Потребление молока и микробиом крови у здоровых добровольцев (MAMI)

Edna (экологическая ДНК) - это концепция, которая набирает популярность для получения всесторонних описаний всех организмов, присутствующих в экосистеме. Микробиомы кишечника можно считать специфическим вариантом EDNA. Теоретически, описание кишечного микробиома должно содержать все различные виды микроорганизмов в наших желудочно -кишечных трактах, включая бактерии, вирусы, археи, грибы и другие организмы (например, Черви и фаги). На практике создание таких описаний является сложным из -за ложных временных изменений и технических проблем (например, общепринятый подход 16S рРНК игнорирует многие организмы). Тем не менее, создание точных описаний имеет важное значение, поскольку общепринято, что кишечный микробиом играет критическую роль в поддержании гомеостаза и здоровья хозяина.

Чтобы преодолеть проблемы при отбора проб кишечного микробиома, большинство исследователей в настоящее время полагаются на расследование фекалий. Мы впервые разработали область в разработке улучшенных технических подходов; Например, мы ранее проводили двойное эндоскопическое исследование у здоровых добровольцев, чтобы полностью охарактеризовать этот микробиом. Проблемы с фекальным микробиомом включают его плохой захват прилипшей флоры (которая представляется наиболее актуальной в отношении физиологии человека), она очень гетерогенна и может привести к различным результатам в зависимости от того, какая часть образцов фекалий была взята, и технологические проблемы, поскольку многие эукариоты весьма устойчивы к протоколам изоляции DNA. Кроме того, в фекальном микробиом преобладает диета, которая может существенно варьироваться от повседневного дня у людей. Например, фекальный материал, полученный от завтрака, может иметь значительно различную микробиологическую композицию по сравнению с тем, что происходит от ужина. Следовательно, есть призыв к альтернативам.

Микробиом крови является недавно обнаруженным способом исследования микробиома, интегрируя колонизацию всех видов участков тела, особенно кишечного тракта. Предполагается, что фрагменты ДНК различных микроорганизмов попадают в циркуляцию с помощью механизмов, которые еще полностью поняты. Желудочно -кишечный микробиом считается основным источником микробиома крови, особенно в случае нарушенного кишечного барьера, который может возникать при различных хронических заболеваниях.

Описание всего тела бесклеточных фрагментов ДНК, которое происходит от нечеловеческого происхождения, называется микробиом крови, хотя оно не составляет живых организмов, а скорее их остатков. Сообщается, что сигнатура микробиома крови, как сообщается, предсказуемый биомаркер при дифференцировании пациентов со раком от здоровых людей и даже для различения различных типов рака. Однако подход остается очень спорным из -за биоинформационных ловушек. Хотя мы инвестировали существенную энергию в решение связанных с этим вопросов, поле требует формального подтверждения концепции в прогресс. Текущее исследование предназначено для того, чтобы предоставить это.