出生前全エクソームシーケンスの臨床的有用性 (PWES)

次世代シーケンシング (NGS) は、臨床遺伝子検査のパラダイムを変えています。 高度に焦点を絞った単一遺伝子検査とは異なり、NGS では遺伝子パネル、エクソーム、および全ゲノムを調べることができます。 幅広い分子検査が利用できるようになったため、医師は、遺伝的状態が疑われる患者に最適な診断ツールを選択するという難題に直面しています。 単一遺伝子検査は、多くの場合、特徴的な臨床的特徴と遺伝子座の不均一性が最小限の状態に最も適しています。 NGS ベースの遺伝子パネル検査は、染色体マイクロアレイ分析 (CMA) およびその他の補助的な方法で補完することができ、十分に文書化されているが遺伝的に異質な疾患に対する包括的で実行可能なアプローチを提供します。 全エクソーム配列決定 (WES) と全ゲノム配列決定 (WGS) には、ヒトゲノムのほとんどの遺伝子を並行して調べることができるという利点があります。 WES は、診断率が高く、診断までの時間が短く、費用対効果が高いため、以前に使用されていた方法よりも好ましいと考える人もいます。

エクソームを調査する能力は、新しい機会と新しい課題の両方を開きます。 たとえば、遺伝パターンが不明な未診断の症例に WES を適用する場合、既知の遺伝子のすべてのコード領域を分析する必要があります。 バリアントの解釈機能と臨床的妥当性に関する現在の制限により、スタンドアロンまたは第一選択の診断テストとしての WES の臨床的有用性について疑問が生じます。 追加の課題には、適切かつ堅牢なインフォームド コンセントによる検査前および検査後のカウンセリング、バイオインフォマティクス分析のセットアップと検証、バリアントの解釈と分類、提示された適応症とは無関係の二次的所見の発見と報告に関するポリシーとプロトコルの必要性、要件が含まれます。 WES 結果の検証、品質管理基準への準拠の保証、データの保存とアクセス可能性、および払い戻しの問題について。

現在の臨床基準では、出生前超音波で胎児の構造異常が検出された場合に、出生前設定で染色体マイクロアレイ (CMA) を提供することを推奨しています。 これらのケースでは、正常な核型を持つ胎児の 6.0 ～ 9.1% で、臨床的に関連するコピー数バリアントが報告されています。 ただし、出生前 CMA のインフォームド コンセント プロセスは困難です。特に超音波の異常がある場合、親は困難なニュースを吸収し、かなりのストレスにさらされているためです。 女性は、CMA の陽性結果に「盲目的」である、またはこれらの結果が「有毒な情報」であると感じていると報告しています。 それにもかかわらず、その同じ研究で、超音波の異常のためにCMAに紹介された女性は、異常な結果をすでに予想していたため、否定的な反応の頻度が低いと報告しました.

少数派集団の出生前臨床ケアに WES を導入すると、支払いの範囲、アクセス、およびケアの基準に関する追加の問題と考慮事項が生じます。 テストとその結果の複雑さを超えて、臨床医と医療システムは、次のような多くの考慮事項に対処する必要があります。言語と文化の違い、および遺伝カウンセリングと臨床医と患者の関係に対するそれらの影響。フォローアップ検査と臨床ケアにアクセスする能力;適切な治療とサービスにアクセスする能力;特に出生前の状況、地方、州、および国の中絶法と妊娠中絶に関する意思決定において。 これらの問題やその他の問題は、WES に関する患者の意思決定だけでなく、患者のフォローアップ、カウンセリング、およびサポートに対する検査後のニーズにも影響します。 NGS の臨床的有用性を体系的に評価することの重要性は、WES がどの臨床およびヘルスケアのコンテキストで役立つかを判断し、これらの考慮事項に関する研究を開始するために重要です。

研究者は、診断されていない出生前の症例におけるさまざまな健康関連および生殖転帰の評価を含む、WES の臨床的有用性を調べることを目指しています。