Protocol voor klinische karakterisering van ernstige infectieziekten (CCPSEI) (CCPSEI)

Infectieziekte is wereldwijd de grootste doodsoorzaak. Nieuwe infectieuze agentia, zoals SARS, MERS en SARS CoV-2, nieuwe griepvirussen, virussen die virale hemorragische koorts veroorzaken (bijv. Ebola), en virussen die het centrale zenuwstelsel (CZS) aantasten, zoals TBEV en Nipah, vereisen onderzoek om de pathogeenbiologie en pathogenese in de gastheer te begrijpen. Zelfs voor bekende infecties is resistentie tegen antimicrobiële therapieën wijdverbreid en ontbreken behandelingen om potentieel schadelijke gastheerreacties te beheersen.

Om een ​​mechanistisch begrip van ziekteprocessen te ontwikkelen, zodat risicofactoren voor ernstige ziekte kunnen worden geïdentificeerd en behandelingen kunnen worden ontwikkeld, is het noodzakelijk om pathogeenkarakteristieken te begrijpen die verband houden met virulentie, de replicatiedynamiek en de evolutie van de ziekteverwekker in de gastheer. de dynamiek van de reactie van de gastheer, de farmacologie van antimicrobiële of gastheergerichte therapieën, de transmissiedynamiek en factoren die ten grondslag liggen aan individuele gevoeligheid.

Het nieuwe ernstige acute respiratoire syndroom coronavirus 2 (SARS-CoV-2) heeft geleid tot bijna 500.000 gevallen van COVID-19 en meer dan 22.000 doden wereldwijd. Op 21 maart 2020 waren er 24.738 gevallen en 291 doden in de Verenigde Staten en 190 gevallen in Maryland, VS. De wereld is rampzalig, met meldingen van ernstige overbevolking in ziekenhuizen, tekorten aan medische benodigdheden en onvoldoende medisch personeel om de toename van patiënten die zorg zoeken aan te pakken. Het risico dat deze situatie zich in andere landen voordoet, wordt benadrukt door de neiging tot hoge besmettelijkheid en asymptomatische verspreiding. Om patiënten en de gemeenschap in het algemeen te beschermen, is er dringend onderzoek nodig om quarantaine- en behandelingsstrategieën voor COVID-19 te begeleiden.

Morbiditeit en mortaliteit door COVID-19 wordt in verband gebracht met de ontwikkeling van fulminante respiratoire insufficiëntie. Recente gegevens suggereren dat sterftecijfers oplopen tot 38% onder degenen die IC-zorg nodig hebben, van wie velen Acute Respiratory Distress Syndrome (ARDS) ontwikkelden. Het is momenteel echter niet bekend welke patiënten risico lopen op een ernstige ziekte. Diagnostische hulpmiddelen zijn dringend nodig om immunologische en fysiologische ziektereacties te detecteren om infectie bij asymptomatische personen te identificeren en om infecties op het traject naar ARDS te identificeren. Bovendien blijven de infectieuze reservoirs van SARS CoV-2 onduidelijk, hoewel kinderen belangrijke reservoirs kunnen zijn, gezien het relatief milde ziekteverloop van kinderen en de langdurige virale uitscheiding van zowel respiratoire als ontlastingsmonsters. Dit protocol is bedoeld om deze kritieke kennislacunes en toekomstige vragen die relevant zijn voor het klinische management van COVID-19 aan te pakken.

INPATIËNT Ingeschreven patiënten zullen bij inschrijving volbloed, 1 RNA-buisje, serum, nasofaryngeale (NP) of orofaryngeale (OP) uitstrijkjes laten afnemen. Daaropvolgende bloedafnames (volbloed, serum of plasma) uitsluitend voor onderzoek bij gehospitaliseerde patiënten zullen maximaal 10 ml per dag bedragen. Dit zal over het algemeen een schema volgen van dag 0/1, 3, 7 en wekelijks tijdens ziekenhuisopname. Daaropvolgende collecties na ontslag uit het ziekenhuis vinden plaats na 1 maand, 3 maanden, 6 maanden, 9 maanden en 12 maanden.

Klinische gegevens van routinematige klinische zorg die zullen worden geregistreerd omvatten, maar zijn niet beperkt tot:

• Symptomen
• Uitgebreide medische geschiedenis
• Medicijnen
• Lichamelijk onderzoek inclusief vitale functies en zuurstoftoediening
• Klinische en microbiologische laboratoria uitgevoerd tijdens (volledige bloedtelling (CBC), chemie, lactaat, bloedkweekresultaten, HIV-resultaten)
• Beelden en/of beeldvormingsresultaten uit het ziekenhuisdossier

OUTPATIËNT Na inschrijving neemt een verzendcoördinator contact op met de deelnemer om de bereidheid van de deelnemer om deel te nemen te bevestigen en om het verzendadres te verifiëren waarnaar een zelftestkit voor het onderzoek zal worden verzonden. Deze kit bevat een thermometer, pulsoximeter, handschoenen, NP- en OP-swabs (voor dagen 0, 3, 7, 14), 4 virale transportmedia waarin de wattenstaafjes na het testen worden geplaatst, Tasso- en/of bloedvlektesten kits, Oracol (verzamelbuis voor orale vloeistof).

Deelnemers met bevestigde of vermoede COVID-19, 18 jaar en ouder zullen worden gevolgd met zelfafname van monsters. Het zelf verzamelen van monsters vindt plaats op dag 0, wat binnen 24-48 uur na inschrijving moet plaatsvinden. Zelfafname van monsters vindt ook plaats op dag 3, 7, 14,(-1/+1) en 28 dagen (+32). Deelnemers met aanhoudende symptomen krijgen indien haalbaar een extra ophaaldatum op 21 dagen (-2/+2). Deelnemers wordt geadviseerd dit zelf te doen en niet anderen om hulp te vragen. Een zelftestkit zou duidelijke instructies bevatten voor het zelf verzamelen van monsters. Dit kan respiratoire, orale vloeistof en gedroogde bloedvlek / pijnloze capillaire bloedafname omvatten, afhankelijk van de beschikbaarheid van middelen. Afhankelijk van de verzendingsmiddelen worden monsters tijdelijk opgeslagen in de persoonlijke vriezer van de deelnemer. Vitale functies (bijv. hartslag, zuurstofverzadiging, temperatuur) zullen worden verzameld door deelnemers met positieve COVID-19-resultaten met behulp van apparaten die door het onderzoek worden geleverd wanneer er middelen beschikbaar zijn (bijv. draagbare pulsoximeter en/of thermometer). Vragenlijsten voor demografie, medische geschiedenis, sociaaleconomische, geestelijke gezondheid, huishoudelijke contacten en huisvestingssituatie zullen elektronisch of door studiepersoneel worden afgenomen, afhankelijk van de situatie van de studiedeelnemer. Op elk bemonsteringstijdstip zal een standaardsymptoomvragenlijst worden afgenomen, hetzij elektronisch, hetzij door het onderzoekspersoneel, ook op dag 28.