ピリミジンおよびプリン代謝障害の臨床、ゲノム、薬理学、実験室および食事の決定要因に関する前向き研究
研究の説明:
この研究では、新規または既知だが特徴付けが不完全なピリミジンおよびプリン代謝障害(DPPM)の自然史とメカニズムを調査します。 適格な参加者は、体液中のプリン、ピリミジンおよび関連化合物のレベルにおける生化学的異常、酵素の異常な活性を特定すること、および/またはプリンおよびピリミジンの代謝に関連する遺伝子の病的変異を特定することによって確認されます。 遺伝子およびゲノム分析のために参加者の DNA を収集し、生化学分析のために体液を収集し、酵素分析のために血液および組織サンプルを収集し、マイクロバイオーム分析のために胃腸サンプルを収集します。 一部の参加者は皮膚生検を受ける場合があります。 研究対象者には、NIH臨床研究センターで標準治療に準拠した医学、検査、画像研究が提供されます。 収集されたデータは、自然史の理解を改善し、統計的予測モデルを開発し、新規バイオマーカーを特定および検証するために分析されます [Shchelochkov OA et al、2021]。
目的:
主な目的: 新規で特性が十分に解明されていない DPPM の特徴を説明すること。
二次目的: DPPM の影響を受ける被験者のさまざまな転帰に関連するゲノム、臨床、薬理学、実験室、食事の要因を特定すること。
エンドポイント:
主要評価項目: DPPM のゲノム変異、検査パラメータ、画像所見、マイクロバイオーム変数、栄養歴および投薬歴を特定します。
副次評価項目: さまざまな臨床転帰に関連する疾患パラメーター (入院の頻度、生存、生活の質、機能など) を特定します。
調査の概要
状態
条件
- 代謝性疾患
- プリン-ピリミジン代謝
- AICDA、OMIM *605257、Hyper-IgM による免疫不全、タイプ 2; HIGM2
- UNG、OMIM *191525、ハイパー IgM 症候群 5
- NT5C3A、OMIM *606224、貧血、溶血性、UMPH1 欠損による
- UMPS、OMIM *613891、口腔酸尿症
- DHODH、OMIM *126064、ミラー症候群(軸後顔面骨形成不全症)
- DPYD、OMIM *274270、ジヒドロピリミジンデヒドロゲナーゼ欠損症
- DPYS、OMIM *613326、ジヒドロピリミジナーゼ欠損症
- UPB1、OMIM *606673、ベータウレイドプロピオナーゼ欠損症
- CAD、*1140120、発達性およびてんかん性脳症
- ADA2、OMIM *607575、スネドン症候群;ヴァイス
- PNP、OMIM *164050、ヌクレオシドホスホリラーゼ欠損症
- ADSL、OMIM *608222、アデニルコハク酸リアーゼ欠損症
- ITPA、OMIM *147520、イノシントリホスファターゼ欠損症。発達性およびてんかん性脳症 35
- AMPD2、OMIM *102771、痙性対麻痺 63;橋小脳低形成症
- PRPS1 SA、OMIM *311850 痛風、PRPS 関連のホスホリボシルピロリン酸シンテターゼの超活性
- PRPS1 Def、OMIM *311850、芸術症候群。シャルコー・マリー・トゥース病
- SLC22A12、OMIM *607096 低酸血症
- SLC2A9、OMIM *606142 低酸血症
- XDH、OMIM *607633、キサンチン尿症 1 型
- HPRT1、OMIM *308000 レシュ・ナイハン病
- APRT、OMIM *102600、アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ欠損症
- IMPDH1、OMIM *146690、網膜色素変性症 10 型、レーベル先天性黒内障 11 型
- TPMT、OMIM *187680、トイプリン、代謝不良
- AMPD1、OMIM *102770、ミオアデニル酸デアミナーゼ欠損症によるミオパシー
- AK1、OMIM *103000、アデニル酸キナーゼ欠損症
- AMPD3、OMIM*102772、AMP デアミナーゼ欠損症
詳細な説明
研究の説明:
この研究では、新規または既知だが特徴付けが不完全なピリミジンおよびプリン代謝障害(DPPM)の自然史とメカニズムを調査します。 適格な参加者は、体液中のプリン、ピリミジンおよび関連化合物のレベルにおける生化学的異常、酵素の異常な活性を特定すること、および/またはプリンおよびピリミジンの代謝に関連する遺伝子の病的変異を特定することによって確認されます。 遺伝子およびゲノム分析のために参加者の DNA を収集し、生化学分析のために体液を収集し、酵素分析のために血液および組織サンプルを収集し、マイクロバイオーム分析のために胃腸サンプルを収集します。 一部の参加者は皮膚生検を受ける場合があります。 研究対象者には、NIH臨床研究センターで標準治療に準拠した医学、検査、画像研究が提供されます。 収集されたデータは、自然史の理解を改善し、統計的予測モデルを開発し、新規バイオマーカーを特定および検証するために分析されます [Shchelochkov OA et al、2021]。
目的:
主な目的: 新規で特性が十分に解明されていない DPPM の特徴を説明すること。
二次目的: DPPM の影響を受ける被験者のさまざまな転帰に関連するゲノム、臨床、薬理学、実験室、食事の要因を特定すること。
エンドポイント:
主要評価項目: DPPM のゲノム変異、検査パラメータ、画像所見、マイクロバイオーム変数、栄養歴および投薬歴を特定します。
副次評価項目: さまざまな臨床転帰に関連する疾患パラメーター (入院の頻度、生存、生活の質、機能など) を特定します。
研究の種類
入学 (推定)
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前:Oleg A Shchelochkov, M.D.
- 電話番号:(301) 435-2944
- メール:PurineandPyrimidine@mail.nih.gov
研究場所
-
-
Maryland
-
Bethesda、Maryland、アメリカ、20892
- 募集
- National Institutes of Health Clinical Center
-
コンタクト:
- Shannon Haines
- 電話番号:240-987-8298
- メール:shannon.haines@nih.gov
-
コンタクト:
- NIH Clinical Center Office of Patient Recruitment (OPR)
- 電話番号:TTY dial 711 (800) 411-1222
- メール:ccopr@nih.gov
-
-
参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
サンプリング方法
調査対象母集団
説明
- 包含基準:
この研究には 3 つの集団が含まれます: 既知の DPPM を持つ被験者、研究被験者の家族、および健康な対照。
既知の DPPM を持つ被験者としてこの研究に参加する資格を得るには、個人は以下の基準をすべて満たさなければなりません。
少なくとも生後1か月。
- 圧倒的な臨床的、検査的、生化学的、および/またはゲノム的証拠に基づいてDPPMと一致する病歴;
- プリンおよびピリミジン代謝障害を疑うために使用できる臨床所見には、先天奇形の存在、神経学的、行動学的、免疫学的、リウマチ学的、血液学的、腎臓への関与が含まれますが、これらに限定されません。痛風;家族の1人以上で横紋筋融解症が再発する。
- 臨床検査所見には、CPK の上昇(再発性横紋筋融解症)が含まれる場合がありますが、これに限定されません。好中球減少症、リンパ球減少症、貧血、血小板減少症;そして免疫不全。
- 生化学的証拠には、血液および尿中尿酸塩(プリン分解の最終生成物)における持続的な臨床検査異常が含まれる場合がありますが、これらに限定されません。血液および尿中のベータアラニン(ピリミジン分解の最終生成物)。血漿アミノ酸プロファイルに関する特徴的な所見(血漿アスパラギン酸およびグリシンの上昇)。尿有機酸検査でオロト酸の上昇。尿中に尿酸塩の結晶が存在する。プリンおよびピリミジンパネル上の異常所見(例: メイヨー、PUPYP、PUPYU の血漿および尿のプリンとピリミジン生化学パネル)。
- ゲノム証拠には、プリンとピリミジンの新規合成、分解、回収の経路に関連していることが知られている、またはおそらく関連している遺伝子における病原性変異体およびおそらく病原性変異体の存在が含まれる可能性があります。 当該遺伝子に重要性が不明な変異を有する参加者は、DPPM と一致する臨床的、実験的、生化学的証拠がある場合、プロトコールへの参加を勧誘される場合があります。
- 代謝または遺伝の主治医、または主治医がいる。そして
- 被験者、親(子供の場合)、または法定代理人(LAR)の理解力、および書面によるインフォームドコンセント文書に署名する意欲。
既知の DPPM 患者の罹患していない家族の一員としてこの研究に参加する資格を得るには、個人は以下の基準をすべて満たさなければなりません。
- 少なくとも生後1か月。
- 既知のDPPMの研究に登録されている、または登録されようとしている個人との血縁または結婚による関係。
- 研究チームの専門家の意見では、その個人から採取したサンプルの分析により、罹患した親族の考えられる状態の遺伝的または機能的分析が前進する可能性がある。そして
- 被験者、親(子供の場合)、または LAR の理解能力、および書面によるインフォームドコンセント文書に署名する意欲。
- 同意/同意の手順、病歴および家族歴の検討、および身体検査の際に、家族の一員に DPPM の症状があるという臨床的疑いが生じた場合、臨床状態を明確にするために追加の検討および/または研究が推奨される場合があります。
- この研究に登録するには、参加者が NIH の外に定期的な臨床治療チームを持っている必要があります。
血縁関係のない健康なボランティアとしてこの研究に参加する資格を得るには、個人は以下の基準をすべて満たさなければなりません。
- DPPM の個人歴や家族歴はない。
- 少なくとも生後1か月。
- DPPM の症状はありません。
- 研究チームの専門家の意見では、その個人からのサンプルが研究中の DPPM の機能分析を進める可能性がある。
- そして、被験者、親(子供の場合)、または LAR の理解能力と、書面によるインフォームドコンセント文書に署名する意欲。
- この研究に登録するには、参加者が NIH の外に定期的な臨床治療チームを持っている必要があります。
除外基準:
以下の除外基準を満たす個人は研究の対象となりません。
- DPPM の影響を受けていないが、保護者/LAR なしではインフォームド・コンセントを提供できないなど、他の原因により知的障害がある無関係のボランティアは、この研究には登録されません。 DPPM患者およびDPPM患者の家族は、適切なインフォームド・コンセントが得られた場合(必要に応じて親/保護者/LAR/生命倫理審査の助けを借りて)、研究に参加することができます。
- 研究者の意見では、併発または慢性の症状が研究の解釈を妨げる可能性があります(例: 骨髄抑制を呈する DPPM 患者の骨髄抑制を引き起こす進行中のがん治療)。
- 罹患していない家族または血縁関係のない健康なボランティアとしての妊娠中の参加者は、妊娠中はプロトコルに参加できません。
- NIH 以外に日常的な臨床治療チームを持たない個人は、この研究に登録できません。 登録前に参加者に臨床ケアチームの名前を尋ねます。
研究計画
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
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DPPMが既知または疑われている被験者の家族
1.
少なくとも生後1か月;2.
既知のDPPMまたは疑いのあるDPPMとの研究に登録された、またはこれから登録される個人との血縁または結婚による関係、3.
研究チームの専門家の意見では、その個人から採取したサンプルの分析により、罹患した親族の考えられる状態の遺伝的または機能的分析が前進する可能性が高い。そして4.
被験者、親(子供の場合)、または LAR の理解能力、および書面によるインフォームドコンセント文書に署名する意欲。5.
同意/承認手順中に、家族が診断された DPPM の症状を持っているという臨床的疑いが生じた場合、家族を罹患していない参加者として登録する前に、臨床状態を明確にするために追加のレビューおよび/または研究が要求される場合があります。
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|
健康ボランティア
1.
DPPM の個人歴や家族歴がない、2.
少なくとも生後1か月、3.
DPPM の症状がない;4.
研究チームの専門家の意見では、その個人からのサンプルが研究中の DPPM の機能分析を前進させる可能性がある。 5.
そして、被験者、親(子供の場合)、または LAR の理解能力、および書面によるインフォームドコンセント文書に署名する意欲。
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DPPMが既知、疑わしい、または特徴付けられていない被験者
1. 性別に関係なく、生後1か月以上、2.
研究チームの専門家の意見では、DPPMと一致する病歴。 3. 代謝または遺伝の主治医、または主治医がいる。 4. 対象者、親(子供の場合)、または法定代理人(LAR)の理解力、および書面によるインフォームドコンセント文書に署名する意欲。
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この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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TP は、特性が十分に解明されていない新規 DPPM の特徴を説明します。
時間枠:不定
|
DPPM は、家族間および家族内で顕著な変動性を示します。
私たちは、臨床転帰の違いは、ゲノム、実験室、栄養の決定要因の違いの結果であると仮説を立てています。
DPPM の生化学的証拠を持つ被験者の一部には分子的確証がなく、遺伝子座の不均一性と新規 DPPM を同定する機会が示唆されています。
|
不定
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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DPPM の影響を受ける被験者のさまざまな転帰に関連するゲノム、臨床、薬理学、実験室、食事の要因を特定する。
時間枠:不定
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DPPM の大多数には、効果的かつ決定的な治療法がありません。
臨床的に意味のある転帰に関連する応答バイオマーカーと候補代替エンドポイントを特定することで、将来の新規ゲノム医薬品の臨床試験が可能になります。
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不定
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者:Oleg A Shchelochkov, M.D.、National Human Genome Research Institute (NHGRI)
出版物と役立つリンク
一般刊行物
- Shchelochkov OA, Manoli I, Juneau P, Sloan JL, Ferry S, Myles J, Schoenfeld M, Pass A, McCoy S, Van Ryzin C, Wenger O, Levin M, Zein W, Huryn L, Snow J, Chlebowski C, Thurm A, Kopp JB, Chen KY, Venditti CP. Severity modeling of propionic acidemia using clinical and laboratory biomarkers. Genet Med. 2021 Aug;23(8):1534-1542. doi: 10.1038/s41436-021-01173-2. Epub 2021 May 18.
- Sloan JL, Johnston JJ, Manoli I, Chandler RJ, Krause C, Carrillo-Carrasco N, Chandrasekaran SD, Sysol JR, O'Brien K, Hauser NS, Sapp JC, Dorward HM, Huizing M; NIH Intramural Sequencing Center Group; Barshop BA, Berry SA, James PM, Champaigne NL, de Lonlay P, Valayannopoulos V, Geschwind MD, Gavrilov DK, Nyhan WL, Biesecker LG, Venditti CP. Exome sequencing identifies ACSF3 as a cause of combined malonic and methylmalonic aciduria. Nat Genet. 2011 Aug 14;43(9):883-6. doi: 10.1038/ng.908.
- Balasubramaniam S, Duley JA, Christodoulou J. Inborn errors of purine metabolism: clinical update and therapies. J Inherit Metab Dis. 2014 Sep;37(5):669-86. doi: 10.1007/s10545-014-9731-6. Epub 2014 Jun 28.
- Shchelochkov OA, Manoli I, Sloan JL, Ferry S, Pass A, Van Ryzin C, Myles J, Schoenfeld M, McGuire P, Rosing DR, Levin MD, Kopp JB, Venditti CP. Chronic kidney disease in propionic acidemia. Genet Med. 2019 Dec;21(12):2830-2835. doi: 10.1038/s41436-019-0593-z. Epub 2019 Jun 28.
- Balasubramaniam S, Duley JA, Christodoulou J. Inborn errors of pyrimidine metabolism: clinical update and therapy. J Inherit Metab Dis. 2014 Sep;37(5):687-98. doi: 10.1007/s10545-014-9742-3. Epub 2014 Jul 17.
- Chu Y, Sun S, Huang Y, Gao Q, Xie X, Wang P, Li J, Liang L, He X, Jiang Y, Wang M, Yang J, Chen X, Zhou C, Zhao Y, Ding F, Zhang Y, Wu X, Bai X, Wu J, Wei X, Chen X, Yue Z, Fang X, Huang Q, Wang Z, Huang R. Metagenomic analysis revealed the potential role of gut microbiome in gout. NPJ Biofilms Microbiomes. 2021 Aug 9;7(1):66. doi: 10.1038/s41522-021-00235-2.
- Han ST, Kim AC, Garcia K, Schimmenti LA, Macnamara E, Network UD, Gahl WA, Malicdan MC, Tifft CJ. PUS7 deficiency in human patients causes profound neurodevelopmental phenotype by dysregulating protein translation. Mol Genet Metab. 2022 Mar;135(3):221-229. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.01.103. Epub 2022 Feb 1.
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (実際)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
本研究に関する用語
キーワード
追加の関連 MeSH 用語
- 原発性免疫不全疾患
- 神経症状
- 脳血管障害
- 脳疾患
- 中枢神経系疾患
- 神経系疾患
- 血管疾患
- 心血管疾患
- 病理学的プロセス
- 神経筋疾患
- プリン-ピリミジン代謝、先天性エラー
- 代謝、先天性エラー
- 遺伝性疾患、先天性疾患
- 免疫系疾患
- 末梢神経系疾患
- 神経行動学的症状
- 血液疾患
- 神経変性疾患
- 免疫不全症候群
- 皮膚疾患
- 先天異常
- 皮膚疾患、血管
- 遺伝性変性疾患、神経系
- 血液タンパク質障害
- 知的障害
- 遺伝病、X連鎖
- 脳疾患、代謝、先天性
- 脳疾患、代謝
- 神経系の奇形
- 多発神経障害
- ガンマグロブリン血症
- 遺伝性感覚および運動神経障害
- 先天性、遺伝性、および新生児の疾患と異常
- 病理学的状態、徴候および症状
- 栄養および代謝疾患
- 皮膚および結合組織疾患
- ヘミックおよびリンパ疾患
- X連鎖性知的障害
- 貧血
- 代謝疾患
- 溶血
- シャルコー・マリー・トゥース病
- レッシュ・ナイハン症候群
- スネドン症候群
- 高IgM免疫不全症候群
- ジヒドロピリミジン脱水素酵素欠損症
- アデノシン一リン酸デアミナーゼ欠乏症
- アデニンホスホリボシルトランスフェラーゼ欠乏症
- キサンチン尿、タイプI
- 芸術症候群
- 橋小脳低形成症
- イノシントリホスファターゼ欠乏症
- アデニル致し系リアーゼ欠乏症
- プリンヌクレオシドホスホリラーゼ欠損症
- ADA2タンパク質、ヒト
- ベータ - ウリドプロピオーゼ欠乏症
- ジヒドロピリミジナーゼ欠損症
- Genee-Wiedemann症候群
- オロチンアシドゥリア1
その他の研究ID番号
- 10001625
- 001625-HG
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
米国FDA規制機器製品の研究
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