Akut lymfoblastisk leukemiterapier informerade av genomiska analyser
Tidigare arbete utfört av University of New Mexico Comprehensive Cancer Center (UNMCCC) utredare har avslöjat tidigare okända genomiska mutationer hos barn, ungdomar och unga vuxna med högrisk B- och T-cellprekursor akut lymfatisk leukemi (ALL). Genom att använda genomisk och nästa generations DNA-sekvenseringsteknologier avslöjade dessa utredare att 14% av barn med högrisk ALL har "Philadelphia kromosomliknande" ("Ph-liknande") ALL. Patienter med denna form av ALL visade sig ha en signifikant ökad risk för behandlingsmisslyckande och död.
Ytterligare arbete avslöjade att det finns mer än 40 distinkta genomarrangemang och fusioner som kan resultera i Ph-liknande ALL. Cellinjer och humana leukemiceller som uttrycker några av dessa olika genfusioner var känsliga för för närvarande tillgängliga läkemedel. Detta tyder på att Ph-liknande ALL-patienter med dessa specifika distinkta genfusioner bör riktas in i framtida kliniska prövningar för att behandlas med lämplig terapi. Ytterligare arbete behövs också för att identifiera andra potentiellt målbara genetiska förändringar hos ALL-patienter.
Därför är målet med denna studie att utföra genomisk screening av alla nyligen diagnostiserade ALL-patienter som ses vid UNM och att använda denna information för att registrera patienter till tillgängliga kliniska prövningar av National Clinical Trial Network (NCTN). Om en lämplig NCTN-prövning inte är tillgänglig, kommer bästa kliniska hantering att eftersträvas.
Studieöversikt
Status
Betingelser
Intervention / Behandling
Detaljerad beskrivning
Arbetet som utförts av UNMCCC-utredare och andra som beskrivs kort ovan har gett stora insikter i de biologiska och kliniska egenskaperna och det genomiska landskapet hos Ph-liknande ALL, som är slående heterogent. Genuttrycksprofilering och RNA/transkriptomisk, exom- och helgenomsekvensering har identifierat flera distinkta underklasser av kinasaktiverande lesioner i 91 % av de Ph-liknande ALL-fallen som studerats hittills, oftast omarrangemang och fusioner av kinas- och cytokinreceptorgen. UNMCCC:s utredare samarbetar nu med Children's Oncology Group (COG) och vuxna National Cancer Institute (NCI) Cooperative Groups (Southwest Oncology Group (SWOG), Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) - American College of Radiology Imaging Network (ACRIN), The Alliance) för att utveckla nationella kliniska prövningar för pediatriska, ungdomar och unga vuxna (AYA) och vuxna ALL-patienter som inkorporerar deras genomiska diagnostiska skärmar, molekylär diagnostik och nästa generations sekvenseringsstudier för att identifiera underliggande genomiska lesioner i ALL och rikta patienter till lämplig terapeutisk kurer.
I denna förstudie kommer nästa generations sekvenseringsteknik (NGS) att informera ett riskklassificeringssystem för akut lymfatisk leukemi, som kan anpassas för att identifiera patienter som kan dra nytta av riktade terapier; sådana patienter kommer att riktas mot NCTN National Treatment-prövningar eller UNMCCC-sponsrade prövningar där så är lämpligt, genom detaljerad genomisk dataanalys utförd under College of American Pathologists (CAP)/CLIA-förhållanden och i individuella falldiskussioner i en Molecular Tumor Board.
Dessutom kommer sambandet mellan ras och etnicitet med spektrumet av ALL-associerade genomiska mutationer i New Mexico och regional ALL-population, som inkluderar en betydande andel av underrepresenterade minoriteter, att studeras. Detta kan i slutändan möjliggöra utvecklingen av ett härkomstbaserat riskklassificeringssystem.
Studietyp
Inskrivning (Faktisk)
Fas
- Inte tillämpbar
Kontakter och platser
Studieorter
-
-
New Mexico
-
Albuquerque, New Mexico, Förenta staterna, 87131
- University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
-
-
Deltagandekriterier
Urvalskriterier
Åldrar som är berättigade till studier
- Barn
- Vuxen
- Äldre vuxen
Tar emot friska volontärer
Beskrivning
Inklusionskriterier:
- Ny diagnos av akut lymfatisk leukemi
- Ingen tidigare behandling, exklusive akutstrålning, steroider eller intratekalt cytarabin
- Vilken ålder som helst
- Förmåga att förstå och vilja att underteckna ett skriftligt informerat samtycke.
Exklusions kriterier:
- Tidigare behandling, exklusive akutstrålning, steroider eller intratekal cytarabin
- Inte villig att få cancervård vid University of New Mexico
Studieplan
Hur är studien utformad?
Designdetaljer
- Primärt syfte: Behandling
- Tilldelning: N/A
- Interventionsmodell: Enskild gruppuppgift
- Maskning: Ingen (Open Label)
Vapen och interventioner
Deltagargrupp / Arm |
Intervention / Behandling |
|---|---|
|
Experimentell: Genomisk testning
Nydiagnostiserade ALL-patienter kommer att genomgå genomiska studier listade i primärt mål 1. Analyser kommer att utföras på ett benmärgsaspirat (BM) vid initial diagnos (patienter med ett absolut blastantal på minst 1 000/μL, kan lämna in 2 mL perifert blod vid diagnos för varje 1 ml av erforderlig BM. Hos patienter där aspiratet inte kan erhållas kommer en kärnbiopsi att användas). Dessutom kommer flödescytometrisk analys och djupsekvensering att användas för att karakterisera och övervaka sjukdomens molekylära heterogenitet och klonala utveckling under frontlinjebehandling. BM-, blod- och buckala prover kommer att tas på dag 29 av induktionsbehandlingen och eventuellt vid en senare tidpunkt om återfall inträffar. |
Beroende på resultaten av genomiska tester kommer patienter med genomiska lesioner att inkluderas i tillgängliga nationella kliniska prövningar som sponsras av NCI National Clinical Trials Network (NCTN) (COG och andra vuxna NCI Cooperative Groups).
Om det inte finns någon lämplig NCTN-studie, kommer lämpliga terapeutiska regimer (inklusive för närvarande accepterade vårdstandarder), förändringar i terapi eller behandling med riktade medel mot specifika genomiska lesioner att övervägas.
|
Vad mäter studien?
Primära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
ALL karakterisering: Low Density Array
Tidsram: 3 år
|
Nydiagnostiserade ALL-patienter vid UNMCCC kommer att genomgå Low Density Array (LDA)-kortscreening (en genuttrycksklassificerare för Ph-liknande ALL) vid initial diagnos.
Andelen LDA-status (positiv vs. negativ) och dess 95 % konfidensintervall kommer att beräknas baserat på den exakta binomialfördelningen.
|
3 år
|
|
ALL karakterisering: Next Generation Sequencing
Tidsram: 3 år
|
Nydiagnostiserade ALL-patienter vid UNMCCC kommer att genomgå Next Generation Sequencing (NGS) vid initial diagnos.
NGS (exomisk och transkriptomisk) med tillräckligt läsdjup (500-700x) kommer att användas för att detektera klonal heterogenitet vid diagnos.
Statistisk analys kommer i första hand att vara beskrivande (t.ex.
frekvens (andel) av olika mutationer kommer att beräknas).
|
3 år
|
|
ALL karakterisering: SNP-analys
Tidsram: 3 år
|
Nydiagnostiserade ALL-patienter vid UNMCCC kommer att genomgå Molecular Determination of Genetic Ancestry (med en panel av enkelnukleotidpolymorfismer (SNP)) vid initial diagnos.
Statistisk analys kommer i första hand att vara beskrivande (t.ex.
frekvens (andel) av SNP och genetiska härkomstgrupper kommer att beräknas)
|
3 år
|
Sekundära resultatmått
Resultatmått |
Åtgärdsbeskrivning |
Tidsram |
|---|---|---|
|
Förhållandet mellan patientegenskaper och försöksregistrering
Tidsram: 3 år
|
Genetisk och molekylär karakterisering enligt beskrivningen för de primära utfallsmåtten kommer att sammanfattas för patienter som är inskrivna i NCTN kliniska prövningar och för de som inte är inskrivna i NCTN kliniska prövningar.
De två gruppjämförelserna (NCTN vs icke-NCTN) kommer att testas med hjälp av icke-parametriskt tillvägagångssätt såsom Wilcoxon summa rank test.
|
3 år
|
|
Samband mellan ras/etnicitet och utfall
Tidsram: 3 år
|
Tid-till-händelsedata (såsom Progressionsfri överlevnad (PFS), bestämt kliniskt) kommer att sammanfattas med hjälp av Kaplan-Meier-kurvor tillsammans med log-rank test av behandlingsgrupperna samt ras/etnicitet bestäms genom molekylär bedömning av genetisk härkomst som beskrivs i Primärt resultatmått 3. Multivariabel Cox Proportional Hazards-modell kommer också att undersökas för PFS med behandlings- och/eller etnicitetsvariabler.
|
3 år
|
|
Möjlighet att upptäcka molekylära egenskaper hos ALLA med terapeutisk relevans
Tidsram: 3 år
|
Genomförbarhet kommer att bedömas genom beräkning av följande statistik: procent av patienterna som registrerade sig i NCTN-studier, procent av patienter med minimal återstående sjukdom (MRD) som är fullständigt utvärderade över tid, procent av patienter för vilka molekylär karakterisering är genomförbar och informativ över behandlingskurs.
Alla uppskattade proportioner kommer att åtföljas av exakta 95 % konfidensintervall
|
3 år
|
|
Minimal Residual Disease (MRD) utvärdering
Tidsram: 3 år
|
Slut-induktion Minimal Residual Disease (MRD) kommer att utföras med en Clinical Laboratory Improvement Amendments (CLIA)-godkänd flödescytometrisk analys vid Children's Oncology Group University of Washingtons referenslaboratorium.
Molekylär MRD kommer också att bestämmas med hjälp av forskningsbaserad djupsekvensering.
MRD upprepade gånger mätt över tidpunkter kommer att sammanfattas med hjälp av beskrivande statistik (stapeldiagram för hög vs. låg status).
Samband mellan MRD och behandlingsgrupperna (LAD Positive vs. LAD Negative för NCTN- och Non-NCTN-behandlingsgrupper), med det exakta Pearson Chi-Square-testet med Monte Carlo-simulering vid varje tidpunkt kommer att bedömas.
|
3 år
|
Samarbetspartners och utredare
Sponsor
Utredare
- Huvudutredare: Jodi Mayfield, MD, University of New Mexico, Department of Pediatrics
Publikationer och användbara länkar
Studieavstämningsdatum
Studera stora datum
Studiestart (Faktisk)
Primärt slutförande (Faktisk)
Avslutad studie (Faktisk)
Studieregistreringsdatum
Först inskickad
Först inskickad som uppfyllde QC-kriterierna
Första postat (Beräknad)
Uppdateringar av studier
Senaste uppdatering publicerad (Faktisk)
Senaste inskickade uppdateringen som uppfyllde QC-kriterierna
Senast verifierad
Mer information
Termer relaterade till denna studie
Nyckelord
Ytterligare relevanta MeSH-villkor
Andra studie-ID-nummer
- INST UNM 1503
Plan för individuella deltagardata (IPD)
Planerar du att dela individuella deltagardata (IPD)?
Denna information hämtades direkt från webbplatsen clinicaltrials.gov utan några ändringar. Om du har några önskemål om att ändra, ta bort eller uppdatera dina studieuppgifter, vänligen kontakta register@clinicaltrials.gov. Så snart en ändring har implementerats på clinicaltrials.gov, kommer denna att uppdateras automatiskt även på vår webbplats .