Determinantes epigenómicos del fenotipo neuroendocrino como biomarcadores de neoplasias neuroendocrinas
Determinantes epigenómicos del fenotipo neuroendocrino como biomarcadores para el diagnóstico no invasivo de neoplasias neuroendocrinas
Descripción general del estudio
Estado
Descripción detallada
Las GEP-NEN son un grupo heterogéneo de enfermedades que abarca tumores relativamente indolentes y más agresivos, a veces con componentes mixtos exocrinos/endocrinos (MINEN). Debido a las persistentes incertidumbres en el diagnóstico y el tratamiento, el pronóstico de las formas mixtas y más agresivas sigue siendo malo. Las pruebas no invasivas permitirían una identificación oportuna y un seguimiento en el tiempo. Una mejor comprensión de su biología y del proceso de diferenciación fenotípica puede allanar el camino para nuevas terapias. La diferenciación sigue, y puede inferirse de, cambios en el panorama epigenético que dan forma a los programas transcripcionales. Entre los marcadores epigenéticos, la metilación del ADN es particularmente adecuada para la detección no invasiva, ya que puede medirse en el ADN tumoral circulante (ctDNA). Nuevas tecnologías como Oxford Nanopore Technologies (ONT) permiten el análisis simultáneo de la secuencia del ADN y la metilación, como lo demostraron recientemente Magi et al Nat Comms Biol 2022. Estudios anteriores identificaron distintos paisajes epitranscriptómicos neuroendocrinos, pero se realizaron en muestras de tumores (Yachida et al Cancer Discov 2022), lo que impidió la discriminación de las señales generadas específicamente dentro de las células tumorales neuroendocrinas del ruido debido a las células tumorales exocrinas o no tumorales circundantes. Esto ahora se puede resolver mediante métodos que permiten la secuenciación unicelular directamente de muestras de pacientes congeladas o incluidas en parafina.
El principal resultado esperado es el desarrollo de un nuevo ensayo de biopsia líquida para la detección y seguimiento de GEP-NEN y MiNEN. Con este fin, explotaremos la capacidad de la secuenciación de Oxford Nanopore Technologies (ONT) para producir simultáneamente secuenciación y perfiles de ADN metilado. Es importante destacar que la evaluación del origen celular a partir del ctDNA requiere la comparación de señales fragmentómicas y de metilación con mapas generados previamente de células y tejidos de referencia (Katsman et al 2022 Genome Biology). Para tumores raros como los NEN, estos mapas no están disponibles en la literatura; Los pocos estudios que han caracterizado las características epigenómicas de las NEN probablemente estén contaminados por el estroma circundante, por lo que las señales epigenéticas (incluidas tanto la metilación del ADN como los sitios de unión del factor de transcripción específico del tumor, esenciales para la fragmentómica) pueden no ser informativas para la detección en la sangre.
Tipo de estudio
Inscripción (Estimado)
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
- Nombre: Nicola Fazio, MD
- Número de teléfono: 0257489258
- Correo electrónico: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Francesca Spada, MD
- Número de teléfono: 0257489258
- Correo electrónico: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Ubicaciones de estudio
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Milan, Italia, 20141
- Reclutamiento
- European Institute of Oncology
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Contacto:
- Giuseppe Badalamenti, MD
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Contacto:
- Chiara Maria Grana, MD
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Contacto:
- Lorenzo Gervaso, MD
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Contacto:
- Chiara Alessandra Cella, MD
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Contacto:
- Nicola Fazio, MD,PhD
- Número de teléfono: 0257489258
- Correo electrónico: divisione.gastrointestinale@ieo.it
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Contacto:
- Nicola Fazio, MD,PhD
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Contacto:
- Francesca Spada, MD
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Contacto:
- Luca Mazzarella, MD
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Contacto:
- Elenora Pisa, MD
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Contacto:
- Emilio Bertani, MD
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Contacto:
- Laura Algeri, MD
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Método de muestreo
Población de estudio
Pacientes con GEP-NEN, con el objetivo de recopilar material adecuado y realizar una clínica formal para establecer la sensibilidad y especificidad del ensayo en un escenario clínicamente significativo.
Debido a la relativa rareza de la enfermedad en comparación con las que no son NEN, no inscribiremos a una población consecutiva, pero estableceremos un estudio de casos y controles:
- Casos: pacientes con NEN resecables confirmadas histológicamente
- Controles: pacientes con tumores gastrointestinales no neuroendocrinos resecables, confirmados histológicamente (incluidos gástricos, pancreáticos, colorrectales e intestino delgado).
Los pacientes se inscribirán como casos o controles según su biopsia de diagnóstico prequirúrgica, pero serán definitivamente asignados en el grupo de casos o control según su examen histológico completo posquirúrgico.
Descripción
Criterios de inclusión:
- Paciente con diagnóstico histológicamente confirmado de ECN/MINEN susceptible de cirugía con intención radical
- Paciente con diagnóstico histológicamente confirmado de NET susceptible de cirugía con intención radical
- Paciente con NET/ECN metastásico, susceptible de biopsia o cirugía, incluida la intención paliativa
Histotipo no NEN confirmado histológicamente del paciente:
- Carcinoma colorrectal
- Carcinoma de intestino delgado
- Carcinoma gástrico o esofágico
- Adenocarcinoma ductal pancreático
- Metastasectomía de cualquier carcinoma gastrointestinal no NEN
Criterios de exclusión:
- Calificación G1 y G2 <=10% Ki67
- Presencia de neoplasia concomitante (dentro de los 3 años)
- Alteración hematológica mayor concomitante
- Disfunción concomitante de órganos importantes (p. ej. G3/4 insuficiencia hepática o renal)
- Quimioterapia continua
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
Cohortes e Intervenciones
Grupo / Cohorte |
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Caso de neoplasia neuroendocrina
paciente con neoplasia neuroendocrina confirmada histológicamente y neoplasia neuroendocrina mixta-no neuroendocrina confirmada con cada componente > 30%) y carcinomas neuroendocrinos de alto grado
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Control de neoplasias no neuroendocrinas
paciente con tumores gastrointestinales no neuroendocrinos confirmados histológicamente (incluidos gástricos, pancreáticos, colorrectales e intestino delgado).
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Medida Descripción |
Periodo de tiempo |
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Desarrollar un ensayo de diagnóstico de metaADN/fragmentómica circulante
Periodo de tiempo: 2 años
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Se aprovecharán las diferencias epigenéticas que caracterizan a los tumores neuroendocrinos para construir un ensayo de biopsia líquida basado en la metilación del ADN capaz de detectar ADN tumoral circulante de derivación neuroendocrina, para permitir el diagnóstico y seguimiento no invasivos de GEP-MiNEN.
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2 años
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Investigadores
- Investigador principal: Nicola Fazio, MD, European Institute of Oncology
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Finalización primaria (Estimado)
Finalización del estudio (Estimado)
Fechas de registro del estudio
Enviado por primera vez
Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad
Publicado por primera vez (Actual)
Actualizaciones de registros de estudio
Última actualización publicada (Actual)
Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad
Última verificación
Más información
Términos relacionados con este estudio
Palabras clave
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
- L2-154
Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
producto fabricado y exportado desde los EE. UU.
Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .