Melkconsumptie en bloedmicrobioom bij gezonde vrijwilligers (MAMI)

EDNA (ecologisch DNA) is een concept dat populariteit wint voor het maken van uitgebreide beschrijvingen van alle organismen die aanwezig zijn in een ecosysteem. Darmmicrobiomen kunnen worden beschouwd als een specifieke variant van EDNA. In theorie moet een beschrijving van het darmmicrobioom alle verschillende soorten micro -organismen in ons maagdarmkanaal bevatten, inclusief bacteriën, virussen, archaea, schimmels en andere organismen (b.v. wormen en fagen). In de praktijk is het maken van dergelijke beschrijvingen een uitdaging vanwege valse tijdelijke veranderingen en technische uitdagingen (bijvoorbeeld de veelgebruikte 16S rRNA -benadering negeert veel organismen). Desalniettemin is het maken van nauwkeurige beschrijvingen essentieel omdat het algemeen wordt geaccepteerd dat het darmmicrobioom een ​​cruciale rol speelt bij het handhaven van gastheerhomeostase en gezondheid.

Om de uitdagingen bij het bemonsteren van het intestinale microbioom te overwinnen, vertrouwen de meeste onderzoekers momenteel op indringende feces. We zijn pionier in het veld bij het ontwikkelen van verbeterde technische benaderingen; We hebben bijvoorbeeld eerder een dubbele ballon-endoscopisch onderzoek uitgevoerd bij gezonde vrijwilligers om dit microbioom in zijn geheel te karakteriseren. Problemen met het fecale microbioom omvatten de slechte vangst van de hechtende flora (die het meest relevant lijkt met betrekking tot menselijke fysiologie), het is zeer heterogeen en kan ertoe leiden dat resultaten verschillen afhankelijk van welk deel van fecale monsters is genomen en technologische uitdagingen, omdat veel eukaryoten zijn tegen DNA -isolatieprotocollen. Bovendien wordt het fecale microbioom gedomineerd door dieet, dat aanzienlijk kan variëren van dag tot dag bij mensen. Feecaal materiaal dat afkomstig is van het ontbijt kan bijvoorbeeld een aanzienlijk andere microbiologische samenstelling hebben dan die afgeleid van het diner. Daarom is er een oproep tot alternatieven.

Het bloedmicrobioom is een nieuw ontdekte manier om het microbioom te onderzoeken, waardoor de kolonisatie van allerlei lichaamslocaties, met name het darmkanaal, wordt geïntegreerd. Er wordt gespeculeerd dat de DNA -fragmenten van verschillende micro -organismen de circulatie binnenkomen door mechanismen die nog volledig worden begrepen. Het gastro -intestinale microbioom wordt beschouwd als een belangrijke bron van bloedmicrobioom, vooral in het geval van een verminderde darmbarrière, die kan optreden bij verschillende chronische ziekten.

De beschrijving van het hele lichaam van celvrije DNA-fragmenten die afkomstig zijn van niet-menselijke oorsprong wordt het bloedmicrobioom genoemd, hoewel het geen levende organismen vormt, maar eerder hun overblijfselen. De bloedmicrobioomhandtekening is gemeld als een voorspelbare biomarker bij het differentiëren van patiënten met kanker van gezonde individuen en zelfs voor het onderscheiden van verschillende kankertypen. De aanpak blijft echter zeer controversieel vanwege bio -informatieke valkuilen. Hoewel we aanzienlijke energie hebben geïnvesteerd in het oplossen van de betrokken problemen, vereist het veld een formeel proof-of-concept voor vooruitgang. De huidige studie is bedoeld om dit te bieden.