Epigenetiske faktorer ved kolorektal adenom hos koreanere
Utforskning av epigenetiske faktorer for kolorektal adenom hos koreanere
Denne studien har som mål å utforske epigenetiske faktorer assosiert med kolorektal adenom (CRA) i den koreanske befolkningen. CRA er en viktig forstadietilstand i adenom-karsinom-sekvensen, og identifisering av metylerte genetiske markører kan forbedre tidlig oppdagelse og risikostratifisering for kolorektal kreft (CRC).
Totalt 32 pasienter som gjennomgår koloskopisk polypektomi vil bli inkludert. Adenomatøst og tilstøtende normalt vev vil bli samlet inn for desoksyribonukleinsyre (DNA)-ekstraksjon og bisulfittkonvertering. Kvantitativ metyleringsspesifikk polymerasekjedereaksjon (qMSP) og Sanger-sekvensering vil bli brukt for å vurdere metyleringsstatusen til kandidatgener (SFRP2, TFPI2, SEPT9 og SDC2). Avføringsprøver vil også bli analysert ved helgenomsekvensering (WGS) for å evaluere mikrobiom og genetiske profiler.
Studien søker å avgjøre om metyleringsnivåene av disse genene er signifikant forhøyet i adenomvev sammenlignet med normal slimhinne, og dermed identifisere potensielle biomarkører for overvåking av kolorektal neoplasi og personaliserte koloskopi-oppfølgingsintervaller.
Studieoversikt
Status
Status
Forhold
Forhold
Detaljert beskrivelse
Tykktarmskreft (CRC) er en av de vanligste kreftformene i Korea, og rangerer som nummer to i nasjonale kreftforekomststatistikker. De fleste CRC-tilfeller oppstår gjennom adenom-carcinom-sekvensen, der epigenetiske og genetiske endringer spiller avgjørende roller. Å identifisere metylerte genetiske markører i tykktarmsadenom kan gi innsikt i tidlige kreftmekanismer og muliggjøre mer individualiserte overvåkingsstrategier etter polypektomi.
Denne studien fokuserer på å utforske epigenetiske faktorer – spesielt DNA-metyleringsmønstre – assosiert med tykktarmsadenom hos koreanske pasienter. Totalt 32 deltakere som gjennomgår koloskopisk polypektomi vil bli rekruttert. Fra hver deltaker vil både adenomatøst vev og tilstøtende normal slimhinne (omtrent 5 millimeter (mm) i størrelse) bli samlet inn. Avføringsprøver vil også bli innhentet for mikrobiom- og genomanalyse.
DNA ekstrahert fra vevs- og avføringsprøver vil gjennomgå bisulfittkonvertering ved bruk av EZ DNA Methylation-Gold Kit (Zymo Research). Kvantitativ metyleringsspesifikk polymerasekjedereaksjon (qMSP) vil bli utført for å evaluere promotermetyleringsnivåer av fire kandidatgener – SFRP2 (Secreted Frizzled Related Protein 2), TFPI2 (Tissue Factor Pathway Inhibitor 2), SEPT9 (Septin 9) og SDC2 (Syndecan 2) – som tidligere har vist potensial som biomarkører for tykktarmsneoplasi. Utvalgte prøver vil også gjennomgå Sanger-sekvensering for CpG-nivå metyleringsprofilering. Avførings-DNA vil bli analysert gjennom hele-genom-sekvensering (WGS) på Illumina NovaSeq 6000-plattformen for å vurdere mikrobiel sammensetning og genetisk kontekst.
Metyleringsindekser (MtI) og prosentandel av metylert referanse (PMR)-verdier vil bli beregnet og sammenlignet mellom adenom og tilstøtende normalvev. Receiver operating characteristic (ROC)-kurveanalyse vil fastslå sensitiviteten og spesifisiteten til hvert gen som en potensiell biomarkør.
Ved å identifisere metylerte gener som er signifikant oppregulert i adenomatøst vev, har denne studien som mål å foreslå kandidat-epigenetiske markører for å forutsi tilbakefall eller ondartet transformasjon av tykktarmsadenom. Funnene kan bidra til å avgrense overvåkingsintervaller etter polypektomi og støtte presisjonsforebyggingsstrategier i CRC.
Studietype
Studietype
Registrering (Antatt)
Registrering
Kontakter og plasseringer
Studiekontakt
Studiekontakt
- Navn: OneJoong KIM, M.D.
- Telefonnummer: 82+010+2111+0415
- E-post: biblian@chamc.co.kr
Studiesteder
-
-
Gyeonggi-do
-
Seongnam-si, Gyeonggi-do, Sør -Korea, 13496
- Bundang CHA Hospital
-
Ta kontakt med:
- KIM OneJoong
- Telefonnummer: 01021115353
- E-post: biblian@chamc.co.kr
-
-
Deltakelseskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Kvalifikasjonskriterier
Alder som er kvalifisert for studier
- Voksen
- Eldre voksen
Tar imot friske frivillige
Prøvetakingsmetode
Studiepopulasjon
Beskrivelse
Inklusjonskriterier:
Voksne i alderen 19–85 år.
Skal gjennomgå koloskopisk polypektomi for kolorektal adenom.
I stand til å forstå studiens formål og gi skriftlig samtykke.
Tilstrekkelig vev tilgjengelig for både adenom- og normal slimhinneprøvetaking.
Eksklusjonskriterier:
Tidligere kolorektal kreft, inflammatorisk tarmsykdom eller arvelig kolorektal kreftsyndrom (f.eks. FAP, Lynch-syndrom).
Tidligere kolorektal kirurgi som kan endre anatomi eller patologi.
Utilstrekkelig prøvekvalitet eller mislykket DNA-ekstraksjon.
Avslag eller tilbakekallelse av informert samtykke.
Alvorlige komorbiditeter som gjør deltakelse upassende etter forskerens skjønn.
Studieplan
Hvordan er studiet utformet?
Designdetaljer
Antall grupper / kohorter
Kohorter og intervensjoner
Gruppe / KohortGruppe / Kohort |
|---|
|
Kolorektal adenomgruppe
Deltakere som gjennomgår koloskopisk polypektomi for kolorektal adenom.
Adenomatøst vev og tilstøtende normal slimhinne vil bli samlet inn for metylerings- og sekvenseringsanalyse.
|
Hva måler studien?
Primære resultatmål
Primære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Metyleringsindeks av SFRP2 i tarmvev
Tidsramme: Utgangspunkt (enkelt tidspunkt)]
|
Kvantitativ vurdering av DNA-metylering i adenomatøse versus tilstøtende normale kolorektale vev.
Metyleringsnivåer vil bli bestemt ved bruk av kvantitativ metyleringsspesifikk PCR (qMSP) og uttrykt som metyleringsindeks (MtI, %).
|
Utgangspunkt (enkelt tidspunkt)]
|
|
Metyleringsindeks av TFPI2 i tarmvev
Tidsramme: Baseline (enkelt tidspunkt)]
|
Kvantitativ vurdering av DNA-metylering i adenomatøs vev versus tilstøtende normalt kolorektalt vev.
Metyleringsnivåer vil bli bestemt ved bruk av kvantitativ metyleringsspesifikk PCR (qMSP) og uttrykt som metyleringsindeks (MtI, %).
|
Baseline (enkelt tidspunkt)]
|
|
Metyleringsindeksen til SEPT9 i tykktarmvev
Tidsramme: Utgangspunkt (enkelt tidspunkt)]
|
Kvantitativ vurdering av DNA-metyleringsnivåer i adenomatøse versus tilstøtende normale kolorektale vev.
Metyleringsnivåer vil bli bestemt ved bruk av kvantitativ metyleringsspesifikk PCR (qMSP) og uttrykt som metyleringsindeks (MtI, %).
|
Utgangspunkt (enkelt tidspunkt)]
|
|
Metyleringsindeks for SDC2 i kolorektalvev
Tidsramme: Baseline (enkelt tidspunkt)]
|
Kvantitativ vurdering av DNA-metylering i adenomatøse versus tilstøtende normale tarmvev.
Metyleringsnivåer vil bli bestemt ved bruk av kvantitativ metylering-spesifikk PCR (qMSP) og uttrykt som metyleringsindeks (MtI, %).
|
Baseline (enkelt tidspunkt)]
|
Sekundære resultatmål
Sekundære resultatmål
Resultatmål |
Tiltaksbeskrivelse |
Tidsramme |
|---|---|---|
|
Sensitivitet og spesifisitet av metylert SFRP2 for deteksjon av adenom
Tidsramme: Baseline (enkelt tidspunkt)
|
Receiver operating characteristic (ROC)-kurveanalyse vil bli brukt for å evaluere den diagnostiske ytelsen til metylert SFRP2 i å skille adenomatøst vev fra normalt vev.
Prosentandelen av metylerte referanseverdier (PMR) fra qMSP vil bli sammenlignet mellom gruppene.
|
Baseline (enkelt tidspunkt)
|
|
Sensitivitet og spesifisitet for metylert TFPI2 for deteksjon av adenom
Tidsramme: Baseline (Enkelt tidspunkt)
|
Receiver operating characteristic (ROC)-kurveanalyse vil bli brukt til å evaluere den diagnostiske ytelsen til metylert TFPI2 i å skille adenomatøst vev fra normalt vev.
Prosentandelen av metylerte referanse (PMR)-verdier fra qMSP vil bli sammenlignet mellom gruppene.
|
Baseline (Enkelt tidspunkt)
|
|
Følsomhet og spesifisitet av metylert SEPT9 for å oppdage adenom
Tidsramme: Utgangspunkt (enkelt tidspunkt)
|
Receiver operating characteristic (ROC)-kurveanalyse vil bli brukt for å evaluere diagnostisk ytelse av metylert SEPT9 i å skille adenomatøst vev fra normalt vev.
Prosentandelen av metylerte referanse (PMR)-verdier fra qMSP vil bli sammenlignet mellom gruppene.
|
Utgangspunkt (enkelt tidspunkt)
|
|
Følsomhet og spesifisitet for metylert SDC2 for deteksjon av adenom
Tidsramme: Baseline (Enkelt tidspunkt)
|
Analyse av mottakeroperasjonskarakteristikk (ROC)-kurve vil bli brukt for å vurdere den diagnostiske ytelsen til metylert SDC2 i å skille adenomatøst vev fra normalt vev.
Prosentandelen av metylerte referanse (PMR)-verdier fra qMSP vil bli sammenlignet mellom gruppene. |
Baseline (Enkelt tidspunkt)
|
Samarbeidspartnere og etterforskere
Sponsor
Sponsor
Studierekorddatoer
Studer hoveddatoer
Studiestart (Antatt)
Studiestart
Primær fullføring (Antatt)
Primær fullføring
Studiet fullført (Antatt)
Studiet fullført
Datoer for studieregistrering
Først innsendt
Først innsendt
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først innsendt som oppfylte QC-kriteriene
Først lagt ut (Faktiske)
Først lagt ut
Oppdateringer av studieposter
Sist oppdatering lagt ut (Faktiske)
Sist oppdatering lagt ut
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Siste oppdatering sendt inn som oppfylte QC-kriteriene
Sist bekreftet
Sist bekreftet
Mer informasjon
Begreper knyttet til denne studien
Nøkkelord
Andre studie-ID-numre
Andre studie-ID-numre
- CHAMC IRB 2025-05-034-004
Plan for individuelle deltakerdata (IPD)
Planlegger du å dele individuelle deltakerdata (IPD)?
Legemiddel- og utstyrsinformasjon, studiedokumenter
Studerer et amerikansk FDA-regulert medikamentprodukt
Studerer et amerikansk FDA-regulert enhetsprodukt
Denne informasjonen ble hentet direkte fra nettstedet clinicaltrials.gov uten noen endringer. Hvis du har noen forespørsler om å endre, fjerne eller oppdatere studiedetaljene dine, vennligst kontakt register@clinicaltrials.gov. Så snart en endring er implementert på clinicaltrials.gov, vil denne også bli oppdatert automatisk på nettstedet vårt. .
Kliniske studier på Kolorektalt adenom
-
NCT07146165RekrutteringAdenom tykktarm | Adenom tykktarmspolypp
-
NCT01607866TilbaketrukketPleomorfisk adenom i parotidkjertelen
-
NCT06577610Har ikke rekruttert ennåSessilt tagget adenom | Adenom tykktarmspolypp
-
NCT07387419RekrutteringAdenom med mild autonom kortisolsekresjon | Ikke-sekreterende adenom
-
NCT07470827Aktiv, ikke rekrutterendeKarsinom | Adenom | Kolorektalt adenom | Hyperplastisk polypp | Sessile taggete lesjon | Ikke-adenom
-
NCT07505056Har ikke rekruttert ennå
-
NCT01411189FullførtMagekreft | Gastrisk adenom | Colon Nos Polypectomy Tubulært adenom
-
NCT02306603Rekruttering
-
NCT06603948Fullført
-
NCT06158776Fullført