脊髄性筋萎縮症におけるロングリード解析 - LOREASI (LOREASI)
脊髄性筋萎縮症の遺伝カウンセリングにおける主要課題に対処するためのロングリード解析を用いたSMN1遺伝子のシス重複の検出
脊髄性筋萎縮症（SMA）はSMN1遺伝子の欠失によって引き起こされる重度の神経筋疾患であり、最も重症な型では治療なしでは小児期に死に至ります。 両パートナーが保因者であるカップルを検出するための遺伝カウンセリングは特に重要です。 一部の国では、妊娠前スクリーニングが提供されています。 しかし、SMN1遺伝子が並列に2コピー存在する（2+0ジェノタイプ）ため、一部の保因者は検出を逃れています。 現在、診断目的で使用されている分子遺伝学的手法ではこれらの2+0ジェノタイプを検出できず、遺伝カウンセリングにおいて重大な課題となっています。
この研究は、超長鎖分子の分析に基づく新技術を用いてSMN1遺伝子の並列重複を検出し、現在の技術では特定されていないヘテロ接合体被験者を検出し、遺伝カウンセリングを改善することを目的としています。
調査の概要
詳細な説明
脊髄性筋萎縮症（SMA）は、重度の常染色体劣性神経筋疾患であり、最も重篤な型では治療なしに小児期に死亡に至ります。 両親が共にヘテロ接合体であるカップルを検出するための遺伝カウンセリングは特に重要です。 一部の国では、妊娠前スクリーニングが提供されています。 しかしながら、第2アレル上のSMN1遺伝子のシス重複（[2+0]遺伝子型）の存在により、一部の個人のヘテロ接合状態は検出を逃れることがあります。 現在、診断目的で使用されている分子遺伝学的手法ではこれらの[2+0]遺伝子型を検出できず、遺伝カウンセリングにおいて重大な課題となっています。
SMAの原因となるSMN1遺伝子は、ヒト参照ゲノム（「暗黒領域」）において未だ十分に理解されていない5q11q13領域に位置しています。 この逆位重複領域の構造は、欠失、重複、および遺伝子変換を引き起こす組換え事象を促進します。 テロメア領域に位置するSMN1遺伝子は、セントロメア領域に位置する非常に相同性の高いコピーであるSMN2遺伝子を持っています。 重複事象に関する詳細な知識の不足が、遺伝カウンセリングの改善を目的とした分子ツールの開発を妨げています。
本研究は、超長分子の分析に基づく新技術を用いてSMN1遺伝子のシス重複を検出することを目的としています。 我々は、この複雑な領域を分析するための光学マッピング（Bionano）の有用性を評価します。
研究の種類
入学 (推定)
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究連絡先
- 名前：Pascale Saugier-Veber, PharmD PhD
- 電話番号：(+33) 2 32 88 64 51
- メール：Pascale.Saugier-Veber@chu-rouen.fr
研究場所
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-
-
Rouen、フランス
- 募集
- CHU Rouen
-
コンタクト：
- Pascale Saugier-Veber
- 電話番号：(+33) 2 32 88 64 51
- メール：Pascale.Saugier-Veber@chu-rouen.fr
-
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
説明
対象基準
• 成人被験者：
以下のいずれかに該当する被験者：
- SMN1遺伝子のコピー数が1または3（対照群）で、SMN2遺伝子のコピー数が可変
- cis配置のSMN1遺伝子コピー数が2（2+0ジェノタイプ）（試験群）
- フランスの健康保険に加入していること
- 同意書に署名していること
除外基準
- 妊娠中または授乳中の女性
- 行政または司法決定により自由を奪われている者、または後見・保佐下にある者
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 主な目的：防止
- 割り当て：非ランダム化
- 介入モデル：並列代入
- マスキング：なし（オープンラベル）
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
|---|---|
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実験的：対照群
SMN1遺伝子のコピー数が1つまたは3つで、SMN2遺伝子のコピー数が可変の被験者
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本研究への参加に同意した被験者からは、血液サンプル（EDTA 2x5 mL）を採取し、同日中に4℃でD+1配達を保証する配送業者を用いてルーアン大学病院の遺伝学検査室に送付されます。
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|
実験的：テストグループ
SMN1遺伝子の一方の対立遺伝子上に2コピー（シス配置）を持ち、他方の対立遺伝子に欠失を有する2+0ジェノタイプを保有する被験者
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本研究への参加に同意した被験者からは、血液サンプル（EDTA 2x5 mL）を採取し、同日中に4℃でD+1配達を保証する配送業者を用いてルーアン大学病院の遺伝学検査室に送付されます。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
|---|---|
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[2+0] SMN1 遺伝子型を識別する能力
時間枠：登録から解析終了まで（36か月）
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登録から解析終了まで（36か月）
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二次結果の測定
結果測定 |
時間枠 |
|---|---|
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超長鎖DNA分子の組み立てを実行する能力
時間枠：登録から解析終了まで（36か月間）
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登録から解析終了まで（36か月間）
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協力者と研究者
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (推定)
研究の完了 (推定)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (推定)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
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