포도막 흑색종의 형태학적, 유전적 및 종양 미세환경 특성 (MicroGenUM)
포도막 흑색종의 형태학적, 유전적 및 종양 미세환경 특성과 전이 및 사망률의 발달에 미치는 영향.
이 연구의 목적은 포도막 흑색종의 형태-표현형 평가와 질병 중증도, 종양 진행 및 치료에 대한 반응과 관련될 수 있는 분자 예후 인자를 식별하는 것입니다.
이러한 목표는 면역조직화학적 및 유전적 분석을 통해 달성될 것입니다.
연구 개요
상세 설명
질병의 단계에 관계없이 수술 표본의 조직은 포르말린에 고정되고 임상 실습을 위해 이미 수집된 샘플의 파라핀에 포함되며 Fondazione Policlinico Universitario A의 병리 해부학 UOC 기록 보관소에 보관됩니다. Gemelli IRCCS는 다음 용도로 사용됩니다. 연구 목적으로 이러한 샘플을 사용하는 것에 대한 환자의 정보에 입각한 동의가 있어야 합니다. UOC Anatomia Patologica는 아카이브 자료(슬라이드)의 복구를 처리합니다.
임상 실습에 의해 준비될 가명화된 슬라이드는 면역조직화학적 분석을 위해 피렌체에 있는 Azienda Ospedaliero-Universitaria Careggi의 병리 조직학 및 분자 진단 연구소로 보내지며, 이는 아래 보고된 대로 수행됩니다. 다음 분석이 수행되면 슬라이드가 폐기됩니다.
FFPE 샘플에서 파생된 3μm 두께의 섹션은 면역조직화학적 분석을 위해 준비됩니다. 자동 면역염색기(Ventana Discovery ULTRA, Ventana Medical Systems, Tucson, AZ)를 사용하여 샘플 처리를 수행할 것입니다. 절편은 EZ prep(#950-102; Ventana Medical Systems, Tucson, AZ)에서 탈파라핀 처리한 후 Cell Conditioning 1(CC1) 완충액(#950-124; Ventana Medical Systems, Tucson, AZ)으로 처리하여 항원 회복을 촉진합니다. 마지막으로 원하는 염색에 따라 1차 항체가 분배되고 Ultramap 항마우스 또는 항토끼 검출 키트로 신호가 생성됩니다. TME 특성화를 위해 샘플은 CD3, CD4, CD8, CD68, CD163과 같은 1차 항체로 염색됩니다. IHC로 처리된 모든 섹션은 Aperio AT2 플랫폼(Leica Biosystems, Wetzlar, DE)을 사용하여 전체 슬라이드 이미지(WSI)에서 디지털 방식으로 스캔됩니다. 플로렌스 대학에서 수행될 디지털 병리학은 고도로 표준화된 접근 방식을 사용하여 디지털 이미지를 정량적으로 분석합니다. 면역 세포 간의 상호 작용을 정량적으로 측정하고 상대적인 공간 분포를 특성화할 수 있습니다. 또한 MU의 TME를 심층적으로 연구할 수 있는 추가 정보를 생성할 수 있습니다.
University of Florence에 있는 HALO 이미지 분석 플랫폼은 i) 세포 정량화, 마킹 강도 평가, 세포 구획(핵, 세포질, 막) 인식; ii) 종양 내 및 주변 부분에서 세포의 상대적 분포를 식별하여 공간 분석; iii) 디지털 이미지와 함께 생성된 데이터베이스 공유.
단일 또는 다중 IHC로 라벨링된 샘플은 TME를 구성하는 다양한 세포 하위 집합을 특성화하기 위해 이 자동 디지털 정량화 시스템을 사용하여 평가됩니다. 다중 면역조직화학과 디지털 분석을 결합하여 데이터를 정확하게 분석하여 새로운 서명을 찾기 위한 새로운 분석 작업 흐름을 생성합니다. 디지털 분석에서 파생된 모든 데이터는 MU의 병리학에서 새로운 예후 인자를 식별하기 위해 병리학의 진행과 상관 관계가 있습니다.
임상 실습에서 정기적으로 수행되기 때문에 데이터가 이미 우리에게 제공되는 세포유전학적 변이의 식별을 위한 분석은 Fondazione Policlinico Gemelli의 유전학 연구소에서 연구에 등록한 전체 환자 코호트에서 신선한 조직 샘플에 대해 수행되었습니다. 임상 실습에 따라 수술실에서 촬영합니다. Agilent Technologies의 올리고뉴클레오티드 플랫폼에서 Array-CGH 방법을 사용했습니다. MU 샘플의 종양 DNA는 임상 실습에 따라 Gentra Pure Gene 상용 키트(QIAGEN)를 사용하여 추출했습니다. 일단 추출되면 얻은 DNA의 양과 순도를 평가했습니다. 품질에 적합한 것으로 간주되는 모든 샘플은 Agilent Technologies에서 지정한 프로토콜에 따라 처리되었습니다. 얻은 데이터는 Cytogenomics 소프트웨어를 사용하여 분석되었습니다. 이러한 분석을 통해 종양의 유전형 특성을 얻을 수 있습니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Monica Maria Pagliara, MD,PhD
- 전화번호: 0630154528
- 이메일: oncologiaoculare@policlinicogemelli.it
연구 장소
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Rome, 이탈리아, 00168
- 모병
- Monica Maria Pagliara - Oncologia Oculare
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연락하다:
- Monica Maria Pagliara, MD
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
설명
포함 기준:
- 18세 이상
- 포도막 흑색종의 임상 및 조직학적 진단;
- 포르말린 고정 파라핀 포매 조직(FFPE)을 얻을 수 있는 능력.
- 제핵 또는 미세 바늘 생검으로 얻은 종양 조직에서 유전자 분석 결과의 가용성.
- 제핵 또는 미세 바늘 생검으로부터 최소 5년의 추적 관찰.
- 연구 목적으로 데이터를 사용하기 위한 서면 동의서.
제외 기준:
- 연령 < 18세;
- 선택된 환자에 대한 충분한 임상 데이터 부족.
- 5년 미만의 후속 조치.
- 연구 목적을 위한 데이터 처리에 대한 정보에 입각한 동의를 거부합니다.
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
개입 / 치료 |
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회고적 코호트
조직학적 및 세포유전학적 분석을 받고 있는 포도막 흑색종으로 진단된 환자.
안종양과에 의뢰된 환자들 중에서 증례를 확인하고 추적관찰을 마쳤다.
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Agilent Technologies의 올리고뉴클레오티드 플랫폼에서 Array-CGH 방법을 사용했습니다.
MU 샘플의 종양 DNA는 임상 실습에 따라 Gentra Pure Gene 상용 키트(QIAGEN)를 사용하여 추출했습니다.
추출한 후 얻은 DNA의 양과 순도를 평가했습니다.
품질에 적합한 것으로 간주되는 모든 샘플은 Agilent Technologies에서 지정한 프로토콜에 따라 처리되었습니다.
얻은 데이터는 Cytogenomics 소프트웨어를 사용하여 분석되었습니다.
이러한 분석을 통해 종양의 유전형 특성을 얻을 수 있습니다.
디지털 병리학은 고도로 표준화된 접근 방식을 사용하여 디지털 이미지의 정량적 분석을 가능하게 하는 새로운 분야입니다.
면역 세포 간의 상호 작용을 정량적으로 측정하고 상대적인 공간 분포를 특성화할 수 있습니다.
또한, 포도막 흑색종의 종양 미세 환경에 대한 심도 있는 연구를 가능하게 하는 추가 정보를 생성할 수 있습니다.
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예상 코호트
조직학적 및 세포유전학적 분석을 받고 있는 포도막 흑색종으로 진단된 환자.
사례는 안구 종양학에 회부된 환자에서 확인되며 여전히 후속 조치를 완료해야 합니다.
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Agilent Technologies의 올리고뉴클레오티드 플랫폼에서 Array-CGH 방법을 사용했습니다.
MU 샘플의 종양 DNA는 임상 실습에 따라 Gentra Pure Gene 상용 키트(QIAGEN)를 사용하여 추출했습니다.
추출한 후 얻은 DNA의 양과 순도를 평가했습니다.
품질에 적합한 것으로 간주되는 모든 샘플은 Agilent Technologies에서 지정한 프로토콜에 따라 처리되었습니다.
얻은 데이터는 Cytogenomics 소프트웨어를 사용하여 분석되었습니다.
이러한 분석을 통해 종양의 유전형 특성을 얻을 수 있습니다.
디지털 병리학은 고도로 표준화된 접근 방식을 사용하여 디지털 이미지의 정량적 분석을 가능하게 하는 새로운 분야입니다.
면역 세포 간의 상호 작용을 정량적으로 측정하고 상대적인 공간 분포를 특성화할 수 있습니다.
또한, 포도막 흑색종의 종양 미세 환경에 대한 심도 있는 연구를 가능하게 하는 추가 정보를 생성할 수 있습니다.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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포도막 흑색종의 형태 표현형 평가(Digital Pathology - array-CGH)
기간: 5 년
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연구의 주요 목적은 포도막 흑색종의 형태-표현형 평가입니다.
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5 년
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2차 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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질병 중증도와 상관관계가 있을 수 있는 분자적 예후 인자를 확인하고,
기간: 5 년
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질병 중증도, 종양 진행 및 치료에 대한 반응과 관련될 수 있는 분자적 예후 인자를 식별합니다.
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5 년
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전체 응답률(ORR) 평가
기간: 5 년
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1, 3년 및 5년차의 ORR(년)
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5 년
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무진행 생존(PFS) 평가
기간: 5 년
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1,3,5세 PFS(년)
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5 년
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공동 작업자 및 조사자
간행물 및 유용한 링크
일반 간행물
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포도막 흑색종에 대한 임상 시험
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