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Terapie per la leucemia linfoblastica acuta basate su analisi genomiche

9 gennaio 2024 aggiornato da: New Mexico Cancer Care Alliance

Un precedente lavoro svolto dai ricercatori del Comprehensive Cancer Center dell’Università del New Mexico (UNMCCC) ha rivelato mutazioni genomiche precedentemente sconosciute in bambini, adolescenti e giovani adulti affetti da leucemia linfoblastica acuta (LLA) da precursori delle cellule B e T ad alto rischio. Utilizzando tecnologie genomiche e di sequenziamento del DNA di nuova generazione, questi ricercatori hanno rivelato che il 14% dei bambini con LLA ad alto rischio hanno LLA "simile al cromosoma Filadelfia" ("simile al Ph"). È stato riscontrato che i pazienti con questa forma di LLA avevano un rischio significativamente maggiore di fallimento del trattamento e di morte.

Ulteriori lavori hanno rivelato che esistono più di 40 distinti riarrangiamenti e fusioni genetiche che possono provocare la LLA Ph-simile. Le linee cellulari e le cellule leucemiche umane che esprimono alcune di queste diverse fusioni genetiche erano sensibili ai farmaci attualmente disponibili. Ciò suggerisce che i pazienti con LLA Ph-simile con queste specifiche fusioni genetiche distinte dovrebbero essere presi di mira nei futuri studi clinici per essere trattati con una terapia appropriata. È inoltre necessario ulteriore lavoro per identificare altre alterazioni genetiche potenzialmente individuabili nei pazienti ALL.

Pertanto, l'obiettivo di questo studio è quello di eseguire lo screening genomico di tutti i pazienti con LLA di nuova diagnosi visitati all'UNM e di utilizzare queste informazioni per arruolare i pazienti negli studi clinici disponibili nella National Clinical Trial Network (NCTN). Se non è disponibile uno studio NCTN appropriato, verrà perseguita la migliore gestione clinica.

Panoramica dello studio

Descrizione dettagliata

Il lavoro svolto dai ricercatori dell'UNMCCC e da altri, come descritto brevemente sopra, ha fornito importanti informazioni sulle caratteristiche biologiche e cliniche e sul panorama genomico della LLA Ph-simile, che è sorprendentemente eterogeneo. Il profilo dell'espressione genica e il sequenziamento dell'RNA/trascrittomica, dell'esoma e dell'intero genoma hanno identificato diverse sottoclassi distinte di lesioni che attivano la chinasi nel 91% dei casi di LLA Ph-simile studiati fino ad oggi, più comunemente riarrangiamenti e fusioni dei geni del recettore della chinasi e delle citochine. I ricercatori dell'UNMCCC stanno ora collaborando con il Children's Oncology Group (COG) e i gruppi cooperativi per adulti del National Cancer Institute (NCI) (Southwest Oncology Group (SWOG), Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) - American College of Radiology Imaging Network (ACRIN), The Alliance) per sviluppare studi clinici nazionali su pazienti pediatrici, adolescenti e giovani adulti (AYA) e adulti con LLA che incorporino i loro screening diagnostici genomici, diagnostica molecolare e studi di sequenziamento di prossima generazione per identificare le lesioni genomiche sottostanti nella LLA e indirizzare i pazienti verso terapie appropriate. regimi.

In questo studio di fattibilità, le tecnologie di sequenziamento di prossima generazione (NGS) forniranno informazioni su un sistema di classificazione del rischio di leucemia linfoblastica acuta, che potrebbe essere adattato per identificare i pazienti che potrebbero trarre beneficio da terapie mirate; tali pazienti saranno indirizzati agli studi sul trattamento nazionale dell'NCTN o agli studi sponsorizzati dall'UNMCCC, ove appropriato, attraverso un'analisi dettagliata dei dati genomici eseguita in condizioni del College of American Pathologists (CAP)/CLIA e in discussioni di casi individuali in un Molecular Tumor Board.

Inoltre, verrà studiata l'associazione di razza ed etnia con lo spettro delle mutazioni genomiche associate alla ALL nel New Mexico e nella popolazione regionale di ALL, che comprende una percentuale significativa di minoranze sottorappresentate. Ciò potrebbe in definitiva consentire lo sviluppo di un sistema di classificazione del rischio basato sull’ascendenza.

Tipo di studio

Interventistico

Iscrizione (Effettivo)

21

Fase

  • Non applicabile

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Luoghi di studio

    • New Mexico
      • Albuquerque, New Mexico, Stati Uniti, 87131
        • University of New Mexico Comprehensive Cancer Center

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino
  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

No

Descrizione

Criterio di inclusione:

  • Nuova diagnosi di leucemia linfoblastica acuta
  • Nessuna terapia precedente, escluse radiazioni di emergenza, steroidi o citarabina intratecale
  • Qualsiasi età
  • Capacità di comprensione e disponibilità a firmare un documento di consenso informato scritto.

Criteri di esclusione:

  • Terapia precedente, escluse radiazioni di emergenza, steroidi o citarabina intratecale
  • Non disposto a ricevere cure contro il cancro presso l'Università del New Mexico

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Scopo principale: Trattamento
  • Assegnazione: N / A
  • Modello interventistico: Assegnazione di gruppo singolo
  • Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)

Armi e interventi

Gruppo di partecipanti / Arm
Intervento / Trattamento
Sperimentale: Test genomici

I pazienti con LLA di nuova diagnosi saranno sottoposti a studi genomici elencati nell'Obiettivo primario 1. Le analisi saranno eseguite su un aspirato di midollo osseo (BM) alla diagnosi iniziale (i pazienti con una conta assoluta di blasti di almeno 1.000 / μL, possono inviare 2 mL di sangue periferico alla diagnosi per ogni ml di midollo osseo richiesto. Nei pazienti in cui non è possibile ottenere l'aspirato, verrà utilizzata una biopsia centrale).

Inoltre, l'analisi citofluorimetrica e il sequenziamento profondo verranno utilizzati per caratterizzare e monitorare l'eterogeneità molecolare e l'evoluzione clonale della malattia durante la terapia di prima linea. I campioni di midollo osseo, sangue e buccale verranno raccolti il ​​giorno 29 del trattamento di induzione e possibilmente in un momento successivo in caso di recidiva.

A seconda dei risultati dei test genomici, i pazienti con lesioni genomiche selezionabili verranno arruolati negli studi clinici nazionali disponibili sponsorizzati dalla NCI National Clinical Trials Network (NCTN) (COG e altri gruppi cooperativi NCI per adulti). Se non esiste uno studio NCTN adeguato, verranno presi in considerazione regimi terapeutici appropriati (compresi gli standard di cura attualmente accettati), modifiche della terapia o trattamento con agenti mirati a specifiche lesioni genomiche.

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
TUTTA la caratterizzazione: Array a bassa densità
Lasso di tempo: 3 anni
I pazienti con LLA di nuova diagnosi presso l'UNMCCC saranno sottoposti a screening con scheda Low Density Array (LDA) (un classificatore di espressione genica per LLA Ph-simile) alla diagnosi iniziale. La proporzione dello stato LDA (positivo vs. negativo) e il relativo intervallo di confidenza al 95% saranno calcolati in base all'esatta distribuzione binomiale.
3 anni
Caratterizzazione di ALL: Sequenziamento di nuova generazione
Lasso di tempo: 3 anni
TUTTI i pazienti di nuova diagnosi presso l'UNMCCC verranno sottoposti al sequenziamento di nuova generazione (NGS) alla diagnosi iniziale. Verranno utilizzate NGS (esomiche e trascrittomiche) con una profondità di lettura sufficiente (500-700x) per rilevare l'eterogeneità clonale alla diagnosi. L’analisi statistica sarà principalmente descrittiva (es. verrà calcolata la frequenza (proporzione) delle varie mutazioni).
3 anni
Caratterizzazione di TUTTI: analisi SNP
Lasso di tempo: 3 anni
I pazienti ALL di nuova diagnosi presso l'UNMCCC saranno sottoposti alla determinazione molecolare degli antenati genetici (utilizzando un pannello di polimorfismi a singolo nucleotide (SNP)) alla diagnosi iniziale. L’analisi statistica sarà principalmente descrittiva (es. verrà calcolata la frequenza (proporzione) degli SNP e dei gruppi di discendenza genetica)
3 anni

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Relazione tra le caratteristiche del paziente e l'arruolamento nello studio
Lasso di tempo: 3 anni
La caratterizzazione genetica e molecolare descritta per le misure di esito primarie sarà riassunta per i pazienti arruolati negli studi clinici sull'NCTN e per coloro che non sono arruolati negli studi clinici sull'NCTN. I confronti tra due gruppi (NCTN vs. non NCTN) saranno testati utilizzando un approccio non parametrico come il test dei ranghi della somma di Wilcoxon.
3 anni
Relazione tra razza/etnia e risultato
Lasso di tempo: 3 anni
I dati relativi al tempo all'evento (come la sopravvivenza libera da progressione (PFS), determinata clinicamente) saranno riepilogati utilizzando le curve di Kaplan-Meier insieme al test log-rank da parte dei gruppi di trattamento, nonché la razza/etnia determinata attraverso la valutazione molecolare dell'ascendenza genetica come descritto nella Misura di esito primario 3. Il modello multivariabile dei rischi proporzionali di Cox sarà esplorato anche per la PFS con variabili di trattamento e/o etnia.
3 anni
Fattibilità di scoprire caratteristiche molecolari nella LLA con rilevanza terapeutica
Lasso di tempo: 3 anni
La fattibilità sarà valutata calcolando le seguenti statistiche: percentuale di pazienti arruolati negli studi NCTN, percentuale di pazienti con malattia minima residua (MRD) che sono stati completamente valutati nel tempo, percentuale di pazienti per i quali la caratterizzazione molecolare è fattibile e informativa nel corso del tempo. corso di trattamento. Tutte le proporzioni stimate saranno accompagnate da intervalli di confidenza esatti al 95%.
3 anni
Valutazione della malattia minima residua (MRD).
Lasso di tempo: 3 anni
La malattia minima residua (MRD) di induzione finale verrà eseguita utilizzando un test citometrico a flusso approvato dal Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA) presso il Children's Oncology Group University of Washington Reference Laboratory. La MRD molecolare sarà determinata anche utilizzando il sequenziamento profondo basato sulla ricerca. La MRD misurata ripetutamente in diversi punti temporali verrà riepilogata utilizzando statistiche descrittive (grafico a barre per lo stato Alto vs. Basso). Verranno valutate le associazioni tra la MRD e i gruppi di trattamento (LAD positivo vs. LAD negativo per i gruppi di trattamento NCTN e non NCTN), utilizzando l'esatto test Chi-quadrato di Pearson con simulazione Monte Carlo in ogni momento.
3 anni

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Jodi Mayfield, MD, University of New Mexico, Department of Pediatrics

Pubblicazioni e link utili

La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

28 luglio 2016

Completamento primario (Effettivo)

19 marzo 2022

Completamento dello studio (Effettivo)

20 ottobre 2022

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

5 ottobre 2015

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

16 ottobre 2015

Primo Inserito (Stimato)

20 ottobre 2015

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

11 gennaio 2024

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

9 gennaio 2024

Ultimo verificato

1 gennaio 2024

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

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