신경내분비 종양에 대한 바이오마커로서의 신경내분비 표현형의 EpigenOMic 결정인자
신경내분비 종양의 비침습적 진단을 위한 바이오마커로서의 신경내분비 표현형의 EpigenOMic 결정인자
연구 개요
상태
상세 설명
GEP-NEN은 상대적으로 활동이 없고 더 공격적인 종양을 포함하며 때로는 혼합 외분비/내분비 구성 요소(MINEN)를 포함하는 이질적인 질병 그룹입니다. 진단과 치료의 지속적인 불확실성으로 인해 혼합형과 보다 공격적인 형태의 예후는 여전히 좋지 않습니다. 비침습적 테스트를 통해 시간이 지남에 따라 적시에 식별하고 모니터링할 수 있습니다. 그들의 생물학과 표현형 분화 과정에 대한 더 나은 이해는 새로운 치료법의 길을 열어줄 수 있습니다. 분화는 전사 프로그램을 형성하는 후성유전적 환경의 변화를 따르고 그 변화로부터 추론될 수 있습니다. 후성유전학적 마커 중에서 DNA 메틸화는 순환 종양 DNA(ctDNA)에서 측정할 수 있으므로 비침습적 검출에 특히 적합합니다. ONT(Oxford Nanopore Technologies)와 같은 새로운 기술은 최근 Magi et al Nat Comms Biol 2022에서 보여준 것처럼 DNA 서열과 메틸화의 동시 분석을 가능하게 합니다. 이전 연구에서는 뚜렷한 신경내분비 외분비 전사체 지형이 확인되었지만 종양 표본에서 수행되었으며(Yachida et al Cancer Discov 2022), 이는 주변의 비종양 또는 외분비 종양 세포로 인한 소음과 신경내분비 종양 세포 내에서 특이적으로 생성된 신호의 구별을 방해했습니다. 이제 이 문제는 냉동 또는 파라핀 포매 환자 샘플에서 직접 단일 세포 서열을 분석할 수 있는 방법으로 해결될 수 있습니다.
주요 예상 결과는 GEP-NEN 및 MiNEN의 검출 및 모니터링을 위한 새로운 액체 생검 분석법의 개발입니다. 이를 위해 우리는 ONT(Oxford Nanopore Technologies) 시퀀싱 기능을 활용하여 시퀀싱과 메틸화된 DNA 프로필을 동시에 생성할 것입니다. 중요한 것은 ctDNA의 기원 세포를 평가하려면 이전에 생성된 참조 세포 및 조직 맵과 메틸화 및 단편화 신호를 비교해야 한다는 것입니다(Katsman et al 2022 Genome Biology). NEN과 같은 희귀 종양의 경우 이러한 지도는 문헌에서 사용할 수 없습니다. NEN의 후생유전학적 특징을 특징으로 한 소수의 연구는 주변 간질에 의해 오염되었을 가능성이 높으므로 후성유전학적 신호(DNA 메틸화 및 종양 특이적 전사 인자 결합 부위 모두를 포함하여 단편학에 필수적인)는 혈액에서 검출하는 데 유익하지 않을 수 있습니다.
연구 유형
등록 (추정된)
연락처 및 위치
연구 연락처
- 이름: Nicola Fazio, MD
- 전화번호: 0257489258
- 이메일: divisione.gastrointestinale@ieo.it
연구 연락처 백업
- 이름: Francesca Spada, MD
- 전화번호: 0257489258
- 이메일: divisione.gastrointestinale@ieo.it
연구 장소
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Milan, 이탈리아, 20141
- 모병
- European Institute of Oncology
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연락하다:
- Giuseppe Badalamenti, MD
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연락하다:
- Chiara Maria Grana, MD
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연락하다:
- Lorenzo Gervaso, MD
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연락하다:
- Chiara Alessandra Cella, MD
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연락하다:
- Nicola Fazio, MD,PhD
- 전화번호: 0257489258
- 이메일: divisione.gastrointestinale@ieo.it
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연락하다:
- Nicola Fazio, MD,PhD
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연락하다:
- Francesca Spada, MD
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연락하다:
- Luca Mazzarella, MD
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연락하다:
- Elenora Pisa, MD
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연락하다:
- Emilio Bertani, MD
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연락하다:
- Laura Algeri, MD
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참여기준
자격 기준
공부할 수 있는 나이
- 성인
- 고령자
건강한 자원 봉사자를 받아들입니다
샘플링 방법
연구 인구
적절한 물질을 수집하고 정식 임상을 통해 임상적으로 의미 있는 시나리오에서 분석의 민감도와 특이성을 확립하는 것을 목표로 하는 GEP-NEN 환자.
비NEN에 비해 질병의 상대적 희귀성으로 인해 우리는 연속적인 인구를 등록하지 않을 것이지만 사례 대조 연구를 설정할 것입니다.
- 사례: 절제 가능하고 조직학적으로 확인된 NEN 환자
- 대조군: 조직학적으로 절제 가능하고 확인된 비신경내분비 위장관 종양(위, 췌장, 대장, 소장 포함) 환자.
환자는 수술 전 진단 생검을 기반으로 증례 또는 대조군으로 등록되지만 수술 후 전체 조직학적 검사를 기준으로 증례 또는 대조군에 확정적으로 할당됩니다.
설명
포함 기준:
- 조직학적으로 NEC/MINEN 진단이 확인되어 급진적인 수술이 가능한 환자
- 조직학적으로 확인된 NET 진단을 받은 환자는 급진적인 의도로 수술을 받을 수 있습니다.
- 완화 목적을 포함하여 생검 또는 수술이 가능한 전이성 NET/NEC 환자
환자의 조직학적으로 NEN이 아닌 조직형이 확인되었습니다.
- 대장암종
- 소장암종
- 위암 또는 식도암종
- 췌장 관 선암종
- NEN GI가 아닌 암종의 전이 절제술
제외 기준:
- 등급 G1 및 G2 <=10% Ki67
- 수반되는 신생물의 존재(3년 이내)
- 수반되는 주요 혈액학적 변화
- 수반되는 주요 장기 기능 장애(예: G3/4 간 또는 신부전)
- 진행 중인 화학 요법
공부 계획
연구는 어떻게 설계됩니까?
디자인 세부사항
코호트 및 개입
그룹/코호트 |
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신경내분비종양 사례
조직학적으로 확인된 신경내분비종양 및 확증된 혼합 신경내분비-비 신경내분비종양(각 성분의 비율 > 30%) 및 고급 신경내분비암종 환자
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비신경내분비종양 조절
조직학적으로 확인된 비신경내분비 위장관 종양(위, 췌장, 대장, 소장 포함) 환자.
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연구는 무엇을 측정합니까?
주요 결과 측정
결과 측정 |
측정값 설명 |
기간 |
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순환하는 methDNA/fragmentomics 진단 분석법 개발
기간: 2년
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신경내분비 종양을 특징짓는 후성유전학적 차이를 활용하여 신경내분비 유래의 순환 종양 DNA를 검출할 수 있는 DNA 메틸화 기반 액체 생검 분석을 구축하고 GEP-MiNEN의 비침습적 진단 및 모니터링을 가능하게 할 것입니다.
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2년
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공동 작업자 및 조사자
수사관
- 수석 연구원: Nicola Fazio, MD, European Institute of Oncology
연구 기록 날짜
연구 주요 날짜
연구 시작 (실제)
기본 완료 (추정된)
연구 완료 (추정된)
연구 등록 날짜
최초 제출
QC 기준을 충족하는 최초 제출
처음 게시됨 (실제)
연구 기록 업데이트
마지막 업데이트 게시됨 (실제)
QC 기준을 충족하는 마지막 업데이트 제출
마지막으로 확인됨
추가 정보
이 연구와 관련된 용어
추가 관련 MeSH 약관
기타 연구 ID 번호
- L2-154
약물 및 장치 정보, 연구 문서
미국 FDA 규제 의약품 연구
미국 FDA 규제 기기 제품 연구
미국에서 제조되어 미국에서 수출되는 제품
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