LRP1 メチル化と結腸がん

結腸直腸がん (CRC) は、フランスおよび世界中の主要な公衆衛生問題です。 大腸がんは、フランスで発生率と死亡率が 3 番目に多いがんです。 これらのがんの大部分は、散発的に発生し、前駆病変である腺腫から発生する腺がんです。 同じ病期のすべての CRC が同じ予後を示すわけではありません。 さまざまなパラメーターが予後に影響を与える要因として特定されており、治療の調整を可能にします。 組織予後不良因子は、腫瘍または粘液性腺癌サブタイプによる血管および神経の浸潤です。 分子レベルでは、マイクロサテライト不安定性 (MSI) の存在は予後を改善しますが、BRAF 変異の存在は独立した予後不良因子です。

結腸発がんのさまざまな分子経路には、染色体不安定性経路、DNA ミスマッチ修復のエラーを引き起こすマイクロサテライト不安定性経路、および CpG アイランド メチレーター表現型 (CIMP) があります。 遺伝子プロモーターの CpG アイランドの過剰メチル化は、遺伝子発現の過剰またはほとんどの場合、遺伝子発現の不足を引き起こします。 CIMP は CRC の 15% 近くで観察され、特定の臨床的および病理学的特徴、つまり高齢の患者、女性優位、右結腸の関与、低分化腺癌または粘液性腺癌と関連しています。 分子の観点から見ると、高 CIMP 表現型は、BRAFV600E 変異の存在、RAS 変異の欠如、およびマイクロサテライト不安定性の存在と強く関連しています。 CIMP の予後値には実際に議論の余地があります。 最近のメタ分析では、CIMP 表現型が予後不良と関連していることが判明しました。 CDKN2A などの一部の遺伝子プロモーターのメチル化は予後不良と関連しています。

LRP-1 (低密度リポタンパク質受容体関連タンパク質 1) は、LDL 受容体ファミリーに属する多機能エンドサイトーシス受容体です。 それは、癌細胞の拡散に関与する多くの細胞外酵素、メタロプロテイナーゼおよびセリンプロテイナーゼのクリアランスを仲介します。 LRP-1 活性の低下または LRP-1 発現の喪失は、特定の種類の癌における癌細胞の攻撃性の増加と相関します。 LRP-1 の発現は CRC においてほとんど研究されていません。 結腸腺癌における LRP-1 タンパク質発現に関する免疫組織化学的研究は、これまでに 1 件だけ発表されています。 この研究は、腫瘍細胞が LRP-1 を発現しているが、ケースのほぼ半数では正常細胞の疝痛よりも発現が弱いことを示しています。 発現の減少に関与するメカニズムは不明です。

特にこの遺伝子のプロモーターには CpG アイランド (メチル化標的) が豊富に含まれているため、エピジェネティックなメカニズムが LRP-1 遺伝子プロモーターの過剰メチル化として関与している可能性があります。

がん患者の全生存期間に対する LRP-1 発現レベルの臨床的影響は、2 つの研究で評価されています。1 つは肝細胞がん患者に関する研究、もう 1 つは原始肺腺がん患者に関する研究です。 両方の研究において、免疫組織化学的および LRP-1 の遺伝子発現の減少は、全生存期間の減少と相関していました。 CRC における LRP-1 発現の臨床的および予後への影響、およびその特定の分子または形態学的プロファイルとの関連は、現在まで研究されていません。

この研究では、研究者らは、よく特徴付けられた一連の CRC における LRP-1 遺伝子プロモーターのメチル化パターンを研究します。

この研究の主な目的は、CRC の予後における LRP-1 プロモーター遺伝子のメチル化の役割をメチル化分析によって研究することです。

この研究の第 2 の目的は、CIMP の予後への影響を評価することです。

この研究は、CRCにおけるLRP-1遺伝子プロモーターのメチル化を調査する最初の研究となる。 この研究は、大腸がんにおける LRP-1 遺伝子プロモーターのメチル化の予後的役割と、臨床的、形態学的、または分子的パラメーターとの関連の可能性についての知識を増やすのに役立ちます。

この研究は単一施設の後ろ向きコホート研究です。

研究者はまず、病理部門のソフトウェア DIAMIC で、コンポーネント コード「結腸」、損傷コード「腺癌」、期間「2006 年から 2012 年」を含むリクエストを使用して、適格な患者全員のリストを作成します。 リンチ症候群または他の家族性癌症候群に罹患している患者は研究から除外される。 インフォームドコンセントは、選択されたすべての患者に送信されます。

患者リストが完成したら、次のようにします。

• 患者の医療記録は、社会人口統計学的データおよび臨床データ、結腸腫瘍の位置、TNM 病期、MSI、RAS および BRAF の状態、同時性転移の有無、治療の種類と期間、2016 年 1 月 6 日までの患者の追跡調査について検討されます。ポイント（転移の発生、病気の再発、患者の死亡など）。
• すべての病理学的スライドの中央レビューは、WHO 2010 分類による腺癌のサブタイプ、分化、ポリープとその種類との関連、pTNM 段階、浸潤前線と出芽、間質の種類、腫瘍壊死の存在と量などの基準に従って実行されます。

• メチル化分析:

  • パイロシーケンスによる LRP1 遺伝子プロモーターのメチル化解析。
  • MLH1、MINT1、MINT2、MINT31、および CDKN2A 遺伝子プロモーターの高解像度融解分析による CIMP ステータスの決定。

統計分析：

• データの説明: 量的変数の平均と標準偏差。カテゴリ変数の数値とパーセンテージ。
• 単変量解析（スチューデント検定およびウィルコクソン検定、Chi2 またはフィッシャーの正確確率）および多変量解析（ロジスティック回帰）による、LRP-1 遺伝子プロモーターの高度なメチル化を有する腫瘍と、LRP-1 遺伝子プロモーターのメチル化がないかまたはほとんどメチル化されていない腫瘍の比較。
• 単変量解析 (ログランク検定) および多変量解析 (Cox モデル) による、LRP1 プロモーターのメチル化や CIMP 状態など、患者の転帰に関連する因子を検索します。