Studie av lungeproteiner hos pasienter med lungebetennelse

OBJEKTIV:

Målet med denne studien er å analysere bronchoalveolar lavage (BAL) væske fra pasienter med lungeinfiltrater for å oppdage nye biomarkører og protein/peptidekspresjonsmønstre som er assosiert med spesifikke typer lungesykdommer og infeksjoner. Bronkoalveolær lavage (BAL) er en standardmetode for å få prøver fra nedre luftveier for å evaluere lungeinfiltrater for å diagnostisere infeksjon, malignitet eller ikke-infeksiøs betennelse. Etter innsamling av BAL (under en klinisk indisert brokoskopi), sendes prøver rutinemessig til det kliniske mikrobiologilaboratoriet for flekker, kulturer og molekylær analyse. Vi har nylig utviklet en rask, kulturuavhengig metode for å identifisere unike peptidmarkører i BAL som identifiserer spesifikke bakteriearter. Vi utvider omfanget av 04-CC-0119 som opprinnelig var basert på kun innsamling av BAL-supernatant, til nå å samle inn, analysere og lagre hele (ubehandlet) BAL. Tilgjengeligheten av nye metoder for å analysere BAL vil utvide omfanget av studien for å analysere BAL-proteiner, lungeceller og mikrobielle patogener. Dette vil tillate forbedret karakterisering av vertens respons på lungebetennelse og infeksjon og bidra til å vurdere muligheten for å bruke den kulturuavhengige tilnærmingen på kliniske BAL-prøver for å identifisere spesifikke patogener.

BEFOLKNING:

Studiepopulasjonen vil inkludere alle pasienter som gjennomgår bronkoskopi for kliniske indikasjoner ved det kliniske senteret som gir informert samtykke til blodprøvetaking (valgfritt) og analyse av BAL, som beskrevet i denne protokollen. Vi planlegger å anskaffe BAL-prøver som gjenspeiler et spekter av fellesskapservervede og opportunistiske patogener assosiert med lungesykdom. I tillegg analyse av en rekke ikke-infeksiøse lungeprosesser (f. akutt lungeskade, akutt respiratorisk distress-syndrom og engraftment-syndrom) er viktig for å utvikle mål på sensitivitet og spesifisitet.

DESIGN:

Dette er en prospektiv observasjonsstudie.

UTFALL:

Det forventede resultatet er å:

Utvikle en database med proteinmasseprofiler av BAL-væske knyttet til spesifikke mikrobiologiske diagnoser.

Å samle, analysere og lagre BAL for å validere nytten av den genoproteomiske kulturuavhengige metoden for mikrobiell identifikasjon.

Å analysere lungeceller assosiert med smittsomme eller inflammatoriske lungetilstander.

Planen vår er å anskaffe 1000 prøver fra det kliniske senteret med en rekke kliniske diagnoser, inkludert bakterielle, virale, parasittiske og soppinfeksjoner og steril betennelse. Når et tilstrekkelig antall prøver i en individuell kategori er samlet inn (ca. 20-30), vil prøvene bli analysert med gjeldende proteomiske teknikker.