임상 치료 및 연구의 일환으로 종양학 환자의 프로파일링 (PROSPER)

PROSPER는 게놈 결과를 환자 치료 및 연구에 통합하는 능력을 평가하는 파일럿 프로젝트입니다.

모든 환자는 참여에 동의합니다. 참여는 전적으로 자발적입니다. 부인과 암 환자 또는 오클랜드 시 병원에서 의료 종양학 하에 암 치료를 받고 있는 1상 시험에 잠재적으로 자격이 있는 환자는 이 연구 참여를 고려하기 위해 접근할 것입니다. 18세 이상이고 잠재적으로 추가 치료(치료 표준 또는 임상 시험의 일부로)를 받을 자격이 있는 모든 환자가 고려됩니다.

PROSPER에 참여하는 데 동의하는 환자는 보관된 종양 표본(원발 종양 및/또는 전이, 종양 블록 또는 15-20개의 염색되지 않은 파라핀 포매 슬라이드[블록을 사용할 수 없는 경우 최소 15개의 염색되지 않은 슬라이드] 및 H&E 염색된 슬라이드 1개)을 제공합니다. 분자 프로파일링은 오클랜드 대학에서 지역 전문 지식을 활용하여 수행됩니다. 578개 암 유전자 패널의 500x-1000x 커버리지를 얻는 혼성화 캡처 DNA 시퀀싱 접근법이 사용될 것입니다. 이 접근 방식은 최근 Cristin Print 교수의 오클랜드 대학 연구실(NimbleGen 종합 암 패널)에서 40쌍 이상의 종양 및 정상 FFPE 조직을 성공적으로 분석하는 데 사용되었습니다. 분자 프로파일링 후 남아 있는 종양 조직은 은행에 저장되고(환자의 동의 하에) 추가 게놈 시퀀싱 분석(예: 전체 게놈 시퀀싱), RNA 발현 분석(Affymetrix Primeview), 단백질 발현 분석(예: 웨스턴 블롯, IHC) 및/또는 DNA 카피 수 분석(예: 배열 CGH, 정량적 PCR, FISH) 사용 가능한 리소스를 기반으로 합니다. 이러한 분석의 검증된 결과만 치료 의사에게 전달되고 환자의 기록에서 사용할 수 있습니다.

환자는 바이오뱅킹을 위해 전혈을 제공하는 데 동의해야 합니다. 이는 체질적(종양) 분자적 변화와 체질적 변화를 구별하기 위한 정상적인 DNA의 출처를 제공할 것입니다. 혈액 샘플은 또한 순환하는 종양 DNA를 검출하는 데 사용되어 새로운 생검에 대한 대안으로 이를 평가합니다.

재발 문서에서 환자는 추가 프로파일링을 위해 종양 생검 및 혈액 샘플을 제공하도록 요청받을 것입니다(가능한 경우). 생검이 임상 시험에서 점점 더 일반적인 요구 사항이 됨에 따라 환자의 의지, 절차상의 안전성 및 유용한 조직 획득이 성공의 중요한 요소입니다. 높은 등급의 장액성 난소암 환자에서 연구 생검은 안전하고 실행 가능한 것으로 나타났습니다. 이 프로젝트에서 연구자들은 종양 생검과 함께 ctDNA(순환 종양 DNA)를 수집하여 생검에 대한 비침습적 대안으로서 ctDNA의 역할에 대한 상관 관계 및 검증을 허용합니다. 기준선 발현 프로필을 각 환자의 치료 결과와 연결하면 환자 선택 및 모니터링을 개선하여 약물 요법을 최적화하는 데 도움이 됩니다. 이 프로젝트는 유방암, 결장직장암 및 신경내분비암에서 이미 진행 중인 혈장 게놈 이니셔티브를 기반으로 구축될 것입니다.

생검 및 샘플링할 부위의 타당성에 대한 모든 결정은 참가자에 대한 일차 진료 책임이 있는 임상의의 재량에 따릅니다. 재발 또는 약물 내성 출현 시 추가로 신선한 종양 샘플을 얻는 것의 가능한 위험 및 이점을 환자에게 충분히 설명할 것입니다. 새로운 종양을 얻기 위해 생검을 받는 것에 대한 동의는 전적으로 자발적이며 PROSPER에 참여하거나 관련 임상 시험에 참여하는 환자의 자격에 영향을 미치지 않습니다. 참가자는 이전에 동의한 경우에도 모든 단계에서 생검을 거부할 수 있습니다. 재발 시 생검은 타당성 및 표준 치료의 일부로 수행되는 다른 개입에 따라 외과적으로 또는 방사선학적으로 수행될 수 있습니다. 고립 재발이 있는 이들 환자 중 작은 비율이 수술을 받을 수 있으며 이 시나리오에서는 이 시점에서 샘플을 수집합니다. 생검을 방사선학적으로 수행해야 하는 경우 최소 3개의 14-16 게이지 코어 종양 생검을 수집합니다.

PROSPER는 프로파일링 프로그램의 임상적 중요성과 타당성을 평가할 것입니다. 혜택 측정에는 임상 시험의 일부로 치료받은 환자의 비율이 포함됩니다. 분자 이상에 기초한 표적 치료를 받는 환자 수; 실제로 분자 정보의 통합. 이 연구는 첫해에 50-100명의 환자를 프로파일링하는 것을 목표로 합니다. 오클랜드 병원에서는 매년 난소암, 자궁경부암 또는 자궁내막암 환자 150명이 치료를 받고 있습니다. 또한 매년 100-150명의 재발성 질환 환자가 치료를 받습니다. 이렇게 하면 이 프로젝트에 적합한 많은 인구가 생성됩니다.

환자의 임상 세부 정보를 등록하기 위한 보안 PROSPER 데이터베이스가 구축됩니다. 연구 기간 동안 데이터 품질과 보안을 극대화하기 위해 현지 SOP에 따라 데이터 관리 프로세스를 따를 것입니다.

레지스트리는 비밀번호로 보호되며 등록된 사용자만 액세스할 수 있습니다. PROSPER에 등록하기 위해 환자를 추천하는 의사는 임상 의사 결정에 사용할 식별 가능한 형식으로 각 환자의 결과를 볼 수 있습니다. 다른 등록된 의사는 비식별화된 방식으로 다른 모든 환자 세부 정보를 볼 수 있으므로 유사한 환자의 임상 세부 정보 및 분석 결과를 볼 수 있습니다. 환자의 정보가 연구의 일환으로 해외로 전송되는 경우 비식별 데이터만 전송됩니다.

손실, 무단 액세스, 사용, 수정 또는 공개 또는 기타 오용으로부터 건강 정보를 보호하기 위해 적절한 조치가 취해질 것입니다. 조직 수집을 위해 환자 정보는 비식별화되고 모든 조직 표본에 대해 각 참여자에게 새로운 고유 영숫자 식별자가 할당됩니다. 개인 식별은 보안 영역의 잠긴 파일에 있는 하드카피와 암호로 보호된 암호화된 데이터베이스에 보관되는 마스터 인덱스를 참조해야만 가능합니다. 전문 과학 연구를 위해 조직 또는 분리된 분자 제품을 해외로 보내는 경우 익명의 연구 ID만 제공됩니다.

임상 데이터는 지역 임상 책임자의 승인에 따라 주 조사자, 프로젝트 관리자, 지역 임상 책임자 또는 기타 의료 전문가가 환자의 의료 기록에서 대학의 책임 하에 있는 보안 서버에 보관된 암호로 보호된 중앙 데이터베이스로 수집됩니다. 오클랜드. 모든 데이터는 분석 전에 데이터베이스에서 추출된 시점에서 익명화됩니다.

이 연구에서 발생하는 간행물에는 직접 식별 가능한 정보가 포함되지 않으며 NHI 번호, 생년월일 또는 기증자의 이름이 환자 치료에 관련된 협력자를 제외하고 협력자와 공유되지 않습니다.

환자 치료와 관련된 임상의는 환자가 동의한 경우 프로파일링 결과에 액세스할 수 있습니다.