LRP1 메틸화 및 결장암

대장암(CRC)은 프랑스와 전 세계적으로 주요 공중 보건 문제입니다. CRC는 프랑스에서 발병률과 사망률이 세 번째로 흔한 암입니다. 이러한 암의 대부분은 산발적으로 발생하고 전구체 병변인 선종에서 발생하는 선암종입니다. 동일한 질병 단계를 가진 모든 CRC는 동일한 예후를 갖지 않습니다. 예후에 영향을 미치는 요인으로 다양한 매개 변수가 확인되었으며 치료를 조정할 수 있습니다. 불량한 조직 예후 인자는 종양 또는 점액성 선암종 하위 유형에 의한 혈관 및 신경 침범입니다. 분자 수준에서 미세부수체 불안정성(MSI)의 존재는 예후를 개선하는 반면, BRAF 돌연변이의 존재는 독립적인 불량한 예후 인자입니다.

결장 발암의 다양한 분자 경로는 염색체 불안정성 경로, DNA 불일치 복구 오류를 유발하는 미소부수체 불안정성 경로 및 CIMP(CpG Island Methylator Phenotype)입니다. 유전자 프로모터의 CpG 섬의 과메틸화는 과잉 또는 가장 빈번하게 유전자 발현 미만으로 이어진다. CIMP는 CRC의 약 15%에서 관찰되며 특정 임상 및 병리학적 특징과 관련이 있습니다: 고령 환자, 여성 우세, 우측 결장 침범, 저분화 또는 점액성 선암종. 분자적 관점에서 높은 CIMP 표현형은 BRAFV600E 돌연변이의 존재, RAS 돌연변이의 부재 및 미소부수체 불안정성의 존재와 강하게 연관되어 있습니다. CIMP의 예후적 가치는 실제로 논란의 여지가 있습니다. 최근 메타 분석에서는 CIMP 표현형이 불량한 예후와 관련이 있음을 발견했습니다. CDKN2A와 같은 일부 유전자 프로모터의 메틸화는 불량한 예후와 관련이 있습니다.

LRP-1(저밀도 지단백 수용체 관련 단백질 1)은 LDL 수용체 패밀리에 속하는 다기능 세포내 수용체입니다. 그것은 암 세포의 확산에 관여하는 많은 세포외 효소(메탈로프로테이나제 및 세린 프로테이나제)의 제거를 매개합니다. LRP-1 활성 감소 또는 LRP-1 발현 손실은 특정 유형의 암에서 암세포의 공격성 증가와 관련이 있습니다. LRP-1의 발현은 CRC에서 거의 연구된 적이 없습니다. 결장 선암종에서 LRP-1 단백질 발현에 대한 단 하나의 면역조직화학적 연구가 지금까지 발표되었습니다. 이 연구는 종양 세포가 LRP-1을 발현하지만 거의 절반의 경우에서 정상 세포의 산통보다 약함을 보여줍니다. 표현 감소와 관련된 메커니즘은 알려져 있지 않습니다.

특히 이 유전자의 프로모터가 CpG 섬(메틸화 표적)이 풍부하기 때문에 후생유전학적 기전이 LRP-1 유전자 프로모터의 과메틸화와 관련될 수 있습니다.

암 환자의 전체 생존에 대한 LRP-1 발현 수준의 임상적 영향은 두 가지 연구에서 평가되었습니다: 하나는 간세포 암종을 앓고 있는 환자에 대한 것이고 다른 하나는 원시 폐 선암종을 앓고 있는 환자에 대한 것입니다. 두 연구 모두에서 LRP-1의 면역조직화학적 및 유전자 발현의 감소는 전반적인 생존 감소와 관련이 있었습니다. CRC에서 LRP-1 발현의 임상적 및 예후적 영향과 특정 분자 또는 형태학적 프로필과의 연관성은 현재까지 연구되지 않았습니다.

이 작업에서 연구자들은 잘 특성화된 일련의 CRC에서 LRP-1 유전자 프로모터의 메틸화 패턴을 연구할 것입니다.

이 연구의 주요 목적은 메틸화 분석을 통해 CRC의 예후에서 LRP-1 프로모터 유전자 메틸화의 역할을 연구하는 것입니다.

이 연구의 두 번째 목적은 CIMP의 예후 영향을 평가하는 것입니다.

이 연구는 CRC에서 LRP-1 유전자 프로모터 메틸화를 탐구하는 첫 번째 연구입니다. 이 연구는 CRC에서 LRP-1 유전자 프로모터 메틸화의 예후적 역할과 임상적, 형태학적 또는 분자적 매개변수와의 가능한 연관성에 대한 지식을 높이는 데 도움이 될 것입니다.

이 연구는 단일 센터 후향적 코호트 연구입니다.

조사관은 먼저 병리과의 소프트웨어 DIAMIC에서 구성 요소 코드 "결장", 손상 코드 "선암" 및 기간 "2006년과 2012년 사이"를 사용하여 모든 적격 환자 목록을 설계합니다. 린치 증후군 또는 기타 가족성 암 증후군을 앓고 있는 환자는 연구에서 제외됩니다. 정보에 입각한 동의서는 선택된 모든 환자에게 전송됩니다.

환자 목록이 완료되면:

• 환자의 의료 기록은 다음에 대해 검토됩니다: 사회인구학적 및 임상 데이터 결장 종양 위치, TNM 단계, MSI, RAS 및 BRAF 상태, 동시 전이의 존재, 치료 유형 및 기간, 2016년 1월 6일 날짜까지의 환자 추적 점(전이 발생, 질병 재발, 환자 사망, ...).
• WHO 2010 분류에 따른 선암종 하위 유형, 분화, 용종 및 그 유형과의 연관성, pTNM 병기, 침범 전두엽 및 발아, 간질 유형, 종양 괴사의 존재 및 양과 같은 기준에 대해 모든 병리학적 슬라이드의 중앙 검토가 수행될 것입니다.

• 메틸화 분석:

  • 파이로시퀀싱에 의한 LRP1 유전자 프로모터 메틸화 분석.
  • MLH1, MINT1, MINT2, MINT31 및 CDKN2A 유전자 프로모터의 고해상도 용융 분석에 의한 CIMP 상태 결정.

통계 분석:

• 데이터 설명: 양적 변수에 대한 평균 및 표준 편차; 범주형 변수의 수와 백분율.
• 단변량 분석(Student's test 및 Wilcoxon test, Chi2 또는 Fisher's exact) 및 다변량(logistic regression)에 의한 LRP-1 유전자 프로모터의 메틸화가 높은 종양과 LRP-1 유전자 프로모터의 메틸화가 없거나 적은 종양의 비교 .
• 단변량 분석(로그 순위 테스트) 및 다변량(Cox 모델)에 의한 LRP1 프로모터의 메틸화 및 CIMP 상태를 포함하여 환자 결과와 관련된 검색 요인.