게놈 분석을 통해 정보를 얻은 급성 림프구성 백혈병 치료법
뉴멕시코대학교 종합암센터(UNMCCC) 연구자들이 수행한 이전 연구에서는 고위험 B 및 T 세포 전구체 급성 림프구성 백혈병(ALL)을 앓고 있는 어린이, 청소년 및 젊은 성인에서 이전에 알려지지 않은 게놈 돌연변이가 밝혀졌습니다. 게놈 및 차세대 DNA 시퀀싱 기술을 사용하여 이 연구자들은 고위험 ALL에 걸린 어린이의 14%가 "필라델피아 염색체 유사"("Ph 유사") ALL을 가지고 있음을 밝혔습니다. 이러한 형태의 ALL을 앓고 있는 환자는 치료 실패 및 사망 위험이 상당히 증가한 것으로 나타났습니다.
추가 연구에서는 Ph 유사 ALL을 초래할 수 있는 40개 이상의 서로 다른 유전자 재배열 및 융합이 있음이 밝혀졌습니다. 이러한 서로 다른 유전자 융합체 중 일부를 발현하는 세포주와 인간 백혈병 세포는 현재 이용 가능한 약물에 민감했습니다. 이는 이러한 특정한 별개의 유전자 융합을 가진 Ph 유사 ALL 환자가 향후 임상 시험에서 적절한 치료법으로 치료되도록 목표로 삼아야 함을 시사합니다. ALL 환자에서 잠재적으로 표적이 될 수 있는 다른 유전적 변이를 확인하기 위한 추가 작업도 필요합니다.
따라서 이 연구의 목표는 UNM에서 새로 진단된 모든 ALL 환자에 대한 게놈 스크리닝을 수행하고 이 정보를 사용하여 NCTN(National Clinical Trial Network) 임상 시험에 환자를 등록하는 것입니다. 적절한 NCTN 시험이 가능하지 않은 경우 최선의 임상 관리가 추구됩니다.
연구 개요
상세 설명
위에 간략하게 설명된 UNMCCC 조사관과 다른 사람들이 수행한 작업은 생물학적 및 임상적 특징과 놀랍도록 이질적인 Ph 유사 ALL의 게놈 환경에 대한 주요 통찰력을 제공했습니다. 유전자 발현 프로파일링과 RNA/전사체, 엑솜 및 전체 게놈 시퀀싱을 통해 현재까지 연구된 Ph 유사 ALL 사례의 91%에서 키나제 활성화 병변의 여러 가지 별개의 하위 클래스가 확인되었으며, 가장 일반적으로 키나제 및 사이토카인 수용체 유전자 재배열 및 융합이 발생했습니다. UNMCCC 조사관들은 현재 COG(어린이 종양학 그룹) 및 성인 국립 암 연구소(NCI) 협력 그룹(SWOG), 동부 종양학 그룹(ECOG) - American College of Radiology Imaging Network(ACRIN), The Alliance)는 ALL의 근본적인 게놈 병변을 확인하고 환자를 적절한 치료법으로 목표로 삼기 위해 게놈 진단 스크린, 분자 진단 및 차세대 시퀀싱 연구를 통합하는 소아, 청소년 및 젊은 성인(AYA) 및 성인 ALL 환자를 위한 국가 임상 시험을 개발합니다. 요법.
이 타당성 연구에서 차세대 시퀀싱(NGS) 기술은 급성 림프구성 백혈병 위험 분류 시스템에 정보를 제공할 것이며, 이는 표적 치료의 혜택을 받을 수 있는 환자를 식별하는 데 적용될 수 있습니다. 그러한 환자는 미국병리학회(CAP)/CLIA 조건 하에 수행된 상세한 게놈 데이터 분석과 분자종양위원회의 개별 사례 토론을 통해 NCTN 국민 치료 시험 또는 적절한 경우 UNMCCC 후원 시험을 목표로 할 것입니다.
또한, 과소대표된 소수민족의 상당 부분을 포함하는 뉴멕시코 및 지역 ALL 인구의 ALL 관련 게놈 돌연변이 스펙트럼과 인종 및 민족의 연관성을 연구할 것입니다. 이는 궁극적으로 혈통 기반 위험 분류 시스템의 개발을 허용할 수 있습니다.
연구 유형
등록 (실제)
단계
- 해당 없음
연락처 및 위치
연구 장소
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New Mexico
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Albuquerque, New Mexico, 미국, 87131
- University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 어린이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
설명
포함 기준:
- 급성림프구성백혈병의 새로운 진단
- 응급 방사선, 스테로이드 또는 척수강내 시타라빈을 제외한 이전 치료 없음
- 모든 연령
- 서면 동의서에 대한 이해 능력과 서명 의지.
제외 기준:
- 응급 방사선, 스테로이드 또는 척추강내 시타라빈을 제외한 이전 치료
- 뉴멕시코 대학교에서 암 치료를 받을 의향이 없음
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
- 주 목적: 치료
- 할당: 해당 없음
- 중재 모델: 단일 그룹 할당
- 마스킹: 없음(오픈 라벨)
무기와 개입
참가자 그룹 / 팔 |
개입 / 치료 |
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실험적: 게놈 테스트
새로 진단된 ALL 환자는 일차 목표 1에 나열된 게놈 연구를 받게 됩니다. 분석은 초기 진단 시 골수(BM) 흡인에 대해 수행됩니다(절대 모세포 수가 1,000/μL 이상인 환자는 말초 혈액 2mL를 제출할 수 있음) 필요한 BM 1mL당 진단 시. 흡인물을 얻을 수 없는 환자의 경우 중심부 생검을 사용합니다. 또한, 일선 치료 중 질병의 분자 이질성과 클론성 진화를 특성화하고 모니터링하기 위해 유세포 분석 및 심층 염기서열분석을 사용할 것입니다. BM, 혈액 및 협측 표본은 유도 치료 29일차에 수집되며, 재발이 발생하면 나중에 수집할 수도 있습니다. |
게놈 테스트 결과에 따라 표적 가능한 게놈 병변이 있는 환자는 NCI 국립 임상 시험 네트워크(NCTN)(COG 및 기타 성인 NCI 협력 그룹)가 후원하는 이용 가능한 국가 임상 시험에 등록됩니다.
적합한 NCTN 시험이 존재하지 않는 경우, 적절한 치료 요법(현재 허용되는 표준 치료 포함), 치료법 변경 또는 특정 게놈 병변에 대한 표적 제제를 사용한 치료가 고려됩니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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모든 특성화: 저밀도 어레이
기간: 3 년
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UNMCCC에서 새로 진단된 ALL 환자는 초기 진단 시 저밀도 어레이(LDA) 카드 검사(Ph 유사 ALL에 대한 유전자 발현 분류기)를 받게 됩니다.
LDA 상태(양성 대 음성)의 비율과 95% 신뢰 구간은 정확한 이항 분포를 기반으로 계산됩니다.
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3 년
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모든 특성화: 차세대 시퀀싱
기간: 3 년
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UNMCCC에서 새로 진단된 모든 환자는 초기 진단 시 차세대 염기서열분석(NGS)을 받게 됩니다.
충분한 판독 깊이(500-700x)의 NGS(엑소믹 및 전사체)를 사용하여 진단 시 클론 이질성을 검출합니다.
통계 분석은 주로 설명적입니다(예:
다양한 돌연변이의 빈도(비율)가 계산됩니다.
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3 년
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모든 특성화: SNP 분석
기간: 3 년
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UNMCCC에서 새로 진단된 ALL 환자는 초기 진단 시 유전적 조상의 분자 결정(단일 염기 다형성(SNP) 패널 사용)을 받게 됩니다.
통계 분석은 주로 설명적입니다(예:
SNP 및 유전적 조상 그룹의 빈도(비율)가 계산됩니다.
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3 년
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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환자 특성과 시험 등록의 관계
기간: 3 년
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일차 결과 측정에 대해 설명된 유전적 및 분자적 특성 분석은 NCTN 임상 시험에 등록된 환자와 NCTN 임상 시험에 등록되지 않은 환자에 대해 요약됩니다.
두 그룹 비교(NCTN 대 비 NCTN)는 Wilcoxon 합계 순위 테스트와 같은 비모수적 접근 방식을 사용하여 테스트됩니다.
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3 년
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인종/민족과 결과의 관계
기간: 3 년
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사건 발생 시간 데이터(예: 임상적으로 결정된 무진행 생존(PFS))는 치료 그룹의 로그 순위 테스트와 함께 Kaplan-Meier 곡선을 사용하고 유전적 조상의 분자 평가를 통해 결정된 인종/민족을 요약합니다. 1차 결과 측정 3에 설명된 대로. 다변량 Cox 비례 위험 모델도 치료 및/또는 인종 변수를 사용하여 PFS에 대해 탐색됩니다.
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3 년
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치료 관련성을 지닌 ALL의 분자적 특징 발견의 타당성
기간: 3 년
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타당성은 다음 통계를 계산하여 평가됩니다. NCTN 시험에 등록한 환자의 비율, 시간 경과에 따라 완전히 평가된 최소 잔존 질환(MRD) 환자의 비율, 분자 특성 분석이 가능하고 유익한 환자의 비율 치료과정.
모든 추정 비율에는 정확한 95% 신뢰구간이 수반됩니다.
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3 년
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최소잔존질환(MRD) 평가
기간: 3 년
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유도 말기 최소 잔류 질환(MRD)은 워싱턴 대학교 참조 연구소의 아동 종양학 그룹에서 CLIA(Clinical Laboratory Improvement Amendments) 승인 유세포 분석법을 사용하여 수행됩니다.
분자 MRD는 또한 연구 기반의 심층 염기서열 분석을 사용하여 결정됩니다.
여러 시점에 걸쳐 반복적으로 측정된 MRD는 기술 통계(높음 대 낮음 상태에 대한 막대 그래프)를 사용하여 요약됩니다.
각 시점에서 Monte Carlo 시뮬레이션과 함께 정확한 Pearson Chi-Square 테스트를 사용하여 MRD와 치료 그룹(NCTN 및 비-NCTN 치료 그룹에 대한 LAD 양성 대 LAD 음성) 간의 연관성을 평가합니다.
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3 년
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Jodi Mayfield, MD, University of New Mexico, Department of Pediatrics
간행물 및 유용한 링크
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (실제)
연구 완료 (실제)
연구 등록 날짜
최초 제출
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