新生児ゲノム配列決定 (BeginNGS) の前向き研究
2024年11月12日 更新者:Stephen F. Kingsmore、Rady Pediatric Genomics & Systems Medicine Institute
この臨床試験の目的は、BeginNGS と呼ばれる全ゲノム配列決定を使用した新生児スクリーニングの新しい方法をテストすることです。 遺伝性疾患の疑いがなく、サンディエゴのラディ小児病院のNICUに入院している新生児が登録される。 この研究が答えようとしている主な質問は次のとおりです。
- この集団における全ゲノム配列決定 (DWGS) の診断収率はどれくらいですか?
- DWGS と比較した BeginNGS および全エクソーム シーケンス (WES) の診断感度と特異度はどのようなものですか?
- この集団に DWGS を導入することに関連する潜在的な問題は何ですか?
登録された新生児は血液サンプルが採取され、次の 3 つの検査を受けます。
- DWGS
- NGS の開始
- ウェス
調査の概要
詳細な説明
乾燥血斑 (DBS) を検査する新生児スクリーニング (NBS) は、症状の発症時または発症前の治療を可能にする効果的な治療法が利用可能ないくつかの疾患に罹患している新生児を特定します。
NBS はこれらの疾患の転帰を改善するため、米国のほぼすべての乳児に実施されています。
現在の連邦政府推奨の NBS リストは 35 の症状に限定されており、年間最大 6,600 人の子供が罹患していることが特定されています。
しかし、NBS によってスクリーニングされない遺伝性疾患では、診断と治療の遅れにより予後は依然として不良です。
私たちは最近、BeginNGS と呼ばれる、全ゲノム配列決定 (WGS) を使用した効果的な治療法が利用できる 434 件の重度の小児遺伝病に対する NBS 用システムを開発しました。
遡及研究では、BeginNGS の真陰性率 (特異度) が 99.7%、真陽性率 (感度) が 88.8% であることが示されました。
私たちは現在、サンディエゴのラディ小児病院(RCHSD)の新生児集中治療室(NICU)に入院している新生児を対象とした最初の前向き研究を実施し、BeginNGS の感度と特異性を標準的な診断用迅速全ゲノム配列決定の感度と特異性と比較することを提案します( DWGS)と全エクソームシーケンス(WES)。
この研究は、将来の大規模な臨床試験の準備中です。
研究の種類
介入
入学 (実際)
120
段階
- 適用できない
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
-
-
California
-
San Diego、California、アメリカ、92123
- Rady Children's Hospital San Diego
-
-
参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
- 子
健康ボランティアの受け入れ
はい
説明
包含基準:
- RCHSD NICUに入院している生後10日以内の新生児。
除外基準:
- Rady Children's Institute for Genomic Medicine での別の臨床研究に登録している新生児、または DWGS が注文されている、または検討されている新生児。
- 母親が18歳未満の新生児。
- 州の被後見人である新生児。
- 親/法的保護者が同意を得ることができない新生児。
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか?
デザインの詳細
- 主な目的:ふるい分け
- 割り当て:なし
- 介入モデル:単一グループの割り当て
- マスキング:なし(オープンラベル)
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
|---|---|
|
実験的:入学者
登録された幼児は 3 つのテスト (DWGS、BeginNGS、および WES) を受けます。
DWGS は標準的な方法で実行されます。
BeginNGSとWESは登録完了後に一括で実行されます。
BeginNGS および WES の診断感度と特異度は、DWGS (臨床検査改善法改正法に準拠した標準臨床検査) と比較されます。
|
標準的な診断用全ゲノム配列決定が実行されます。
434 の遺伝性疾患をスクリーニングするゲノム配列決定。
全エクソームシーケンスが実行されます。
|
この研究は何を測定していますか?
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
|
DWGS によって遺伝性疾患と診断された登録乳児の割合。
時間枠:18ヶ月
|
割合
|
18ヶ月
|
二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
|
BeginNGS によって遺伝性疾患があると特定された登録乳児の割合。
時間枠:18ヶ月
|
割合
|
18ヶ月
|
|
WES によって遺伝性疾患があると特定された登録乳児の割合。
時間枠:18ヶ月
|
割合
|
18ヶ月
|
|
標準 NBS 検査で陽性反応を示した登録乳児の割合。
時間枠:18ヶ月
|
割合
|
18ヶ月
|
|
調査に参加することに同意した親の割合。
時間枠:18ヶ月
|
割合
|
18ヶ月
|
|
親の拒否理由。
時間枠:18ヶ月
|
アンケート
|
18ヶ月
|
|
サンプルがラボに到着してから DWGS 結果が返されるまでの時間。
時間枠:18ヶ月
|
時間(日)
|
18ヶ月
|
|
誕生から DWGS 結果が返されるまでの時間。
時間枠:18ヶ月
|
時間(日)
|
18ヶ月
|
|
DWGS によって報告されていない診断所見が BeginNGS または WES によって特定された場合の確認テストの結果。
時間枠:18ヶ月
|
確認された調査結果の割合
|
18ヶ月
|
協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
捜査官
- 主任研究者:Stephen Kingsmore, MD DSc、Rady Children's Institute for Genomic Medicine
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2023年3月13日
一次修了 (実際)
2024年2月28日
研究の完了 (実際)
2024年11月12日
試験登録日
最初に提出
2024年2月16日
QC基準を満たした最初の提出物
2024年2月16日
最初の投稿 (実際)
2024年2月26日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
2024年11月14日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2024年11月12日
最終確認日
2024年11月1日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- 20226892
医薬品およびデバイス情報、研究文書
米国FDA規制医薬品の研究
いいえ
米国FDA規制機器製品の研究
いいえ
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。