산전 전체 엑솜 시퀀싱의 임상적 유용성 (PWES)

차세대 시퀀싱(NGS)은 임상 유전자 검사의 패러다임을 바꾸고 있습니다. 고도로 집중된 단일 유전자 검사와 달리 NGS는 유전자 패널, 엑솜 및 전체 게놈을 검사할 수 있습니다. 광범위한 분자 검사가 가능해짐에 따라 주치의는 유전 질환이 의심되는 환자에게 가장 적합한 진단 도구를 선택해야 하는 난제에 직면해 있습니다. 단일 유전자 검사는 종종 독특한 임상적 특징과 최소한의 유전자좌 이질성을 가진 조건에 가장 적합합니다. 염색체 마이크로어레이 분석(CMA) 및 기타 보조 방법으로 보완할 수 있는 NGS 기반 유전자 패널 검사는 잘 문서화되었지만 유 전적으로 이질적인 장애에 대한 포괄적이고 실행 가능한 접근 방식을 제공합니다. 전체 엑솜 시퀀싱(WES) 및 전체 게놈 시퀀싱(WGS)은 인간 게놈에서 대부분의 유전자에 대한 병렬 조사를 가능하게 하는 이점이 있습니다. 어떤 사람들에게는 WES가 더 높은 진단 수율, 더 짧은 진단 시간 및 개선된 비용 효율성으로 인해 이전에 사용된 방법보다 선호됩니다.

엑솜을 조사하는 능력은 새로운 기회와 새로운 도전 모두를 열어줍니다. 예를 들어, 유전 패턴이 불분명한 진단되지 않은 사례에 WES를 적용할 때 알려진 유전자의 모든 코딩 영역을 분석해야 합니다. 변형 해석 능력과 임상적 타당성에 대한 현재의 제한은 WES가 독립 실행형 또는 1차 선택 진단 테스트로서 임상적 유용성에 대한 의문을 제기합니다. 추가 과제에는 적절하고 강력한 정보에 입각한 동의, 생물 정보학 분석 설정 및 검증, 변형 해석 및 분류, 제시 적응증과 관련 없는 이차 결과의 발견 및 보고에 관한 정책 및 프로토콜의 필요성, 요구 사항을 포함하는 사전 및 사후 테스트 상담이 포함됩니다. WES 결과 검증, 품질 관리 표준 준수 보장, 데이터 저장 및 접근성, 환급 문제.

현재 임상 표준은 태아의 구조적 이상이 산전 초음파를 통해 감지되는 경우 산전 설정에서 염색체 마이크로어레이(CMA)를 제공할 것을 권장합니다. 이 경우 임상적으로 관련된 복제 수 변이가 정상적인 핵형을 가진 태아의 6.0-9.1%에서 보고되었습니다. 그러나 산전 CMA에 대한 정보에 입각한 동의 절차는 까다롭습니다. 특히 초음파 이상이 있는 경우 부모가 어려운 소식을 받아들이고 상당한 스트레스를 받고 있기 때문입니다. 여성들은 긍정적인 CMA 결과에 "눈이 멀게" 되거나 이러한 결과가 특히 불확실한 유전 정보나 해석할 수 없는 변이의 경우에 그들이 가지지 않았으면 하는 "독성 정보" 정보라고 느꼈다고 보고했습니다. 그럼에도 불구하고 동일한 연구에서 초음파 이상으로 인해 CMA를 의뢰받은 여성은 이미 비정상적인 결과를 예상했기 때문에 부정적인 반응이 덜 자주 보고되었습니다.

WES를 소외된 인구의 산전 임상 치료에 도입하면 지불 범위, 접근성 및 치료 기준에 대한 추가 문제와 고려 사항이 제기됩니다. 테스트와 그 결과의 순전한 복잡성을 넘어 임상의와 의료 시스템은 다음을 포함한 수많은 고려 사항을 해결해야 합니다. 언어 및 문화 차이와 유전 상담 및 임상의-환자 관계에 미치는 영향; 후속 테스트 및 임상 치료에 접근할 수 있는 능력; 적절한 치료 및 서비스를 이용할 수 있는 능력; 특히 산전 환경, 지역, 주 및 국가 낙태법 및 임신 중절에 대한 의사 결정에서. 이러한 문제 및 기타 문제는 WES에 대한 환자의 의사 결정뿐만 아니라 환자 후속 조치, 상담 및 지원에 대한 검사 후 요구 사항에도 영향을 미칩니다. NGS의 임상적 유용성을 체계적으로 평가하는 것의 중요성은 WES가 어떤 임상 및 의료 상황에서 유용할지 결정하고 이러한 고려 사항에 대한 연구를 시작하는 데 매우 중요합니다.

조사자는 진단되지 않은 산전 사례에서 다양한 건강 관련 및 생식 결과 평가를 포함하여 WES의 임상적 유용성을 조사하는 것을 목표로 합니다.