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Sequenciamento médico do genoma inteiro para descoberta do genoma

1 de março de 2024 atualizado por: National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Sequenciamento médico do genoma completo para descoberta de genes

Fundo:

- Várias doenças hereditárias raras afetam apenas alguns pacientes, e as causas genéticas dessas condições permanecem desconhecidas. Os pesquisadores estão estudando o uso de uma nova tecnologia chamada sequenciamento completo do genoma para saber qual gene ou genes causam essas condições. Compreender os genes que causam essas doenças é importante para melhorar o diagnóstico e o tratamento dos pacientes afetados.

Objetivos.

  • Identificar a causa genética de distúrbios que são difíceis de identificar com as técnicas existentes.
  • Desenvolver as melhores práticas para os desafios médicos e de aconselhamento do sequenciamento completo do genoma.

Elegibilidade:

  • Indivíduos que têm um dos distúrbios raros considerados neste estudo. Essas condições são geralmente aquelas em que a causa genética do distúrbio é desconhecida. A elegibilidade da maioria dos participantes individuais será decidida caso a caso pelos pesquisadores.
  • Membros da família de indivíduos afetados, se esse membro da família (muitas vezes um dos pais) pode fornecer informações genéticas.

Projeto:

  • Os participantes deste estudo terão pelo menos um e, em alguns casos, vários dos seguintes procedimentos:
  • Uma avaliação genética médica.
  • Outros exames que podem incluir radiografias, exames de ressonância magnética (MRI) e consultas com outros médicos. Nem todos os estudos são necessários para cada pessoa, mas as informações dos testes podem ser necessárias para prosseguir com alguns de nossos estudos de sequenciamento de genes.
  • Fotografias clínicas para documentar certos aspectos da doença.
  • Amostras de sangue e biópsia de pele, ou outras amostras de tecido, conforme exigido pelos médicos do estudo.
  • Testes genéticos, conforme decisão dos pesquisadores. No entanto, a maioria dos participantes deste estudo pode esperar passar pelo sequenciamento completo do genoma, que é uma técnica para estudar todos os genes de uma pessoa.
  • Alguns participantes podem ser solicitados a participar de uma entrevista por telefone e/ou de uma pesquisa na Internet.
  • Os participantes terão escolhas sobre os tipos de resultados do sequenciamento do genoma inteiro que desejam aprender.
  • Depois que os testes forem concluídos e os resultados dos estudos genéticos forem conhecidos, os participantes receberão uma visita de retorno aos Institutos Nacionais de Saúde para conhecer esses resultados. Durante esta visita, os participantes serão solicitados a preencher pesquisas e participar de entrevistas relacionadas às suas decisões de participar do estudo e conhecer os resultados dos testes genéticos individuais.

Visão geral do estudo

Descrição detalhada

Nosso objetivo é usar sequenciamento médico em escala genômica (GSMS, para incluir exome e todo

sequenciamento do genoma conforme apropriado) para descobrir lesões moleculares causais para um conjunto de fenótipos graves e raros hipoteticamente causados ​​por mutações somáticas, mutações germinativas de novo heterozigóticas, recessivas hereditárias hereditárias ou mutações dominantes herdadas hereditárias germinativas em genes atualmente desconhecidos ou não caracterizados. O objetivo desta pesquisa é triplo: identificar variantes de sequência causais para distúrbios cuja etiologia molecular era previamente desconhecida, aplicar essa visão tanto aos distúrbios raros em estudo quanto aos fenótipos mais comuns e aprimorar o estudo da mutação em um genoma amplo nível.

Planejamos recrutar aproximadamente três a seis indivíduos afetados junto com ambos os pais para cada fenótipo em estudo. Trios recrutados prospectivamente serão levados ao NIH Clinical Center para breves avaliações clínicas e avaliação molecular. Cada trio será submetido ao GSMS com a opção de aprender resultados clinicamente relevantes, ou seja, aqueles que explicam o distúrbio em questão (o que chamamos de variante primária), bem como outros achados clinicamente relevantes descobertos incidentalmente como parte do GSMS processo (o que chamamos de variantes secundárias). Os participantes receberão uma visita de retorno ao NIH para conhecer esses resultados.

Os dados de sequência gerados no NIH Intramural Sequencing Center (NISC) serão rastreados pela equipe do laboratório Biesecker em busca de variantes de sequência que estejam em conformidade com o padrão de herança hipotético. Todas as variantes de sequência consideradas clinicamente relevantes serão validadas em um laboratório certificado pela CLIA e os resultados devolvidos ao participante. Este protocolo está sendo elaborado de forma a fornecer o potencial de longo prazo para a realização de muitos projetos clínicos diferentes.

Tipo de estudo

Observacional

Inscrição (Estimado)

2000

Contactos e Locais

Esta seção fornece os detalhes de contato para aqueles que conduzem o estudo e informações sobre onde este estudo está sendo realizado.

Contato de estudo

Estude backup de contato

  • Nome: Leslie G Biesecker, M.D.
  • Número de telefone: (301) 402-2041
  • E-mail: lesb@mail.nih.gov

Locais de estudo

    • Maryland
      • Bethesda, Maryland, Estados Unidos, 20892
        • Recrutamento
        • National Institutes of Health Clinical Center

Critérios de participação

Os pesquisadores procuram pessoas que se encaixem em uma determinada descrição, chamada de critérios de elegibilidade. Alguns exemplos desses critérios são a condição geral de saúde de uma pessoa ou tratamentos anteriores.

Critérios de elegibilidade

Idades elegíveis para estudo

  • Filho
  • Adulto
  • Adulto mais velho

Aceita Voluntários Saudáveis

Não

Método de amostragem

Amostra Não Probabilística

População do estudo

Pacientes ou probandos familiares com causa genética de distúrbios intratáveis ​​ou difíceis de identificar com a técnica existente.

Descrição

  • CRITÉRIO DE INCLUSÃO:

Um indivíduo que é afetado por um distúrbio em estudo e tem mais de 4 semanas. Nossa lista inicial de distúrbios exemplares foi descontinuada; esses distúrbios foram exemplos daqueles que atendem aos atributos gerais para inclusão neste protocolo. Conforme mencionado acima, os indivíduos com distúrbios que escolhemos para investigar sob este protocolo geralmente representam casos simples com fenótipos raros cuja etiologia molecular é desconhecida.

Em casos raros, podemos aceitar DNA de indivíduos falecidos, incluindo DNA ou outras amostras biológicas salvas de fetos/neonatos falecidos de acordo com a Política 400. Essas amostras podem nos fornecer oportunidades excepcionais para estudar variantes e manifestações de distúrbios de supercrescimento genético graves, nos quais o feto/neonato é inviável devido à gravidade das manifestações. Nas raras circunstâncias em que planejamos aceitar amostras de fetos/neonatos não viáveis, podemos nos envolver com mães grávidas para iniciar discussões de consentimento e coordenar a coleta de amostras. Só iremos inscrever mulheres grávidas que doarem voluntariamente tecido fetal de testes pré-natais invasivos e para as quais a análise trio seja apropriada e necessária. Embora raras, podem haver circunstâncias em que os objetivos científicos (para elucidar a etiologia molecular da condição genética do probando) não seriam possíveis sem a análise do DNA do feto/probando e dos pais biológicos. As condições definidas em 45CFR46.205 são atendidos para a inclusão de recém-nascidos inviáveis:

  • As funções vitais do neonato não serão mantidas artificialmente;
  • A pesquisa não interromperá os batimentos cardíacos ou a respiração do recém-nascido;
  • Não haverá risco adicional para o neonato decorrente da pesquisa;
  • O objetivo da pesquisa é o desenvolvimento de conhecimentos biomédicos importantes que não podem ser obtidos por nenhum outro meio; e
  • O consentimento informado legalmente eficaz é obtido de acordo com os regulamentos aplicáveis.

Membros da família de um indivíduo afetado onde esse membro da família (geralmente um dos pais) é potencialmente informativo ou útil para ligação ou outras análises bioinformáticas de variantes genéticas podem ser inscritos. Os probandos menores de idade ou adultos com deficiência decisória são elegíveis se tiverem um pai ou responsável legal que tenha autoridade para assinar um formulário de consentimento em seu nome.

EXCLUSÃO INCLUSÃO:

Os probandos que são adultos e com deficiência de decisão não são elegíveis se não tiverem um tutor legal que tenha autoridade para assinar um formulário de consentimento em seu nome.

Indivíduos que tenham conhecido distúrbios afetivos ou psiquiátricos significativos que, no julgamento da equipe, possam prejudicar sua capacidade de entender e usar adequadamente informações médicas e genéticas complexas serão considerados com deficiência de decisão e serão inelegíveis, a menos que tenham nomeado (ou, no caso de filhos menores, estão sob a custódia de) um substituto apropriado para tomar decisões.

Além disso, a tutela para probandos adultos com deficiência cognitiva deve ser legalmente estabelecida e a prova de tutela deve ser fornecida antes da inscrição dessa família.

Solicitamos a capacidade de usar este protocolo para múltiplos distúrbios genéticos, sem delineá-los especificamente a priori. Acreditamos que essa abordagem seja apropriada porque, para quase todos os distúrbios hereditários, os riscos e benefícios do GSMS não diferem substancialmente. Este conceito foi validado pelo nosso agora fechado protocolo 94-HG-0193, que era um protocolo de base ampla para distúrbios de anomalias congênitas hereditárias, muitos dos quais não se enquadram perfeitamente em uma classificação diagnóstica específica.

Conforme mencionado, podemos solicitar permissão para reter algumas informações sobre possíveis participantes que, no momento de sua consulta, podem não ser elegíveis para o estudo, mas que podem se tornar elegíveis no futuro. Como esses participantes não assinarão um formulário de consentimento, propomos NÃO contar esses participantes em nossos Relatórios de Inscrição de Inclusão, mas forneceremos ao IRB uma contagem dos registros retidos em cada Revisão Contínua.

Os documentos de consentimento para este protocolo estão disponíveis em inglês e espanhol. Em casos raros, podemos inscrever participantes que falam outros idiomas usando a Tradução do Formulário de Consentimento por Escrito do NIH.

Não matricularemos mulheres grávidas, exceto conforme descrito na seção acima.

Plano de estudo

Esta seção fornece detalhes do plano de estudo, incluindo como o estudo é projetado e o que o estudo está medindo.

Como o estudo é projetado?

Detalhes do projeto

  • Modelos de observação: Coorte
  • Perspectivas de Tempo: Prospectivo

Coortes e Intervenções

Grupo / Coorte
Distúrbios genéticos
Pacientes ou probandos familiares com causa genética de distúrbios intratáveis ​​ou difíceis de identificar com a técnica existente.

O que o estudo está medindo?

Medidas de resultados primários

Medida de resultado
Descrição da medida
Prazo
Etiologia molecular das doenças raras
Prazo: Em andamento
Identificar a causa genética de distúrbios que são intratáveis ​​ou difíceis de identificar com as técnicas existentes, por exemplo, distúrbios devido a novas mutações com baixa capacidade reprodutiva por meio de sequenciamento de exoma ou genoma
Em andamento
Analisar os resultados do GSMS para distúrbios raros para os quais as causas genéticas são conhecidas, mas não totalmente descritas
Prazo: Em andamento
Nosso objetivo é sequenciar casos penetrantes para estudar as variações moleculares de distúrbios genéticos raros, para melhor prever a patogenicidade e identificar novas variantes causais.
Em andamento

Colaboradores e Investigadores

É aqui que você encontrará pessoas e organizações envolvidas com este estudo.

Investigadores

  • Investigador principal: Leslie G Biesecker, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)

Publicações e links úteis

A pessoa responsável por inserir informações sobre o estudo fornece voluntariamente essas publicações. Estes podem ser sobre qualquer coisa relacionada ao estudo.

Datas de registro do estudo

Essas datas acompanham o progresso do registro do estudo e os envios de resumo dos resultados para ClinicalTrials.gov. Os registros do estudo e os resultados relatados são revisados ​​pela National Library of Medicine (NLM) para garantir que atendam aos padrões específicos de controle de qualidade antes de serem publicados no site público.

Datas Principais do Estudo

Início do estudo (Real)

18 de fevereiro de 2010

Datas de inscrição no estudo

Enviado pela primeira vez

13 de março de 2010

Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ

13 de março de 2010

Primeira postagem (Estimado)

16 de março de 2010

Atualizações de registro de estudo

Última Atualização Postada (Estimado)

4 de março de 2024

Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade

1 de março de 2024

Última verificação

29 de fevereiro de 2024

Mais Informações

Termos relacionados a este estudo

Plano para dados de participantes individuais (IPD)

Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?

NÃO

Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo

Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA

Não

Essas informações foram obtidas diretamente do site clinicaltrials.gov sem nenhuma alteração. Se você tiver alguma solicitação para alterar, remover ou atualizar os detalhes do seu estudo, entre em contato com register@clinicaltrials.gov. Assim que uma alteração for implementada em clinicaltrials.gov, ela também será atualizada automaticamente em nosso site .

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