単細胞マルチオミクスに基づく COVID-2019 ワクチン免疫応答

免疫系は人体の重要な部分であり、病気の発生と密接に関係しています。 伝統的な分類方法に基づいて、それは主に自然免疫と適応免疫の 2 つの分野に分けられます。 自然免疫細胞には、主に単球 (Mono)、ナチュラルキラー (NK) 細胞、樹状細胞 (DC) が含まれます。 適応免疫細胞には主に B リンパ球 (B) と T リンパ球 (T) が含まれます。 末梢血単核球 (PBMC) には、主に T 細胞、B 細胞、NK 細胞、単細胞、および DC 細胞が含まれます。

これらの細胞集団の割合は個人によって異なります。 通常、PBMCでは、Tリンパ球が45〜70%、B細胞が5〜15%、NK細胞が5〜20%、Mono細胞が10〜30%、DC細胞が1〜2%を占めます。 その中で、B 細胞は、移行期、ナイーブ、記憶サブグループおよび形質細胞に分類できます。 一方、T 細胞は主に分化 4+ (CD4+) T 細胞のクラスターと分化 8+ (CD8+) T 細胞のクラスターで構成されており、その比率は約 2:1 です。 さらに、CD4+ T 細胞と CD8+ T 細胞は、ナイーブ細胞、抗原と接触している中心記憶細胞、エフェクター記憶細胞、エフェクター細胞にさらに分類できます。 単細胞は、古典的単球と非古典的分化クラスター 16+ (CD16+) 炎症誘発性単球に分類できます。 DC 細胞には、形質細胞樹状細胞 (pDC) および骨髄性樹状細胞 (mDC) が含まれます。

近年、scRNA-seq は急速に発展し、免疫系に関連する研究で広く使用されており、従来の認識を打ち破り、免疫細胞の分類について新たな理解を獲得しています。 特に、新たな scRNA-seq は、多細胞生物における細胞の不均一性の研究に新しいアイデアを提供します。 細胞トランスクリプトームの発現プロファイルの変化を単一細胞レベルで分析すると、個々の細胞の軌跡の変化を明確に示し、新しい細胞型を明らかにし、免疫細胞の潜在的な機能を発見できます。

成人は比較的安定した免疫システムを持っており、外部環境からの干渉はほとんどありません。 したがって、この研究は、健康な成人を募集し、scRNA-seq などのマルチオミクス技術を使用して健康な成人の PBMC を系統的に分類し、さらなる疾患関連研究の基礎を提供することを目的としています。