Akuutin lymfoblastisen leukemian hoidot genomianalyysien perusteella
New Mexicon yliopiston Comprehensive Cancer Centerin (UNMCCC) tutkijoiden aikaisempi työ on paljastanut aiemmin tuntemattomia genomimutaatioita lapsilla, nuorilla ja nuorilla aikuisilla, joilla on korkea riski B- ja T-soluprekursorien akuutti lymfoblastinen leukemia (ALL). Genomisia ja seuraavan sukupolven DNA-sekvensointitekniikoita käyttämällä nämä tutkijat paljastivat, että 14 prosentilla lapsista, joilla on korkea riski ALL, on "Philadelphia-kromosomin kaltainen" ("Ph-kaltainen") ALL. Potilailla, joilla oli tämä ALL-muoto, havaittiin merkittävästi lisääntyneen hoidon epäonnistumisen ja kuoleman riski.
Lisätyö osoitti, että on olemassa yli 40 erillistä geenien uudelleenjärjestelyä ja fuusiota, jotka voivat johtaa Ph:n kaltaiseen ALL:iin. Solulinjat ja ihmisen leukeemiset solut, jotka ilmentävät joitain näistä erilaisista geenifuusioista, olivat herkkiä tällä hetkellä saatavilla oleville lääkkeille. Tämä viittaa siihen, että Ph:n kaltaiset ALL-potilaat, joilla on nämä spesifiset erilliset geenifuusiot, tulisi kohdentaa tulevissa kliinisissä tutkimuksissa asianmukaisella hoidolla. Lisätyötä tarvitaan myös muiden mahdollisesti kohdistettavien geneettisten muutosten tunnistamiseksi ALL-potilailla.
Siksi tämän tutkimuksen tavoitteena on suorittaa genominen seulonta kaikille äskettäin diagnosoiduille ALL-potilaille, jotka nähdään UNM:ssä, ja käyttää näitä tietoja potilaiden rekisteröimiseksi saatavilla oleviin National Clinical Trial Network (NCTN) kliinisiin tutkimuksiin. Jos asianmukaista NCTN-tutkimusta ei ole saatavilla, pyritään parhaaseen kliiniseen hoitoon.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
YK:n UNMCCC:n tutkijoiden ja muiden suorittama työ, kuten yllä on kuvattu lyhyesti, on tarjonnut merkittäviä näkemyksiä Ph-kaltaisen ALL:n biologisista ja kliinisistä ominaisuuksista ja genomisesta maisemasta, joka on hämmästyttävän heterogeeninen. Geeniekspression profilointi ja RNA/transkriptominen, eksomin ja koko genomin sekvensointi ovat tunnistaneet useita erillisiä kinaasia aktivoivien leesioiden alaluokkia 91 %:ssa tähän mennessä tutkituista Ph-kaltaisista ALL-tapauksista, yleisimmin kinaasi- ja sytokiinireseptorigeenien uudelleenjärjestelyt ja fuusiot. UNMCCC:n tutkijat tekevät nyt yhteistyötä Children's Oncology Groupin (COG) ja aikuisten kansallisen syöpäinstituutin (NCI) yhteistyöryhmien (Southwest Oncology Group (SWOG), Eastern Cooperative Oncology Groupin (ECOG) – American College of Radiology Imaging Network (ACRIN) – kanssa. Alliance) kehittää kansallisia kliinisiä tutkimuksia lapsi-, nuoriso- ja nuorille aikuisille (AYA) ja aikuisille ALL-potilaille, jotka sisältävät heidän genomisen diagnostiset seulonnan, molekyylidiagnostiikan ja seuraavan sukupolven sekvensointitutkimukset taustalla olevien genomivaurioiden tunnistamiseksi ALL:ssa ja kohdistaakseen potilaat asianmukaiseen hoitoon hoito-ohjelmat.
Tässä toteutettavuustutkimuksessa seuraavan sukupolven sekvensointitekniikat (NGS) antavat tietoa akuutin lymfoblastisen leukemian riskien luokitusjärjestelmästä, jota voidaan mukauttaa tunnistamaan potilaat, jotka saattavat hyötyä kohdistetuista hoidoista. Tällaiset potilaat kohdistetaan tarvittaessa NCTN National Treatment -tutkimuksiin tai UNMCCC:n sponsoroimiin tutkimuksiin yksityiskohtaisen genomitietojen analyysin avulla, joka suoritetaan College of American Pathologists (CAP)/CLIA-olosuhteissa ja yksittäisissä tapauksissa keskusteluissa Molecular Tumor Boardissa.
Lisäksi tutkitaan rodun ja etnisen alkuperän yhteyttä ALL:iin liittyvien genomimutaatioiden spektriin New Mexicossa ja alueellisessa ALL-väestössä, johon kuuluu merkittävä osa aliedustettuja vähemmistöjä. Tämä saattaa viime kädessä mahdollistaa sukujuureen perustuvan riskiluokitusjärjestelmän kehittämisen.
Opintotyyppi
Ilmoittautuminen (Todellinen)
Vaihe
- Ei sovellettavissa
Yhteystiedot ja paikat
Opiskelupaikat
-
-
New Mexico
-
Albuquerque, New Mexico, Yhdysvallat, 87131
- University of New Mexico Comprehensive Cancer Center
-
-
Osallistumiskriteerit
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Uusi diagnoosi akuutista lymfoblastisesta leukemiasta
- Ei aikaisempaa hoitoa, lukuun ottamatta hätäsäteilyä, steroideja tai intratekaalista sytarabiinia
- Minkä ikäisen tahansa
- Kyky ymmärtää ja halukkuus allekirjoittaa kirjallinen tietoinen suostumusasiakirja.
Poissulkemiskriteerit:
- Aikaisempi hoito, lukuun ottamatta hätäsäteilyä, steroideja tai intratekaalista sytarabiinia
- Ei halua saada syöpähoitoa New Mexicon yliopistossa
Opintosuunnitelma
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
- Ensisijainen käyttötarkoitus: Hoito
- Jako: Ei käytössä
- Inventiomalli: Yksittäinen ryhmätehtävä
- Naamiointi: Ei mitään (avoin tarra)
Aseet ja interventiot
Osallistujaryhmä / Arm |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Kokeellinen: Genominen testaus
Äskettäin diagnosoidut ALL-potilaat läpikäyvät ensisijaisessa tavoitteessa 1 luetellut genomitutkimukset. Analyysit suoritetaan luuytimen (BM) aspiraatilla alkuperäisen diagnoosin yhteydessä (potilaat, joiden absoluuttinen blastimäärä on vähintään 1 000/μl, voivat lähettää 2 ml perifeeristä verta diagnoosin yhteydessä jokaista 1 ml:aa vaadittua BM:ää kohti. Potilaille, joilta aspiraattia ei saada, käytetään ydinbiopsiaa). Lisäksi virtaussytometristä analyysiä ja syväsekvensointia käytetään taudin molekyylien heterogeenisyyden ja kloonaalisen evoluution karakterisointiin ja seurantaan etulinjan hoidon aikana. BM-, veri- ja bukkaalinäytteet otetaan induktiohoidon päivänä 29 ja mahdollisesti myöhemmässä vaiheessa, jos uusiutumista tapahtuu. |
Genomitestien tuloksista riippuen potilaat, joilla on kohdistettavia genomisia vaurioita, kirjataan saatavilla oleviin kansallisiin kliinisiin tutkimuksiin, joita sponsoroi NCI National Clinical Trials Network (NCTN) (COG ja muut aikuisten NCI:n yhteistyöryhmät).
Jos sopivaa NCTN-tutkimusta ei ole, harkitaan asianmukaisia hoito-ohjelmia (mukaan lukien tällä hetkellä hyväksytyt hoitostandardit), hoidon muutoksia tai hoitoa kohdennetuilla aineilla tiettyihin genomivaurioihin.
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
KAIKKI luonnehdinnat: Low Density Array
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Äskettäin diagnosoidut ALL-potilaat UNMCCC:ssä käyvät läpi Low Density Array (LDA) -korttiseulonnan (Ph-kaltaisen ALL:n geenin ilmentymisen luokitin) alustavan diagnoosin yhteydessä.
LDA-tilan osuus (positiivinen vs. negatiivinen) ja sen 95 %:n luottamusväli lasketaan tarkan binomiaalisen jakauman perusteella.
|
3 vuotta
|
|
KAIKKI luonnehdinnat: Next Generation Sequencing
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Äskettäin diagnosoidut ALL-potilaat UNMCCC:ssä läpikäyvät seuraavan sukupolven sekvensoinnin (NGS) ensimmäisen diagnoosin yhteydessä.
Riittävän lukusyvyyden (500-700x) NGS:ää (eksominen ja transkriptominen) käytetään klonaalisen heterogeenisyyden havaitsemiseen diagnoosin yhteydessä.
Tilastollinen analyysi on ensisijaisesti kuvaavaa (esim.
eri mutaatioiden taajuus (osuus) lasketaan).
|
3 vuotta
|
|
KAIKKI karakterisointi: SNP-analyysi
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Äskettäin diagnosoidut ALL-potilaat UNMCCC:ssä läpikäyvät geneettisen alkuperän molekyylimäärityksen (käyttämällä yhden nukleotidin polymorfismien (SNP) paneelia) alkuperäisen diagnoosin yhteydessä.
Tilastollinen analyysi on ensisijaisesti kuvaavaa (esim.
SNP:iden ja geneettisten esi-isien ryhmien esiintymistiheys (osuus) lasketaan)
|
3 vuotta
|
Toissijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Potilaan ominaisuuksien suhde tutkimukseen ilmoittautumiseen
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Geneettinen ja molekyylinen karakterisointi, joka on kuvattu Primary Outcome Measures -kohdassa, tehdään yhteenveto potilaista, jotka ovat mukana NCTN-kliinisissä tutkimuksissa ja niille, jotka eivät ole mukana NCTN-kliinisissä tutkimuksissa.
Kaksi ryhmävertailua (NCTN vs. ei-NCTN) testataan käyttämällä ei-parametrista lähestymistapaa, kuten Wilcoxonin summa rank -testiä.
|
3 vuotta
|
|
Rodun/etnisen alkuperän ja lopputuloksen välinen suhde
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Aika-tapahtumaan liittyvät tiedot (kuten kliinisesti määritetty etenemisvapaa eloonjääminen (PFS)) tehdään yhteenveto käyttäen Kaplan-Meier-käyriä sekä hoitoryhmien log-rank-testiä sekä rotua/etnistä alkuperää, joka määritetään geneettisen syntyperän molekulaarisella arvioinnilla. Kuten on kuvattu Primary Outcome Measure 3:ssa. Monimuuttuja Cox Proportional Hazards -mallia tutkitaan myös PFS:lle hoito- ja/tai etniseen alkuperään liittyvien muuttujien kanssa.
|
3 vuotta
|
|
Mahdollisuus löytää molekyylipiirteitä KAIKISTA, joilla on terapeuttista merkitystä
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
Toteutettavuus arvioidaan laskemalla seuraavat tilastot: prosenttiosuus potilaista, jotka osallistuivat NCTN-tutkimuksiin, prosenttiosuus potilaista, joilla on minimaalinen jäännössairaus (MRD), jotka on arvioitu täysin ajan myötä, prosenttiosuus potilaista, joille molekyylien karakterisointi on mahdollista ja informatiivinen koko ajan. hoitokurssi.
Kaikkiin arvioituihin suhteisiin liittyy tarkat 95 %:n luottamusvälit
|
3 vuotta
|
|
Minimal Residual Disease (MRD) -arviointi
Aikaikkuna: 3 vuotta
|
End-induktion Minimal Residual Disease (MRD) suoritetaan käyttämällä Clinical Laboratory Improvement Changes (CLIA) -hyväksyttyä virtaussytometristä määritystä Washingtonin yliopiston Children's Oncology Groupin vertailulaboratoriossa.
Molecular MRD määritetään myös käyttämällä tutkimukseen perustuvaa syväsekvensointia.
Toistuvasti aikapisteiden välillä mitattu MRD tehdään yhteenveto käyttämällä kuvaavia tilastoja (pylväsdiagrammi High vs. Low -tilasta).
MRD:n ja hoitoryhmien välisiä assosiaatioita (LAD-positiivinen vs. LAD-negatiivinen NCTN- ja ei-NCTN-hoitoryhmille) arvioidaan käyttämällä tarkkaa Pearsonin Chi-Square-testiä ja Monte Carlo -simulaatiota kullakin ajankohtana.
|
3 vuotta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Jodi Mayfield, MD, University of New Mexico, Department of Pediatrics
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Hyödyllisiä linkkejä
Opintojen ennätyspäivät
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Ensimmäinen Lähetetty (Arvioitu)
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Viimeksi vahvistettu
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Avainsanat
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- INST UNM 1503
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .