Onderzoeksonderzoek naar COVID-19-speekseltest

In december 2019 veroorzaakte een nieuw coronavirus een uitbraak in Wuhan, China. Slechts een maand later werd Covid-19 op 30 januari 2020 uitgeroepen tot een noodsituatie op het gebied van de volksgezondheid van internationaal belang. De Wereldgezondheidsorganisatie (WHO) heeft herhaaldelijk aangekondigd dat 'diagnostische tests voor COVID-19 van cruciaal belang zijn om het virus op te sporen, de epidemiologie te begrijpen, het casemanagement te informeren en de overdracht te onderdrukken'. De prioriteit binnen Public Health England (PHE) was het opschalen van tests voor de volksgezondheid met behulp van moleculaire diagnose door middel van real-time RT-PCR (RdRp-gen) assay op basis van orale uitstrijkjes.

Enkele van de belangrijkste uitdagingen die openbaar worden gepresenteerd met betrekking tot testen zijn de snelheid van mobilisatie, problemen met de toeleveringsketen als gevolg van de internationale vraag naar cruciale testmaterialen zoals kits, uitstrijkjes en chemische reagentia, en de kwaliteit en het comfort van de vaak gebruikte nasofaryngeale (NSP) uitstrijkjes.

Chronomics heeft nieuwe methoden ontwikkeld om deze problemen aan te pakken. Ten eerste heeft Chronomics, vanwege het tekort aan de specifieke merkproducten die worden gebruikt in het officiële CDC FDA EUA COVID-19 RT-qPCR-protocol voor RNA-extractie, het testen van componenten verzameld en samengesteld om een ​​extractiekit te creëren met een grotere beschikbaarheid van levering voor gebruik binnen het protocol. Ten tweede zijn de methoden van Chronomics gebaseerd op speekselverzameling die pijnloos en gemakkelijk te verzamelen is.

Het doel van deze studie is om de Chronomics-test te vergelijken met de NPS-tests en het protocol dat momenteel in gebruik is om de doeltreffendheid van de Chronomics-aanpak aan te tonen. De belangrijkste vraag is: presteert de speekseltest van Chronomics net zo goed als de NPS NHS-test? Er zijn twee componenten van het testkader van Chronomics die de onderzoekers willen valideren om hierin te voeden. Ten eerste dat de alternatieve reagentia en workflow van Chronomics (RNA-extractie en RT-PCR-stappen) geen invloed hebben op de detectiegevoeligheid en ten tweede dat de alternatieve bemonsteringsbron van speeksel van Chronomics ook geen invloed heeft op de detectiegevoeligheid. Om deze twee componenten te valideren, vergelijken de onderzoekers zowel een Chronomics-speekselmonster met een NHS NPS-monster als een Chronomics NPS-monster met een NHS NPS-monster. De onderzoekers zouden toegang nodig hebben tot de output (en informatie over de gekoppelde patiënt) voor de NHS gouden standaard workflow.