치료 결과 개선을 위한 차세대 염기서열 분석을 통한 골수성 암의 유전자 돌연변이 스크리닝

유전적 돌연변이는 골수암(급성 골수성 백혈병, 골수이형성 증후군 및 골수증식성 신생물 포함)의 병인 및 예후와 밀접한 관련이 있습니다. 최근 몇 년 동안 다양한 유전적 돌연변이를 표적으로 하는 다수의 새로운 치료제가 개발되었습니다. 예를 들어, FLT3-ITD 및 IDH2 돌연변이가 있는 환자는 각각 미도스타우린 및 에나시데닙으로부터 이점을 얻는 것으로 나타났습니다. 또한, TP53 변이 환자는 한때 매우 높은 위험군으로 분류되었는데, 저메틸화제인 데시타빈에 호의적으로 반응하는 것으로 밝혀졌습니다. 오늘날 전통적인 Sanger 방법으로 다양한 종류의 암 돌연변이를 탐지하는 것은 시간 소모적일 뿐만 아니라 비용 효율적이지 않습니다. NGS(next generation sequencing)의 등장으로 패널 유전자 돌연변이를 보다 빠르고 정확하며 경제적으로 검출할 수 있게 되었습니다.

이 연구에서 조사관은 사내에서 설계된 표적 NGS 패널을 사용하여 골수암 참가자의 골수 관련 유전자 돌연변이를 선별하고 분석합니다. 환자의 혈액 또는 골수 표본에서 전체 핵산을 추출한 다음 다중 PCR 증폭을 기반으로 라이브러리 준비 절차를 거칩니다. 시퀀싱은 Illumina MiSeq 시퀀서에서 수행되며 그 결과는 당사에서 개발한 생물정보 워크플로우를 사용하여 분석됩니다. 간단히 말해서, 시퀀싱된 읽기는 BWA-mem을 사용하여 인간 참조 게놈 hg19에 정렬되고 Mutect2로 호출된 체세포 돌연변이입니다. 변형은 RefSeq, dbSNP, 1000 Genome Project, COSMIC 및 ClinVar 데이터베이스와 함께 SnpEff를 통해 주석이 추가됩니다. 연구자들은 위에서 언급한 골수성 암의 돌연변이 환경을 구축하고 이러한 돌연변이가 임상 결과와 어떻게 연결되는지 조사하는 것을 목표로 합니다.