- ICH GCP
- Rejestr badań klinicznych w USA
- Badanie kliniczne NCT04336423
Analiza mikrobiomu zdrowych palaczy i chorych na POChP
Przegląd badań
Status
Interwencja / Leczenie
Szczegółowy opis
Typ studiów
Zapisy (Oczekiwany)
Kontakty i lokalizacje
Lokalizacje studiów
-
-
-
Seoul, Republika Korei, 138-736
- Department of Pulmonary and Critical Care Medicine and Clinical Research Center for Chronic Obstructive Airway Diseases, Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
-
-
Kryteria uczestnictwa
Kryteria kwalifikacji
Wiek uprawniający do nauki
Akceptuje zdrowych ochotników
Płeć kwalifikująca się do nauki
Metoda próbkowania
Badana populacja
Zdrowy palacz Zdrowi palacze z historią palenia co najmniej 10 paczkolat i prawidłowym wynikiem spirometrycznym
Pacjenci z POChP Pacjenci z paleniem tytoniu w wywiadzie trwającym co najmniej 10 paczkolat i utrzymującym się ograniczeniem przepływu powietrza przez drogi oddechowe, które nie było w pełni odwracalne (np. natężona objętość wydechowa po podaniu leku rozszerzającego oskrzela w ciągu 1 sekundy/natężona pojemność życiowa (FEV1/FVC) <0,7)
Opis
Kryteria przyjęcia:
- Pacjenci z historią palenia co najmniej 10 paczkolat
- Pacjenci z trwałym ograniczeniem przepływu powietrza przez drogi oddechowe, które nie było w pełni odwracalne (np. natężona objętość wydechowa po podaniu leku rozszerzającego oskrzela w ciągu 1 sekundy/natężona pojemność życiowa (FEV1/FVC) <0,7)
Kryteria wyłączenia:
- Pacjenci ze współistniejącą chorobą, która może wpływać na wyniki badania (np. nowotwór złośliwy, zastoinowa niewydolność serca, zaburzenia naczyniowo-mózgowe, przewlekła niewydolność nerek, cukrzyca z ciężkimi powikłaniami lub niekontrolowane nadciśnienie)
- Pacjenci z chorobami układu oddechowego innymi niż obturacyjna choroba płuc (np. po wcześniejszej resekcji płuc, płuca zniszczone gruźlicą i rozstrzeni oskrzeli)
Plan studiów
Jak projektuje się badanie?
Szczegóły projektu
Kohorty i interwencje
Grupa / Kohorta |
Interwencja / Leczenie |
|---|---|
|
Zdrowy palacz
Zdrowi palacze z historią palenia co najmniej 10 paczkolat i prawidłowym wynikiem spirometrii
|
Próbki pobierane są od uczestników.
Nie jest wymagana dalsza interwencja.
Pobrane próbki będą dalej analizowane.
|
|
Pacjent z POChP
Pacjenci z historią palenia tytoniu trwającą co najmniej 10 paczkolat i uporczywym ograniczeniem przepływu powietrza przez drogi oddechowe, które nie było w pełni odwracalne (np.
natężona objętość wydechowa po podaniu leku rozszerzającego oskrzela w ciągu 1 sekundy/natężona pojemność życiowa (FEV1/FVC) <0,7)
|
Próbki pobierane są od uczestników.
Nie jest wymagana dalsza interwencja.
Pobrane próbki będą dalej analizowane.
|
Co mierzy badanie?
Podstawowe miary wyniku
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Różnorodność alfa mierzona za pomocą analizy ilościowej operacyjnej jednostki taksonomicznej (OTU).
Ramy czasowe: Średnio 3 miesiące
|
DNA jest ekstrahowane z każdej próbki od każdego pacjenta przy użyciu zestawu do izolacji DNA.
Uniwersalne startery 16S służą do amplifikacji genów 16S rybosomalnego kwasu rybonukleinowego (rRNA) w systemie reakcji łańcuchowej polimerazy (PCR).
Po amplifikacji przeprowadza się sekwencjonowanie przy użyciu bazy danych GREENGENES, po czym analiza metagenomiczna została przeprowadzona przez korporację MD Healthcare przy użyciu oprogramowania MDx-Pro (Ver.1,
Seul, Korea Południowa).
Przypisanie taksonomiczne tych sekwencji odbywa się z odcięciem operacyjnej jednostki taksonomicznej (OTU) wynoszącej 3%.
|
Średnio 3 miesiące
|
|
Skład mikrobiomu metodą analizy metagenomicznej
Ramy czasowe: Średnio 3 miesiące
|
Skład mikrobiomu przedstawiono w postaci wykresu słupkowego.
|
Średnio 3 miesiące
|
Miary wyników drugorzędnych
Miara wyniku |
Opis środka |
Ramy czasowe |
|---|---|---|
|
Różnorodność biologiczna opisana indeksem różnorodności Shannona i indeksem Simpsona
Ramy czasowe: Średnio 3 miesiące
|
Indeks Shannona i indeks Simpsona oblicza się przy użyciu danych metagenomicznych.
|
Średnio 3 miesiące
|
|
Różnorodność biologiczna opisana za pomocą analizy głównych składników (PCA)
Ramy czasowe: Średnio 3 miesiące
|
PCA przeprowadza się dla wszystkich odczytów genu 16S rRNA zgrupowanych z 97% podobieństwem.
|
Średnio 3 miesiące
|
Współpracownicy i badacze
Sponsor
Śledczy
- Główny śledczy: Sei Won Lee, M.D. Ph.D., University of Ulsan College of Medicine, Asan Medical Center
Publikacje i pomocne linki
Publikacje ogólne
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Morris A, Beck JM, Schloss PD, Campbell TB, Crothers K, Curtis JL, Flores SC, Fontenot AP, Ghedin E, Huang L, Jablonski K, Kleerup E, Lynch SV, Sodergren E, Twigg H, Young VB, Bassis CM, Venkataraman A, Schmidt TM, Weinstock GM; Lung HIV Microbiome Project. Comparison of the respiratory microbiome in healthy nonsmokers and smokers. Am J Respir Crit Care Med. 2013 May 15;187(10):1067-75. doi: 10.1164/rccm.201210-1913OC.
- Cabrera-Rubio R, Garcia-Nunez M, Seto L, Anto JM, Moya A, Monso E, Mira A. Microbiome diversity in the bronchial tracts of patients with chronic obstructive pulmonary disease. J Clin Microbiol. 2012 Nov;50(11):3562-8. doi: 10.1128/JCM.00767-12. Epub 2012 Aug 22.
Daty zapisu na studia
Główne daty studiów
Rozpoczęcie studiów (OCZEKIWANY)
Zakończenie podstawowe (OCZEKIWANY)
Ukończenie studiów (OCZEKIWANY)
Daty rejestracji na studia
Pierwszy przesłany
Pierwszy przesłany, który spełnia kryteria kontroli jakości
Pierwszy wysłany (RZECZYWISTY)
Aktualizacje rekordów badań
Ostatnia wysłana aktualizacja (RZECZYWISTY)
Ostatnia przesłana aktualizacja, która spełniała kryteria kontroli jakości
Ostatnia weryfikacja
Więcej informacji
Terminy związane z tym badaniem
Słowa kluczowe
Dodatkowe istotne warunki MeSH
Inne numery identyfikacyjne badania
- Microbiome cohort
Plan dla danych uczestnika indywidualnego (IPD)
Planujesz udostępniać dane poszczególnych uczestników (IPD)?
Informacje o lekach i urządzeniach, dokumenty badawcze
Bada produkt leczniczy regulowany przez amerykańską FDA
Bada produkt urządzenia regulowany przez amerykańską FDA
Te informacje zostały pobrane bezpośrednio ze strony internetowej clinicaltrials.gov bez żadnych zmian. Jeśli chcesz zmienić, usunąć lub zaktualizować dane swojego badania, skontaktuj się z register@clinicaltrials.gov. Gdy tylko zmiana zostanie wprowadzona na stronie clinicaltrials.gov, zostanie ona automatycznie zaktualizowana również na naszej stronie internetowej .
Badania kliniczne na Choroba płuc, przewlekła obturacja
-
Spero TherapeuticsZakończonyKompleks Mycobacterium Avium | Niegruźlicze Mycobacterium Pulmonary DiseaseStany Zjednoczone