臨床ケアと研究の一環としての腫瘍患者のプロファイリング (PROSPER)

PROSPER は、ゲノム結果を患者ケアと研究に統合する能力を評価するパイロット プロジェクトです。

すべての患者は参加に同意するものとします。 参加は完全に任意となります。 婦人科がん患者、またはオークランド市立病院の腫瘍内科でがん治療を受けている第I相試験の対象となる可能性がある患者には、この試験への参加を検討するよう打診される。 18 歳以上でさらなる治療（標準治療または臨床試験の一環）を受ける可能性があるすべての患者が考慮されます。

PROSPER への参加に同意した患者は、アーカイブされた腫瘍標本 (原発腫瘍および/または転移、腫瘍ブロックまたは未染色のパラフィン包埋スライド 15 ～ 20 枚 [ブロックが利用できない場合は最低 15 枚の未染色スライド]、および H&E 染色スライド 1 枚) を提供します。 分子プロファイリングは、地元の専門知識を活用してオークランド大学で実施されます。 578 個の癌遺伝子のパネルを 500x ～ 1000x カバーするハイブリダイゼーション キャプチャ DNA シーケンス手法が使用されます。 このアプローチは最近、Cristin Print 教授のオークランド大学研究室 (NimbleGen 包括的がんパネル) によって、40 以上の腫瘍組織と正常 FFPE 組織のペアの分析に成功しました。 分子プロファイリング後に残った腫瘍組織は（患者の同意を得て）保管され、追加のゲノム配列分析（例：ゲノム配列解析）の対象となる場合があります。 全ゲノム配列決定）、RNA 発現解析（Affymetrix Primeview）、タンパク質発現解析（例: ウェスタンブロット、IHC)、および/または DNA コピー数分析 (例: アレイ CGH、定量 PCR、FISH）は、利用可能なリソースに基づきます。 これらの分析の検証された結果のみが治療医師に伝えられ、患者の記録で利用できるようになります。

患者はバイオバンキングのために全血を提供することに同意する必要があります。 これは、構造的な分子変化と体細胞（腫瘍）分子の変化を区別するための正常な DNA のソースを提供します。 血液サンプルは循環腫瘍 DNA の検出にも使用され、新鮮な生検の代替として評価されます。

再発患者は、記録上、（可能な場合）さらなるプロファイリングのために腫瘍生検と血液サンプルの提供を求められます。 臨床試験では生検がますます一般的な要件となっているため、患者の意欲、処置の安全性、有用な組織の取得が成功の重要な要素となります。 高悪性度漿液性卵巣がんの患者では、研究生検が安全で実行可能であることが示されています。 このプロジェクトでは、研究者は腫瘍生検とともに ctDNA (循環腫瘍 DNA) を収集し、生検の非侵襲的代替手段としての ctDNA の役割の相関関係と検証を可能にします。 ベースライン発現プロファイルを各患者の治療結果に関連付けることは、患者の選択とモニタリングを改善することで薬物療法の最適化に役立ちます。 このプロジェクトは、乳がん、結腸直腸がん、および神経内分泌がんにおいてすでに実施されている血漿ゲノムの取り組みを基礎にして構築されます。

生検の適否および採取部位に関するすべての意思決定は、参加者のプライマリケアの責任を負う臨床医の裁量に委ねられます。 再発または薬剤耐性の発現時に追加の新鮮な腫瘍サンプルを採取することで起こり得るリスクと利点については、患者に十分に説明されます。 新鮮な腫瘍を採取するための生検を受けることへの同意は完全に任意であり、PROSPER または関連する臨床試験への患者の参加資格には影響しません。 参加者は、たとえ事前に同意していたとしても、どの段階でも生検を拒否することができます。 再発時の生検は、実現可能性と標準治療の一環として行われている他の介入に応じて、外科的または放射線学的に行われる場合があります。 これらの単独再発患者のうち少数は手術を受ける可能性があり、このシナリオではこの時点でサンプルが収集されます。 生検が放射線学的に行われる場合、少なくとも 3 つの 14 ～ 16 ゲージのコア腫瘍生検が収集されます。

PROSPER は、プロファイリング プログラムの臨床的意義と実現可能性を評価します。 利益の尺度には、臨床試験の一環として治療を受けた患者の割合が含まれます。分子異常に基づく標的療法を受けている患者の数。そして実際の分子情報の統合。 この研究は、初年度に50～100人の患者をプロファイルすることを目的としています。 オークランド病院では、毎年 150 人の卵巣がん、子宮頸がん、または子宮内膜がんの新規患者が治療されています。 さらに、毎年 100 ～ 150 人の再発患者が治療を受けています。 これにより、このプロジェクトの対象となる多数の人口が生まれます。

患者の臨床詳細を登録するための安全なPROSPERデータベースが確立されます。 調査期間中は、データの品質とセキュリティを最大限に高めるために、現地の SOP に従ってデータ管理プロセスが実行されます。

レジストリはパスワードで保護されており、登録ユーザーのみがアクセスできます。 PROSPER への登録を患者に紹介する医師は、臨床上の意思決定に使用するために、各患者の結果を識別可能な形式で表示できるようになります。 他の登録医師は、匿名化された方法で他のすべての患者の詳細を確認できるようになり、同様の患者の臨床詳細や検査結果を閲覧できるようになります。 研究の一環として患者の情報が海外に送信される場合、匿名化されたデータのみが送信されます。

医療情報を紛失、不正アクセス、使用、変更、開示、その他の悪用から保護するために適切な措置が講じられます。 組織の収集では、患者情報は匿名化され、すべての組織標本の各参加者に新しい一意の英数字の識別子が割り当てられます。 個人の特定は、マスターインデックスを参照することによってのみ可能になります。マスターインデックスは、安全な領域にあるロックされたファイル内のハードコピーと、パスワードで保護された暗号化されたデータベースに保存されます。 組織または単離された分子製品が専門的な科学研究のために海外に送られる場合、匿名化された研究 ID のみが提供されます。

臨床データは、主任研究者、プロジェクトマネージャー、地元の臨床責任者、または地元の臨床責任者の承認の下、他の医療専門家によって患者の医療記録から収集され、大学の責任の下、安全なサーバーに保管されているパスワードで保護された中央データベースに収集されます。オークランドの。 すべてのデータは、分析前にデータベースから抽出される時点で匿名化されます。

この研究から生じる出版物には直接特定可能な情報は含まれません。また、患者のケアに関与する協力者を除き、NHI 番号、生年月日、ドナーの名前が協力者と共有されることはありません。

患者のケアに携わる臨床医は、患者が同意した場合にはプロファイリング結果にアクセスできます。