw niektórych przypadkach kilka z następujących procedur:
  • Ocena genetyki medycznej.
  • Inne testy, które mogą obejmować zdjęcia rentgenowskie, rezonans magnetyczny (MRI) i konsultacje z innymi lekarzami. Nie wszystkie badania są konieczne dla każdej osoby, ale informacje z testów mogą być wymagane do przeprowadzenia niektórych z naszych badań sekwencjonowania genów.
  • Zdjęcia kliniczne w celu udokumentowania niektórych aspektów zaburzenia.
  • Próbki biopsji krwi i skóry lub inne próbki tkanek zgodnie z wymaganiami lekarzy prowadzących badanie.
  • Testy genetyczne, zgodnie z decyzją naukowców. Jednak większość uczestników tego badania może spodziewać się sekwencjonowania całego genomu, co jest techniką badania wszystkich genów danej osoby.
  • Niektórzy uczestnicy mogą zostać poproszeni o wzięcie udziału w rozmowie telefonicznej i/lub ankiecie internetowej.
  • Uczestnicy będą mogli wybrać, jakich wyników sekwencjonowania całego genomu chcą się nauczyć.
  • Po zakończeniu testów i poznaniu wyników badań genetycznych uczestnikom zaoferowana zostanie ponowna wizyta w Narodowym Instytucie Zdrowia w celu zapoznania się z tymi wynikami. Podczas tej wizyty uczestnicy zostaną poproszeni o wypełnienie ankiet i udział w wywiadach związanych z podjęciem decyzji o udziale w badaniu oraz poznanie indywidualnych wyników badań genetycznych.

Przegląd badań

Szczegółowy opis

Naszym celem jest wykorzystanie sekwencjonowania medycznego w skali genomu (GSMS, w celu uwzględnienia egzomu i całości

sekwencjonowanie genomu w stosownych przypadkach) w celu wykrycia przyczynowych zmian molekularnych dla zestawu rzadkich, ciężkich fenotypów, co do których przypuszcza się, że są spowodowane mutacjami somatycznymi, mutacjami heterozygotycznymi de novo w linii zarodkowej, odziedziczonymi recesywnie w linii zarodkowej lub odziedziczonymi dominującymi mutacjami w linii zarodkowej w obecnie nieznanych lub niescharakteryzowanych genach. Cel tych badań jest trojaki: zidentyfikowanie wariantów sekwencji przyczynowych dla zaburzeń, których etiologia molekularna była wcześniej nieznana, zastosowanie tej wiedzy zarówno do badanych rzadkich zaburzeń, jak i bardziej powszechnych fenotypów oraz usprawnienie badania mutacji na całym genomie poziom.

Planujemy rekrutować około trzech do sześciu osób dotkniętych chorobą wraz z obojgiem rodziców dla każdego badanego fenotypu. Potencjalnie rekrutowane trio zostanie przewiezione do Centrum Klinicznego NIH w celu przeprowadzenia krótkich ocen klinicznych i oceny molekularnej. Każde trio otrzyma zgodę na GSMS z możliwością poznania wyników istotnych klinicznie, to znaczy tych, które wyjaśniają dane zaburzenie (co nazywamy wariantem pierwotnym), a także inne istotne klinicznie ustalenia odkryte przypadkowo w ramach GSMS proces (co nazywamy wariantami wtórnymi). Uczestnikom zaoferowana zostanie ponowna wizyta w NIH, aby poznać te wyniki.

Dane sekwencji wygenerowane w Intramural Sequencing Center (NISC) NIH zostaną sprawdzone przez personel laboratorium Biesecker pod kątem wariantów sekwencji zgodnych z hipotetycznym wzorcem dziedziczenia. Wszystkie warianty sekwencji uznane za istotne klinicznie zostaną zweryfikowane w laboratorium z certyfikatem CLIA, a wyniki zwrócone temu uczestnikowi. Protokół ten został zaprojektowany w sposób, który zapewni długoterminowy potencjał realizacji wielu różnych projektów klinicznych.

Typ studiów

Obserwacyjny

Zapisy (Szacowany)

2000

Kontakty i lokalizacje

Ta sekcja zawiera dane kontaktowe osób prowadzących badanie oraz informacje o tym, gdzie badanie jest przeprowadzane.

Kontakt w sprawie studiów

Kopia zapasowa kontaktu do badania

  • Nazwa: Leslie G Biesecker, M.D.
  • Numer telefonu: (301) 402-2041
  • E-mail: lesb@mail.nih.gov

Lokalizacje studiów

    • Maryland
      • Bethesda, Maryland, Stany Zjednoczone, 20892
        • Rekrutacyjny
        • National Institutes of Health Clinical Center

Kryteria uczestnictwa

Badacze szukają osób, które pasują do określonego opisu, zwanego kryteriami kwalifikacyjnymi. Niektóre przykłady tych kryteriów to ogólny stan zdrowia danej osoby lub wcześniejsze leczenie.

Kryteria kwalifikacji

Wiek uprawniający do nauki

  • Dziecko
  • Dorosły
  • Starszy dorosły

Akceptuje zdrowych ochotników

Nie

Metoda próbkowania

Próbka bez prawdopodobieństwa

Badana populacja

Pacjenci lub probanci rodzinni z genetyczną przyczyną zaburzeń, które są nieuleczalne lub trudne do zidentyfikowania za pomocą istniejącej techniki.

Opis

  • KRYTERIA PRZYJĘCIA:

Osoba dotknięta badanym zaburzeniem w wieku powyżej 4 tygodni. Nasza wstępna lista przykładowych zaburzeń została przerwana; te zaburzenia były przykładami tych, które spełniają ogólne kryteria włączenia do tego protokołu. Jak stwierdzono powyżej, osoby z zaburzeniami, które zdecydujemy się zbadać w ramach tego protokołu, będą generalnie reprezentować przypadki simplex z rzadkimi fenotypami, których etiologia molekularna jest nieznana.

W rzadkich przypadkach możemy przyjąć DNA od osób zmarłych, w tym DNA lub inne zachowane próbki biologiczne zmarłych płodów/noworodków zgodnie z Polityką 400. Próbki te mogą zapewnić nam wyjątkowe możliwości badania wariantów i objawów poważnych zaburzeń genetycznych, w których płód/noworodek jest niezdolny do życia ze względu na nasilenie objawów. W rzadkich okolicznościach, gdy planujemy pobrać próbki od niezdolnych do życia płodów/noworodków, możemy nawiązać współpracę z ciężarnymi matkami, aby rozpocząć rozmowy na temat zgody i skoordynować pobieranie próbek. Będziemy rejestrować tylko kobiety w ciąży, które dobrowolnie oddają tkankę płodową z inwazyjnych badań prenatalnych i dla których analiza trio jest odpowiednia i konieczna. Chociaż rzadko, mogą zaistnieć okoliczności, w których cele naukowe (wyjaśnienie molekularnej etiologii stanu genetycznego probanda) nie byłyby możliwe bez analizy DNA płodu/probanda i biologicznych rodziców. Warunki określone w 45CFR46.205 są spełnione dla włączenia niezdolnych do życia noworodków:

  • Funkcje życiowe noworodka nie będą sztucznie podtrzymywane;
  • Badania nie zatrzymają bicia serca ani oddechu noworodka;
  • Nie będzie dodatkowego ryzyka dla noworodka wynikającego z badań;
  • Celem badań jest rozwój ważnej wiedzy biomedycznej, której nie można zdobyć w żaden inny sposób; oraz
  • Uzyskanie świadomej zgody prawnie skutecznej odbywa się zgodnie z obowiązującymi przepisami.

Członkowie rodziny osoby dotkniętej chorobą, w przypadku gdy ten członek rodziny (często rodzic) jest potencjalnie informacyjny lub przydatny do powiązania lub innych analiz bioinformatycznych wariantów genetycznych, mogą zostać zarejestrowani. Probandy, które są niepełnoletnie lub osoby dorosłe z zaburzeniami decyzyjnymi, kwalifikują się, jeśli mają rodzica lub opiekuna prawnego, który jest upoważniony do podpisania formularza zgody w ich imieniu.

WYKLUCZENIE WŁĄCZENIE:

Probandy, które są dorosłe i mają trudności w podejmowaniu decyzji, nie kwalifikują się, jeśli nie mają opiekuna prawnego, który jest upoważniony do podpisania formularza zgody w ich imieniu.

Osoby, u których stwierdzono istotne zaburzenia afektywne lub psychiczne, które w ocenie zespołu mogą upośledzać ich zdolność rozumienia i właściwego wykorzystywania złożonych informacji medycznych i genetycznych, zostaną uznane za osoby z zaburzeniami decyzyjnymi i nie będą się kwalifikować, chyba że wyznaczą (lub, w przypadku małoletnich dzieci znajdują się pod opieką) odpowiedniego zastępczego decydenta.

Ponadto opieka nad dorosłymi probantami z upośledzeniem funkcji poznawczych musi być ustanowiona prawnie, a dowód opieki musi zostać dostarczony przed zapisaniem tej rodziny.

Prosimy o możliwość korzystania z tego protokołu w przypadku wielu zaburzeń genetycznych, bez szczegółowego określania ich a priori. Uważamy, że to podejście jest właściwe, ponieważ w przypadku prawie wszystkich dziedzicznych zaburzeń ryzyko i korzyści GSMS nie różnią się zasadniczo. Ta koncepcja została potwierdzona przez nasz obecnie zamknięty protokół 94-HG-0193, który był szeroko zakrojonym protokołem dla dziedzicznych wad wrodzonych, z których wiele nie mieści się dokładnie w określonej klasyfikacji diagnostycznej.

Jak wspomniano, możemy poprosić o pozwolenie na zachowanie niektórych informacji o potencjalnych uczestnikach, którzy w momencie zapytania mogą nie kwalifikować się do badania, ale mogą kwalifikować się w przyszłości. Ponieważ ci uczestnicy nie będą podpisywać formularza zgody, proponujemy NIE uwzględniać tych uczestników w naszych raportach o włączeniu, ale dostarczymy IRB zestawienie zatrzymanych zapisów podczas każdej ciągłej oceny.

Dokumenty zgody na ten protokół są dostępne w języku angielskim i hiszpańskim. W rzadkich przypadkach możemy zapisać uczestników, którzy mówią innymi językami, korzystając z tłumaczenia krótkiego pisemnego formularza zgody NIH.

Nie będziemy rejestrować kobiet w ciąży, z wyjątkiem przypadków opisanych w sekcji powyżej.

Plan studiów

Ta sekcja zawiera szczegółowe informacje na temat planu badania, w tym sposób zaprojektowania badania i jego pomiary.

Jak projektuje się badanie?

Szczegóły projektu

  • Modele obserwacyjne: Kohorta
  • Perspektywy czasowe: Spodziewany

Kohorty i interwencje

Grupa / Kohorta
Zaburzenia genetyczne
Pacjenci lub probanci rodzinni z genetyczną przyczyną zaburzeń, które są nieuleczalne lub trudne do zidentyfikowania za pomocą istniejącej techniki.

Co mierzy badanie?

Podstawowe miary wyniku

Miara wyniku
Opis środka
Ramy czasowe
Molekularna etiologia chorób rzadkich
Ramy czasowe: Bieżący
Zidentyfikuj genetyczną przyczynę zaburzeń, które są nieuleczalne lub trudne do zidentyfikowania za pomocą istniejących technik, na przykład zaburzenia spowodowane nowymi mutacjami o słabej zdolności reprodukcyjnej poprzez sekwencjonowanie egzomu lub genomu
Bieżący
Analizuj wyniki GSMS dla rzadkich zaburzeń, dla których przyczyny genetyczne są znane, ale nie w pełni opisane
Ramy czasowe: Bieżący
Naszym celem jest sekwencjonowanie penetrujących przypadków w celu zbadania wariacji molekularnych rzadkich zaburzeń genetycznych, lepszego przewidywania patogeniczności i identyfikacji nowych wariantów przyczynowych.
Bieżący

Współpracownicy i badacze

Tutaj znajdziesz osoby i organizacje zaangażowane w to badanie.

Śledczy

  • Główny śledczy: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Publikacje i pomocne linki

Osoba odpowiedzialna za wprowadzenie informacji o badaniu dobrowolnie udostępnia te publikacje. Mogą one dotyczyć wszystkiego, co jest związane z badaniem.

Daty zapisu na studia

Daty te śledzą postęp w przesyłaniu rekordów badań i podsumowań wyników do ClinicalTrials.gov. Zapisy badań i zgłoszone wyniki są przeglądane przez National Library of Medicine (NLM), aby upewnić się, że spełniają określone standardy kontroli jakości, zanim zostaną opublikowane na publicznej stronie internetowej.

Główne daty studiów

Rozpoczęcie studiów (Rzeczywisty)

18 lutego 2010

Daty rejestracji na studia

Pierwszy przesłany

13 marca 2010

Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości

13 marca 2010

Pierwszy wysłany (Szacowany)

16 marca 2010

Aktualizacje rekordów badań

Ostatnia wysłana aktualizacja (Szacowany)

4 marca 2024

Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości

1 marca 2024

Ostatnia weryfikacja

29 lutego 2024

Więcej informacji

Terminy związane z tym badaniem

Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)

Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?

NIE

Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze

Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA

Nie

Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .

3
Subskrybuj