EpigenOMické determinanty neuroendokrinního fenotypu jako biomarkery pro neuroendokrinní novotvary
EpigenOMické determinanty neuroendokrinního fenotypu jako biomarkery pro neinvazivní diagnostiku neuroendokrinních novotvarů
Přehled studie
Postavení
Detailní popis
GEP-NEN jsou heterogenní skupinou onemocnění, která zahrnuje relativně indolentní a agresivnější nádory, někdy se smíšenými exokrinními/endokrinními složkami (MINEN). Vzhledem k přetrvávajícím nejistotám v diagnostice a léčbě zůstává prognóza smíšených a agresivnějších forem špatná. Neinvazivní testy by umožnily včasnou identifikaci a sledování v průběhu času. Lepší pochopení jejich biologie a procesu fenotypové diferenciace může připravit cestu pro nové terapie. Diferenciace následuje a lze z ní odvodit změny v epigenetické krajině, které utvářejí transkripční programy. Z epigenetických markerů je methylace DNA zvláště vhodná pro neinvazivní detekci, protože ji lze měřit v cirkulující nádorové DNA (ctDNA). Nové technologie jako Oxford Nanopore Technologies (ONT) umožňují současnou analýzu sekvence DNA a methylace, jak jsme nedávno ukázali Magi et al Nat Comms Biol 2022. Předchozí studie identifikovaly odlišné neuroendokrinní epi-transkriptomické krajiny, ale byly provedeny na vzorcích nádorů (Yachida et al. Cancer Discov 2022), což brání rozlišování signálů specificky generovaných v neuroendokrinních nádorových buňkách od hluku způsobeného okolními nenádorovými nebo exokrinními nádorovými buňkami. To je nyní potenciálně řešeno metodami umožňujícími jednobuněčné sekvenování přímo ze zmrazených nebo parafínových vzorků pacientů.
Hlavním očekávaným výsledkem je vývoj nového testu tekuté biopsie pro detekci a monitorování GEP-NEN a MiNEN. Za tímto účelem využijeme schopnost sekvenování Oxford Nanopore Technologies (ONT) k současnému získání sekvenování a profilů methylované DNA. Důležité je, že posouzení buňky původu z ctDNA vyžaduje srovnání methylačních a fragmentomických signálů s dříve vytvořenými mapami referenčních buněk a tkání (Katsman et al 2022 Genome Biology). Pro vzácné nádory, jako jsou NEN, nejsou tyto mapy v literatuře dostupné; několik studií, které charakterizovaly epigenomické rysy NEN, je pravděpodobně kontaminováno okolním stromatem, takže epigenetické signály (včetně methylace DNA a vazebných míst pro transkripční faktor specifický pro nádor, zásadní pro fragmentomiku) mohou být pro detekci v krvi neinformativní.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní kontakt
- Jméno: Nicola Fazio, MD
- Telefonní číslo: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Studijní záloha kontaktů
- Jméno: Francesca Spada, MD
- Telefonní číslo: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Studijní místa
-
-
-
Milan, Itálie, 20141
- Nábor
- European Institute of Oncology
-
Kontakt:
- Giuseppe Badalamenti, MD
-
Kontakt:
- Chiara Maria Grana, MD
-
Kontakt:
- Lorenzo Gervaso, MD
-
Kontakt:
- Chiara Alessandra Cella, MD
-
Kontakt:
- Nicola Fazio, MD,PhD
- Telefonní číslo: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
-
Kontakt:
- Nicola Fazio, MD,PhD
-
Kontakt:
- Francesca Spada, MD
-
Kontakt:
- Luca Mazzarella, MD
-
Kontakt:
- Elenora Pisa, MD
-
Kontakt:
- Emilio Bertani, MD
-
Kontakt:
- Laura Algeri, MD
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
- Dospělý
- Starší dospělý
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Pacienti s GEP-NEN, s cílem shromáždit adekvátní materiál a pro formální klinické stanovení citlivosti a specificity testu v klinicky smysluplném scénáři.
Vzhledem k relativní vzácnosti onemocnění ve srovnání s non-NEN nezařadíme po sobě jdoucí populaci, ale vytvoříme případovou kontrolní studii:
- Případy: pacienti s resekabilními, histologicky potvrzenými NEN
- Kontroly: pacienti s resekabilními, histologicky potvrzenými neneuroendokrinními gastrointestinálními nádory (včetně žaludečního, pankreatického, kolorektálního, tenkého střeva).
Pacienti budou zařazeni jako případy nebo kontroly na základě jejich předoperační diagnostické biopsie, ale definitivně budou zařazeni do případu nebo kontrolní skupiny na základě jejich pooperačního úplného histologického vyšetření.
Popis
Kritéria zahrnutí:
- Pacient s histologicky potvrzenou diagnózou NEC/MINEN vhodný k operaci s radikálním záměrem
- Pacientka s histologicky potvrzenou diagnózou NET vhodná k operaci s radikálním záměrem
- Pacient s metastatickým NET/NEC, vhodný k biopsii nebo operaci, včetně paliativního záměru
Histologicky potvrzený non-NEN histotyp pacienta:
- Kolorektální karcinom
- Karcinom tenkého střeva
- Karcinom žaludku nebo jícnu
- Duktální adenokarcinom pankreatu
- Metastasektomie z jakéhokoli non-NEN GI karcinomu
Kritéria vyloučení:
- Klasifikace G1 a G2 <=10 % Ki67
- Přítomnost souběžného novotvaru (do 3 let)
- Současné velké hematologické změny
- Současná dysfunkce hlavních orgánů (např. G3/4 selhání jater nebo ledvin)
- Probíhající chemoterapie
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Případ neuroendokrinního novotvaru
pacient s histologicky potvrzeným neuroendokrinním novotvarem a potvrzeným smíšeným neuroendokrinním-non neuroendokrinním novotvarem s každou složkou > 30 %) a neuroendokrinními karcinomy vysokého stupně
|
|
Neneuroendokrinní kontrola novotvaru
pacient s histologicky potvrzenými neneuroendokrinními nádory gastrointestinálního traktu (včetně žaludečního, pankreatického, kolorektálního, tenkého střeva).
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Vyvinout diagnostický test cirkulující methDNA/fragmentomiky
Časové okno: 2 roky
|
Epigenetické rozdíly charakterizující neuroendokrinní nádory budou využity k vytvoření testu tekuté biopsie založeného na methylaci DNA schopného detekovat cirkulující nádorovou DNA neuroendokrinní derivace, což umožní neinvazivní diagnostiku a monitorování GEP-MiNEN.
|
2 roky
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Nicola Fazio, MD, European Institute of Oncology
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- L2-154
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
produkt vyrobený a vyvážený z USA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Neuroendokrinní novotvar
-
Peking Union Medical College HospitalNábor
-
Asan Medical CenterNáborRakovina žaludku | Metastatický adenokarcinom rakoviny žaludku | NEOPLASM ŽALUDKUJižní Korea
-
National University Hospital, SingaporeVanderbilt University Medical Center; National University Cancer Institute,...Zatím nenabíráme
-
Leiden University Medical CenterNáborRakovina žaludku | PET-CT | Lokálně pokročilý adenokarcinom žaludku | NEOPLASM ŽALUDKUHolandsko
-
University Health Network, TorontoZatím nenabírámeNovotvar mandlí | Novotvar orofaryngu | Transorální robotická chirurgieKanada