- ICH GCP
- Registre américain des essais cliniques
- Essai clinique NCT06092346
Étude prospective des déterminants cliniques, génomiques, pharmacologiques, de laboratoire et diététiques des troubles du métabolisme de la pyrimidine et de la purine
Description de l'étude :
Cette étude explorera l'histoire naturelle et les mécanismes de troubles nouveaux ou connus mais incomplètement caractérisés du métabolisme de la pyrimidine et des purines (DPPM). Les participants éligibles seront vérifiés en identifiant les anomalies biochimiques dans les niveaux de purines, de pyrimidines et de composés apparentés dans les fluides corporels, l'activité anormale des enzymes et/ou en identifiant des variantes pathogènes dans les gènes liés aux purines et au métabolisme des pyrimidines. Nous collecterons l'ADN des participants pour les analyses génétiques et génomiques, les fluides corporels pour l'analyse biochimique, les échantillons de sang et de tissus pour l'analyse enzymatique, les échantillons gastro-intestinaux pour l'analyse du microbiome. Certains participants peuvent subir une biopsie cutanée. Les sujets de l'étude se verront proposer des études médicales, de laboratoire et d'imagerie au NIH Clinical Research Center conformément aux normes de soins. Les données collectées seront analysées pour améliorer la compréhension de l'histoire naturelle, développer des modèles de prédiction statistique, identifier et valider de nouveaux biomarqueurs [Shchelochkov OA et al, 2021].
Objectifs:
Objectif principal : Décrire les caractéristiques des DPPM nouveaux et mal caractérisés.
Objectifs secondaires : Identifier les facteurs génomiques, cliniques, pharmacologiques, de laboratoire et alimentaires associés à des résultats variables chez les sujets affectés par les DPPM.
Points finaux :
Critère d'évaluation principal : identifier les variantes génomiques, les paramètres de laboratoire, les résultats d'images, les variables du microbiome, les antécédents nutritionnels et médicamenteux des DPPM.
Critères d'évaluation secondaires : identifier les paramètres de la maladie associés à des résultats cliniques variables (par exemple, fréquence des hospitalisations, survie, qualité de vie, fonction).
Aperçu de l'étude
Statut
Les conditions
- Maladie métabolique
- Métabolisme purine-pyrimidine
- AICDA, OMIM *605257, Immunodéficience avec hyper-IgM, type 2 ; HIGM2
- UNG, OMIM *191525, syndrome hyper-IgM 5
- NT5C3A, OMIM *606224, anémie hémolytique due à un déficit en UMPH1
- UMPS, OMIM *613891, acidurie orotique
- DHODH, OMIM *126064, syndrome de Miller (dysostose acrofaciale postaxiale)
- DPYD, OMIM *274270, déficit en dihydropyrimidine déshydrogénase
- DPYS, OMIM *613326, Déficit en dihydropyrimidinase
- UPB1, OMIM *606673, déficit en bêta-uréidopropionase
- CAD, *1140120, Encéphalopathie développementale et épileptique
- ADA2, OMIM *607575, syndrome de Sneddon ; VAIHS
- PNP, OMIM *164050, déficit en nucléoside phosphorylase
- ADSL, OMIM *608222, Déficit en adénylosuccinate lyase
- ITPA, OMIM *147520, déficit en inosine triphosphatase ; Encéphalopathie développementale et épileptique 35
- AMPD2, OMIM *102771, paraplégie spastique 63 ; Hypoplasie pontocérébelleuse
- PRPS1 SA, OMIM *311850 Goutte, superactivité de la phosphoribosylpyrophosphate synthétase liée au PRPS
- PRPS1 Def, OMIM *311850, syndrome des arts ; Maladie de Charcot-Marie-Tooth
- SLC22A12, OMIM *607096 Hypouricémie
- SLC2A9, OMIM *606142 Hypouricémie
- XDH, OMIM *607633, Xanthinurie Type 1
- HPRT1, OMIM *308000 Maladie de Lesch-Nyhan
- APRT, OMIM *102600, Déficit en adénine phosphoribosyltransférase
- IMPDH1, OMIM *146690, rétinite pigmentaire de type 10, amauriose congénitale de Leber de type 11
- TPMT, OMIM *187680, Thoipurines, mauvais métabolisme de
- AMPD1, OMIM *102770, myopathie due à un déficit en myoadénylate désaminase
- AK1, OMIM *103000, déficit en adénylate kinase
- AMPD3, OMIM*102772, déficit en AMP désaminase
Description détaillée
Description de l'étude :
Cette étude explorera l'histoire naturelle et les mécanismes de troubles nouveaux ou connus mais incomplètement caractérisés du métabolisme de la pyrimidine et des purines (DPPM). Les participants éligibles seront vérifiés en identifiant les anomalies biochimiques dans les niveaux de purines, de pyrimidines et de composés apparentés dans les fluides corporels, l'activité anormale des enzymes et/ou en identifiant des variantes pathogènes dans les gènes liés aux purines et au métabolisme des pyrimidines. Nous collecterons l'ADN des participants pour les analyses génétiques et génomiques, les fluides corporels pour l'analyse biochimique, les échantillons de sang et de tissus pour l'analyse enzymatique, les échantillons gastro-intestinaux pour l'analyse du microbiome. Certains participants peuvent subir une biopsie cutanée. Les sujets de l'étude se verront proposer des études médicales, de laboratoire et d'imagerie au NIH Clinical Research Center conformément aux normes de soins. Les données collectées seront analysées pour améliorer la compréhension de l'histoire naturelle, développer des modèles de prédiction statistique, identifier et valider de nouveaux biomarqueurs [Shchelochkov OA et al, 2021].
Objectifs:
Objectif principal : Décrire les caractéristiques des DPPM nouveaux et mal caractérisés.
Objectifs secondaires : Identifier les facteurs génomiques, cliniques, pharmacologiques, de laboratoire et alimentaires associés à des résultats variables chez les sujets affectés par les DPPM.
Points finaux :
Critère d'évaluation principal : identifier les variantes génomiques, les paramètres de laboratoire, les résultats d'images, les variables du microbiome, les antécédents nutritionnels et médicamenteux des DPPM.
Critères d'évaluation secondaires : identifier les paramètres de la maladie associés à des résultats cliniques variables (par exemple, fréquence des hospitalisations, survie, qualité de vie, fonction).
Type d'étude
Inscription (Estimé)
Contacts et emplacements
Coordonnées de l'étude
- Nom: Oleg A Shchelochkov, M.D.
- Numéro de téléphone: (301) 435-2944
- E-mail: PurineandPyrimidine@mail.nih.gov
Lieux d'étude
-
-
Maryland
-
Bethesda, Maryland, États-Unis, 20892
- Recrutement
- National Institutes of Health Clinical Center
-
Contact:
- Shannon Haines
- Numéro de téléphone: 240-987-8298
- E-mail: shannon.haines@nih.gov
-
Contact:
- NIH Clinical Center Office of Patient Recruitment (OPR)
- Numéro de téléphone: TTY dial 711 (800) 411-1222
- E-mail: ccopr@nih.gov
-
-
Critères de participation
Critère d'éligibilité
Âges éligibles pour étudier
- Enfant
- Adulte
- Adulte plus âgé
Accepte les volontaires sains
Méthode d'échantillonnage
Population étudiée
La description
- CRITÈRE D'INTÉGRATION:
Trois populations seront incluses dans cette étude : les sujets atteints de DPPM connu, les membres de la famille des sujets de l'étude et les témoins sains.
Afin d'être éligible à participer à cette étude en tant que sujet avec un DPPM connu, une personne doit répondre à tous les critères suivants :
Au moins un mois ;
- Des antécédents médicaux qui, sur la base de la prépondérance des preuves cliniques, de laboratoire, biochimiques et/ou génomiques, sont conformes aux DPPM ;
- Les résultats cliniques pouvant être utilisés pour suspecter des troubles du métabolisme des purines et des pyrimidines comprendront, sans toutefois s'y limiter, la présence de malformations congénitales, d'atteintes neurologiques, comportementales, immunologiques, rhumatologiques, hématologiques et rénales ; goutte; et rhabdomyolyse récurrente chez un ou plusieurs membres de la famille.
- Les résultats de laboratoire peuvent inclure, sans toutefois s'y limiter, une CPK élevée (rhabdomyolyse récurrente) ; neutropénie, lymphopénie, anémie, thrombocytopénie ; et l'immunodéficience.
- Les preuves biochimiques peuvent englober, sans toutefois s'y limiter, des anomalies de laboratoire persistantes dans le sang et l'urate urinaire (un produit terminal de la dégradation des purines) ; bêta-alanine sanguine et urinaire (un produit terminal de la dégradation de la pyrimidine) ; résultats caractéristiques sur les profils d'acides aminés plasmatiques (augmentation de l'aspartate et de la glycine plasmatiques) ; taux élevé d'acide orotique dans le dosage de l'acide organique urinaire ; présence de cristaux d'urate dans l'urine ; résultats anormaux sur les panels purine et pyrimidine (par ex. panels biochimiques de purines et de pyrimidines de plasma et d'urine à Mayo, PUPYP et PUPYU).
- Les preuves génomiques peuvent inclure la présence de variants pathogènes et probablement pathogènes dans des gènes connus ou liés de manière plausible aux voies de synthèse, de dégradation et de récupération de novo des purines et des pyrimidines. Les participants présentant des variantes de signification inconnue dans lesdits gènes peuvent être invités à participer au protocole, s'ils disposent de preuves cliniques, de laboratoire et biochimiques compatibles avec les DPPM.
- Avoir un médecin métabolique ou génétique primaire, ou un fournisseur de soins primaires ; et
- Capacité du sujet, des parents (dans le cas d'enfants) ou d'un représentant légalement autorisé (LAR) à comprendre et la volonté de signer un document de consentement éclairé écrit.
Afin d'être éligible à participer à cette étude en tant que membre non affecté de la famille d'un sujet atteint de DPPM connu, une personne doit répondre à tous les critères suivants :
- Au moins un mois ;
- Lien de parenté, par le sang ou le mariage, avec une personne inscrite ou sur le point d'être inscrite à l'étude avec un DPPM connu ;
- Il est probable, de l'avis des experts de l'équipe d'étude, que l'analyse d'un échantillon provenant de l'individu ferait progresser l'analyse génétique ou fonctionnelle de l'état possible du parent affecté ; et
- Capacité du sujet, des parents (dans le cas des enfants) ou d'un LAR à comprendre et volonté de signer un document de consentement éclairé écrit.
- Si, au cours de la procédure de consentement/assentiment, de l'examen des antécédents médicaux et familiaux et de l'examen physique, des soupçons cliniques apparaissent selon lesquels un membre de la famille présente des symptômes de DPPM, un examen et/ou des études supplémentaires peuvent être recommandés pour clarifier l'état clinique.
- Les participants doivent disposer d'une équipe de soins cliniques de routine en dehors du NIH pour s'inscrire à cette étude.
Afin d'être éligible à participer à cette étude en tant que volontaire sain non apparenté, une personne doit répondre à tous les critères suivants :
- Aucun antécédent personnel ou familial de DPPM ;
- Au moins un mois ;
- Aucun symptôme de DPPM ;
- Probabilité, de l'avis d'expert de l'équipe d'étude, qu'un échantillon provenant de l'individu fasse progresser l'analyse fonctionnelle du DPPM étudié ;
- Et la capacité du sujet, des parents (dans le cas des enfants) ou d'un LAR à comprendre et la volonté de signer un document de consentement éclairé écrit.
- Les participants doivent disposer d'une équipe de soins cliniques de routine en dehors du NIH pour s'inscrire à cette étude.
CRITÈRE D'EXCLUSION:
Les personnes répondant aux critères d'exclusion suivants ne sont pas éligibles à l'étude :
- Volontaires non apparentés qui ne sont pas affectés par le DPPM mais ont une déficience intellectuelle due à d'autres causes, telles qu'ils ne peuvent pas donner leur consentement éclairé sans tuteur/LAR, ne seront pas inscrits dans cette étude. Les personnes concernées et les membres de la famille des personnes atteintes de DPPM peuvent participer à l'étude lorsqu'un consentement éclairé approprié est obtenu (avec l'aide des parents/tuteur/LAR/examen bioéthique si nécessaire).
- Conditions intercurrentes ou chroniques qui, de l'avis des enquêteurs, peuvent alors interférer avec l'interprétation des études de recherche (par ex. traitement anticancéreux en cours entraînant une suppression de la moelle osseuse chez un patient atteint de DPPM présentant également une suppression de la moelle osseuse).
- Les participantes enceintes en tant que membres non affectés de la famille ou en tant que volontaires sains non apparentés ne peuvent pas rejoindre le protocole pendant la grossesse.
- Les personnes ne disposant pas d'une équipe de soins cliniques de routine en dehors du NIH ne peuvent pas s'inscrire à cette étude. Nous demanderons aux participants le nom de l'équipe de soins cliniques avant l'inscription.
Plan d'étude
Comment l'étude est-elle conçue ?
Détails de conception
Cohortes et interventions
Groupe / Cohorte |
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Membre de la famille d'un sujet atteint de DPPM connu ou suspecté
1.
Âge d'au moins un mois ;2.
Relation, par le sang ou le mariage, avec une personne inscrite ou sur le point d'être inscrite à l'étude avec un DPPM connu ou suspecté ;3.
Il est probable, de l'avis des experts de l'équipe d'étude, que l'analyse d'un échantillon provenant de l'individu ferait progresser l'analyse génétique ou fonctionnelle de l'état possible du parent affecté ; et4.
Capacité du sujet, des parents (dans le cas des enfants) ou d'un LAR à comprendre et volonté de signer un document de consentement éclairé écrit.5.
Si, au cours de la procédure de consentement/assentiment, des soupçons cliniques apparaissent selon lesquels un membre de la famille présente des symptômes des DPPM diagnostiqués, un examen et/ou des études supplémentaires peuvent être demandés pour clarifier l'état clinique avant d'inscrire un membre de la famille en tant que participant non affecté.
|
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Bénévoles en bonne santé
1.
Aucun antécédent personnel ou familial de DPPM ;2.
Au moins un mois ;3.
Aucun symptôme de DPPM ;4.
Probabilité, de l'avis d'expert de l'équipe d'étude, qu'un échantillon provenant de l'individu fasse progresser l'analyse fonctionnelle du DPPM étudié ; 5.
Et la capacité du sujet, des parents (dans le cas des enfants) ou d'un LAR à comprendre et la volonté de signer un document de consentement éclairé écrit.
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Sujets présentant des DPPM connus, suspectés ou non caractérisés
1. Quel que soit le sexe, âgé d’au moins un mois ;2.
Des antécédents médicaux qui, de l'avis d'expert de l'équipe d'étude, sont conformes au DPPM ; 3. Avoir un médecin métabolique ou génétique primaire, ou un fournisseur de soins primaires ; et 4. Capacité du sujet, des parents (dans le cas d'enfants) ou d'un représentant légalement autorisé (LAR) à comprendre et la volonté de signer un document de consentement éclairé écrit.
|
Que mesure l'étude ?
Principaux critères de jugement
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
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Les TP décrivent les caractéristiques des DPPM nouveaux et mal caractérisés.
Délai: indéfini
|
Les DPPM démontrent une variabilité inter- et intra-familiale significative.
Nous émettons l'hypothèse que les différences dans les résultats cliniques sont le résultat de différences dans les déterminants génomiques, de laboratoire et nutritionnels.
Une proportion de sujets présentant des preuves biochimiques de DPPM n'ont pas de confirmation moléculaire, ce qui suggère une hétérogénéité de locus et la possibilité d'identifier de nouveaux DPPM.
|
indéfini
|
Mesures de résultats secondaires
Mesure des résultats |
Description de la mesure |
Délai |
|---|---|---|
|
Identifier les facteurs génomiques, cliniques, pharmacologiques, de laboratoire et alimentaires associés à des résultats variables chez les sujets affectés par les DPPM.
Délai: indéfini
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La grande majorité des DPPM manquent de traitements efficaces et définitifs.
L'identification de biomarqueurs de réponse et de paramètres de substitution candidats associés à des résultats cliniques significatifs permettra de futurs essais cliniques pour de nouveaux médicaments génomiques.
|
indéfini
|
Collaborateurs et enquêteurs
Les enquêteurs
- Chercheur principal: Oleg A Shchelochkov, M.D., National Human Genome Research Institute (NHGRI)
Publications et liens utiles
Publications générales
- Shchelochkov OA, Manoli I, Juneau P, Sloan JL, Ferry S, Myles J, Schoenfeld M, Pass A, McCoy S, Van Ryzin C, Wenger O, Levin M, Zein W, Huryn L, Snow J, Chlebowski C, Thurm A, Kopp JB, Chen KY, Venditti CP. Severity modeling of propionic acidemia using clinical and laboratory biomarkers. Genet Med. 2021 Aug;23(8):1534-1542. doi: 10.1038/s41436-021-01173-2. Epub 2021 May 18.
- Sloan JL, Johnston JJ, Manoli I, Chandler RJ, Krause C, Carrillo-Carrasco N, Chandrasekaran SD, Sysol JR, O'Brien K, Hauser NS, Sapp JC, Dorward HM, Huizing M; NIH Intramural Sequencing Center Group; Barshop BA, Berry SA, James PM, Champaigne NL, de Lonlay P, Valayannopoulos V, Geschwind MD, Gavrilov DK, Nyhan WL, Biesecker LG, Venditti CP. Exome sequencing identifies ACSF3 as a cause of combined malonic and methylmalonic aciduria. Nat Genet. 2011 Aug 14;43(9):883-6. doi: 10.1038/ng.908.
- Balasubramaniam S, Duley JA, Christodoulou J. Inborn errors of purine metabolism: clinical update and therapies. J Inherit Metab Dis. 2014 Sep;37(5):669-86. doi: 10.1007/s10545-014-9731-6. Epub 2014 Jun 28.
- Shchelochkov OA, Manoli I, Sloan JL, Ferry S, Pass A, Van Ryzin C, Myles J, Schoenfeld M, McGuire P, Rosing DR, Levin MD, Kopp JB, Venditti CP. Chronic kidney disease in propionic acidemia. Genet Med. 2019 Dec;21(12):2830-2835. doi: 10.1038/s41436-019-0593-z. Epub 2019 Jun 28.
- Balasubramaniam S, Duley JA, Christodoulou J. Inborn errors of pyrimidine metabolism: clinical update and therapy. J Inherit Metab Dis. 2014 Sep;37(5):687-98. doi: 10.1007/s10545-014-9742-3. Epub 2014 Jul 17.
- Chu Y, Sun S, Huang Y, Gao Q, Xie X, Wang P, Li J, Liang L, He X, Jiang Y, Wang M, Yang J, Chen X, Zhou C, Zhao Y, Ding F, Zhang Y, Wu X, Bai X, Wu J, Wei X, Chen X, Yue Z, Fang X, Huang Q, Wang Z, Huang R. Metagenomic analysis revealed the potential role of gut microbiome in gout. NPJ Biofilms Microbiomes. 2021 Aug 9;7(1):66. doi: 10.1038/s41522-021-00235-2.
- Han ST, Kim AC, Garcia K, Schimmenti LA, Macnamara E, Network UD, Gahl WA, Malicdan MC, Tifft CJ. PUS7 deficiency in human patients causes profound neurodevelopmental phenotype by dysregulating protein translation. Mol Genet Metab. 2022 Mar;135(3):221-229. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.01.103. Epub 2022 Feb 1.
Liens utiles
Dates d'enregistrement des études
Dates principales de l'étude
Début de l'étude (Réel)
Achèvement primaire (Estimé)
Achèvement de l'étude (Estimé)
Dates d'inscription aux études
Première soumission
Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité
Première publication (Réel)
Mises à jour des dossiers d'étude
Dernière mise à jour publiée (Réel)
Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité
Dernière vérification
Plus d'information
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- Déficit en dihydropyrimidinase
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