ゲノム解析による急性リンパ性白血病の治療法
ニューメキシコ大学総合がんセンター（UNMCCC）の研究者らが行ったこれまでの研究で、高リスクB細胞およびT細胞前駆体急性リンパ芽球性白血病（ALL）の小児、青少年、若年成人におけるこれまで知られていなかったゲノム変異が明らかになった。 研究者らは、ゲノムおよび次世代 DNA 配列決定技術を使用して、高リスク ALL の小児の 14% が「フィラデルフィア染色体様」(「Ph 様」) ALL であることを明らかにしました。 この形態の ALL 患者は、治療の失敗と死亡のリスクが大幅に高いことが判明しました。
さらなる研究により、Ph 様 ALL を引き起こす可能性のある 40 を超える異なる遺伝子再構成と融合が存在することが明らかになりました。 これらの異なる遺伝子融合の一部を発現する細胞株およびヒト白血病細胞は、現在利用可能な薬剤に対して感受性がありました。 これは、これらの特定の異なる遺伝子融合を有する Ph 様 ALL 患者が、適切な治療法で治療されるよう将来の臨床試験の対象とされるべきであることを示唆しています。 ALL患者における他の潜在的に標的となり得る遺伝子変化を特定するには、さらなる研究も必要である。
したがって、この研究の目標は、UNM で診察されたすべての新たに診断された ALL 患者のゲノム スクリーニングを実施し、この情報を利用して利用可能な National Clinical Trial Network (NCTN) 臨床試験に患者を登録することです。 適切な NCTN 試験が利用できない場合は、最善の臨床管理が追求されます。
調査の概要
詳細な説明
上で簡単に説明した UNMCCC 研究者らによって行われた研究は、驚くほど不均一な Ph 様 ALL の生物学的特徴と臨床的特徴、およびゲノムの状況について大きな洞察を提供しました。 遺伝子発現プロファイリングとRNA/トランスクリプトーム、エクソーム、および全ゲノム配列決定により、これまでに研究されたPh様ALL症例の91%において、キナーゼ活性化病変のいくつかの異なるサブクラスが同定されており、最も一般的なものはキナーゼおよびサイトカイン受容体遺伝子の再構成および融合である。 UNMCCCの研究者らは現在、小児腫瘍学グループ(COG)および成人の国立がん研究所(NCI)の協力グループ(南西部腫瘍学グループ(SWOG)、東部協力腫瘍学グループ(ECOG)、米国放射線学会画像ネットワーク(ACRIN)、アライアンス）は、ゲノム診断スクリーニング、分子診断、および次世代シーケンス研究を組み込んだ小児、青年期および若年成人（AYA）および成人のALL患者を対象とした国内臨床試験を開発して、ALLの根本的なゲノム病変を特定し、患者を適切な治療の対象にします。養生法。
この実現可能性研究では、次世代シーケンス (NGS) 技術が急性リンパ芽球性白血病のリスク分類システムに情報を提供します。このシステムは、標的療法の恩恵を受ける可能性のある患者を特定するために適応される可能性があります。このような患者は、米国病理学者協会（CAP）/CLIA条件下で実施される詳細なゲノムデータ分析および分子腫瘍委員会での個別の症例の議論を通じて、必要に応じてNCTN国民治療試験またはUNMCCC主催の試験の対象となる。
さらに、過小評価されている少数派がかなりの割合で含まれるニューメキシコ州および地域の ALL 人口における ALL 関連ゲノム変異のスペクトルと、人種および民族性との関連性が研究される予定です。 これにより、最終的には祖先ベースのリスク分類システムの開発が可能になる可能性があります。
研究の種類
入学 (実際)
段階
- 適用できない
連絡先と場所
研究場所
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New Mexico
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Albuquerque、New Mexico、アメリカ、87131
- University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
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参加基準
適格基準
就学可能な年齢
- 子
- 大人
- 高齢者
健康ボランティアの受け入れ
説明
包含基準:
- 急性リンパ芽球性白血病の新たな診断
- 緊急放射線、ステロイド、くも膜下腔内シタラビンを除く、以前の治療歴がないこと
- 年齢問わず
- 書面によるインフォームドコンセント文書を理解する能力と署名する意欲。
除外基準:
- 過去の治療（緊急放射線、ステロイド、くも膜下腔内シタラビンを除く）
- ニューメキシコ大学でがん治療を受ける気はない
研究計画
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
- 主な目的：処理
- 割り当て：なし
- 介入モデル：単一グループの割り当て
- マスキング：なし（オープンラベル）
武器と介入
参加者グループ / アーム |
介入・治療 |
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実験的：ゲノム検査
新たに診断されたALL患者は、主要目的1に記載されているゲノム研究を受けることになる。分析は、初回診断時に骨髄（BM）吸引液に対して実施される（絶対芽球数が少なくとも1,000/μLの患者は、2 mLの末梢血を提出してもよい）必要なBMの1 mLごとに診断時に。 吸引物を採取できない患者の場合は、コア生検が使用されます。 さらに、フローサイトメトリー分析とディープシーケンスは、最前線の治療中の分子の不均一性と疾患のクローン進化を特徴付け、監視するために使用されます。 骨髄、血液、頬の検体は導入治療の 29 日目に採取されますが、再発した場合はそれ以降の時点でも採取されます。 |
ゲノム検査の結果に応じて、標的化可能なゲノム病変を有する患者は、NCI 全国臨床試験ネットワーク (NCTN) (COG およびその他の成人 NCI 協力グループ) が後援する利用可能な全国臨床試験に登録されます。
適切な NCTN 試験が存在しない場合は、適切な治療計画 (現在受け入れられている標準治療を含む)、治療法の変更、または特定のゲノム病変に対する標的薬剤による治療が検討されます。
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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ALL の特性評価: 低密度アレイ
時間枠：3年
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UNMCCC で新たに診断された ALL 患者は、初回診断時に低密度アレイ (LDA) カード スクリーニング (Ph 様 ALL の遺伝子発現分類子) を受けます。
LDA ステータスの割合 (陽性と陰性) およびその 95% 信頼区間は、正確な二項分布に基づいて計算されます。
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3年
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ALL の特性評価: 次世代シーケンシング
時間枠：3年
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UNMCCC で新たに診断された ALL 患者は、初回診断時に次世代シーケンス (NGS) を受けます。
診断時にクローンの不均一性を検出するために、十分な読み取り深度 (500 ～ 700x) の NGS (エキソミックおよびトランスクリプトーム) が使用されます。
統計分析は主に記述的なものになります（例:
さまざまな変異の頻度（割合）が計算されます）。
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3年
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ALL 特性評価: SNP 分析
時間枠：3年
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UNMCCCで新たに診断されたALL患者は、初回診断時に遺伝的祖先の分子決定（一塩基多型（SNP）のパネルを使用）を受けることになる。
統計分析は主に記述的なものになります（例:
SNP と遺伝的祖先グループの頻度 (割合) が計算されます)
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3年
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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患者の特徴と治験登録との関係
時間枠：3年
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主要結果尺度について説明した遺伝的および分子的特徴付けは、NCTN 臨床試験に登録されている患者および NCTN 臨床試験に登録されていない患者について要約されます。
2 つのグループの比較 (NCTN 対非 NCTN) は、Wilcoxon 合計ランク テストなどのノンパラメトリック アプローチを使用してテストされます。
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3年
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人種/民族と結果の関係
時間枠：3年
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発症までの時間データ（臨床的に決定される無増悪生存期間（PFS）など）は、治療グループによるログランク検定とともにカプラン・マイヤー曲線を使用して要約され、遺伝的祖先の分子評価を通じて決定される人種/民族も含まれます。多変数コックス比例ハザード モデルは、治療変数および/または民族性変数を使用して PFS についても調査されます。
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3年
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治療に関連するALLの分子的特徴を発見する可能性
時間枠：3年
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実現可能性は、次の統計の計算によって評価されます: NCTN 試験に登録した患者の割合、長期にわたって完全に評価された微小残存病変 (MRD) の患者の割合、分子的特徴付けが実行可能で有益な患者の割合治療コース。
すべての推定比率には、正確な 95% 信頼区間が伴います。
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3年
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最小残存病変 (MRD) の評価
時間枠：3年
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導入末期の最小残存病変（MRD）は、ワシントン大学小児腫瘍学グループ参考研究所で臨床検査改善修正（CLIA）承認のフローサイトメトリーアッセイを使用して実施されます。
分子MRDは、研究に基づいたディープシークエンシングを使用して決定されます。
複数の時点にわたって繰り返し測定された MRD は、記述統計 (高ステータスと低ステータスの棒グラフ) を使用して要約されます。
各時点でのモンテカルロシミュレーションによる正確なピアソンカイ二乗検定を使用して、MRDと治療群の間の関連性(NCTNおよび非NCTN治療群のLAD陽性対LAD陰性)が評価されます。
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3年
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協力者と研究者
捜査官
- 主任研究者：Jodi Mayfield, MD、University of New Mexico, Department of Pediatrics
出版物と役立つリンク
研究記録日
主要日程の研究
研究開始 (実際)
一次修了 (実際)
研究の完了 (実際)
試験登録日
最初に提出
QC基準を満たした最初の提出物
最初の投稿 (推定)
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
最終確認日
詳しくは
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