- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk forsøg NCT01087320
Helgenom medicinsk sekvensering til genomopdagelse
Helgenom medicinsk sekvensering til genopdagelse
Baggrund:
- En række sjældne arvelige sygdomme rammer kun få patienter, og de genetiske årsager til disse tilstande er fortsat ukendte. Forskere studerer brugen af en ny teknologi kaldet helgenom-sekventering for at finde ud af, hvilket eller hvilke gener der forårsager disse tilstande. Det er vigtigt at forstå generne, der forårsager disse sygdomme, for at forbedre diagnosticering og behandling af berørte patienter.
Mål:
- At identificere den genetiske årsag til lidelser, der er svære at identificere med eksisterende teknikker.
- At udvikle bedste praksis for de medicinske og rådgivningsmæssige udfordringer ved helgenomsekventering.
Berettigelse:
- Personer, der har en af de sjældne lidelser, der overvejes i denne undersøgelse. Disse tilstande er generelt dem, hvor den genetiske årsag til lidelsen er ukendt. De fleste individuelle deltageres berettigelse vil blive afgjort fra sag til sag af forskerne.
- Familiemedlemmer til berørte personer, hvis dette familiemedlem (ofte en forælder) kan give genetisk information.
Design:
- Deltagere i denne undersøgelse vil have mindst én og i nogle tilfælde flere af følgende procedurer:
- En medicinsk genetik evaluering.
- Andre test, der kan omfatte røntgen, magnetisk resonansbilleddannelse (MRI) undersøgelser og konsultationer med andre læger. Ikke alle undersøgelser er nødvendige for hver person, men oplysningerne fra testene kan være nødvendige for at fortsætte med nogle af vores gensekventeringsundersøgelser.
- Kliniske fotografier for at dokumentere visse aspekter af lidelsen.
- Blod- og hudbiopsiprøver eller andre vævsprøver, som krævet af undersøgelsens læger.
- Gentest, som forskerne har besluttet. De fleste deltagere i denne undersøgelse kan dog forvente at gennemgå hele genomsekventering, som er en teknik til at studere alle en persons gener.
- Nogle deltagere kan blive bedt om at deltage i et telefoninterview og/eller en webbaseret undersøgelse.
- Deltagerne vil have valg om, hvilke slags resultater fra hele genomsekventering de ønsker at lære.
- Efter at testene er afsluttet, og resultaterne af de genetiske undersøgelser er kendt, vil deltagerne blive tilbudt et genbesøg til National Institutes of Health for at lære disse resultater. Under dette besøg vil deltagerne blive bedt om at udfylde undersøgelser og deltage i interviews relateret til deres beslutninger om at deltage i undersøgelsen og at lære individuelle genetiske testresultater.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Detaljeret beskrivelse
Vi sigter mod at bruge medicinsk sekventering i genomskala (GSMS, for at inkludere eksom og helhed
genomsekventering efter behov) for at opdage kausative molekylære læsioner for et sæt af sjældne, alvorlige fænotyper, der antages at være forårsaget af enten somatiske mutationer, germline de novo heterozygote mutationer, germline nedarvede recessive eller germline arvede dominante mutationer i aktuelt ukendte eller ukarakteriserede gener. Målet med denne forskning er tredelt: at identificere kausative sekvensvarianter for lidelser, hvis molekylære ætiologi tidligere var ukendt, at anvende denne indsigt på både de sjældne lidelser, der er undersøgt, og mere almindelige fænotyper, og at forbedre studiet af mutation på et genom-dækkende område. niveau.
Vi planlægger at rekruttere cirka tre til seks berørte individer sammen med begge forældre for hver fænotype, der undersøges. Prospektivt rekrutterede trioer vil blive bragt til NIH Clinical Center for korte kliniske evalueringer og molekylær evaluering. Hver trio vil få samtykke til GSMS med mulighed for at lære klinisk relevante resultater, det vil sige dem, der forklarer den pågældende lidelse (det vi refererer til som den primære variant) samt andre klinisk relevante fund opdaget tilfældigt som en del af GSMS. proces (det vi omtaler som sekundære varianter). Deltagerne vil blive tilbudt et genbesøg til NIH for at lære disse resultater.
Sekvensdata genereret på NIH Intramural Sequencing Center (NISC) vil blive screenet af personalet i Biesecker-laboratoriet for sekvensvarianter, der er i overensstemmelse med det hypoteserede arvemønster. Alle sekvensvarianter, der anses for klinisk relevante, vil blive valideret i et CLIA-certificeret laboratorium, og resultaterne returneres til den pågældende deltager. Denne protokol bliver designet på en måde, der vil give det langsigtede potentiale til at forfølge mange forskellige kliniske projekter.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Anslået)
Kontakter og lokationer
Studiekontakt
- Navn: Julie Sapp
- Telefonnummer: (301) 435-2832
- E-mail: sappj@mail.nih.gov
Undersøgelse Kontakt Backup
- Navn: Leslie G Biesecker, M.D.
- Telefonnummer: (301) 402-2041
- E-mail: lesb@mail.nih.gov
Studiesteder
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, Forenede Stater, 20892
- Rekruttering
- National Institutes of Health Clinical Center
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Prøveudtagningsmetode
Studiebefolkning
Beskrivelse
- INKLUSIONSKRITERIER:
En person, der er ramt af en lidelse under undersøgelse og er ældre end 4 uger. Vores første liste over eksempler på lidelser er blevet afbrudt; disse lidelser var eksempler på dem, der opfylder de generelle attributter til inklusion i denne protokol. Som nævnt ovenfor vil personer med lidelser, som vi vælger at undersøge under denne protokol, generelt repræsentere simpleks tilfælde med sjældne fænotyper, hvis molekylære ætiologi er ukendt.
I sjældne tilfælde kan vi acceptere DNA fra afdøde individer, herunder DNA eller andre gemte biologiske prøver fra afdøde fostre/nyfødte i overensstemmelse med Politik 400. Disse prøver kan give os usædvanlige muligheder for at studere varianter og manifestationer af alvorlige genetiske overvækstlidelser, hvor fosteret/det nyfødte barn er ulevedygtigt på grund af sværhedsgraden af manifestationerne. I de sjældne tilfælde, hvor vi planlægger at acceptere prøver fra ikke-levedygtige fostre/nyfødte, kan vi gå i dialog med gravide mødre for at påbegynde samtykkediskussioner og koordinere prøveindsamling. Vi vil kun tilmelde gravide kvinder, som frivilligt donerer føtalt væv fra invasiv prænatal testning, og for hvilke trioanalyse er passende og nødvendig. Selvom det er sjældent, kan der være omstændigheder, hvor de videnskabelige mål (at belyse den molekylære ætiologi af probandens genetiske tilstand) ikke ville være mulige uden at analysere fosterets/probandens og de biologiske forældres DNA. Betingelserne fastsat i 45CFR46.205 er opfyldt for inklusion af ikke-levedygtige nyfødte:
- Vitale funktioner hos den nyfødte vil ikke blive vedligeholdt kunstigt;
- Forskningen vil ikke afslutte hjerteslag eller respiration hos den nyfødte;
- Der vil ikke være nogen yderligere risiko for den nyfødte som følge af forskningen;
- Formålet med forskningen er udvikling af vigtig biomedicinsk viden, som ikke kan opnås på anden vis; og
- Det juridisk effektive informerede samtykke indhentes i overensstemmelse med gældende regler.
Familiemedlemmer til et berørt individ, hvor dette familiemedlem (ofte en forælder) er potentielt informativ eller nyttig til kobling eller andre bioinformatiske analyser af genetiske varianter, kan tilmeldes. Probands, der er mindreårige eller beslutningshæmmede voksne, er berettigede, hvis de har en forælder eller værge, der har bemyndigelse til at underskrive en samtykkeerklæring på deres vegne.
EXKLUSION INKLUSION:
Probander, der er voksne og beslutningshæmmede, er ikke berettigede, hvis de ikke har en juridisk værge, der har bemyndigelse til at underskrive en samtykkeerklæring på deres vegne.
Forsøgspersoner, der har kendte, signifikante affektive eller psykiatriske lidelser, som efter teamets vurdering kan svække deres evne til at forstå og på passende måde bruge kompleks medicinsk og genetisk information, vil blive betragtet som beslutningshæmmede og vil være udelukket, medmindre de har udpeget (eller, i tilfælde af mindreårige børn, er varetægtsfængslet af) en passende stedfortrædende beslutningstager.
Derudover skal værgemål for kognitivt svækkede voksne probander være lovligt etableret, og bevis for værgemål skal fremlægges før denne families indskrivning.
Vi anmoder om muligheden for at bruge denne protokol til flere genetiske lidelser uden specifikt at afgrænse dem på forhånd. Vi mener, at denne tilgang er passende, fordi risici og fordele ved GSMS ikke er væsentligt forskellige for næsten alle arvelige lidelser. Dette koncept blev valideret af vores nu lukkede protokol 94-HG-0193, som var en bredt baseret protokol for arvelige medfødte anomalisygdomme, hvoraf mange ikke falder pænt ind i en specifik diagnostisk klassifikation.
Som nævnt kan vi anmode om tilladelse til at opbevare nogle oplysninger om potentielle deltagere, som på tidspunktet for deres henvendelse muligvis ikke er kvalificerede til undersøgelsen, men som kan blive kvalificerede i fremtiden. Da disse deltagere ikke vil underskrive en samtykkeerklæring, foreslår vi IKKE at tælle disse deltagere med i vores inklusionstilmeldingsrapporter, men vil give IRB en oversigt over bevarede optegnelser ved hver løbende gennemgang.
Samtykkedokumenter til denne protokol er tilgængelige på engelsk og spansk. I sjældne tilfælde kan vi tilmelde deltagere, der taler andre sprog ved hjælp af NIH Short Written Consent Form Translation.
Vi vil ikke tilmelde gravide kvinder, undtagen som beskrevet i afsnittet ovenfor.
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Observationsmodeller: Kohorte
- Tidsperspektiver: Fremadrettet
Kohorter og interventioner
Gruppe / kohorte |
---|
Genetiske lidelser
Patienter eller familie probands med genetiske årsager til lidelser, der er vanskelige eller vanskelige at identificere med eksisterende teknik.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
---|---|---|
Molekylær ætiologi af sjældne sygdomme
Tidsramme: Igangværende
|
Identificer den genetiske årsag til lidelser, der er uløselige eller svære at identificere med eksisterende teknikker, for eksempel lidelser på grund af nye mutationer med dårlig reproduktiv kondition gennem exom- eller genom-sekventering
|
Igangværende
|
Analyser GSMS-resultater for sjældne lidelser, hvor genetiske årsager er kendt, men ikke fuldt beskrevet
Tidsramme: Igangværende
|
Vi sigter mod at sekvensere penetrerende tilfælde for at studere de molekylære variationer af sjældne genetiske lidelser, for bedre at forudsige patogenicitet og identificere nye årsagsvarianter.
|
Igangværende
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Publikationer og nyttige links
Generelle publikationer
- Marteau TM, Dormandy E, Michie S. A measure of informed choice. Health Expect. 2001 Jun;4(2):99-108. doi: 10.1046/j.1369-6513.2001.00140.x.
- Evans JP, Green RC. Direct to consumer genetic testing: Avoiding a culture war. Genet Med. 2009 Aug;11(8):568-9. doi: 10.1097/GIM.0b013e3181afbaed. No abstract available.
- Mardis ER. Next-generation DNA sequencing methods. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2008;9:387-402. doi: 10.1146/annurev.genom.9.081307.164359.
Hjælpsomme links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Anslået)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- 100065
- 10-HG-0065
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter
Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt
Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Medfødt anomali
-
University Hospital, GhentRekrutteringMullerian Anomaly of Uterus, Nec | Mullersk anomali af vagina | Mullersk anomali af livmoderhalsenBelgien
-
University Hospital, GhentRekrutteringMullerian Anomaly of Uterus, Nec | Mullersk anomali af vagina | Mullersk anomali af livmoderhalsenBelgien
-
Cure CMDCongenital Muscle Disease International RegistrTrukket tilbageLAMA2-MD (Merosin Deficient Congenital Muskeldystrofi, MDC1A)Forenede Stater
-
Uludag UniversityUkendtMullerian Anomaly of Uterus, NecKalkun
-
QLT Inc.AfsluttetLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Forenede Stater, Canada, Tyskland, Holland, Det Forenede Kongerige
-
MeiraGTx UK II LtdSyne Qua Non LimitedAfsluttetØjensygdomme | Nethindesygdomme | Øjensygdomme, arvelig | Leber Congenital Amaurosis (LCA)Forenede Stater, Det Forenede Kongerige
-
QLT Inc.AfsluttetLeber Congenital Amaurosis (LCA) | Retinitis Pigmentosa (RP)Forenede Stater, Canada, Danmark, Tyskland, Holland, Schweiz, Det Forenede Kongerige
-
QLT Inc.AfsluttetLCA (Leber Congenital Amaurosis) | RP (Retinitis Pigmentosa)Canada, Forenede Stater, Tyskland, Holland, Det Forenede Kongerige
-
Institut National de la Santé Et de la Recherche...RekrutteringMikroftalmi | Aniridia | Anophthalmia | Anterior Segment Dysgenesis 6, Peters Anomaly Subtype | Anterior Segment Dysgenesis 3, Rieger SubtypeFrankrig
-
Enzyvant Therapeutics GmBHNational Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID); Eunice Kennedy... og andre samarbejdspartnereGodkendt til markedsføringDiGeorges syndrom | DiGeorge Anomali | Fuldfør DiGeorge Anomaly | Komplet DiGeorge SyndromForenede Stater