Терапия острого лимфобластного лейкоза, основанная на геномном анализе
Предыдущая работа, проведенная исследователями Комплексного онкологического центра Университета Нью-Мексико (UNMCCC), выявила ранее неизвестные геномные мутации у детей, подростков и молодых людей с острым лимфобластным лейкозом (ОЛЛ)-предшественником В- и Т-клеток высокого риска. Используя геномные технологии и технологии секвенирования ДНК нового поколения, эти исследователи обнаружили, что 14% детей с ОЛЛ высокого риска имеют ОЛЛ, подобный филадельфийской хромосоме («Филадельфийская хромосома»). Было обнаружено, что у пациентов с этой формой ОЛЛ значительно повышен риск неудачи лечения и смерти.
Дальнейшие исследования показали, что существует более 40 различных перестроек и слияний генов, которые могут привести к Ph-подобному ОЛЛ. Клеточные линии и лейкозные клетки человека, экспрессирующие некоторые из этих различных слияний генов, были чувствительны к доступным в настоящее время лекарствам. Это говорит о том, что пациенты с Ph-подобным ОЛЛ с этими специфическими слияниями генов должны стать целью будущих клинических исследований для лечения соответствующей терапией. Также необходима дальнейшая работа для выявления других потенциально целенаправленных генетических изменений у ВСЕХ пациентов.
Таким образом, цель этого исследования — провести геномный скрининг всех впервые диагностированных пациентов с ОЛЛ, наблюдаемых в UNM, и использовать эту информацию для включения пациентов в доступные клинические исследования Национальной сети клинических исследований (NCTN). Если соответствующее исследование NCTN недоступно, будет использовано лучшее клиническое лечение.
Обзор исследования
Статус
Условия
Вмешательство/лечение
Подробное описание
Работа, выполненная исследователями UNMCCC и другими лицами, кратко описанная выше, дала важное представление о биологических и клинических особенностях и геномном ландшафте Ph-подобного ОЛЛ, который поразительно гетерогенен. Профилирование экспрессии генов и секвенирование РНК/транскриптома, экзома и всего генома выявили несколько различных подклассов поражений, активирующих киназу, в 91% случаев Ph-подобного ОЛЛ, изученных на сегодняшний день, чаще всего это перестановки и слияния генов киназных и цитокиновых рецепторов. Исследователи UNMCCC в настоящее время сотрудничают с Группой детской онкологии (COG) и кооперативными группами Национального института рака для взрослых (NCI) (Юго-западная онкологическая группа (SWOG), Восточная кооперативная онкологическая группа (ECOG) - Сеть визуализации Американского колледжа радиологии (ACRIN), Альянс) для разработки национальных клинических исследований для детей, подростков и молодых людей (AYA) и взрослых пациентов с ОЛЛ, которые включают геномные диагностические скрининги, молекулярную диагностику и исследования секвенирования следующего поколения для выявления основных геномных поражений при ОЛЛ и нацеливания пациентов на соответствующее терапевтическое лечение. режимы.
В этом технико-экономическом обосновании технологии секвенирования следующего поколения (NGS) будут использоваться в системе классификации риска острого лимфобластного лейкоза, которая может быть адаптирована для выявления пациентов, которым может быть полезна таргетная терапия; такие пациенты будут направлены на участие в исследованиях национального лечения NCTN или исследованиях, спонсируемых UNMCCC, где это необходимо, посредством детального анализа геномных данных, выполняемого в условиях Коллегии американских патологов (CAP) / CLIA, и обсуждения отдельных случаев в Совете по молекулярным опухолям.
Кроме того, будет изучена связь расы и этнической принадлежности со спектром геномных мутаций, связанных с ALL, в Нью-Мексико и региональной популяции ALL, которая включает значительную долю недостаточно представленных меньшинств. В конечном итоге это может позволить разработать систему классификации рисков на основе происхождения.
Тип исследования
Регистрация (Действительный)
Фаза
- Непригодный
Контакты и местонахождение
Места учебы
-
-
New Mexico
-
Albuquerque, New Mexico, Соединенные Штаты, 87131
- University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
-
-
Критерии участия
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Ребенок
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Описание
Критерии включения:
- Новый диагноз острого лимфобластного лейкоза
- Отсутствие предшествующей терапии, за исключением экстренной лучевой терапии, стероидов или интратекального цитарабина.
- В любом возрасте
- Способность понимать и готовность подписать письменный документ об информированном согласии.
Критерий исключения:
- Предыдущая терапия, за исключением экстренной лучевой терапии, стероидов или интратекального цитарабина.
- Не желает получать онкологическую помощь в Университете Нью-Мексико.
Учебный план
Как устроено исследование?
Детали дизайна
- Основная цель: Уход
- Распределение: Н/Д
- Интервенционная модель: Одногрупповое задание
- Маскировка: Нет (открытая этикетка)
Оружие и интервенции
Группа участников / Армия |
Вмешательство/лечение |
|---|---|
|
Экспериментальный: Геномное тестирование
ВСЕ пациенты с впервые диагностированным ОЛЛ пройдут геномные исследования, перечисленные в основной задаче 1. Анализы будут проводиться на аспирате костного мозга (КМ) при первоначальном диагнозе (пациенты с абсолютным количеством бластов не менее 1000/мкл могут сдать 2 мл периферической крови). при постановке диагноза на каждый 1 мл необходимой БМ. У пациентов, у которых аспират не может быть получен, будет использоваться кор-биопсия). Кроме того, проточно-цитометрический анализ и глубокое секвенирование будут использоваться для характеристики и мониторинга молекулярной гетерогенности и клональной эволюции заболевания во время терапии первой линии. Образцы КМ, крови и щеки будут собраны на 29-й день индукционного лечения и, возможно, позднее, если произойдет рецидив. |
В зависимости от результатов геномного тестирования пациенты с целевыми геномными поражениями будут включены в доступные национальные клинические исследования, спонсируемые Национальной сетью клинических испытаний NCI (NCTN) (COG и другие кооперативные группы NCI для взрослых).
Если подходящего исследования NCTN не существует, будут рассмотрены соответствующие терапевтические схемы (включая принятые в настоящее время стандарты лечения), изменения в терапии или лечение таргетными агентами для конкретных геномных поражений.
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
ВСЕ характеристики: Массив низкой плотности
Временное ограничение: 3 года
|
Впервые диагностированные пациенты с ОЛЛ в UNMCCC пройдут скрининг карточной матрицей низкой плотности (LDA) (классификатор экспрессии генов для Ph-подобного ОЛЛ) при первоначальном диагнозе.
Доля статуса LDA (положительный и отрицательный) и его 95% доверительный интервал будут рассчитаны на основе точного биномиального распределения.
|
3 года
|
|
ВСЕ характеристики: секвенирование следующего поколения
Временное ограничение: 3 года
|
ВСЕ пациенты, у которых впервые диагностирован ВСЕ в UNMCCC, при первоначальном диагнозе будут подвергнуты секвенированию следующего поколения (NGS).
NGS (экзомный и транскриптомный) достаточной глубины считывания (500-700x) будет использоваться для обнаружения клональной гетерогенности при постановке диагноза.
Статистический анализ будет преимущественно описательным (например,
будет рассчитана частота (доля) различных мутаций).
|
3 года
|
|
ВСЕ характеристики: анализ SNP
Временное ограничение: 3 года
|
ВСЕ пациенты с впервые диагностированным ОЛЛ в UNMCCC будут подвергнуты молекулярному определению генетического происхождения (с использованием панели однонуклеотидных полиморфизмов (SNP)) при первоначальном диагнозе.
Статистический анализ будет преимущественно описательным (например,
будет рассчитана частота (доля) SNP и групп генетического происхождения)
|
3 года
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Связь характеристик пациентов с набором пациентов в исследование
Временное ограничение: 3 года
|
Генетическая и молекулярная характеристика, описанная для показателей первичного результата, будет суммирована для пациентов, участвующих в клинических исследованиях NCTN, и для тех, кто не участвует в клинических исследованиях NCTN.
Сравнение двух групп (NCTN и не-NCTN) будет проверено с использованием непараметрического подхода, такого как критерий суммы рангов Уилкоксона.
|
3 года
|
|
Связь между расой/этнической принадлежностью и результатом
Временное ограничение: 3 года
|
Данные о времени до события (такие как выживаемость без прогрессирования (ВБП), определенная клинически) будут суммированы с использованием кривых Каплана-Мейера вместе с лог-ранговым тестом по группам лечения, а также расовой/этнической принадлежности, определенной посредством молекулярной оценки генетического происхождения. как описано в разделе «Основной показатель результата 3». Многовариантная модель пропорциональных рисков Кокса также будет изучена для ВБП с переменными лечения и/или этнической принадлежности.
|
3 года
|
|
Возможность обнаружения молекулярных особенностей ОЛЛ, имеющих терапевтическое значение
Временное ограничение: 3 года
|
Осуществимость будет оцениваться путем расчета следующих статистических данных: процент пациентов, принявших участие в исследованиях NCTN, процент пациентов с минимальной остаточной болезнью (МОБ), которые полностью оценены с течением времени, процент пациентов, для которых молекулярная характеристика осуществима и информативна в течение периода времени. курс лечения.
Все оцененные доли будут сопровождаться точными 95% доверительными интервалами.
|
3 года
|
|
Оценка минимальной остаточной болезни (MRD)
Временное ограничение: 3 года
|
Конечная индукция минимальной остаточной болезни (MRD) будет проводиться с использованием проточно-цитометрического анализа, одобренного Поправками к усовершенствованию клинических лабораторий (CLIA), в Справочной лаборатории группы детской онкологии Вашингтонского университета.
Молекулярный MRD также будет определяться с использованием глубокого секвенирования на основе исследований.
MRD, неоднократно измеренный в разные моменты времени, будет суммирован с использованием описательной статистики (гистограмма для высокого и низкого статуса).
Взаимосвязь между MRD и группами лечения (LAD-положительная и LAD-отрицательная для групп лечения NCTN и Non-NCTN) будет оцениваться с использованием точного критерия хи-квадрат Пирсона с моделированием Монте-Карло в каждый момент времени.
|
3 года
|
Соавторы и исследователи
Спонсор
Следователи
- Главный следователь: Jodi Mayfield, MD, University of New Mexico, Department of Pediatrics
Публикации и полезные ссылки
Даты записи исследования
Изучение основных дат
Начало исследования (Действительный)
Первичное завершение (Действительный)
Завершение исследования (Действительный)
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
Первый опубликованный (Оцененный)
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
Последняя проверка
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Ключевые слова
Дополнительные соответствующие термины MeSH
Другие идентификационные номера исследования
- INST UNM 1503
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .