Основа иммунного ответа на вакцину против COVID-2019 на одноклеточных мультиомиках

Как важная часть человеческого организма, иммунная система тесно связана с возникновением заболеваний. На основе традиционной методологии классификации он в основном делится на две ветви: врожденный иммунитет и адаптивный иммунитет. Клетки врожденного иммунитета в основном включают моноциты (Mono), естественные клетки-киллеры (NK) и дендритные клетки (DC). Адаптивные иммунные клетки в основном включают В-лимфоциты (В) и Т-лимфоциты (Т). Мононуклеарные клетки периферической крови (PBMC) в основном включают Т-клетки, В-клетки, NK-клетки, моноклетки и DC-клетки.

Доля этих клеточных популяций варьируется у разных людей. Обычно в РВМС Т-лимфоциты составляют 45–70%, В-клетки — 5–15%, NK-клетки — 5–20%, моноклетки — 10–30% и ДК-клетки — 1–2%. Среди них В-клетки можно разделить на переходные, наивные, подгруппы памяти и плазматические клетки. В то время как Т-клетки в основном состоят из кластера дифференцировки 4+ (CD4+) Т-клеток и кластера дифференцировки 8+ (CD8+) Т-клеток с соотношением примерно 2: 1. Более того, CD4+ Т-клетки и CD8+ Т-клетки можно дополнительно разделить на наивные клетки, центральные клетки памяти, контактирующие с антигеном, эффекторные клетки памяти и эффекторные клетки. Моноклетки можно разделить на классические моноциты и неклассический кластер дифференцировки 16+ (CD16+) провоспалительных моноцитов. Клетки DC включают плазмоцитарные дендритные клетки (pDC) и миелоидные дендритные клетки (mDC).

В последние годы scRNA-seq быстро развивалась и широко используется в исследованиях, связанных с иммунной системой, ломая традиционные представления и получая новое понимание классификации иммунных клеток. В частности, появление scRNA-seq дает новые идеи для изучения клеточной гетерогенности многоклеточных организмов. Анализ изменений профиля экспрессии клеточного транскриптома на уровне отдельных клеток может четко показать изменения в траектории отдельных клеток, выявить новые типы клеток и выявить потенциальные функции иммунных клеток.

Взрослые имеют относительно стабильную иммунную систему, практически не подверженную влиянию внешней среды. Таким образом, это исследование предназначено для набора здоровых взрослых и использования методов мультиомики, таких как scRNA-seq, для систематической классификации PBMC здоровых взрослых, чтобы обеспечить основу для дальнейших исследований, связанных с заболеваниями.