En studie av prediktive og prognostiske markører hos pasienter med ikke-småcellet lungekreft

1. Å etablere en retrospektiv sammenstilling av kliniske, histopatologiske, behandlings- og oppfølgingsdata (klinisk patologiske) av tidligere tilfeller av ikke-småcellet lungekreft (NSCLC).
2. Å etablere en prospektiv samling av klinikkpatologisk informasjon fra NSCLC-pasienter med tilsvarende blod- og vevsprøver
3. Å oppdage og validere molekylære biomarkører for overlevelse og behandlingsresultat ved NSCLC

En av de nåværende vanskelighetene i behandlingen av lungekreft er beslutningen om å behandle og hvilken type behandling som skal velges. Det er derfor behov for ytterligere prognostiske (indikerende på sykdomsaggressivitet) og prediktive (indikerende sannsynlig respons på behandling) for lungekreft. For å gjennomføre et vellykket prognostisk og prediktivt markørprogram kreves det flere faktorer, inkludert: en omfattende database som kobler sammen kliniske, histopatologiske, behandlings- og resultatkarakteristikker for hvert enkelt tilfelle, en samling prøver knyttet til databasen som er egnet for testing av kandidatmarkører , og et tverrfaglig, interdepartementalt ekspertisenivå i håndtering av lungekreft.

Mål 1:

En gjennomgang av saksjournalene vil bli utført for å trekke ut kliniske, behandlings- og oppfølgingsdata

Mål 2:

Pasienter i alderen 21 år eller mer med nydiagnostisert, ubehandlet ikke-småcellet lungekreft skal oppsøkes for samtykke. Pasienter vil bli identifisert gjennom patologijournalene og fra studieforskernes klinikk. Etter samtykke fra forsøkspersonen vil baseline-karakteristikker innhentes. Oppfølgingsdata om mottatte terapier og påvist toksisitet vil bli innhentet. Tumorprøver vil kun innhentes fra pasienter med NSCLC som gjennomgår kirurgi som en del av rutinemessig klinisk behandling. Den kirurgiske prøven vil bli sendt til patologi for å verifisere tilstrekkeligheten til den diagnostiske prøven i henhold til vanlig praksis. Blod vil bli samlet ved baseline (eller før eventuell anti-kreftbehandling) og vil bli tatt igjen på tidspunktet for tilbakefall eller sykdomsprogresjon. Innsamling vil innebære å trekke 7 ml blod inn i et Vacutainer CPT-rør (Becton Dickinson, USA), sentrifugering, ekstraksjon av et separert lag av mononukleære celler (MNC), merking etterfulgt av lagring under -80oC. Hyppigheten av blodtap vil være ca. 1-5 ganger (7-35 ml totalt). Antall ganger avhenger av om lungekreften får tilbakefall og i avansert stadium, hvor ofte lungekreften får tilbakefall etter behandling. DNA og RNA vil bli ekstrahert av CSIS og lagret i fryserom der. Lagrede prøver vil bli brukt til undersøkelse av prognostiske og prediktive markører for utfall og for oppdagelse av nye molekylære endringer

Mål 3:

Biomarkøranalyse av svulst og blod. Blod vil bli anriket for sirkulerende tumorceller (CTC) ved bruk av tidligere optimaliserte metoder (11) og DNA vil bli ekstrahert fra CTC og tumor ved hjelp av Tri-Reagent (Molecular Research Center, Cincinatti, OH). DNA vil bli ekstrahert fra tumor-, CTC- og mononukleerte celler og testet for somatiske lungemutasjoner ved sekvensering (2). Germline DNA vil bli analysert for gener knyttet til genetisk risiko for NSCLC og, for behandlingstoksisitet, for gener relatert til NSCLC kjemoterapi metabolske veier.

Tissue microarray (TMA) er en metode med høy gjennomstrømning for å analysere et stort antall formalinfikserte, parafininnstøpte svulster til en minimal kostnad og innsats. For å analysere uttrykket av proteiner av antatt relevans for EGFR-funksjon, celleproliferasjon, angiogenese, apoptose, metastaser og hormonell, vil TMA bli brukt. PTEN og C/EBPa vil også bli analysert.