Эта страница была переведена автоматически, точность перевода не гарантируется. Пожалуйста, обратитесь к английской версии для исходного текста.

Эпигеномные детерминанты нейроэндокринного фенотипа как биомаркеры нейроэндокринных новообразований

15 января 2025 г. обновлено: European Institute of Oncology

Эпигеномные детерминанты нейроэндокринного фенотипа как биомаркеры неинвазивной диагностики нейроэндокринных новообразований

Для смешанных нейроэндокринных (НЭ) ненейроэндокринных новообразований (МиНЭН) ГЭП ключевой проблемой, влияющей на прогноз, иногда является сложность получения своевременного диагноза, поскольку компонент НЭ часто локализуется в более глубоких анатомических местах и/или становится преобладающим с течением времени. Тканевого материала биопсии может быть недостаточно для определения компонента NE, когда он особенно мал, и это может повлиять на терапевтическое решение. Кроме того, GEP NEN необходимо охарактеризовать на предмет наличия биомаркеров, потенциально поддающихся лекарственному воздействию, и в этом отношении жидкая биопсия имеет явное преимущество перед твердой. Здесь мы будем использовать эпигенетические различия, характеризующие опухоли NE, для создания анализа жидкой биопсии на основе метилирования ДНК, способного обнаруживать циркулирующую опухолевую ДНК происхождения NE, чтобы обеспечить неинвазивную диагностику и мониторинг GEP-MiNEN.

Обзор исследования

Статус

Рекрутинг

Условия

Подробное описание

ГЭП-НЭН представляют собой гетерогенную группу заболеваний, которая включает относительно вялотекущие и более агрессивные опухоли, иногда со смешанным экзокринным/эндокринным компонентом (МИНЭН). Из-за сохраняющихся неопределенностей в диагностике и лечении прогноз при смешанных и более агрессивных формах остается плохим. Неинвазивные тесты позволят своевременно идентифицировать и осуществлять мониторинг с течением времени. Лучшее понимание их биологии и процесса фенотипической дифференциации может проложить путь к новым методам лечения. Дифференцировка следует и может быть выведена из изменений в эпигенетическом ландшафте, которые формируют программы транскрипции. Среди эпигенетических маркеров метилирование ДНК особенно хорошо подходит для неинвазивного обнаружения, поскольку его можно измерить в циркулирующей опухолевой ДНК (цДНК). Новые технологии, такие как Oxford Nanopore Technologies (ONT), позволяют одновременно анализировать последовательность ДНК и метилирование, как мы недавно показали в Magi et al Nat Comms Biol 2022. Предыдущие исследования выявили различные нейроэндокринные эпитранскриптомные ландшафты, но проводились на образцах опухолей (Yachida et al Cancer Discov 2022), что затрудняло различение сигналов, специфически генерируемых внутри нейроэндокринных опухолевых клеток, от шума, создаваемого окружающими неопухолевыми или экзокринными опухолевыми клетками. В настоящее время эта проблема потенциально решается с помощью методов, позволяющих секвенировать отдельные клетки непосредственно из замороженных или залитых в парафин образцов пациентов.

Основным ожидаемым результатом является разработка нового метода жидкой биопсии для обнаружения и мониторинга GEP-NEN и MiNEN. С этой целью мы будем использовать возможности секвенирования Oxford Nanopore Technologies (ONT) для одновременного получения профилей секвенирования и метилированной ДНК. Важно отметить, что оценка происхождения клеток по ктДНК требует сравнения сигналов метилирования и фрагментомики с ранее созданными картами эталонных клеток и тканей (Кацман и др., 2022 Genome Biology). Для редких опухолей, таких как НЭН, эти карты в литературе отсутствуют; те немногие исследования, которые охарактеризовали эпигеномные особенности НЭН, вероятно, контаминированы окружающей стромой, поэтому эпигенетические сигналы (включая как метилирование ДНК, так и сайты связывания опухолеспецифических транскрипционных факторов, необходимые для фрагментомики) могут быть неинформативными для обнаружения в крови.

Тип исследования

Наблюдательный

Регистрация (Оцененный)

130

Контакты и местонахождение

В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.

Контакты исследования

Учебное резервное копирование контактов

Места учебы

  • Италия
      • Milan, Италия, 20141
        • Рекрутинг
        • European Institute of Oncology
        • Контакт:
          • Giuseppe Badalamenti, MD
        • Контакт:
          • Chiara Maria Grana, MD
        • Контакт:
          • Lorenzo Gervaso, MD
        • Контакт:
          • Chiara Alessandra Cella, MD
        • Контакт:
        • Контакт:
          • Nicola Fazio, MD,PhD
        • Контакт:
          • Francesca Spada, MD
        • Контакт:
          • Luca Mazzarella, MD
        • Контакт:
          • Elenora Pisa, MD
        • Контакт:
          • Emilio Bertani, MD
        • Контакт:
          • Laura Algeri, MD

Критерии участия

Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.

Критерии приемлемости

Возраст, подходящий для обучения

  • Взрослый
  • Пожилой взрослый

Принимает здоровых добровольцев

Нет

Метод выборки

Вероятностная выборка

Исследуемая популяция

Пациенты с ГЭП-НЭН с целью сбора адекватного материала и формального клинического установления чувствительности и специфичности анализа в клинически значимом сценарии.

Из-за относительной редкости заболевания по сравнению с не-НЭНами мы не будем включать последовательную популяцию, а проведем исследование случай-контроль:

  • Случаи: пациенты с операбельными гистологически подтвержденными НЭН.
  • Контрольная группа: пациенты с операбельными, гистологически подтвержденными ненейроэндокринными опухолями желудочно-кишечного тракта (включая рак желудка, поджелудочной железы, колоректального кишечника, тонкой кишки).

Пациенты будут включены в группу больных или контрольную группу на основании предоперационной диагностической биопсии, но будут окончательно распределены в группу больных или контрольную группу на основании полного гистологического исследования после операции.

Описание

Критерии включения:

  • Больной с гистологически подтвержденным диагнозом НЭК/МИНЕН подлежит хирургическому вмешательству с радикальной целью.
  • Больной с гистологически подтвержденным диагнозом НЭО подлежит хирургическому вмешательству с радикальной целью.
  • Пациент с метастатическим НЭО/НЭК, поддающийся биопсии или хирургическому вмешательству, включая паллиативные намерения

  • У пациента гистологически подтвержден гистотип, отличный от NEN:

    1. Колоректальный рак
    2. Рак тонкой кишки
    3. Рак желудка или пищевода
    4. Аденокарцинома протоков поджелудочной железы
    5. Метастазэктомия при любой карциноме ЖКТ, не относящейся к NEN

Критерии исключения:

  • Степень G1 и G2 <= 10% Ki67
  • Наличие сопутствующего новообразования (в течение 3 лет)
  • Сопутствующие серьезные гематологические изменения
  • Сопутствующая серьёзная органная дисфункция (например, печеночная или почечная недостаточность G3/4)
  • Текущая химиотерапия

Учебный план

В этом разделе представлена ​​подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.

Как устроено исследование?

Детали дизайна

Когорты и вмешательства

Группа / когорта
Случай нейроэндокринного новообразования
пациент с гистологически подтвержденным нейроэндокринным новообразованием и подтвержденным смешанным нейроэндокринно-ненейроэндокринным новообразованием с содержанием каждого компонента > 30%) и нейроэндокринной карциномой высокой степени злокачественности
Контроль ненейроэндокринных новообразований
пациент с гистологически подтвержденными ненейроэндокринными опухолями желудочно-кишечного тракта (в том числе желудка, поджелудочной железы, колоректальной кишки, тонкой кишки).

Что измеряет исследование?

Первичные показатели результатов

Мера результата
Мера Описание
Временное ограничение
Разработать диагностический анализ циркулирующей метДНК/фрагментомики.
Временное ограничение: 2 года
Эпигенетические различия, характеризующие нейроэндокринные опухоли, будут использованы для создания анализа жидкой биопсии на основе метилирования ДНК, способного обнаруживать циркулирующую опухолевую ДНК нейроэндокринного происхождения, чтобы обеспечить неинвазивную диагностику и мониторинг GEP-MiNEN.
2 года

Соавторы и исследователи

Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.

Спонсор

European Institute of Oncology

Соавторы

Azienda Ospedaliera Universitaria Policlinico Paolo Giaccone Palermo

Следователи

  • Главный следователь: Nicola Fazio, MD, European Institute of Oncology

Даты записи исследования

Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.

Изучение основных дат

Начало исследования (Действительный)

21 октября 2024 г.

Первичное завершение (Оцененный)

21 октября 2026 г.

Завершение исследования (Оцененный)

21 октября 2026 г.

Даты регистрации исследования

Первый отправленный

15 января 2025 г.

Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества

15 января 2025 г.

Первый опубликованный (Действительный)

25 марта 2025 г.

Обновления учебных записей

Последнее опубликованное обновление (Действительный)

25 марта 2025 г.

Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества

15 января 2025 г.

Последняя проверка

1 августа 2024 г.

Дополнительная информация

Термины, связанные с этим исследованием

Ключевые слова

Дополнительные соответствующие термины MeSH

Другие идентификационные номера исследования

  • L2-154

Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы

Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.

Нет

Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.

Нет

продукт, произведенный в США и экспортированный из США.

Нет

Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .

Подписаться