Mælkeforbrug og blodmikrobiome hos raske frivillige (MAMI)

Edna (økologisk DNA) er et koncept, der vinder popularitet for at lave omfattende beskrivelser af alle organismer, der er til stede i et økosystem. Tarmmikrobiomer kan betragtes som en specifik variant af Edna. I teorien skal en beskrivelse af tarmmikrobiomet indeholde alle forskellige slags mikroorganismer i vores mave -tarmkanal, herunder bakterier, vira, archaea, svampe og andre organismer (f.eks. orme og fager). I praksis er det udfordrende at gøre sådanne beskrivelser på grund af falske tidsmæssige ændringer og tekniske udfordringer (f.eks. Den almindeligt anvendte 16S rRNA -tilgang ignorerer mange organismer). Ikke desto mindre er det vigtigt at gøre nøjagtige beskrivelser, da det generelt accepteres, at tarmmikrobiomet spiller kritiske roller i at opretholde værtshomeostase og sundhed.

For at overvinde udfordringerne ved prøveudtagning af tarmmikrobiomet er de fleste efterforskere i øjeblikket afhængige af at sorte fæces. Vi har været banebrydende for at udvikle forbedrede tekniske tilgange; For eksempel udførte vi tidligere en dobbelt-ballon endoskopisk undersøgelse hos raske frivillige for at karakterisere dette mikrobiom i sin helhed. Problemer med det fækale mikrobiom inkluderer dets dårlige indfangning af den vedhæftede flora (som synes at være den mest relevante angående menneskelige fysiologi), det er meget heterogene og kan få resultater til at variere afhængigt af hvilken del af fækale prøver, der blev taget, og teknologiske udfordringer, da mange eukaryoter er ganske modstandsdygtige efter DNA -isoleringsprotokoller. Derudover domineres det fækale mikrobiom af diæt, hvilket kan variere væsentligt fra dag til dag hos mennesker. For eksempel kan fækalt materiale, der stammer fra morgenmaden, have en markant anderledes mikrobiologisk sammensætning sammenlignet med den afledte fra middagen. Derfor er der et opfordring til alternativer.

Blodmikrobiomet er en nyligt opdaget måde at undersøge mikrobiomet på, hvilket integrerer koloniseringen af ​​alle slags kropssteder, især tarmkanalen. Det spekuleres i, at DNA -fragmenterne af forskellige mikroorganismer kommer ind i cirkulationen gennem mekanismer, der endnu er fuldt ud forstået. Mave -tarm -mikrobiomet betragtes som en vigtig kilde til blodmikrobiom, især i tilfælde af en nedsat tarmbarriere, som kan forekomme i forskellige kroniske sygdomme.

Beskrivelsen af ​​hele kroppen af ​​cellefrie DNA-fragmenter, der stammer fra ikke-menneskelig oprindelse, kaldes blodmikrobiomet, selvom det ikke udgør levende organismer, men snarere deres rester. Blodmikrobiomsignaturen er rapporteret som en forudsigelig biomarkør til at differentiere patienter med kræft fra raske individer og endda for at skelne mellem forskellige kræftformer. Imidlertid forbliver fremgangsmåden meget kontroversiel på grund af bioinformatiske faldgruber. Mens vi har investeret betydelig energi i at løse de involverede spørgsmål, kræver feltet et formelt proof-of-concept for at komme videre. Den aktuelle undersøgelse er beregnet til at give dette.