건강한 흡연자와 COPD 환자의 마이크로바이옴 분석
2020년 4월 3일 업데이트: Sei Won Lee, Asan Medical Center
이 연구는 건강한 흡연자와 만성 폐쇄성 폐질환(COPD) 환자로부터 3년 동안 몇 달마다 가래와 대변 샘플을 수집하여 마이크로바이옴 코호트를 구축하는 것입니다.
이 연구의 목적은 다양한 샘플(예:
가래, 대변) 건강한 흡연자와 COPD 환자의 차이점을 설명합니다.
연구 개요
상세 설명
장-폐 축 이론이 도입된 후, 광범위한 연구에서 건강한 흡연자와 COPD 환자 사이에서 호흡기 샘플 또는 폐 조직을 형성하는 미생물의 다양성이 밝혀졌습니다.
이전 연구에서 건강한 흡연자와 COPD 환자 사이의 폐 조직에서 마이크로바이옴 구성의 뚜렷한 차이가 보고되었습니다.
이번 연구는 서울아산병원 추적관리 중인 건강한 흡연자와 만성폐쇄성폐질환(COPD) 환자를 대상으로 3년 동안 몇 달 간격으로 가래와 분변 검체를 채취해 마이크로바이옴 코호트를 구축하는 것이다.
이 연구의 목적은 다양한 샘플(예:
가래, 대변) 건강한 흡연자와 COPD 환자의 차이점을 설명합니다.
이 연구는 인간의 내장-폐 축 모델을 확립하는 데 도움이 될 것입니다.
연구 유형
관찰
등록 (예상)
60
연락처 및 위치
이 섹션에서는 연구를 수행하는 사람들의 연락처 정보와 이 연구가 수행되는 장소에 대한 정보를 제공합니다.
연구 장소
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Seoul, 대한민국, 138-736
- Department of Pulmonary and Critical Care Medicine and Clinical Research Center for Chronic Obstructive Airway Diseases, Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
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참여기준
연구원은 적격성 기준이라는 특정 설명에 맞는 사람을 찾습니다. 이러한 기준의 몇 가지 예는 개인의 일반적인 건강 상태 또는 이전 치료입니다.
자격 기준
공부할 수 있는 나이
18년 이상 (성인, OLDER_ADULT)
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
예
연구 대상 성별
모두
샘플링 방법
비확률 샘플
연구 인구
건강한 흡연자 흡연력이 10갑년 이상이고 폐활량 측정값이 정상인 건강한 흡연자
COPD 환자 최소 10갑년 이상의 흡연력이 있고 완전히 가역적이지 않은 지속적인 기류 제한이 있는 환자(예: 기관지 확장제 후 1초간 강제 호기량/강제 폐활량(FEV1/FVC) <0.7)
설명
포함 기준:
- 10갑년 이상의 흡연력이 있는 환자
- 완전히 가역적이지 않은 지속적인 기류 제한이 있는 환자(예: 기관지 확장제 후 1초간 강제 호기량/강제 폐활량(FEV1/FVC) <0.7)
제외 기준:
- 연구 결과에 영향을 줄 수 있는 동반 질환이 있는 환자(예: 악성 종양, 울혈성 심부전, 뇌혈관 장애, 만성 신부전, 심각한 합병증이 있는 당뇨병 또는 조절되지 않는 고혈압)
- 폐쇄성 폐질환 이외의 호흡기 질환(예: 이전 폐절제술, 결핵에 의한 파괴된 폐, 기관지확장증 등)이 있는 환자
공부 계획
이 섹션에서는 연구 설계 방법과 연구가 측정하는 내용을 포함하여 연구 계획에 대한 세부 정보를 제공합니다.
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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건강한 흡연자
흡연력이 10갑년 이상이고 폐활량 측정값이 정상인 건강한 흡연자
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참가자로부터 샘플을 얻습니다.
추가 개입이 필요하지 않습니다.
획득한 샘플은 추가로 분석됩니다.
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COPD 환자
10 pack-year 이상의 흡연력이 있고 완전히 가역적이지 않은 지속적인 기류 제한(예:
기관지 확장제 후 1초간 강제 호기량/강제 폐활량(FEV1/FVC) <0.7)
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참가자로부터 샘플을 얻습니다.
추가 개입이 필요하지 않습니다.
획득한 샘플은 추가로 분석됩니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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운영 분류 단위(OTU) 정량 분석으로 측정한 알파 다양성
기간: 평균 3개월
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DNA Isolation Kit를 사용하여 각 환자의 각 샘플에서 DNA를 추출합니다.
16S 범용 프라이머는 PCR(polymerase chain reaction) 시스템으로 16S 리보솜 리보핵산(rRNA) 유전자의 증폭에 사용됩니다.
증폭 후 GREENGENES 데이터베이스를 이용하여 시퀀싱을 수행한 후 MDx-Pro 소프트웨어(Ver.1,
대한민국 서울).
이러한 서열의 분류학적 할당은 3%의 운영 분류학적 단위(OTU) 컷오프로 수행됩니다.
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평균 3개월
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Metagenomic 분석에 의한 Microbiome 구성
기간: 평균 3개월
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마이크로바이옴의 구성은 막대 그래프로 표시됩니다.
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평균 3개월
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
|---|---|---|
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Shannon 다양성 지수와 Simpson 지수로 설명되는 생물다양성
기간: 평균 3개월
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Shannon 지수와 Simpson 지수는 metagenomic 데이터를 사용하여 계산됩니다.
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평균 3개월
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주성분 분석(PCA)에 의해 기술된 생물다양성
기간: 평균 3개월
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PCA는 97% 유사성으로 클러스터링된 모든 16S rRNA 유전자 읽기에 대해 수행됩니다.
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평균 3개월
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공동 작업자 및 조사자
여기에서 이 연구와 관련된 사람과 조직을 찾을 수 있습니다.
수사관
- 수석 연구원: Sei Won Lee, M.D. Ph.D., University of Ulsan College of Medicine, Asan Medical Center
간행물 및 유용한 링크
연구에 대한 정보 입력을 담당하는 사람이 자발적으로 이러한 간행물을 제공합니다. 이것은 연구와 관련된 모든 것에 관한 것일 수 있습니다.
일반 간행물
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Morris A, Beck JM, Schloss PD, Campbell TB, Crothers K, Curtis JL, Flores SC, Fontenot AP, Ghedin E, Huang L, Jablonski K, Kleerup E, Lynch SV, Sodergren E, Twigg H, Young VB, Bassis CM, Venkataraman A, Schmidt TM, Weinstock GM; Lung HIV Microbiome Project. Comparison of the respiratory microbiome in healthy nonsmokers and smokers. Am J Respir Crit Care Med. 2013 May 15;187(10):1067-75. doi: 10.1164/rccm.201210-1913OC.
- Cabrera-Rubio R, Garcia-Nunez M, Seto L, Anto JM, Moya A, Monso E, Mira A. Microbiome diversity in the bronchial tracts of patients with chronic obstructive pulmonary disease. J Clin Microbiol. 2012 Nov;50(11):3562-8. doi: 10.1128/JCM.00767-12. Epub 2012 Aug 22.
연구 기록 날짜
이 날짜는 ClinicalTrials.gov에 대한 연구 기록 및 요약 결과 제출의 진행 상황을 추적합니다. 연구 기록 및 보고된 결과는 공개 웹사이트에 게시되기 전에 특정 품질 관리 기준을 충족하는지 확인하기 위해 국립 의학 도서관(NLM)에서 검토합니다.
연구 주요 날짜
연구 시작 (예상)
2020년 4월 6일
기본 완료 (예상)
2023년 12월 31일
연구 완료 (예상)
2023년 12월 31일
연구 등록 날짜
최초 제출
2020년 4월 3일
QC 기준을 충족하는 최초 제출
2020년 4월 3일
처음 게시됨 (실제)
2020년 4월 7일
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
2020년 4월 7일
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
2020년 4월 3일
마지막으로 확인됨
2020년 4월 1일
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
키워드
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- Microbiome cohort
개별 참가자 데이터(IPD) 계획
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아니요
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
아니
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
아니
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