Akut lymfoblastisk leukæmiterapi baseret på genomiske analyser
Tidligere arbejde udført af University of New Mexico Comprehensive Cancer Center (UNMCCC) efterforskere har afsløret hidtil ukendte genomiske mutationer hos børn, unge og unge voksne med højrisiko B- og T-celle-precursor akut lymfatisk leukæmi (ALL). Ved at bruge genomiske og næste generations DNA-sekventeringsteknologier afslørede disse efterforskere, at 14% af børn med højrisiko ALL har "Philadelphia kromosom-lignende" ("Ph-lignende") ALL. Patienter med denne form for ALL viste sig at have en signifikant øget risiko for behandlingssvigt og død.
Yderligere arbejde afslørede, at der er mere end 40 forskellige gen-omlejringer og fusioner, der kan resultere i Ph-lignende ALL. Cellelinjer og humane leukæmiceller, der udtrykker nogle af disse forskellige genfusioner, var følsomme over for aktuelt tilgængelige lægemidler. Dette tyder på, at Ph-lignende ALL-patienter med disse specifikke distinkte genfusioner bør målrettes i fremtidige kliniske forsøg for at blive behandlet med passende terapi. Der er også behov for yderligere arbejde for at identificere andre potentielt målrettede genetiske ændringer hos ALLE patienter.
Derfor er målet med denne undersøgelse at udføre genomisk screening af alle nyligt diagnosticerede ALL-patienter set på UNM og at bruge denne information til at indskrive patienter til tilgængelige kliniske forsøg fra National Clinical Trial Network (NCTN). Hvis et passende NCTN-forsøg ikke er tilgængeligt, vil den bedste kliniske behandling blive forfulgt.
Studieoversigt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljeret beskrivelse
Arbejdet udført af UNMCCC-forskere og andre som beskrevet kort ovenfor har givet stor indsigt i de biologiske og kliniske træk og det genomiske landskab af Ph-lignende ALL, som er slående heterogent. Genekspressionsprofilering og RNA/transkriptomisk, exom- og helgenom-sekventering har identificeret adskillige forskellige underklasser af kinaseaktiverende læsioner i 91% af de Ph-lignende ALL-tilfælde, der er undersøgt til dato, mest almindeligt kinase- og cytokinreceptorgenomlejringer og -fusioner. UNMCCC-efterforskere samarbejder nu med Children's Oncology Group (COG) og de voksne National Cancer Institute (NCI) Cooperative Groups (Southwest Oncology Group (SWOG), Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) - American College of Radiology Imaging Network (ACRIN), The Alliance) for at udvikle nationale kliniske forsøg for pædiatriske, teenagere og unge voksne (AYA) og voksne ALL-patienter, der inkorporerer deres genomiske diagnostiske screeninger, molekylær diagnostik og næste generations sekventeringsundersøgelser for at identificere underliggende genomiske læsioner i ALL og målrette patienter til passende terapeutisk regimer.
I denne feasibility-undersøgelse vil næste generations sekventeringsteknologier (NGS) informere et risikoklassificeringssystem for akut lymfatisk leukæmi, som kan tilpasses til at identificere patienter, der kan drage fordel af målrettede behandlinger; sådanne patienter vil blive målrettet mod NCTN National Treatment-forsøg eller UNMCCC-sponsorerede forsøg, hvor det er relevant, gennem detaljeret genomisk dataanalyse udført under College of American Pathologists (CAP)/CLIA-betingelser og i individuelle sagsdiskussioner i et Molecular Tumor Board.
Derudover vil sammenhængen mellem race og etnicitet med spektret af ALL-associerede genomiske mutationer i New Mexico og den regionale ALL-befolkning, som omfatter en betydelig del af underrepræsenterede minoriteter, blive undersøgt. Dette kan i sidste ende muliggøre udviklingen af et herkomstbaseret risikoklassificeringssystem.
Undersøgelsestype
Tilmelding (Faktiske)
Fase
- Ikke anvendelig
Kontakter og lokationer
Studiesteder
-
-
New Mexico
-
Albuquerque, New Mexico, Forenede Stater, 87131
- University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
-
-
Deltagelseskriterier
Berettigelseskriterier
Aldre berettiget til at studere
- Barn
- Voksen
- Ældre voksen
Tager imod sunde frivillige
Beskrivelse
Inklusionskriterier:
- Ny diagnose af akut lymfatisk leukæmi
- Ingen tidligere behandling, undtagen nødbestråling, steroider eller intratekal cytarabin
- Enhver alder
- Evne til at forstå og villighed til at underskrive et skriftligt informeret samtykkedokument.
Ekskluderingskriterier:
- Tidligere behandling, undtagen nødbestråling, steroider eller intrathecal cytarabin
- Ikke villig til at få kræftbehandling på University of New Mexico
Studieplan
Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?
Design detaljer
- Primært formål: Behandling
- Tildeling: N/A
- Interventionel model: Enkelt gruppeopgave
- Maskning: Ingen (Åben etiket)
Våben og indgreb
Deltagergruppe / Arm |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Eksperimentel: Genomisk test
Nydiagnosticerede ALL-patienter vil gennemgå genomiske undersøgelser anført i Primært mål 1. Analyser vil blive udført på et knoglemarvsaspirat (BM) ved indledende diagnose (patienter med et absolut blasttal på mindst 1.000/μL, kan indsende 2 ml perifert blod ved diagnose for hver 1 ml påkrævet BM. Hos patienter, hvor aspiratet ikke kan opnås, vil en kernebiopsi blive brugt). Derudover vil flowcytometrisk analyse og dyb sekventering blive brugt til at karakterisere og overvåge den molekylære heterogenitet og klonale udvikling af sygdommen under frontlinjebehandling. BM, blod og bukkale prøver vil blive udtaget på dag 29 af induktionsbehandlingen og muligvis på et senere tidspunkt, hvis der opstår tilbagefald. |
Afhængigt af de genomiske testresultater vil patienter med målrettede genomiske læsioner blive tilmeldt tilgængelige nationale kliniske forsøg, der er sponsoreret af NCI National Clinical Trials Network (NCTN) (COG og andre voksne NCI Cooperative Groups).
Hvis der ikke findes et passende NCTN-forsøg, vil passende terapeutiske regimer (inklusive aktuelt accepterede plejestandarder), ændringer i terapi eller behandling med målrettede midler til specifikke genomiske læsioner blive overvejet.
|
Hvad måler undersøgelsen?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
ALL karakterisering: Low Density Array
Tidsramme: 3 år
|
Nydiagnosticerede ALL-patienter på UNMCCC vil gennemgå Low Density Array (LDA)-kortscreening (en genekspressionsklassifikator for Ph-lignende ALL) ved den første diagnose.
Andelen af LDA-status (positiv vs. negativ) og dens 95 % konfidensinterval vil blive beregnet ud fra den nøjagtige binomiale fordeling.
|
3 år
|
|
ALLE karakterisering: Next Generation Sequencing
Tidsramme: 3 år
|
Nydiagnosticerede ALLE patienter på UNMCCC vil gennemgå Next Generation Sequencing (NGS) ved den første diagnose.
NGS (eksomisk og transkriptomisk) med en tilstrækkelig læsedybde (500-700x) vil blive anvendt til at påvise klonal heterogenitet ved diagnose.
Statistisk analyse vil primært være beskrivende (f.eks.
frekvens (andel) af forskellige mutationer vil blive beregnet).
|
3 år
|
|
ALL karakterisering: SNP-analyse
Tidsramme: 3 år
|
Nydiagnosticerede ALL-patienter ved UNMCCC vil gennemgå molekylær bestemmelse af genetisk herkomst (ved hjælp af et panel af enkeltnukleotidpolymorfismer (SNP'er)) ved den første diagnose.
Statistisk analyse vil primært være beskrivende (f.eks.
frekvens (andel) af SNP'er og genetiske herkomstgrupper vil blive beregnet)
|
3 år
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Foranstaltningsbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Sammenhæng mellem patientegenskaber og forsøgstilmelding
Tidsramme: 3 år
|
Genetisk og molekylær karakterisering som beskrevet for de primære resultatmål vil blive opsummeret for patienter, der er tilmeldt NCTN kliniske forsøg og for dem, der ikke er indrulleret i NCTN kliniske forsøg.
De to gruppesammenligninger (NCTN vs. ikke-NCTN) vil blive testet ved hjælp af en ikke-parametrisk tilgang, såsom Wilcoxon sum rank test.
|
3 år
|
|
Sammenhæng mellem race/etnicitet og udfald
Tidsramme: 3 år
|
Tid-til-hændelse data (såsom Progressionsfri overlevelse (PFS), bestemt klinisk) vil blive opsummeret ved hjælp af Kaplan-Meier kurver sammen med log-rang test af behandlingsgrupperne samt race/etnicitet bestemt gennem molekylær vurdering af genetisk herkomst som beskrevet i Primært resultatmål 3. Multivariable Cox Proportional Hazards-model vil også blive udforsket for PFS med behandlings- og/eller etnicitetsvariable.
|
3 år
|
|
Mulighed for at opdage molekylære funktioner i ALLE med terapeutisk relevans
Tidsramme: 3 år
|
Gennemførligheden vil blive vurderet ved beregning af følgende statistikker: procent af patienter, der indrulleredes i NCTN-forsøg, procent af patienter med minimal residual sygdom (MRD), som er fuldstændigt evalueret over tid, procent af patienter, for hvem molekylær karakterisering er mulig og informativ over behandlingsforløb.
Alle estimerede proportioner vil blive ledsaget af nøjagtige 95 % konfidensintervaller
|
3 år
|
|
Minimal Residual Disease (MRD) evaluering
Tidsramme: 3 år
|
End-induktion Minimal Residual Disease (MRD) vil blive udført ved hjælp af et Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA)-godkendt flow-cytometrisk assay ved Children's Oncology Group University of Washington Reference Laboratory.
Molekylær MRD vil også blive bestemt ved hjælp af forskningsbaseret dyb sekventering.
MRD gentagne gange målt på tværs af tidspunkter vil blive opsummeret ved hjælp af beskrivende statistik (søjlediagram for høj vs. lav status).
Associationer mellem MRD og behandlingsgrupperne (LAD Positive vs. LAD Negative for NCTN og Non-NCTN behandlingsgrupper), ved brug af den nøjagtige Pearson Chi-Square test med Monte Carlo simulering på hvert tidspunkt vil blive vurderet.
|
3 år
|
Samarbejdspartnere og efterforskere
Sponsor
Efterforskere
- Ledende efterforsker: Jodi Mayfield, MD, University of New Mexico, Department of Pediatrics
Publikationer og nyttige links
Datoer for undersøgelser
Studer store datoer
Studiestart (Faktiske)
Primær færdiggørelse (Faktiske)
Studieafslutning (Faktiske)
Datoer for studieregistrering
Først indsendt
Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier
Først opslået (Anslået)
Opdateringer af undersøgelsesjournaler
Sidste opdatering sendt (Faktiske)
Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier
Sidst verificeret
Mere information
Begreber relateret til denne undersøgelse
Nøgleord
Yderligere relevante MeSH-vilkår
Andre undersøgelses-id-numre
- INST UNM 1503
Plan for individuelle deltagerdata (IPD)
Planlægger du at dele individuelle deltagerdata (IPD)?
Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .
Kliniske forsøg med Leukæmi, akut lymfatisk
-
National Cancer Institute (NCI)Aktiv, ikke rekrutterendeVoksen T Akut lymfoblastisk leukæmi | Barndom T Akut lymfoblastisk leukæmi | Ann Arbor Stage II voksen lymfoblastisk lymfom | Ann Arbor Stage II Childhood Lymfoblastisk Lymfom | Ann Arbor Stage III voksen lymfoblastisk lymfom | Ann Arbor Stage III barndomslymfoblastisk lymfom | Ann Arbor Stage IV... og andre forholdForenede Stater, Canada, Australien, New Zealand