Terapie akutní lymfoblastické leukémie na základě genomických analýz
Předchozí práce, kterou provedli vyšetřovatelé Komplexního onkologického centra University of New Mexico (UNMCCC), odhalila dosud neznámé genomové mutace u dětí, dospívajících a mladých dospělých s vysoce rizikovou akutní lymfoblastickou leukémií (ALL) prekurzorů B a T buněk. Pomocí genomických technologií a technologií sekvenování DNA nové generace tito výzkumníci odhalili, že 14 % dětí s vysoce rizikovou ALL má ALL „podobnou chromozomu Philadelphia“ („Ph-like“). U pacientů s touto formou ALL bylo zjištěno významně zvýšené riziko selhání léčby a úmrtí.
Další práce odhalila, že existuje více než 40 odlišných genových přeuspořádání a fúzí, které mohou vést k ALL podobné Ph. Buněčné linie a lidské leukemické buňky exprimující některé z těchto různých genových fúzí byly citlivé na aktuálně dostupná léčiva. To naznačuje, že pacienti s ALL podobnou Ph s těmito specifickými odlišnými genovými fúzemi by se měli v budoucích klinických studiích zaměřit na léčbu vhodnou terapií. Další práce je také zapotřebí k identifikaci dalších potenciálně cílených genetických změn u pacientů s ALL.
Cílem této studie je proto provést genomický screening všech nově diagnostikovaných pacientů s ALL pozorovaných na UNM a použít tyto informace k zařazení pacientů do dostupných klinických studií National Clinical Trial Network (NCTN). Pokud není k dispozici vhodná studie NCTN, bude se snažit o nejlepší klinický management.
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Intervence / Léčba
Detailní popis
Práce provedená vyšetřovateli UNMCCC a dalšími, jak je stručně popsáno výše, poskytla hlavní pohled na biologické a klinické rysy a genomickou krajinu Ph-like ALL, která je nápadně heterogenní. Profilování genové exprese a sekvenování RNA/transkriptomické, exomové a celého genomu identifikovalo několik odlišných podtříd lézí aktivujících kinázu v 91 % dosud studovaných případů ALL podobných Ph, nejčastěji přeuspořádání a fúze genů kináz a cytokinových receptorů. Vyšetřovatelé UNMCCC nyní spolupracují s Dětskou onkologickou skupinou (COG) a Kooperativními skupinami National Cancer Institute (NCI) pro dospělé (Southwest Oncology Group (SWOG), Eastern Cooperative Oncology Group (ECOG) – American College of Radiology Imaging Network (ACRIN), The Alliance) k vývoji národních klinických studií pro pediatrické, adolescentní a mladé dospělé (AYA) a dospělé pacienty s ALL, které zahrnují jejich genomické diagnostické screeningy, molekulární diagnostiku a sekvenační studie nové generace k identifikaci základních genomových lézí u ALL a zacílení pacientů na vhodnou terapeutickou léčbu. režimy.
V této studii proveditelnosti budou technologie sekvenování nové generace (NGS) informovat o klasifikačním systému rizik akutní lymfoblastické leukémie, který může být přizpůsoben k identifikaci pacientů, kteří by mohli mít prospěch z cílených terapií; takoví pacienti budou zacíleni na studie NCTN National Treatment nebo studie sponzorované UNMCCC tam, kde to bude vhodné, prostřednictvím podrobné analýzy genomických dat provedené v rámci podmínek College of American Pathologists (CAP)/CLIA a v jednotlivých případech diskusí v Molecular Tumor Board.
Kromě toho bude studována asociace rasy a etnického původu se spektrem genomových mutací souvisejících s ALL v Novém Mexiku a regionální populaci ALL, která zahrnuje významný podíl nedostatečně zastoupených menšin. To může v konečném důsledku umožnit vývoj systému klasifikace rizik založeného na předcích.
Typ studie
Zápis (Aktuální)
Fáze
- Nelze použít
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
New Mexico
-
Albuquerque, New Mexico, Spojené státy, 87131
- University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dítě
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Nová diagnóza akutní lymfoblastické leukémie
- Žádná předchozí terapie, s výjimkou nouzového ozařování, steroidů nebo intratekálního cytarabinu
- Jakýkoli věk
- Schopnost porozumět a ochota podepsat písemný informovaný souhlas.
Kritéria vyloučení:
- Předchozí terapie, s výjimkou nouzového ozařování, steroidů nebo intratekálního cytarabinu
- Není ochoten získat onkologickou péči na University of New Mexico
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Primární účel: Léčba
- Přidělení: N/A
- Intervenční model: Přiřazení jedné skupiny
- Maskování: Žádné (otevřený štítek)
Zbraně a zásahy
Skupina účastníků / Arm |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Experimentální: Genomické testování
Nově diagnostikovaní pacienti s ALL podstoupí genomické studie uvedené v primárním cíli 1. Analýzy budou provedeny na aspirátu kostní dřeně (BM) při prvotní diagnóze (pacienti s absolutním počtem blastů alespoň 1 000/μl mohou odevzdat 2 ml periferní krve při diagnóze na každý 1 ml požadovaného BM. U pacientů, u kterých nelze získat aspirát, se použije jádrová biopsie). Kromě toho bude k charakterizaci a sledování molekulární heterogenity a klonální evoluce onemocnění během terapie první linie použita průtoková cytometrická analýza a hluboké sekvenování. Vzorky BM, krve a bukální dutiny budou odebrány 29. den indukční léčby a možná i později, pokud dojde k relapsu. |
V závislosti na výsledcích genomického testování budou pacienti s cílitelnými genomickými lézemi zařazeni do dostupných národních klinických studií, které jsou sponzorovány sítí NCI National Clinical Trials Network (NCTN) (COG a další kooperativní skupiny dospělých NCI).
Pokud neexistuje žádná vhodná studie NCTN, budou zváženy vhodné terapeutické režimy (včetně aktuálně uznávaných standardů péče), změny terapie nebo léčba cílenými látkami na specifické genomové léze.
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
VŠECHNY charakterizace: Low Density Array
Časové okno: 3 roky
|
Nově diagnostikovaní pacienti s ALL v UNMCCC podstoupí při počáteční diagnóze screening karty Low Density Array (LDA) (klasifikátor genové exprese pro Ph-like ALL).
Podíl stavu LDA (pozitivní vs. negativní) a jeho 95% interval spolehlivosti bude vypočítán na základě přesné binomické distribuce.
|
3 roky
|
|
VŠECHNY charakterizace: Next Generation Sequencing
Časové okno: 3 roky
|
Nově diagnostikovaní všichni pacienti v UNMCCC podstoupí při počáteční diagnóze sekvenování nové generace (NGS).
NGS (exomická a transkriptomická) s dostatečnou hloubkou čtení (500-700x) bude použita k detekci klonální heterogenity při diagnóze.
Statistická analýza bude primárně popisná (např.
bude vypočítána frekvence (podíl) různých mutací).
|
3 roky
|
|
Charakterizace ALL: SNP analýza
Časové okno: 3 roky
|
Nově diagnostikovaní ALL pacienti v UNMCCC podstoupí molekulární stanovení genetického původu (pomocí panelu jednonukleotidových polymorfismů (SNP)) při počáteční diagnóze.
Statistická analýza bude primárně popisná (např.
frekvence (proporce) SNP a genetické skupiny předků budou vypočteny)
|
3 roky
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Vztah charakteristik pacienta k zařazení do studie
Časové okno: 3 roky
|
Genetická a molekulární charakterizace, jak je popsána u primárních výstupních opatření, bude shrnuta pro pacienty, kteří jsou zařazeni do klinických studií NCTN, a pro ty, kteří nejsou zařazeni do klinických studií NCTN.
Srovnání dvou skupin (NCTN vs. non-NCTN) budou testována pomocí neparametrického přístupu, jako je Wilcoxonův sumární test.
|
3 roky
|
|
Vztah mezi rasou/etnickou příslušností a výsledkem
Časové okno: 3 roky
|
Údaje o čase do události (jako je přežití bez progrese (PFS), stanovené klinicky) budou shrnuty pomocí Kaplanových-Meierových křivek spolu s log-rank testem léčenými skupinami, stejně jako rasa/etnická příslušnost určená pomocí molekulárního hodnocení genetického původu. jak je popsáno v Primárním výstupním opatření 3. Pro PFS bude také zkoumán multivariabilní Coxův model proporcionálních rizik s léčebnými a/nebo etnickými proměnnými.
|
3 roky
|
|
Proveditelnost objevu molekulárních vlastností u ALL s terapeutickým významem
Časové okno: 3 roky
|
Proveditelnost bude posouzena výpočtem následujících statistik: procento pacientů, kteří se zapsali do studií NCTN, procento pacientů s minimální reziduální nemocí (MRD), kteří jsou kompletně vyhodnoceni v průběhu času, procento pacientů, pro které je molekulární charakterizace proveditelná a informativní v průběhu léčebný kurz.
Všechny odhadované podíly budou doprovázeny přesnými 95% intervaly spolehlivosti
|
3 roky
|
|
Hodnocení minimálního reziduálního onemocnění (MRD).
Časové okno: 3 roky
|
End-indduction Minimal Residual Disease (MRD) bude prováděno pomocí průtokového cytometrického testu schváleného CLIA (Clinical Laboratory Improvement Addments) v referenční laboratoři Children's Oncology Group University of Washington.
Molekulární MRD bude také stanovena pomocí hloubkového sekvenování založeného na výzkumu.
Opakovaně měřená MRD napříč časovými body bude sumarizována pomocí deskriptivní statistiky (sloupkový graf pro stav Vysoká vs. Nízká).
Budou hodnoceny asociace mezi MRD a léčebnými skupinami (LAD pozitivní vs. LAD negativní pro NCTN a non-NCTN léčebné skupiny), za použití přesného Pearsonova Chi-Square testu se simulací Monte Carlo v každém časovém bodě.
|
3 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Jodi Mayfield, MD, University of New Mexico, Department of Pediatrics
Publikace a užitečné odkazy
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Aktuální)
Dokončení studie (Aktuální)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Odhadovaný)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- INST UNM 1503
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .