嘧啶和嘌呤代谢紊乱的临床、基因组、药理学、实验室和饮食决定因素的前瞻性研究
研究描述:
本研究将探讨新型或已知但不完全表征的嘧啶和嘌呤代谢(DPPM)疾病的自然史和机制。 合格的参与者将通过识别体液中嘌呤、嘧啶和相关化合物水平的生化异常、酶的异常活性和/或识别与嘌呤和嘧啶代谢相关的基因的致病性变异来确定。 我们将收集参与者的 DNA 用于遗传和基因组分析、体液用于生化分析、血液和组织样本用于酶分析、胃肠样本用于微生物组分析。 一些参与者可能会接受皮肤活检。 研究对象将在 NIH 临床研究中心接受符合护理标准的医学、实验室和影像研究。 将分析收集的数据,以增进对自然历史的理解,开发统计预测模型,识别和验证新型生物标志物[Shchelochkov OA et al, 2021]。
目标:
主要目标:描述新颖且特征较差的 DPPM 的特征。
次要目标:确定与受 DPPM 影响的受试者的可变结果相关的基因组、临床、药理学、实验室和饮食因素。
端点:
主要终点:识别 DPPM 的基因组变异、实验室参数、图像发现、微生物组变量、营养和用药史。
次要终点:确定与可变临床结果相关的疾病参数(例如住院频率、生存率、生活质量、功能)。
研究概览
地位
条件
- 代谢性疾病
- 嘌呤-嘧啶代谢
- AICDA,OMIM *605257,高 IgM 免疫缺陷,2 型; HIGM2
- UNG、OMIM *191525、高 IgM 综合征 5
- NT5C3A,OMIM *606224,贫血,溶血,由于 UMPH1 缺乏
- UMPS,OMIM *613891,乳清酸尿症
- DHODH,OMIM *126064,米勒综合征(轴后肢面发育不全)
- DPYD、OMIM *274270、二氢嘧啶脱氢酶缺乏症
- DPYS、OMIM *613326、二氢嘧啶酶缺乏症
- UPB1、OMIM *606673、β-脲基丙酸酶缺乏症
- CAD,*1140120,发育性和癫痫性脑病
- ADA2,OMIM *607575,Sneddon 综合征;瓦伊赫斯
- PNP、OMIM *164050、核苷磷酸化酶缺乏
- ADSL、OMIM *608222、腺苷酸琥珀酸裂解酶缺乏
- ITPA,OMIM *147520,肌苷三磷酸酶缺乏症;发育性和癫痫性脑病 35
- AMPD2,OMIM *102771,痉挛性截瘫 63;脑桥小脑发育不全
- PRPS1 SA、OMIM *311850 痛风、PRPS 相关磷酸核糖焦磷酸合成酶超活性
- PRPS1 Def,OMIM *311850,艺术综合症;腓骨肌萎缩症
- SLC22A12,OMIM *607096 低尿酸血症
- SLC2A9,OMIM *606142 低尿酸血症
- XDH,OMIM *607633,黄嘌呤尿症 1 型
- HPRT1、OMIM *308000 Lesch-Nyhan 病
- APRT、OMIM *102600、腺嘌呤磷酸核糖转移酶缺乏症
- IMPDH1、OMIM *146690、色素性视网膜炎 10 型、莱伯先天性黑蒙症 11 型
- TPMT、OMIM *187680、硫嘌呤、代谢不良
- AMPD1、OMIM *102770、肌腺苷酸脱氨酶缺乏引起的肌病
- AK1、OMIM *103000、腺苷酸激酶缺乏
- AMPD3、OMIM*102772、AMP 脱氨酶缺乏症
详细说明
研究描述:
本研究将探讨新型或已知但不完全表征的嘧啶和嘌呤代谢(DPPM)疾病的自然史和机制。 合格的参与者将通过识别体液中嘌呤、嘧啶和相关化合物水平的生化异常、酶的异常活性和/或识别与嘌呤和嘧啶代谢相关的基因的致病性变异来确定。 我们将收集参与者的 DNA 用于遗传和基因组分析、体液用于生化分析、血液和组织样本用于酶分析、胃肠样本用于微生物组分析。 一些参与者可能会接受皮肤活检。 研究对象将在 NIH 临床研究中心接受符合护理标准的医学、实验室和影像研究。 将分析收集的数据,以增进对自然历史的理解,开发统计预测模型,识别和验证新型生物标志物[Shchelochkov OA et al, 2021]。
目标:
主要目标:描述新颖且特征较差的 DPPM 的特征。
次要目标:确定与受 DPPM 影响的受试者的可变结果相关的基因组、临床、药理学、实验室和饮食因素。
端点:
主要终点:识别 DPPM 的基因组变异、实验室参数、图像发现、微生物组变量、营养和用药史。
次要终点:确定与可变临床结果相关的疾病参数(例如住院频率、生存率、生活质量、功能)。
研究类型
注册 (估计的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名:Oleg A Shchelochkov, M.D.
- 电话号码:(301) 435-2944
- 邮箱:PurineandPyrimidine@mail.nih.gov
学习地点
-
-
Maryland
-
Bethesda、Maryland、美国、20892
- 招聘中
- National Institutes of Health Clinical Center
-
接触:
- Shannon Haines
- 电话号码:240-987-8298
- 邮箱:shannon.haines@nih.gov
-
接触:
- NIH Clinical Center Office of Patient Recruitment (OPR)
- 电话号码:TTY dial 711 (800) 411-1222
- 邮箱:ccopr@nih.gov
-
-
参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 孩子
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
描述
- 纳入标准:
本研究将包括三个人群:已知 DPPM 的受试者、研究受试者的家庭成员以及健康对照。
为了有资格作为具有已知 DPPM 的受试者参与本研究,个人必须满足以下所有标准:
至少一个月大;
- 根据临床、实验室、生化和/或基因组证据的优势,病史与 DPPM 一致;
- 可用于怀疑嘌呤和嘧啶代谢紊乱的临床表现包括但不限于存在先天性畸形、神经、行为、免疫、风湿、血液、肾脏受累;痛风;一名或多名家庭成员复发性横纹肌溶解症。
- 实验室检查结果可能包括但不限于 CPK 升高(复发性横纹肌溶解症);中性粒细胞减少症、淋巴细胞减少症、贫血、血小板减少症;和免疫缺陷。
- 生化证据可能包括但不限于血液和尿尿酸(嘌呤降解的最终产物)持续实验室异常;血液和尿液 β-丙氨酸(嘧啶降解的最终产物);血浆氨基酸谱的特征性发现(血浆天冬氨酸和甘氨酸升高);尿液有机酸测定中乳清酸升高;尿液中存在尿酸盐晶体;嘌呤和嘧啶组的异常发现(例如 Mayo、PUPYP 和 PUPYU 的血浆和尿液嘌呤和嘧啶生化检测组)。
- 基因组证据可能包括已知或可能与嘌呤和嘧啶的从头合成、降解和回收途径相关的基因中存在致病性和可能致病性变异。 如果参与者具有与 DPPM 一致的临床、实验室和生化证据,则可能会邀请上述基因中具有未知意义的变异的参与者参与该方案。
- 有一名初级代谢或遗传医生,或初级保健提供者;和
- 受试者、父母(对于儿童)或法定授权代表 (LAR) 的理解能力和签署书面知情同意文件的意愿。
为了有资格作为已知 DPPM 受试者的未受影响家庭成员参与本研究,个人必须满足以下所有标准:
- 至少一个月大;
- 与已知 DPPM 登记或即将登记参加研究的个人有血缘或婚姻关系;
- 根据研究小组的专家意见,对个体样本的分析可能会促进对受影响亲属可能状况的遗传或功能分析;和
- 受试者、父母(对于儿童)或 LAR 的理解能力和签署书面知情同意文件的意愿。
- 如果在同意/同意程序、病史和家族史审查以及体检期间,临床怀疑家庭成员患有 DPPM 症状,可能会建议进行额外审查和/或研究以澄清临床状况。
- 参与者必须拥有 NIH 之外的常规临床护理团队才能参加本研究。
为了有资格作为无关健康志愿者参与本研究,个人必须满足以下所有标准:
- 无 DPPM 个人或家族史;
- 至少一个月大;
- 无 DPPM 症状;
- 根据研究小组的专家意见,来自个人的样本可能会促进所研究的 DPPM 的功能分析;
- 以及受试者、父母(对于儿童)或 LAR 的理解能力以及签署书面知情同意文件的意愿。
- 参与者必须拥有 NIH 之外的常规临床护理团队才能参加本研究。
排除标准:
符合以下排除标准的个人没有资格参加该研究:
- 未受 DPPM 影响但因其他原因导致智力障碍,以致在没有监护人/LAR 的情况下无法提供知情同意书的无关志愿者将不参加本研究。 在获得适当的知情同意后,受影响的个人和 DPPM 患者的家庭成员可以参加研究(必要时在父母/监护人/LAR/生物伦理审查的帮助下)。
- 研究人员认为,并发或慢性疾病可能会干扰研究的解释(例如, 持续的癌症治疗导致 DPPM 患者出现骨髓抑制,同时也出现骨髓抑制)。
- 怀孕参与者作为未受影响的家庭成员或作为无关的健康志愿者在怀孕期间无法加入该方案。
- 没有 NIH 之外的常规临床护理团队的个人无法参加本研究。 我们将在注册前询问参与者临床护理团队的名称。
学习计划
研究是如何设计的?
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
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患有已知或疑似 DPPM 的受试者的家庭成员
1.
至少1个月大;2.
与已登记或即将登记参加已知或疑似 DPPM 的研究的个人有血缘或婚姻关系;3.
根据研究小组的专家意见,对个体样本的分析可能会促进对受影响亲属可能状况的遗传或功能分析;和4。
受试者、父母(如果是儿童)或 LAR 的理解能力和签署书面知情同意文件的意愿。5。
如果在同意/同意程序期间,临床怀疑家庭成员患有诊断为 DPPM 的症状,则在将家庭成员登记为未受影响的参与者之前,可能会要求进行额外的审查和/或研究以澄清临床状况。
|
|
健康志愿者
1.
无 DPPM 个人或家族史;2.
至少1个月大;3.
无DPPMs症状;4.
根据研究小组的专家意见,来自个人的样本可能会促进所研究的 DPPM 的功能分析; 5.
以及受试者、父母(对于儿童)或 LAR 的理解能力以及签署书面知情同意文件的意愿。
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具有已知或可疑或未表征的 DPPM 的受试者
1. 不论性别,至少1个月大;2.
研究小组的专家意见与 DPPM 一致的病史; 3. 有一名初级代谢或遗传医师,或初级保健提供者; 4. 受试者、父母(对于儿童)或法定授权代表 (LAR) 的理解能力和签署书面知情同意文件的意愿。
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研究衡量的是什么?
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
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TP 描述了特征较差的新型 DPPM 的特征。
大体时间:不定
|
DPPM 表现出显着的家庭间和家庭内差异。
我们假设临床结果的差异是基因组、实验室和营养决定因素差异的结果。
部分具有 DPPM 生化证据的受试者没有分子确认,这表明位点异质性和识别新 DPPM 的机会。
|
不定
|
次要结果测量
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
|---|---|---|
|
确定与受 DPPM 影响的受试者的可变结果相关的基因组、临床、药理学、实验室和饮食因素。
大体时间:不定
|
绝大多数 DPPM 缺乏有效且明确的治疗方法。
识别与临床有意义的结果相关的反应生物标志物和候选替代终点将使未来新型基因组药物的临床试验成为可能。
|
不定
|
合作者和调查者
调查人员
- 首席研究员:Oleg A Shchelochkov, M.D.、National Human Genome Research Institute (NHGRI)
出版物和有用的链接
一般刊物
- Shchelochkov OA, Manoli I, Juneau P, Sloan JL, Ferry S, Myles J, Schoenfeld M, Pass A, McCoy S, Van Ryzin C, Wenger O, Levin M, Zein W, Huryn L, Snow J, Chlebowski C, Thurm A, Kopp JB, Chen KY, Venditti CP. Severity modeling of propionic acidemia using clinical and laboratory biomarkers. Genet Med. 2021 Aug;23(8):1534-1542. doi: 10.1038/s41436-021-01173-2. Epub 2021 May 18.
- Sloan JL, Johnston JJ, Manoli I, Chandler RJ, Krause C, Carrillo-Carrasco N, Chandrasekaran SD, Sysol JR, O'Brien K, Hauser NS, Sapp JC, Dorward HM, Huizing M; NIH Intramural Sequencing Center Group; Barshop BA, Berry SA, James PM, Champaigne NL, de Lonlay P, Valayannopoulos V, Geschwind MD, Gavrilov DK, Nyhan WL, Biesecker LG, Venditti CP. Exome sequencing identifies ACSF3 as a cause of combined malonic and methylmalonic aciduria. Nat Genet. 2011 Aug 14;43(9):883-6. doi: 10.1038/ng.908.
- Balasubramaniam S, Duley JA, Christodoulou J. Inborn errors of purine metabolism: clinical update and therapies. J Inherit Metab Dis. 2014 Sep;37(5):669-86. doi: 10.1007/s10545-014-9731-6. Epub 2014 Jun 28.
- Shchelochkov OA, Manoli I, Sloan JL, Ferry S, Pass A, Van Ryzin C, Myles J, Schoenfeld M, McGuire P, Rosing DR, Levin MD, Kopp JB, Venditti CP. Chronic kidney disease in propionic acidemia. Genet Med. 2019 Dec;21(12):2830-2835. doi: 10.1038/s41436-019-0593-z. Epub 2019 Jun 28.
- Balasubramaniam S, Duley JA, Christodoulou J. Inborn errors of pyrimidine metabolism: clinical update and therapy. J Inherit Metab Dis. 2014 Sep;37(5):687-98. doi: 10.1007/s10545-014-9742-3. Epub 2014 Jul 17.
- Chu Y, Sun S, Huang Y, Gao Q, Xie X, Wang P, Li J, Liang L, He X, Jiang Y, Wang M, Yang J, Chen X, Zhou C, Zhao Y, Ding F, Zhang Y, Wu X, Bai X, Wu J, Wei X, Chen X, Yue Z, Fang X, Huang Q, Wang Z, Huang R. Metagenomic analysis revealed the potential role of gut microbiome in gout. NPJ Biofilms Microbiomes. 2021 Aug 9;7(1):66. doi: 10.1038/s41522-021-00235-2.
- Han ST, Kim AC, Garcia K, Schimmenti LA, Macnamara E, Network UD, Gahl WA, Malicdan MC, Tifft CJ. PUS7 deficiency in human patients causes profound neurodevelopmental phenotype by dysregulating protein translation. Mol Genet Metab. 2022 Mar;135(3):221-229. doi: 10.1016/j.ymgme.2022.01.103. Epub 2022 Feb 1.
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (实际的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (实际的)
研究记录更新
最后更新发布 (实际的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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其他研究编号
- 10001625
- 001625-HG
计划个人参与者数据 (IPD)
计划共享个人参与者数据 (IPD)?
药物和器械信息、研究文件
研究美国 FDA 监管的药品
研究美国 FDA 监管的设备产品
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