Determinantes epigenômicos do fenótipo neuroendócrino como biomarcadores para neoplasias neuroendócrinas
Determinantes epigenômicos do fenótipo neuroendócrino como biomarcadores para diagnóstico não invasivo de neoplasias neuroendócrinas
Visão geral do estudo
Status
Descrição detalhada
GEP-NENs são um grupo heterogêneo de doenças que engloba tumores relativamente indolentes e mais agressivos, às vezes com componentes mistos exócrinos/endócrinos (MINENs). Devido às incertezas persistentes no diagnóstico e tratamento, o prognóstico das formas mistas e mais agressivas permanece ruim. Testes não invasivos permitiriam a identificação e o monitoramento oportunos ao longo do tempo. Uma melhor compreensão da sua biologia e do processo de diferenciação fenotípica pode abrir caminho para novas terapias. A diferenciação segue e pode ser inferida a partir de mudanças na paisagem epigenética que moldam os programas transcricionais. Entre os marcadores epigenéticos, a metilação do DNA é particularmente adequada para detecção não invasiva, pois pode ser medida no DNA tumoral circulante (ctDNA). Novas tecnologias como Oxford Nanopore Technologies (ONT) permitem a análise simultânea da sequência de DNA e metilação, como mostramos recentemente por Magi et al Nat Comms Biol 2022. Estudos anteriores identificaram paisagens epitranscriptômicas neuroendócrinas distintas, mas foram conduzidos em amostras de tumor (Yachida et al Cancer Discov 2022), impedindo a discriminação de sinais gerados especificamente dentro de células tumorais neuroendócrinas a partir do ruído devido às células tumorais não tumorais ou exócrinas circundantes. Isso agora é potencialmente resolvido por métodos que permitem o sequenciamento unicelular diretamente de amostras de pacientes congeladas ou embebidas em parafina.
O principal resultado esperado é o desenvolvimento de um novo ensaio de biópsia líquida para detecção e monitoramento de GEP-NENs e MiNENs. Para este fim, exploraremos a capacidade do sequenciamento da Oxford Nanopore Technologies (ONT) para produzir simultaneamente sequenciamento e perfis de DNA metilado. É importante ressaltar que a avaliação da célula de origem do ctDNA requer a comparação dos sinais de metilação e fragmentômica com mapas gerados anteriormente de células e tecidos de referência (Katsman et al 2022 Genome Biology). Para tumores raros como os NENs, estes mapas não estão disponíveis na literatura; os poucos estudos que caracterizaram as características epigenômicas dos NENs estão provavelmente contaminados pelo estroma circundante, portanto os sinais epigenéticos (incluindo a metilação do DNA e os locais de ligação do fator de transcrição específico do tumor, essenciais para a fragmentômica) podem não ser informativos para detecção no sangue.
Tipo de estudo
Inscrição (Estimado)
Contactos e Locais
Contato de estudo
- Nome: Nicola Fazio, MD
- Número de telefone: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Estude backup de contato
- Nome: Francesca Spada, MD
- Número de telefone: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Locais de estudo
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Milan, Itália, 20141
- Recrutamento
- European Institute of Oncology
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Contato:
- Giuseppe Badalamenti, MD
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Contato:
- Chiara Maria Grana, MD
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Contato:
- Lorenzo Gervaso, MD
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Contato:
- Chiara Alessandra Cella, MD
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Contato:
- Nicola Fazio, MD,PhD
- Número de telefone: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
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Contato:
- Nicola Fazio, MD,PhD
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Contato:
- Francesca Spada, MD
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Contato:
- Luca Mazzarella, MD
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Contato:
- Elenora Pisa, MD
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Contato:
- Emilio Bertani, MD
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Contato:
- Laura Algeri, MD
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Método de amostragem
População do estudo
Pacientes com GEP-NENs, visando coletar material adequado e para um clínico formal estabelecer a sensibilidade e especificidade do ensaio em um cenário clinicamente significativo.
Devido à relativa raridade da doença em comparação com não NENs, não inscreveremos uma população consecutiva, mas montaremos um estudo caso-controle:
- Casos: pacientes com NENs ressecáveis e confirmados histologicamente
- Controles: pacientes com tumores gastrointestinais não neuroendócrinos ressecáveis, confirmados histologicamente (incluindo gástrico, pancreático, colorretal, intestino delgado).
Os pacientes serão inscritos como casos ou controles com base em sua biópsia diagnóstica pré-cirúrgica, mas serão definitivamente alocados no caso ou grupo controle com base em seu exame histológico completo pós-operatório.
Descrição
Critérios de inclusão:
- Paciente com diagnóstico histologicamente confirmado de NEC/MINEN passível de cirurgia com intenção radical
- Paciente com diagnóstico histologicamente confirmado de TNE passível de cirurgia com intenção radical
- Paciente com TNE/NEC metastático, passível de biópsia ou cirurgia, incluindo intenção paliativa
Histótipo não NEN confirmado histologicamente pelo paciente:
- Carcinoma colorretal
- Carcinoma do intestino delgado
- Carcinoma gástrico ou esofágico
- Adenocarcinoma ductal pancreático
- Metastasectomia de qualquer carcinoma GI não NEN
Critérios de exclusão:
- Classificação G1 e G2 <=10% Ki67
- Presença de neoplasia concomitante (dentro de 3 anos)
- Alteração hematológica importante concomitante
- Disfunção concomitante de órgãos importantes (por ex. G3/4 insuficiência hepática ou renal)
- Quimioterapia em andamento
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
Coortes e Intervenções
Grupo / Coorte |
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Caso de neoplasia neuroendócrina
paciente com neoplasia neuroendócrina confirmada histologicamente e neoplasia mista neuroendócrina-não neuroendócrina confirmada com cada componente > 30%) e carcinomas neuroendócrinos de alto grau
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Controle de neoplasias não neuroendócrinas
paciente com tumores gastrointestinais não neuroendócrinos confirmados histologicamente (incluindo gástrico, pancreático, colorretal, intestino delgado).
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Descrição da medida |
Prazo |
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Desenvolva um ensaio de diagnóstico circulante de methDNA/fragmentômica
Prazo: 2 anos
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As diferenças epigenéticas que caracterizam tumores neuroendócrinos serão exploradas para construir um ensaio de biópsia líquida baseado em metilação de DNA capaz de detectar DNA tumoral circulante de derivação neuroendócrina, para permitir o diagnóstico e monitoramento não invasivo de GEP-MiNENs.
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2 anos
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Nicola Fazio, MD, European Institute of Oncology
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Conclusão Primária (Estimado)
Conclusão do estudo (Estimado)
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
- L2-154
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
produto fabricado e exportado dos EUA
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