Perfilado de pacientes oncológicos como parte de la atención clínica y la investigación (PROSPER)

PROSPER es un proyecto piloto que evaluará la capacidad de integrar los resultados genómicos en la investigación y la atención al paciente.

Todos los pacientes estarán autorizados a participar. La participación será completamente voluntaria. Los pacientes con cánceres ginecológicos o pacientes potencialmente elegibles para un ensayo de fase I que reciben atención oncológica médica en el Auckland City Hospital serán abordados para considerar la participación en este estudio. Se considerarán todos los pacientes mayores de 18 años y potencialmente elegibles para terapia adicional (estándar de atención o como parte de un ensayo clínico).

Los pacientes que acepten participar en PROSPER proporcionarán especímenes tumorales archivados (tumor primario y/o metástasis; bloque tumoral o 15-20 portaobjetos incluidos en parafina sin teñir [mínimo de 15 portaobjetos sin teñir si el bloque no está disponible], más un portaobjetos teñido con H&E). El perfil molecular se realizará en la Universidad de Auckland aprovechando la experiencia local. Se utilizará un enfoque de secuenciación de ADN de captura de hibridación que obtiene una cobertura de 500x-1000x de un panel de 578 genes de cáncer. Este enfoque se ha utilizado recientemente para analizar con éxito más de 40 tejidos FFPE normales y tumorales emparejados por el laboratorio de la Universidad de Auckland de la Prof. Cristin Print (panel integral de cáncer NimbleGen). El tejido tumoral que quede después del perfil molecular se almacenará en un banco (con el consentimiento de los pacientes) y puede estar sujeto a un análisis de secuenciación genómica adicional (p. secuenciación del genoma completo), análisis de expresión de ARN (Affymetrix Primeview), análisis de expresión de proteínas (p. Western blot, IHC) y/o análisis del número de copias de ADN (p. matriz CGH, PCR cuantitativa, FISH) en función de los recursos disponibles. Solo los resultados validados de estos análisis se transmitirán a los médicos tratantes y estarán disponibles en los registros de los pacientes.

Los pacientes deben aceptar proporcionar sangre completa para el biobanco. Esto proporcionará una fuente de ADN normal para diferenciar los cambios moleculares constitucionales frente a los somáticos (tumorales). Las muestras de sangre también se utilizarán para detectar ADN tumoral circulante para evaluar esto como una alternativa a las biopsias frescas.

En la documentación de la recaída, se pedirá a los pacientes (siempre que sea factible) que proporcionen una biopsia del tumor y una muestra de sangre para obtener más perfiles. A medida que las biopsias se vuelven un requisito cada vez más común en los ensayos clínicos, la voluntad de los pacientes, la seguridad del procedimiento y la adquisición de tejidos útiles son elementos críticos para el éxito. En pacientes con cáncer de ovario seroso de alto grado, se ha demostrado que las biopsias son seguras y factibles. En este proyecto, los investigadores recolectarán ctDNA (ADN tumoral circulante) junto con biopsias tumorales para permitir la correlación y validación del papel del ctDNA como una alternativa no invasiva a las biopsias. Relacionar los perfiles de expresión de referencia con los resultados del tratamiento para cada paciente ayudará a optimizar la terapia con medicamentos al mejorar la selección y el seguimiento de los pacientes. Este proyecto se basará en iniciativas de genómica de plasma que ya están en marcha en cánceres de mama, colorrectales y neuroendocrinos.

Toda toma de decisiones sobre la conveniencia de la biopsia y el sitio donde se tomará la muestra quedará a discreción del médico o de los médicos que tengan la responsabilidad de atención primaria de los participantes. Los posibles riesgos y beneficios de obtener muestras de tumor frescas adicionales en el momento de la recaída o la aparición de resistencia a los medicamentos se le explicarán detalladamente al paciente. El consentimiento para someterse a una biopsia para obtener un tumor fresco será completamente voluntario y no afectará la elegibilidad del paciente para participar en PROSPER o en un ensayo clínico relacionado. Los participantes podrán rechazar biopsias en cualquier etapa, incluso si han dado su consentimiento previamente. Las biopsias en caso de recaída pueden tomarse quirúrgica o radiológicamente según la factibilidad y qué otras intervenciones se están realizando como parte de la atención estándar. Una pequeña proporción de estos pacientes con recidiva aislada pueden ser intervenidos quirúrgicamente y en este escenario se recogerán muestras en este momento. Si las biopsias se van a realizar radiológicamente, se recolectarán al menos tres biopsias de tumor central de calibre 14-16.

PROSPER evaluará la importancia clínica y la viabilidad de un programa de elaboración de perfiles. Las medidas de beneficio incluirán el porcentaje de pacientes tratados como parte de un ensayo clínico; número de pacientes que reciben terapia dirigida basada en aberraciones moleculares; e integración de la información molecular en la práctica. El estudio tiene como objetivo perfilar 50-100 pacientes en el primer año. En el Hospital de Auckland, se tratan anualmente 150 nuevos pacientes con cáncer de ovario, cervical o endometrial. Además, cada año se tratan entre 100 y 150 pacientes con enfermedad recidivante. Esto crea una gran población que será elegible para este proyecto.

Se establecerá una base de datos PROSPER segura para registrar los detalles clínicos de los pacientes. A lo largo de la duración del estudio, los procesos de gestión de datos se seguirán de acuerdo con los SOP locales, en un esfuerzo por maximizar la calidad y seguridad de los datos.

El registro estará protegido por contraseña y será accesible solo para usuarios registrados. Los médicos que deriven pacientes para la inscripción en PROSPER podrán ver los resultados de cada uno de sus pacientes en un formato identificable para su uso en la toma de decisiones clínicas. Otros médicos registrados podrán ver todos los demás detalles de los pacientes sin identificación, lo que les permitirá ver los detalles clínicos y los resultados de los análisis de pacientes similares. Si la información de los pacientes se envía al extranjero como parte del estudio, solo se enviarán datos no identificados.

Se tomarán las medidas adecuadas para proteger la información de salud contra pérdida, acceso no autorizado, uso, modificación o divulgación u otro uso indebido. Para la recolección de tejido, se anulará la identificación de la información del paciente y se asignará un nuevo identificador alfanumérico único a cada participante para todas las muestras de tejido. La identificación de las personas solo será posible por referencia a un índice maestro, que se mantendrá en copia impresa en un archivo bajo llave en un área segura, y en una base de datos encriptada protegida con contraseña. Si se envían tejidos o productos moleculares aislados al extranjero para estudios científicos especializados, solo se proporcionará la identificación anonimizada del estudio.

Los datos clínicos serán recopilados por el investigador principal, el gerente del proyecto, el líder clínico local u otro profesional de la salud con la aprobación del líder clínico local, de los registros médicos de los pacientes a una base de datos central protegida por contraseña alojada en un servidor seguro bajo la responsabilidad de la Universidad. de Auckland. Todos los datos serán desidentificados en el punto de extracción de la base de datos antes de cualquier análisis.

No se incluirá información directamente identificable en las publicaciones que surjan de este estudio, ni se compartirán los números de NHI, las fechas de nacimiento o los nombres de los donantes con los colaboradores, con la excepción de los colaboradores involucrados en el cuidado del paciente.

Los médicos involucrados en la atención del paciente tendrán acceso a los resultados del perfil si los pacientes han dado su consentimiento para ello.