Methyl-qPCR: een nieuwe voorspellende marker voor met het Epstein-Barr-virus geassocieerde lymfoproliferaties tijdens allogene hematopoëtische stamceltransplantatie (EBVALLO)
Wetenschappelijke context
Het Epstein-Barr-virus speelt een oorzakelijke rol bij de pathogenese van meerdere verschillende lymfomen. Lymfoproliferatieve ziekten na transplantatie (PTLD) zijn de meest voorkomende door EBV geïnduceerde proliferaties. PTLD na allogene stamceltransplantatie heeft een incidentie van minder dan 5%, maar kan oplopen tot 10-20% bij patiënten met vastgestelde risicofactoren. EBV-DNAemia is voorspellend voor EBV-PTLD en wordt routinematig uitgevoerd met behulp van qPCR op volbloed. Preventieve therapeutische strategieën met anti-CD20-antilichaam worden gebruikt wanneer patiënten boven een gedefinieerde EBV-DNAemia-drempel zitten. Deze benadering blijft beperkt aangezien er geen onderscheid wordt gemaakt tussen een door EBV geïnduceerde lymfoproliferatie (latente cyclus) en/of een replicerend virus (replicatieve cyclus).
Epigenetische modificaties spelen een centrale rol bij het reguleren van de omschakeling van latente naar lytische genexpressie. Specifieke DNA-modificaties kunnen worden beschouwd als moleculaire handtekeningen voor EBV-genomen geassocieerd met de status van de virale infectie (latent versus lytisch). Dienovereenkomstig kunnen deze handtekeningen worden gezien als een krachtig hulpmiddel om de toestand van de virale infectie in vivo te karakteriseren.
Beschrijving van het project Ons primaire doel is om de respectievelijke percentages van EBV-lytische en EBV-latente genomen (prolifererende cellen) te schatten bij patiënten met een hoge EBV-DNA-emie na allogene stamceltransplantatie HSCT door de epigenetische modificaties van het EBV-genoom op specifieke sites. Onze secundaire doelstellingen zijn i) het bepalen van risicofactoren geassocieerd met elk "latent versus lytisch EBV"-profiel en ii) het correleren van de "latent versus lytisch EBV"-profielen met respons op rituximab-infusie en patiëntresultaten.
Hiertoe wordt een retrospectieve studie (n=80) en een prospectieve studie (schatting n=58) opgezet. De verschillende stappen van dit project zijn:
- Om epigenetische modificaties te bestuderen. Het laboratorium ontwikkelt een nieuwe aanpak om latente en lytische genomen te onderscheiden.
- Kwantitatieve analyse door middel van RT-PCR realiseren van verschillende EBV-transcripten die specifiek zijn voor de latente of de lytische fase van het virus. Deze methode zal worden toegepast op RNA dat is geëxtraheerd uit bloedmonsters van patiënten met een verhoogde EBV-virale belasting, onder voorwaarde dat de RNA-integriteit behouden blijft. De resultaten zullen worden gevalideerd op een prospectief cohort van HSCT-patiënten (n=58) (ziekenhuis Saint-Antoine en ziekenhuis La Pitié-Salpêtrière).
- Kwantitatieve analyse uitvoeren van EBV-genomen in plasma-, speeksel- en totale bloedmonsters volgens de huidige routineprocedures Naast totale bloedmonsters zullen plasma en speeksel worden verzameld, aangezien bekend is dat vrije virale deeltjes zich ophopen in deze biologische vloeistoffen bij EBV-reactivering. Deze monsters zullen worden behandeld volgens genormaliseerde procedures die routinematig worden gebruikt in het laboratorium voor medische virologie om EBV in menselijke monsters te kwantificeren.
Verwachte resultaten Door een eenvoudige methode vast te stellen voor het bestuderen van epigenetische modificaties van EBV-genomen, verwachten we het belang van een hoge EBV-virale belasting en de pathofysiologie van post-HSCT PTLD te begrijpen. We streven ernaar om onderscheid te maken tussen de latente / lytische profielen van HSCT-patiënten en om hun respectieve risico's voor het ontwikkelen van PTLD te correleren. Het vaststellen van het epigenetische EBV-profiel in de post-HSCT-setting bij verhoogde virale belasting en PTLD zal ons begrip van de biologische mechanismen die de EBV-status bepalen in post-HSCT verbeteren. Dit moet grote medische en economische problemen oplossen. Deze resultaten zouden een belangrijk therapeutisch effect kunnen hebben
Studie Overzicht
Toestand
Interventie / Behandeling
Gedetailleerde beschrijving
Studieduur :
Totale duur van de studie: 37 maanden Duur van rekrutering: 24 maanden Duur van deelname voor elke patiënt: 13 maanden
Inclusiecriteria:
Retrospectieve studie: Patiënt die HSCT onderging, in het ziekenhuis van Saint-Antoine, tussen 2010-2015, behandeld met rituximab voor hoog niveau EBV-DNAemie (meer dan 3,3 log kopieën/ml).
Prospectieve studie: patiënten die HSCT ondergingen, in het Saint-Antoine ziekenhuis en la Pitié-Salpêtrière, in 2016-2017, behandeld met rituximab voor hoog niveau EBV-DNAemie (meer dan 10 000 c/ml), en/of met lymfoproliferatieve ziekten na transplantatie (PTLD) Bezorgde populatie Patiënten met allogene hematopoëtische stamceltransplantatie (allo-HSCT) met een hoge virusbelasting van het Epstein-Barr-virus (EBV)
Studie eindpunten:
Primair eindpunt (gekoppeld aan het primaire doel) Respectieve percentages van latente versus replicatieve EBV-profielen, gedefinieerd door het methyleringsniveau van specifieke plaatsen van het EBV-genoom, in een cohort van HSCT-patiënten met een hoge EBV-virale belasting (meer dan 3,3 log kopieën/ml) vóór aanvang van de behandeling per rituximab. Er zal een methylatie-index worden berekend op basis van de respectieve verschillen van de "Cyclusdrempels" van de methyl-qPCR uitgevoerd op bloedmonsters van patiënten. Secundaire eindpunten (gekoppeld aan de secundaire doelstellingen)
- Kenmerken van de patiënten volgens de EBV q-PCR-resultaten
Uitkomst van de patiënt volgens het EBV-profiel gedefinieerd door de methyl-qPCR:
- Respons op Rituximab-infusie (EBV DNA-emie < 3,3 log kopieën/ml) na maximaal 4 infusies)
- Ziektevrije overleving (DFS) na 12 maanden gedefinieerd als overleving zonder terugval
- Totale overleving (OS) na 12 maanden
- Terugvalincidentie (RI) na 12 maanden
- Non-relapse mortaliteit (NRM) na 12 maanden
- Aantal post-HSCT-infecties binnen 12 maanden
Statistische analyse :
Vergelijking tussen kenmerken van latente en lytische genomen zal worden uitgevoerd met behulp van parametrische (Student t-test) of niet-parametrische (Mann Whitney-test) indien van toepassing voor continue variabelen, Chi-Square-test voor kwalitatieve variabelen.
Multivariate analyse voor het bepalen van risicofactoren geassocieerd met "lytische EBV"-profielen zal worden uitgevoerd met behulp van logistische regressie.
- Correlatie tussen "latente versus lytische EBV"-profielen" en respons op rituximab-infusie zal worden uitgevoerd met behulp van logistische regressie, waarbij in het model alle andere factoren die mogelijk geassocieerd zijn met de respons op rituximab, worden meegenomen. OS en DFS worden geschat met behulp van de Kaplan-Meier-methode. Cumulatieve incidenties van RI en NRM worden berekend vanaf de datum van opname tot respectievelijk de datum van terugval of overlijden in remissie, waarbij de andere gebeurtenis het concurrerende risico is. Dood of progressie worden beschouwd als concurrerende gebeurtenissen voor het schatten van de incidentie van acute GVHD. Multivariate analyses voor overlevingseindpunten zullen worden uitgevoerd met behulp van het Cox-model voor proportionele risico's. Het type I-foutpercentage is vastgesteld op 0,05 voor het bepalen van factoren die verband houden met de tijd tot gebeurtenisuitkomsten. Alle statistische analyses worden uitgevoerd met R-softwarepakketten (R Foundation for Statistical Computing, Wenen, Oostenrijk)
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
-
Paris, Frankrijk, 75012
- Service d'Hematologie Clinique
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Beschrijving
Inclusiecriteria:
Retrospectieve studie:
- Patiënt die HSCT onderging, in het Saint-Antoine ziekenhuis,
- tussen 2010-2015,
- behandeld met rituximab voor hoog niveau EBV-DNAemie (meer dan 3,3 log kopieën/ml).
Prospectieve studie:
- Patiënten die HSCT hebben ondergaan, in het ziekenhuis van Saint-Antoine en la Pitié-Salpêtrière,
- in 2017-2018,
- behandeld met rituximab voor EBV-DNAemie op hoog niveau (meer dan 10.000c/ml),
- En/of lymfoproliferatieve ziekten (PTLD) na transplantatie hebben
Uitsluitingscriteria:
- Weigering om de geïnformeerde toestemming te ondertekenen
- Patiënt die geen begunstigde is van het socialezekerheidsstelsel
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Fundamentele wetenschap
- Toewijzing: NVT
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / Arm |
Interventie / Behandeling |
|---|---|
|
Ander: EBV+ transplantaatpopulatie
Retrospectieve studie (n=80): Patiënt die HSCT onderging, in het Saint-Antoine ziekenhuis, tussen 2010-2015, behandeld met rituximab voor hoog niveau EBV-DNAemie (meer dan 3,3 log kopieën/ml). Prospectief onderzoek (n=58): Patiënten die HSCT ondergingen, in het Saint-Antoine ziekenhuis en la Pitié-Salpêtrière, in 2016-2017, behandeld met rituximab voor hoog niveau EBV-DNAemie (meer dan 10 000 c/ml), en/of met post-transplantatie lymfoproliferatieve ziekten (PTLD) Bezorgde populatie Allogene hematopoietische stamceltransplantatie (allo-HSCT) patiënten met een hoge Epstein-Barr virus (EBV) viral load |
Bij D0:
Bij D8: bloedafname de resultaten zullen worden vergeleken met de analyse van EBV-transcripten die specifiek zijn voor de latente of replicatieve fase van het virus door reverse transcriptie-kwantitatieve PCR (RT-qPCR), en met de detectie van vrij virus in het speeksel, dat wordt geassocieerd met virale reactivering |
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Respectieve percentages van latente versus replicatieve EBV-profielen
Tijdsspanne: 12 maanden
|
Gedefinieerd door epigenetische modificaties van het EBV-genoom, in een cohort van HSCT-patiënten met een hoge EBV-virale belasting (meer dan 10.000 c/ml) vóór aanvang van de behandeling per rituximab.
|
12 maanden
|
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
|---|---|---|
|
Kenmerken van de patiënten volgens de EBV-resultaten
Tijdsspanne: 12 maanden
|
Om de risicofactoren te bepalen die geassocieerd zijn met latente versus replicatieve EBV-profielen, in allo-HSCT met een hoge virale belasting.
|
12 maanden
|
|
Uitkomst van de patiënt volgens het EBV-profiel
Tijdsspanne: 12 maanden
|
- Respons op Rituximab-infusie (EBV DNA-emie < 3 log kopieën/ml na maximaal 4 infusies)
|
12 maanden
|
Medewerkers en onderzoekers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Eolia Brissot, Associate Professor, Assistance Publique - Hôpitaux de Paris
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
- NI15023
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .