A neuroendokrin fenotípus epigenOMikus meghatározói, mint a neuroendokrin daganatok biomarkerei
A neuroendokrin fenotípus epigenOMikus meghatározói, mint biomarkerek a neuroendokrin daganatok nem invazív diagnosztizálásához
A tanulmány áttekintése
Állapot
Részletes leírás
A GEP-NEN-ek a betegségek heterogén csoportja, amely viszonylag indolens és agresszívabb daganatokat foglal magában, néha vegyes exokrin/endokrin komponensekkel (MINEN). A diagnózis és a kezelés terén fennálló tartós bizonytalanságok miatt a kevert és agresszívebb formák prognózisa továbbra is rossz. A nem invazív tesztek lehetővé teszik az időben történő azonosítást és az idő múlásával történő nyomon követést. Biológiájuk és a fenotípusos differenciálódási folyamat jobb megértése új terápiák előtt nyithatja meg az utat. A differenciálódás az epigenetikai tájban a transzkripciós programokat alakító változásokat követi, és azokból következtethetünk. Az epigenetikai markerek közül a DNS-metiláció különösen alkalmas non-invazív kimutatásra, mivel a keringő tumor DNS-ben (ctDNS) mérhető. Az új technológiák, mint például az Oxford Nanopore Technologies (ONT) lehetővé teszik a DNS-szekvencia és a metiláció egyidejű elemzését, amint azt a közelmúltban Magi és munkatársai, a Nat Comms Biol 2022 kimutatták. A korábbi tanulmányok különálló neuroendokrin epi-transzkriptomikus tájakat azonosítottak, de azokat tumormintákon végezték (Yachida és mtsai. Cancer Discov, 2022), ami megakadályozta a specifikusan neuroendokrin tumorsejtekben generált jelek megkülönböztetését a környező nem tumoros vagy exokrin tumorsejtek zajától. Ezt ma már potenciálisan megoldják olyan módszerekkel, amelyek lehetővé teszik az egysejtű szekvenálást közvetlenül a fagyasztott vagy paraffinba ágyazott betegmintákból.
A fő várható eredmény egy új folyékony biopsziás vizsgálat kifejlesztése a GEP-NEN és a MiNEN kimutatására és monitorozására. Ebből a célból ki fogjuk használni az Oxford Nanopore Technologies (ONT) szekvenálás azon képességét, hogy egyidejűleg szekvenálást és metilált DNS-profilokat készítsünk. Fontos, hogy a ctDNS-ből származó sejt eredetének értékeléséhez a metilációs és fragmentomikai jelek összehasonlítása szükséges a referenciasejtek és szövetek korábban generált térképeivel (Katsman és mtsai, 2022 Genome Biology). Az olyan ritka daganatok esetében, mint a NEN, ezek a térképek nem állnak rendelkezésre a szakirodalomban; Az a néhány tanulmány, amely a NEN-ek epigenomikus jellemzőit jellemezte, valószínűleg szennyezett a környező sztrómával, így az epigenetikai jelek (beleértve a DNS-metilációt és a tumorspecifikus transzkripciós faktor kötőhelyeket is, amelyek elengedhetetlenek a fragmentomikához) nem informatívak lehetnek a vérben történő kimutatáshoz.
Tanulmány típusa
Beiratkozás (Becsült)
Kapcsolatok és helyek
Tanulmányi kapcsolat
- Név: Nicola Fazio, MD
- Telefonszám: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Tanulmányozza a kapcsolattartók biztonsági mentését
- Név: Francesca Spada, MD
- Telefonszám: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Tanulmányi helyek
-
-
-
Milan, Olaszország, 20141
- Toborzás
- European Institute of Oncology
-
Kapcsolatba lépni:
- Giuseppe Badalamenti, MD
-
Kapcsolatba lépni:
- Chiara Maria Grana, MD
-
Kapcsolatba lépni:
- Lorenzo Gervaso, MD
-
Kapcsolatba lépni:
- Chiara Alessandra Cella, MD
-
Kapcsolatba lépni:
- Nicola Fazio, MD,PhD
- Telefonszám: 0257489258
- E-mail: divisione.gastrointestinale@ieo.it
-
Kapcsolatba lépni:
- Nicola Fazio, MD,PhD
-
Kapcsolatba lépni:
- Francesca Spada, MD
-
Kapcsolatba lépni:
- Luca Mazzarella, MD
-
Kapcsolatba lépni:
- Elenora Pisa, MD
-
Kapcsolatba lépni:
- Emilio Bertani, MD
-
Kapcsolatba lépni:
- Laura Algeri, MD
-
-
Részvételi kritériumok
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
- Felnőtt
- Idősebb felnőtt
Egészséges önkénteseket fogad
Mintavételi módszer
Tanulmányi populáció
GEP-NEN-ben szenvedő betegek, akiknek célja a megfelelő anyag gyűjtése és a formális klinikai vizsgálat során az assay érzékenységének és specificitásának megállapítása klinikailag értelmes forgatókönyv szerint.
A betegségnek a nem NEN-ekhez képest viszonylagos ritkasága miatt nem veszünk fel egy egymást követő populációt, hanem eset-kontroll vizsgálatot készítünk:
- Esetek: reszekálható, szövettanilag igazolt NEN-ben szenvedő betegek
- Kontrollok: reszekálható, szövettanilag igazolt, nem neuroendokrin gasztrointesztinális daganatos betegek (beleértve a gyomor-, hasnyálmirigy-, vastag- és végbél-, vékonybél-daganatot).
A betegeket a műtét előtti diagnosztikai biopszia alapján esetekként vagy kontrollként veszik fel, de a műtét utáni teljes szövettani vizsgálatuk alapján véglegesen besorolják őket az esetbe vagy a kontrollcsoportba.
Leírás
Bevételi kritériumok:
- A szövettanilag megerősített NEC/MINEN diagnózisú beteg radikális szándékkal műtétre alkalmas
- A szövettanilag megerősített NET diagnózisú beteg radikális szándékkal műtétre alkalmas
- Áttétes NET/NEC-ben szenvedő beteg, amely alkalmas biopsziára vagy műtétre, beleértve a palliatív szándékot is
A beteg szövettanilag igazolt nem-NEN hisztotípusa:
- Kolorektális karcinóma
- Vékonybél karcinóma
- Gyomor- vagy nyelőcső karcinóma
- Hasnyálmirigy duktális adenokarcinóma
- Metasztázis eltávolítása bármely nem NEN GI karcinómából
Kizárási kritériumok:
- G1 és G2 osztályozás <=10% Ki67
- Egyidejű neoplazma jelenléte (3 éven belül)
- Egyidejű jelentős hematológiai elváltozás
- Egyidejű nagyobb szervi működési zavarok (pl. G3/4 máj- vagy veseelégtelenség)
- Folyamatos kemoterápia
Tanulási terv
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
|---|
|
Neuroendokrin neoplazma eset
beteg szövettanilag igazolt neuroendokrin daganattal és megerősített vegyes neuroendokrin-nem neuroendokrin daganattal, mindegyik komponens > 30%) és magas fokú neuroendokrin karcinómák
|
|
Nem neuroendokrin neoplazma kontroll
szövettanilag igazolt, nem neuroendokrin gasztrointesztinális daganatokban (beleértve a gyomor-, hasnyálmirigy-, vastag- és végbél-, vékonybél-daganatot) szenvedő beteg.
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Dolgozzon ki egy keringő methDNS/fragmentomikai diagnosztikai vizsgálatot
Időkeret: 2 év
|
A neuroendokrin daganatokra jellemző epigenetikai különbségeket kihasználva olyan DNS-metiláción alapuló folyékony biopsziás assay-t állítanak elő, amely képes kimutatni a keringő neuroendokrin eredetű tumor DNS-t, lehetővé téve a GEP-MiNEN-ek non-invazív diagnosztizálását és monitorozását.
|
2 év
|
Együttműködők és nyomozók
Szponzor
Nyomozók
- Kutatásvezető: Nicola Fazio, MD, European Institute of Oncology
Tanulmányi rekorddátumok
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
Elsődleges befejezés (Becsült)
A tanulmány befejezése (Becsült)
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Első közzététel (Tényleges)
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
Utolsó ellenőrzés
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
Kulcsszavak
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- L2-154
Gyógyszer- és eszközinformációk, tanulmányi dokumentumok
Egy amerikai FDA által szabályozott gyógyszerkészítményt tanulmányoz
Egy amerikai FDA által szabályozott eszközterméket tanulmányoz
az Egyesült Államokban gyártott és onnan exportált termék
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .