Deze pagina is automatisch vertaald en de nauwkeurigheid van de vertaling kan niet worden gegarandeerd. Raadpleeg de Engelse versie voor een brontekst.

Klinische toepassing van genetische sequentiebepaling van patiënten met vroege maagkanker en maagadenoom

6 september 2025 bijgewerkt door: Hyuk Lee, Samsung Medical Center

Project voor klinische sequentiebepaling voor vroege maagkanker en precancereuze maagadenoompatiënten voor een gepersonaliseerde kankerkliniek

Omdat gevorderde maagkanker een slechte prognose heeft, is het belangrijk om vroege maagkanker of precancereuze maagadenoompatiënten op te sporen die een genezingspercentage van 95% of meer hebben. Bovendien kan een groot deel van de vroege maagkanker volledig worden verwijderd door endoscopische resectie, waardoor een zeer hoge kwaliteit van leven voor patiënten wordt gegarandeerd. Er zijn momenteel echter geen markers die kunnen worden gebruikt voor de diagnose van vroege maagkanker of maagadenoom. Bovendien is het grootste probleem na endoscopische resectie van vroege maagkanker een metachroon recidief van de kanker, waarvoor herhaalde endoscopische resectie of aanvullende chirurgische gastrectomie vereist is. Er zijn echter geen ontdekte markers voor het voorspellen van herhaling.

Vloeibare biopsie is een methode voor het verkrijgen van lichaamsvloeistoffen zoals maagsap of effusie via een endoscopische inlaat tijdens gastroscopie of colonoscopie en bloed. Op basis van de geavanceerde analysemethode onthult vloeibare biopsie meer genetische informatie dan weefselbiopsie. Daarom is het zeer waarschijnlijk dat het een essentiële factor wordt in toekomstige gepersonaliseerde geneeskunde. Daarom werd deze studie opgezet om te identificeren of de moleculaire profilering van de tumor op basis van weefsel of bloed kan worden gebruikt voor het voorspellen van de prognose en diagnose van vroege maagkanker en precancereus maagadenoom.

Studie Overzicht

Toestand

Werving

Conditie

Gedetailleerde beschrijving

  1. Verkrijging van tumormonsters: Weefsel en 10 ml bloed zullen worden verzameld voor genomisch onderzoek van degenen bij wie histologisch de diagnose maagkanker in een vroeg stadium of precancereuze maagadenoomlaesie is gesteld, en extra weefsel en bloed zullen worden verzameld na 2 maanden, 1 jaar na behandeling en recidief.

  2. Geschiktheid van tmor-monsters

    : Tumorgebieden (> 60%) worden ontleed onder microscopie van ongekleurde secties van 4 μm dik in vergelijking met een met H&E gekleurd objectglaasje, en genomisch DNA werd geëxtraheerd met behulp van een Qiagen DNA FFPE Tissue Kit (Qiagen, Hilden, Duitsland) volgens de gebruiksaanwijzing. Na extractie hebben we concentraties en 260/280 en 260/230 nm-verhoudingen gemeten met behulp van een spectrofotometer (ND1000, Nanodrop Technologies, ThermoFisher Scientific, MA, VS). Elk monster werd vervolgens gekwantificeerd met een Qubit-fluorometer (Life Technologies, Carlsbad, CA, VS). Monsters van genomisch DNA met meer dan 10 ng gemeten met de Qubit-fluorometer werden onderworpen aan AmpliSeq-bibliotheekvoorbereiding. Om "medicijnbare" CNV's te identificeren, gebruikten we een 21-gen nCounter CNV-assay.

  3. Methode voor moleculaire profilering van tumoren

    • Ion Torrent PGM Amplieq Cancer Panel 2.0: We gebruiken het Ion AmpliSep Cancer Panel V2 (Ion Torrent) om frequente somatische mutaties te detecteren die werden geselecteerd op basis van literatuuronderzoek. Het onderzoekt 285 mutaties in 50 vaak gemuteerde oncogenen en tumorsuppressorgenen. Eerst onderging 10 ng DNA van elke 89 FFPE-tumormonsters single-tube, multiplex PCR-amplificatie met behulp van de Ion AmpliSepCancer Primer Pool en de AmpliSepKit-reagentia (Life Technologies). Behandeling van de resulterende amplicons met FuPa Preagent verteert de primers gedeeltelijk en fosforyleert de amplicons . Het fosforylaat van de amplicons wordt geligeerd aan ionendapters en gezuiverd. Voor bibliotheekvoorbereiding met streepjescode vervangen we adapters met streepjescode uit de Ion XpressTM Library Kit. Het geligeerde DNA ondergaat nick-translatie en -amplificatie om de koppeling tussen adapters en amplicons te voltooien en om voldoende materiaal te genereren voor downstream-template-treparatie. Twee ronden Agencourt® AMPure® XP-reagensbinding bij volumeverhoudingen van 0,6 en 1,2 bolletjes tot monster verwijderden input-DNA en niet-geïncorporeerde primers vormen de amplicons. De uiteindelijke bibliotheekmoleculen zijn 125-300 bp groot. Vervolgens brengen we de bibliotheken over naar het Ion OneTouchTM-systeem voor geautomatiseerde sjabloonvoorbereiding. Sequencing wordt uitgevoerd op de Ion PGM™-sequencer volgens de instructies van de fabrikant. We gebruiken IonTorrent-software voor geautomatiseerde gegevensanalyse.
    • nCounter copy Number Variation CodeSets: we hebben op maat een 21-gen CNV-assay ontworpen, zoals beschreven in een eerdere studie. De 21 genen omvatten AURAKA, CCND1, CCNE1, CDK4, CDK6, CDNK1A, CDNK2A, EGFR, ERBB2, ERBB3, FGFR1, FGFR2, IGFR1R, KLF5, KRAS, MDM2, MET, MITF, MYC, PIK3CA en TNIK. Voor detectie van CNV's werden nCounter Copy Number Variation CodeSets gebruikt met 200 ng gezuiverd genomisch DNA. DNA werd gefragmenteerd via AluI-digestie en gedenatureerd bij 95°C. Gefragmenteerd DNA werd gehybridiseerd met de codeset van 21 genen in de nCounter Cancer CN Assay Kit (Nanostring Technologies) gedurende 18 uur bij 65°C en verwerkt volgens de instructies van de fabrikant. De nCounter Digital Analyzer telde en tabelleerde de signalen van reportersondes. Gekwantificeerde gegevens werden geanalyseerd met NanoString's nSolver Analysis Software.

    • Immunohistochemie

      : RET, ATM, PD-L1, FGFR2, MLH, EGFR, ALK, ROS, TRKA. MET-, HER2-, PTEN-verlies (EGFR, CCNEI in geselecteerde gevallen)

    • Kanker scan

      : gerichte deep sequencing bij het Samsung Genome Institute

      : Illumina HiSeq2000/2500-gebaseerde, MiSeq NGS gerichte sequencing

    • ASFA™-spotter
  4. Statistieken : Analyse van genetisch onderzoek is vooral technisch. Gegevens worden gepresenteerd met behulp van samenvattende statistische tabellen en grafieken. De totale ziektevrije overlevingsperiode wordt berekend met de Kaplan-Meier-methode aan de hand van medische dossiers van proefpersonen die endoscopische resectie hebben ondergaan.

Studietype

Observationeel

Inschrijving (Geschat)

1730

Contacten en locaties

In dit gedeelte vindt u de contactgegevens van degenen die het onderzoek uitvoeren en informatie over waar dit onderzoek wordt uitgevoerd.

Studiecontact

Studie Locaties

Deelname Criteria

Onderzoekers zoeken naar mensen die aan een bepaalde beschrijving voldoen, de zogenaamde geschiktheidscriteria. Enkele voorbeelden van deze criteria zijn iemands algemene gezondheidstoestand of eerdere behandelingen.

Geschiktheidscriteria

Leeftijden die in aanmerking komen voor studie

19 jaar tot 100 jaar (Volwassen, Oudere volwassene)

Accepteert gezonde vrijwilligers

NVT

Bemonsteringsmethode

Kanssteekproef

Studie Bevolking

In totaal zullen 1730 patiënten met vroege maagkanker en precancereus maagadenoom worden ingeschreven. Op basis van eerdere studies wordt verwacht dat ongeveer 20% van de proefpersonen mutaties zal hebben. In deze studie zal het recidiefpercentage van metachrone tumoren tussen de mutatiegroep en de niet-mutatiegroep worden vergeleken. Over het algemeen wordt gerapporteerd dat het recidiefpercentage van metachrone tumoren na endoscopische resectie voor vroege maagkanker of maagademona 6% -10% is. In deze studie wordt verwacht dat het recidiefpercentage van de metachrone tumor respectievelijk 10% en 5% zal zijn in de mutatie- en niet-mutatiegroep. Wanneer een tweezijdige chikwadraattest met een power van 5% en 90% type 1-fout wordt uitgevoerd, wordt verwacht dat 346 en 1384 proefpersonen worden opgenomen in respectievelijk de mutatiegroep en de niet-mutatiegroep.

Beschrijving

Inclusiecriteria:

  1. Die ouder zijn dan 19 jaar
  2. Degenen die histologisch werden bevestigd met vroege maagkanker of precancereus maagadenoom
  3. Patiënten met maagkanker in een vroeg stadium of precancereus maagadenoom die onder de bovenstaande criteria vallen en die overtollig weefsel hebben opgeslagen van eerdere niet-onderzoeksdoeleinden biopsie/endodoscopische verwijdering voor behandeling en diagnose
  4. Degenen met een levensverwachting van meer dan 3 maanden
  5. Degenen die vrijwillig hebben ingestemd met deelname aan deze klinische proef

Uitsluitingscriteria:

  1. Degenen die niet genoeg monsters zullen opleveren
  2. Degenen die ongeschikt worden geacht voor deze studie naar het oordeel van de onderzoekers

Studie plan

Dit gedeelte bevat details van het studieplan, inclusief hoe de studie is opgezet en wat de studie meet.

Hoe is de studie opgezet?

Ontwerpdetails

Wat meet het onderzoek?

Primaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Identificeer biomarkers voor differentiële diagnose tussen vroege maagkanker en precancereus adenoom.
Tijdsspanne: Vanaf de datum van de eerste behandeling tot de datum van het eerste recidief of tot 2 jaar, afhankelijk van wat zich het eerst voordeed.

De moleculaire profilering van de tumor wordt op de volgende manier beoordeeld:

  1. Ion Torrent PGM Amplieq Kankerpaneel 2.0
  2. Nanostring kopie nummer variatie (CNV) paneel
  3. Immunohistochemie: RET, ATM, PD-L1, FGFR2, MLH, EGFR, ALK, ROS, TRKA. MET-, HER2-, PTEN-verlies (EGFR, CCNEI in geselecteerde gevallen)
  4. Op Illumina HiSeq2000/2500 gebaseerde, op MiSeq NGS gerichte sequencing
  5. ASFA™-spotter
Vanaf de datum van de eerste behandeling tot de datum van het eerste recidief of tot 2 jaar, afhankelijk van wat zich het eerst voordeed.
Identificeer prognostische biomarkers voor het voorspellen van herhaling van vroege maagkanker en precancereuze adenoomlaesie.
Tijdsspanne: Vanaf de datum van de eerste behandeling tot de datum van het eerste recidief of tot 2 jaar, afhankelijk van wat zich het eerst voordeed.

Vergelijking van het moleculaire profiel van de tumor tussen de gevallen van recidief en niet-recidief.

De moleculaire profilering van de tumor wordt op de volgende manier beoordeeld:

  1. Ion Torrent PGM Amplieq Kankerpaneel 2.0
  2. Nanostring kopie nummer variatie (CNV) paneel
  3. Immunohistochemie: RET, ATM, PD-L1, FGFR2, MLH, EGFR, ALK, ROS, TRKA. MET-, HER2-, PTEN-verlies (EGFR, CCNEI in geselecteerde gevallen)
  4. Op Illumina HiSeq2000/2500 gebaseerde, op MiSeq NGS gerichte sequencing
  5. ASFA™-spotter
Vanaf de datum van de eerste behandeling tot de datum van het eerste recidief of tot 2 jaar, afhankelijk van wat zich het eerst voordeed.

Secundaire uitkomstmaten

Uitkomstmaat
Maatregel Beschrijving
Tijdsspanne
Verandering in het moleculaire profiel van de tumor op seriële biopsieën op het moment van de eerste behandeling, 2 maanden na de behandeling, 1 jaar na de behandeling, of recidief.
Tijdsspanne: Vanaf de datum van de eerste behandeling tot de datum van het eerste recidief of tot 2 jaar, afhankelijk van wat zich het eerst voordeed.
De methode van moleculaire profilering van de tumor is dezelfde als hierboven.
Vanaf de datum van de eerste behandeling tot de datum van het eerste recidief of tot 2 jaar, afhankelijk van wat zich het eerst voordeed.

Medewerkers en onderzoekers

Hier vindt u mensen en organisaties die betrokken zijn bij dit onderzoek.

Sponsor

Samsung Medical Center

Onderzoekers

  • Hoofdonderzoeker: Hyuk Lee, MD, PhD, Samsung Medical Center

Studie record data

Deze datums volgen de voortgang van het onderzoeksdossier en de samenvatting van de ingediende resultaten bij ClinicalTrials.gov. Studieverslagen en gerapporteerde resultaten worden beoordeeld door de National Library of Medicine (NLM) om er zeker van te zijn dat ze voldoen aan specifieke kwaliteitscontrolenormen voordat ze op de openbare website worden geplaatst.

Bestudeer belangrijke data

Studie start (Werkelijk)

17 december 2020

Primaire voltooiing (Geschat)

31 december 2029

Studie voltooiing (Geschat)

31 december 2031

Studieregistratiedata

Eerst ingediend

8 november 2020

Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria

6 december 2020

Eerst geplaatst (Werkelijk)

14 december 2020

Updates van studierecords

Laatste update geplaatst (Geschat)

12 september 2025

Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria

6 september 2025

Laatst geverifieerd

1 september 2025

Meer informatie

Termen gerelateerd aan deze studie

Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden

Andere studie-ID-nummers

  • 2020-08-070-002

Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)

Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?

ONBESLIST

Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel

Nee

Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct

Nee

Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .

Abonneren