Consumo de leche y microbioma en sangre en voluntarios sanos (MAMI)

EDNA (ADN ecológico) es un concepto que está ganando popularidad para hacer descripciones integrales de todos los organismos presentes en un ecosistema. Los microbiomas intestinales pueden considerarse una variante específica de EDNA. En teoría, una descripción del microbioma intestinal debe contener todos los diferentes tipos de microorganismos en nuestro tracto gastrointestinal, incluidas bacterias, virus, arqueas, hongos y otros organismos (p. Ej. gusanos y fagos). En la práctica, hacer tales descripciones es desafiante debido a los cambios temporales espurios y los desafíos técnicos (por ejemplo, el enfoque de ARNr 16S comúnmente utilizado ignora muchos organismos). Sin embargo, hacer descripciones precisas es esencial, ya que generalmente se acepta que el microbioma intestinal desempeña papeles críticos en el mantenimiento de la homeostasis y la salud del acogida.

Para superar los desafíos en el muestreo del microbioma intestinal, la mayoría de los investigadores actualmente dependen de las heces de investigación. Hemos sido pioneros en el campo en el desarrollo de enfoques técnicos mejorados; Por ejemplo, anteriormente realizamos un estudio endoscópico de doble balón en voluntarios sanos para caracterizar este microbioma en su totalidad. Los problemas con el microbioma fecal incluyen su mala captura de la flora adherente (que parece ser la más relevante en relación con la fisiología humana), es altamente heterogénea y puede hacer que los resultados difieran dependiendo de qué parte de las muestras fecales se toman y los desafíos tecnológicos, ya que muchas eucariotas son bastante resistentes a los protocolos de la isolación de ADN. Además, el microbioma fecal está dominado por la dieta, que puede variar sustancialmente de día a día en humanos. Por ejemplo, el material fecal derivado del desayuno puede tener una composición microbiológica significativamente diferente en comparación con la derivada de la cena. Por lo tanto, hay un llamado a alternativas.

El microbioma de sangre es una forma recientemente descubierta de sondear el microbioma, integrando la colonización de todo tipo de sitios corporales, particularmente el tracto intestinal. Se especula que los fragmentos de ADN de varios microorganismos ingresan a la circulación a través de mecanismos que aún se entienden completamente. El microbioma gastrointestinal se considera una fuente importante de microbioma sanguíneo, especialmente en el caso de una barrera intestinal deteriorada, que puede ocurrir en diversas enfermedades crónicas.

La descripción de todo el cuerpo de fragmentos de ADN libres de células que se derivan del origen no humano se llama microbioma de sangre, a pesar de que no constituye organismos vivos, sino sus restos. La firma de microbioma en sangre se ha informado como un biomarcador predecible para diferenciar a los pacientes con cáncer de individuos sanos e incluso para distinguir entre diferentes tipos de cáncer. Sin embargo, el enfoque sigue siendo muy controvertido debido a las trampas bioinformáticas. Si bien hemos invertido una energía sustancial para resolver los problemas involucrados, el campo requiere una prueba de concepto formal para el progreso. El estudio actual está destinado a proporcionar esto.