- ICH GCP
- US Clinical Trials Registry
- Klinisk utprøving NCT04336423
Analyse av mikrobiomet hos friske røykere og KOLS-pasienter
3. april 2020 oppdatert av: Sei Won Lee, Asan Medical Center
Denne studien skal bygge en mikrobiom-kohort ved å samle sputum- og fekale prøver med noen måneders mellomrom i tre år fra friske røykere og pasienter med kronisk obstruktiv lungesykdom (KOLS).
Målet med denne studien er å analysere sammensetningen av mikrobiom av forskjellige prøver (f.
sputum, avføring) og beskriv forskjellen mellom friske røykere og KOLS-pasienter.
Studieoversikt
Status
Har ikke rekruttert ennå
Intervensjon / Behandling
Detaljert beskrivelse
Etter introduksjonen av tarm-lunge-akseteorien avslørte omfattende studier mangfoldet av mikrobiomer blant friske røykere og KOLS-pasienter fra luftveisprøver eller lungevev.
I den forrige studien ble det rapportert tydelig forskjell i sammensetning av mikrobiom i lungevev mellom friske røykere og KOLS-pasienter.
Denne studien er å bygge en mikrobiom-kohort ved å samle sputum- og fekale prøver med noen måneders mellomrom i tre år fra friske røykere og pasienter med kronisk obstruktiv lungesykdom (KOLS) som følges opp av Asan Medical Center.
Målet med denne studien er å analysere sammensetningen av mikrobiom av forskjellige prøver (f.
sputum, avføring) og beskriv forskjellen mellom friske røykere og KOLS-pasienter.
Denne studien vil bidra til å etablere en tarm-lunge-aksemodell hos mennesker.
Studietype
Observasjonsmessig
Registrering (Forventet)
60
Kontakter og plasseringer
Denne delen inneholder kontaktinformasjon for de som utfører studien, og informasjon om hvor denne studien blir utført.
Studiesteder
-
-
-
Seoul, Korea, Republikken, 138-736
- Department of Pulmonary and Critical Care Medicine and Clinical Research Center for Chronic Obstructive Airway Diseases, Asan Medical Center, University of Ulsan College of Medicine
-
-
Deltakelseskriterier
Forskere ser etter personer som passer til en bestemt beskrivelse, kalt kvalifikasjonskriterier. Noen eksempler på disse kriteriene er en persons generelle helsetilstand eller tidligere behandlinger.
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
18 år og eldre (VOKSEN, OLDER_ADULT)
Tar imot friske frivillige
Ja
Kjønn som er kvalifisert for studier
Alle
Prøvetakingsmetode
Ikke-sannsynlighetsprøve
Studiepopulasjon
Frisk røyker Friske røykere med røykehistorie på minst 10 pakkeår og normal spirometriverdi
KOLS-pasient Pasienter med røykehistorie på minst 10 pakningsår og vedvarende luftstrømsbegrensning som ikke var fullt reversibel (f. post-bronkodilatator tvungen ekspirasjonsvolum på 1 sekund/tvungen vital kapasitet (FEV1/FVC) <0,7)
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
- Pasienter med røykehistorie på minst 10 pakkeår
- Pasienter med vedvarende luftstrømsbegrensning som ikke var fullt reversibel (f. post-bronkodilatator tvungen ekspirasjonsvolum på 1 sekund/tvungen vital kapasitet (FEV1/FVC) <0,7)
Ekskluderingskriterier:
- Pasienter med samtidige sykdommer som ville forstyrre studieresultatene (f.eks. malignitet, kongestiv hjertesvikt, cerebrovaskulære lidelser, kronisk nyresvikt, diabetes med alvorlige komplikasjoner eller ukontrollert hypertensjon)
- Pasienter med andre luftveissykdommer enn obstruktiv lungesykdom (f.eks. tidligere pulmonal reseksjon, tuberkuloseødelagt lunge og bronkiektasi)
Studieplan
Denne delen gir detaljer om studieplanen, inkludert hvordan studien er utformet og hva studien måler.
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
Intervensjon / Behandling |
|---|---|
|
Sunn røyker
Friske røykere med røykehistorie på minst 10 pakkeår og normal spirometriverdi
|
Prøver innhentes fra deltakerne.
Ingen ytterligere inngrep er nødvendig.
Innhentede prøver vil bli videre analysert.
|
|
KOLS pasient
Pasienter med røykehistorie på minst 10 pakkeår og vedvarende luftstrømsbegrensning som ikke var fullt reversibel (f.
post-bronkodilatator tvungen ekspirasjonsvolum på 1 sekund/tvungen vital kapasitet (FEV1/FVC) <0,7)
|
Prøver innhentes fra deltakerne.
Ingen ytterligere inngrep er nødvendig.
Innhentede prøver vil bli videre analysert.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Alfa-diversitet målt ved kvantitativ analyse av operasjonell taksonomisk enhet (OTU).
Tidsramme: Gjennomsnittlig 3 måneder
|
DNA ekstraheres fra hver prøve fra hver pasient ved å bruke et DNA-isolasjonssett.
16S universelle primere brukes til amplifisering av 16S ribosomale ribonukleinsyre (rRNA) gener med polymerasekjedereaksjon (PCR) system.
Etter amplisering utføres sekvensering ved å bruke GREENGENES-databasen, hvoretter en metagenomisk analyse ble utført av MD Healthcare-selskapet ved bruk av MDx-Pro-programvare (Ver.1,
Seoul, Sør-Korea).
Taksonomisk tilordning av disse sekvensene utføres med en operasjonell taksonomisk enhet (OTU) cutoff på 3%.
|
Gjennomsnittlig 3 måneder
|
|
Mikrobiomsammensetning ved metagenomisk analyse
Tidsramme: Gjennomsnittlig 3 måneder
|
Sammensetningen av mikrobiom presenteres som søylediagram.
|
Gjennomsnittlig 3 måneder
|
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Biologisk mangfold beskrevet av Shannon-diversitetsindeksen og Simpson-indeksen
Tidsramme: Gjennomsnittlig 3 måneder
|
Shannon-indeksen og Simpson-indeksen beregnes ved å bruke metagenomiske data.
|
Gjennomsnittlig 3 måneder
|
|
Biologisk mangfold beskrevet av Principal Component Analysis (PCA)
Tidsramme: Gjennomsnittlig 3 måneder
|
PCA utføres for alle 16S rRNA-genavlesninger samlet med 97 % likhet.
|
Gjennomsnittlig 3 måneder
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Det er her du vil finne personer og organisasjoner som er involvert i denne studien.
Sponsor
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Sei Won Lee, M.D. Ph.D., University of Ulsan College of Medicine, Asan Medical Center
Publikasjoner og nyttige lenker
Den som er ansvarlig for å legge inn informasjon om studien leverer frivillig disse publikasjonene. Disse kan handle om alt relatert til studiet.
Generelle publikasjoner
- Erb-Downward JR, Thompson DL, Han MK, Freeman CM, McCloskey L, Schmidt LA, Young VB, Toews GB, Curtis JL, Sundaram B, Martinez FJ, Huffnagle GB. Analysis of the lung microbiome in the "healthy" smoker and in COPD. PLoS One. 2011 Feb 22;6(2):e16384. doi: 10.1371/journal.pone.0016384.
- Kim HJ, Kim YS, Kim KH, Choi JP, Kim YK, Yun S, Sharma L, Dela Cruz CS, Lee JS, Oh YM, Lee SD, Lee SW. The microbiome of the lung and its extracellular vesicles in nonsmokers, healthy smokers and COPD patients. Exp Mol Med. 2017 Apr 14;49(4):e316. doi: 10.1038/emm.2017.7.
- Morris A, Beck JM, Schloss PD, Campbell TB, Crothers K, Curtis JL, Flores SC, Fontenot AP, Ghedin E, Huang L, Jablonski K, Kleerup E, Lynch SV, Sodergren E, Twigg H, Young VB, Bassis CM, Venkataraman A, Schmidt TM, Weinstock GM; Lung HIV Microbiome Project. Comparison of the respiratory microbiome in healthy nonsmokers and smokers. Am J Respir Crit Care Med. 2013 May 15;187(10):1067-75. doi: 10.1164/rccm.201210-1913OC.
- Cabrera-Rubio R, Garcia-Nunez M, Seto L, Anto JM, Moya A, Monso E, Mira A. Microbiome diversity in the bronchial tracts of patients with chronic obstructive pulmonary disease. J Clin Microbiol. 2012 Nov;50(11):3562-8. doi: 10.1128/JCM.00767-12. Epub 2012 Aug 22.
Studierekorddatoer
Disse datoene sporer fremdriften for innsending av studieposter og sammendragsresultater til ClinicalTrials.gov. Studieposter og rapporterte resultater gjennomgås av National Library of Medicine (NLM) for å sikre at de oppfyller spesifikke kvalitetskontrollstandarder før de legges ut på det offentlige nettstedet.
Studer hoveddatoer
Studiestart (FORVENTES)
6. april 2020
Primær fullføring (FORVENTES)
31. desember 2023
Studiet fullført (FORVENTES)
31. desember 2023
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
3. april 2020
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
3. april 2020
Først lagt ut (FAKTISKE)
7. april 2020
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (FAKTISKE)
7. april 2020
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
3. april 2020
Sist bekreftet
1. april 2020
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- Microbiome cohort
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
NEI
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Nei
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Nei
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .