EpigenOMiske determinanter av den nevroendokrine fenotypen som biomarkører for nevroendokrine neoplasmer
EpigenOMiske determinanter for den nevroendokrine fenotypen som biomarkører for ikke-invasiv diagnose av nevroendokrine neoplasmer
Studieoversikt
Status
Detaljert beskrivelse
GEP-NEN er en heterogen gruppe sykdommer som omfatter relativt indolente og mer aggressive svulster, noen ganger med blandede eksokrine/endokrine komponenter (MINEN). På grunn av vedvarende usikkerhet i diagnose og behandling, er prognosen for de blandede og mer aggressive formene fortsatt dårlig. Ikke-invasive tester vil muliggjøre rettidig identifikasjon og overvåking over tid. En bedre forståelse av deres biologi og av den fenotypiske differensieringsprosessen kan bane vei for nye terapier. Differensiering følger, og kan utledes av, endringer i det epigenetiske landskapet som former transkripsjonsprogrammer. Blant epigenetiske markører er DNA-metylering spesielt godt egnet for ikke-invasiv deteksjon da den kan måles i sirkulerende tumor-DNA (ctDNA). Nye teknologier som Oxford Nanopore Technologies (ONT) muliggjør samtidig analyse av DNA-sekvens og metylering, som vi nylig viste av Magi et al. Nat Comms Biol 2022. Tidligere studier identifiserte distinkte nevroendokrine epi-transkriptomiske landskap, men ble utført på tumorprøver (Yachida et al Cancer Discov 2022), og hindret diskriminering av signaler spesifikt generert i nevroendokrine tumorceller fra støy på grunn av omkringliggende ikke-tumorale eller eksokrine tumorceller. Dette er nå potensielt løst ved metoder som tillater enkeltcellesekvensering direkte fra frosne eller parafininnstøpte pasientprøver.
Det viktigste forventede resultatet er utviklingen av en ny flytende biopsianalyse for påvisning og overvåking av GEP-NEN og MiNEN. For dette formål vil vi utnytte muligheten til Oxford Nanopore Technologies (ONT) sekvensering til samtidig å gi sekvensering og metylerte DNA-profiler. Viktigere, vurdering av celle opprinnelse fra ctDNA krever sammenligning av metylerings- og fragmentomiske signaler med tidligere genererte kart over referanseceller og vev (Katsman et al 2022 Genome Biology). For sjeldne svulster som NEN-er er disse kartene ikke tilgjengelige i litteraturen; de få studiene som har karakterisert de epigenomiske egenskapene til NEN-er er sannsynligvis forurenset av det omkringliggende stroma, så epigenetiske signaler (inkludert både DNA-metylering og tumorspesifikke transkripsjonsfaktorbindingssteder, avgjørende for fragmentomikk) kan være uinformative for påvisning i blodet.
Studietype
Registrering (Antatt)
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
- Navn: Nicola Fazio, MD
- Telefonnummer: 0257489258
- E-post: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Studer Kontakt Backup
- Navn: Francesca Spada, MD
- Telefonnummer: 0257489258
- E-post: divisione.gastrointestinale@ieo.it
Studiesteder
-
-
-
Milan, Italia, 20141
- Rekruttering
- European Institute of Oncology
-
Ta kontakt med:
- Giuseppe Badalamenti, MD
-
Ta kontakt med:
- Chiara Maria Grana, MD
-
Ta kontakt med:
- Lorenzo Gervaso, MD
-
Ta kontakt med:
- Chiara Alessandra Cella, MD
-
Ta kontakt med:
- Nicola Fazio, MD,PhD
- Telefonnummer: 0257489258
- E-post: divisione.gastrointestinale@ieo.it
-
Ta kontakt med:
- Nicola Fazio, MD,PhD
-
Ta kontakt med:
- Francesca Spada, MD
-
Ta kontakt med:
- Luca Mazzarella, MD
-
Ta kontakt med:
- Elenora Pisa, MD
-
Ta kontakt med:
- Emilio Bertani, MD
-
Ta kontakt med:
- Laura Algeri, MD
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Pasienter med GEP-NEN, som tar sikte på å samle tilstrekkelig materiale og for en formell klinisk for å etablere sensitivitet og spesifisitet av analysen i et klinisk meningsfylt scenario.
På grunn av den relative sjeldenheten til sykdommen sammenlignet med ikke-NEN-er vil vi ikke registrere en påfølgende populasjon, men vi vil sette opp en case-kontrollstudie:
- Tilfeller: pasienter med resekterbare, histologisk bekreftede NEN
- Kontroller: pasienter med resekterbare, histologisk bekreftede ikke-nevroendokrine gastrointestinale svulster (inkludert mage, bukspyttkjertel, kolorektal, tynntarm).
Pasienter vil bli registrert som tilfeller eller kontroller basert på deres pre-kirurgiske diagnostiske biopsi, men vil bli definitivt allokert i tilfellet eller kontrollgruppen basert på deres post-kirurgiske fullstendige histologiske undersøkelse.
Beskrivelse
Inkluderingskriterier:
- Pasient med histologisk bekreftet diagnose NEC/MINEN som kan opereres med radikale hensikter
- Pasient med histologisk bekreftet diagnose NET som kan opereres med radikale hensikter
- Pasient med metastatisk NET/NEC, mottakelig for biopsi eller kirurgi, inkludert palliativ hensikt
Pasient histologisk bekreftet ikke-NEN histotype:
- Kolorektal karsinom
- Tynntarmskarsinom
- Mage- eller spiserørskarsinom
- Pankreas duktal adenokarsinom
- Metastasektomi fra ethvert ikke-NEN GI-karsinom
Ekskluderingskriterier:
- Gradering G1 og G2 <=10 % Ki67
- Tilstedeværelse av samtidig neoplasma (innen 3 år)
- Samtidig store hematologiske endringer
- Samtidig alvorlig organdysfunksjon (f. G3/4 lever- eller nyresvikt)
- Pågående kjemoterapi
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / Kohort |
|---|
|
Nevroendokrin neoplasma tilfelle
pasient med histologisk bekreftet nevroendokrin neoplasma og bekreftet blandet nevroendokrin-ikke-nevroendokrin neoplasma med hver komponent > 30 %) og høygradige nevroendokrine karsinomer
|
|
Ikke-nevroendokrin neoplasmakontroll
pasient med histologisk bekreftede ikke-nevroendokrine gastrointestinale svulster (inkludert mage, bukspyttkjertel, kolorektal, tynntarm).
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Utvikle en sirkulerende methDNA/fragmentomics diagnostisk analyse
Tidsramme: 2 år
|
Epigenetiske forskjeller som karakteriserer nevroendokrine svulster vil bli utnyttet til å bygge en DNA-metyleringsbasert flytende biopsianalyse som er i stand til å oppdage sirkulerende tumor-DNA av nevroendokrin avledning, for å muliggjøre ikke-invasiv diagnose og overvåking av GEP-MiNEN.
|
2 år
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Samarbeidspartnere
Etterforskere
- Hovedetterforsker: Nicola Fazio, MD, European Institute of Oncology
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Faktiske)
Primær fullføring (Antatt)
Studiet fullført (Antatt)
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Ytterligere relevante MeSH-vilkår
Andre studie-ID-numre
- L2-154
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
produkt produsert i og eksportert fra USA
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .