COVID-2019 Vaccin Immune Response Base op Single Cell Multi-Omics

Als belangrijk onderdeel van het menselijk lichaam is het immuunsysteem nauw verbonden met het ontstaan ​​van ziekten. Op basis van de traditionele classificatiemethodiek is het voornamelijk verdeeld in twee takken: aangeboren immuniteit en adaptieve immuniteit. Aangeboren immuuncellen omvatten voornamelijk monocyten (Mono), natural killer (NK) cellen en dendritische cellen (DC). De adaptieve immuuncellen omvatten voornamelijk B-lymfocyten (B) en T-lymfocyten (T). Perifere mononucleaire bloedcellen (PBMC's) omvatten voornamelijk T-cellen, B-cellen, NK-cellen, monocellen en DC-cellen.

Het aandeel van deze celpopulaties varieert van persoon tot persoon. Gewoonlijk zijn in PBMC T-lymfocyten goed voor 45-70%, B-cellen voor 5-15%, NK-cellen voor 5-20%, monocellen voor 10-30% en DC-cellen voor 1-2%. Onder hen kunnen B-cellen worden onderverdeeld in overgangs-, naïeve, geheugensubgroepen en plasmacellen. Terwijl T-cellen voornamelijk zijn samengesteld uit een cluster van differentiatie 4+ (CD4+) T-cellen en een cluster van differentiatie 8+ (CD8+) T-cellen met een verhouding van ongeveer 2:1. Bovendien kunnen CD4+ T-cellen en CD8+ T-cellen verder worden onderverdeeld in naïeve cellen, centrale geheugencellen in contact met antigeen, effectorgeheugencellen en effectorcellen. Monocellen kunnen worden onderverdeeld in klassieke monocyten en niet-klassieke cluster van differentiatie 16+ (CD16+) pro-inflammatoire monocyten. DC-cellen omvatten plasmacytische dendritische cellen (pDC) en myeloïde dendritische cellen (mDC).

In de afgelopen jaren heeft scRNA-seq zich snel ontwikkeld en wordt het veel gebruikt in onderzoek met betrekking tot het immuunsysteem, waarbij traditionele cognitie wordt doorbroken en een nieuw begrip van de classificatie van immuuncellen wordt verkregen. Met name de opkomende scRNA-seq biedt nieuwe ideeën voor de studie van celheterogeniteit in meercellige organismen. Het analyseren van de veranderingen in het expressieprofiel van het celtranscriptoom op het niveau van een enkele cel kan duidelijk de veranderingen in het traject van individuele cellen laten zien, nieuwe celtypen onthullen en de potentiële functies van immuuncellen ontdekken.

Volwassenen hebben een relatief stabiel immuunsysteem, met weinig invloed van buitenaf. Daarom is deze studie bedoeld om gezonde volwassenen te rekruteren en multi-omics-technieken zoals scRNA-seq te gebruiken om de PBMC's van gezonde volwassenen systematisch te classificeren om een ​​basis te bieden voor verder ziektegerelateerd onderzoek.