Denne side blev automatisk oversat, og nøjagtigheden af ​​oversættelsen er ikke garanteret. Der henvises til engelsk version for en kildetekst.

Epigenomiske determinanter af den neuroendokrine fænotype som biomarkører for neuroendokrine neoplasmer

15. januar 2025 opdateret af: European Institute of Oncology

EpigenOMiske determinanter af den neuroendokrine fænotype som biomarkører for ikke-invasiv diagnose af neuroendokrine neoplasmer

For GEP blandede neuroendokrine (NE) ikke-neuroendokrine neoplasmer (MiNENs) er et nøgleproblem, der påvirker prognosen, nogle gange vanskeligheden ved at opnå en rettidig diagnose, da NE-komponenten ofte er lokaliseret i dybere anatomiske steder og/eller bliver udbredt over tid. Vævsmaterialet i biopsier er muligvis ikke nok til at definere NE-komponenten, når denne er særlig lille, og dette kan påvirke den terapeutiske beslutning. Ydermere skal GEP NEN'er karakteriseres for potentielt medicinbare biomarkører, og flydende biopsi har en klar fordel for den solide til dette formål. Her vil vi udnytte epigenetiske forskelle, der karakteriserer NE-tumorer til at bygge et DNA-methyleringsbaseret flydende biopsiassay, der er i stand til at detektere cirkulerende tumor-DNA af NE-afledning, for at muliggøre den ikke-invasive diagnose og overvågning af GEP-MiNEN'er.

Studieoversigt

Status

Rekruttering

Betingelser

Detaljeret beskrivelse

GEP-NEN'er er en heterogen gruppe af sygdomme, der omfatter relativt indolente og mere aggressive tumorer, nogle gange med blandede eksokrine/endokrine komponenter (MINEN'er). På grund af vedvarende usikkerheder i diagnosticering og behandling er prognosen for de blandede og mere aggressive former fortsat dårlig. Ikke-invasive tests vil muliggøre rettidig identifikation og overvågning over tid. En bedre forståelse af deres biologi og af den fænotypiske differentieringsproces kan bane vejen for nye terapier. Differentiering følger, og kan udledes af, ændringer i det epigenetiske landskab, der former transkriptionelle programmer. Blandt epigenetiske markører er DNA-methylering særligt velegnet til ikke-invasiv detektion, da den kan måles i cirkulerende tumor-DNA (ctDNA). Nye teknologier som Oxford Nanopore Technologies (ONT) muliggør samtidig analyse af DNA-sekvens og methylering, som vi for nylig viste af Magi et al. Nat Comms Biol 2022. Tidligere undersøgelser identificerede distinkte neuroendokrine epi-transkriptomiske landskaber, men blev udført på tumorprøver (Yachida et al Cancer Discov 2022), hvilket forhindrede skelnen mellem signaler, der specifikt genereres i neuroendokrine tumorceller, fra støjen på grund af omgivende ikke-tumorale eller eksokrine tumorceller. Dette er nu potentielt løst ved metoder, der tillader enkeltcelle-sekventering direkte fra frosne eller paraffinindlejrede patientprøver.

Det vigtigste forventede resultat er udviklingen af ​​et nyt flydende biopsiassay til påvisning og overvågning af GEP-NEN'er og MiNEN'er. Til dette formål vil vi udnytte evnen til Oxford Nanopore Technologies (ONT) sekventering til samtidig at give sekventering og methylerede DNA-profiler. Det er vigtigt, at vurdering af oprindelsesceller fra ctDNA kræver sammenligning af methylerings- og fragmentomiske signaler med tidligere genererede kort over referenceceller og væv (Katsman et al. 2022 Genome Biology). For sjældne tumorer som NEN'er er disse kort ikke tilgængelige i litteraturen; de få undersøgelser, der har karakteriseret de epigenomiske træk ved NEN'er, er sandsynligvis kontamineret af det omgivende stroma, så epigenetiske signaler (herunder både DNA-methylering og tumorspecifikke transkriptionsfaktorbindingssteder, essentielle for fragmentomics) kan være uinformative for påvisning i blodet.

Undersøgelsestype

Observationel

Tilmelding (Anslået)

130

Kontakter og lokationer

Dette afsnit indeholder kontaktoplysninger for dem, der udfører undersøgelsen, og oplysninger om, hvor denne undersøgelse udføres.

Studiekontakt

Undersøgelse Kontakt Backup

Studiesteder

  • Italien
      • Milan, Italien, 20141
        • Rekruttering
        • European Institute of Oncology
        • Kontakt:
          • Giuseppe Badalamenti, MD
        • Kontakt:
          • Chiara Maria Grana, MD
        • Kontakt:
          • Lorenzo Gervaso, MD
        • Kontakt:
          • Chiara Alessandra Cella, MD
        • Kontakt:
        • Kontakt:
          • Nicola Fazio, MD,PhD
        • Kontakt:
          • Francesca Spada, MD
        • Kontakt:
          • Luca Mazzarella, MD
        • Kontakt:
          • Elenora Pisa, MD
        • Kontakt:
          • Emilio Bertani, MD
        • Kontakt:
          • Laura Algeri, MD

Deltagelseskriterier

Forskere leder efter personer, der passer til en bestemt beskrivelse, kaldet berettigelseskriterier. Nogle eksempler på disse kriterier er en persons generelle helbredstilstand eller tidligere behandlinger.

Berettigelseskriterier

Aldre berettiget til at studere

  • Voksen
  • Ældre voksen

Tager imod sunde frivillige

Ingen

Prøveudtagningsmetode

Sandsynlighedsprøve

Studiebefolkning

Patienter med GEP-NEN'er, der sigter mod at indsamle tilstrækkeligt materiale og for en formel klinisk for at fastslå sensitivitet og specificitet af assayet i et klinisk meningsfuldt scenarie.

På grund af sygdommens relative sjældenhed sammenlignet med ikke-NEN'er vil vi ikke indskrive en fortløbende population, men vi vil oprette et case-kontrol studie:

  • Tilfælde: patienter med resekterbare, histologisk bekræftede NEN'er
  • Kontroller: patienter med resekterbare, histologisk bekræftede ikke-neuroendokrine gastrointestinale tumorer (inklusive gastrisk, pancreas, kolorektal, tyndtarm).

Patienter vil blive indskrevet som tilfælde eller kontroller baseret på deres præ-kirurgiske diagnostiske biopsi, men vil blive definitivt allokeret i tilfælde eller kontrolgruppe baseret på deres post-kirurgiske fulde histologiske undersøgelse.

Beskrivelse

Inklusionskriterier:

  • Patient med histologisk bekræftet diagnose NEC/MINEN, der er modtagelig for operation med radikale hensigter
  • Patient med histologisk bekræftet diagnose NET, der er modtagelig for operation med radikal hensigt
  • Patient med metastatisk NET/NEC, modtagelig for biopsi eller kirurgi, inklusive palliativ hensigt

  • Patient histologisk bekræftet ikke-NEN histotype:

    1. Kolorektalt karcinom
    2. Tyndtarmskarcinom
    3. Gastrisk eller esophageal carcinom
    4. Pancreas duktalt adenokarcinom
    5. Metastasektomi fra ethvert non-NEN GI-karcinom

Ekskluderingskriterier:

  • Gradering G1 og G2 <=10% Ki67
  • Tilstedeværelse af samtidig neoplasma (inden for 3 år)
  • Samtidig større hæmatologisk ændring
  • Samtidig større organdysfunktion (f. G3/4 lever- eller nyresvigt)
  • Løbende kemoterapi

Studieplan

Dette afsnit indeholder detaljer om studieplanen, herunder hvordan undersøgelsen er designet, og hvad undersøgelsen måler.

Hvordan er undersøgelsen tilrettelagt?

Design detaljer

Kohorter og interventioner

Gruppe / kohorte
Neuroendokrin neoplasma tilfælde
patient med histologisk bekræftet neuroendokrin neoplasma og påvist blandet neuroendokrin-ikke-neuroendokrin neoplasma med hver komponent > 30 %) og højgradige neuroendokrine karcinomer
Ikke-neuroendokrin neoplasmakontrol
patient med histologisk bekræftede ikke-neuroendokrine gastrointestinale tumorer (herunder gastrisk, pancreas, kolorektal, tyndtarm).

Hvad måler undersøgelsen?

Primære resultatmål

Resultatmål
Foranstaltningsbeskrivelse
Tidsramme
Udvikle et cirkulerende methDNA/fragmentomics diagnostisk assay
Tidsramme: 2 år
Epigenetiske forskelle, der karakteriserer neuroendokrine tumorer, vil blive udnyttet til at opbygge et DNA-methyleringsbaseret flydende biopsiassay, der er i stand til at detektere cirkulerende tumor-DNA af neuroendokrin afledning, for at muliggøre non-invasiv diagnose og overvågning af GEP-MiNEN'er.
2 år

Samarbejdspartnere og efterforskere

Det er her, du vil finde personer og organisationer, der er involveret i denne undersøgelse.

Sponsor

European Institute of Oncology

Samarbejdspartnere

Azienda Ospedaliera Universitaria Policlinico Paolo Giaccone Palermo

Efterforskere

  • Ledende efterforsker: Nicola Fazio, MD, European Institute of Oncology

Datoer for undersøgelser

Disse datoer sporer fremskridtene for indsendelser af undersøgelsesrekord og resumeresultater til ClinicalTrials.gov. Studieregistreringer og rapporterede resultater gennemgås af National Library of Medicine (NLM) for at sikre, at de opfylder specifikke kvalitetskontrolstandarder, før de offentliggøres på den offentlige hjemmeside.

Studer store datoer

Studiestart (Faktiske)

21. oktober 2024

Primær færdiggørelse (Anslået)

21. oktober 2026

Studieafslutning (Anslået)

21. oktober 2026

Datoer for studieregistrering

Først indsendt

15. januar 2025

Først indsendt, der opfyldte QC-kriterier

15. januar 2025

Først opslået (Faktiske)

25. marts 2025

Opdateringer af undersøgelsesjournaler

Sidste opdatering sendt (Faktiske)

25. marts 2025

Sidste opdatering indsendt, der opfyldte kvalitetskontrolkriterier

15. januar 2025

Sidst verificeret

1. august 2024

Mere information

Begreber relateret til denne undersøgelse

Nøgleord

Yderligere relevante MeSH-vilkår

Andre undersøgelses-id-numre

  • L2-154

Lægemiddel- og udstyrsoplysninger, undersøgelsesdokumenter

Studerer et amerikansk FDA-reguleret lægemiddelprodukt

Ingen

Studerer et amerikansk FDA-reguleret enhedsprodukt

Ingen

produkt fremstillet i og eksporteret fra U.S.A.

Ingen

Disse oplysninger blev hentet direkte fra webstedet clinicaltrials.gov uden ændringer. Hvis du har nogen anmodninger om at ændre, fjerne eller opdatere dine undersøgelsesoplysninger, bedes du kontakte register@clinicaltrials.gov. Så snart en ændring er implementeret på clinicaltrials.gov, vil denne også blive opdateret automatisk på vores hjemmeside .

Kliniske forsøg med Neuroendokrin neoplasma

Søg i lignende forsøg

Sponsorer og samarbejdspartnere

Medicinske tilstande

Narkotikainterventioner

CROs by country

CROs in Uzbekistan

Betingelser

Sjældne sygdomme

Narkotikainterventioner

Kosttilskud

Sponsor / samarbejdspartnere

Placeringer

Abonner